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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Characterization of normal and cancer stem-like cell populations in murine lingual epithelial organoids using single-cell RNA sequencing
2021-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01783-5
PMID:34785704
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠舌上皮类器官中正常和癌症干细胞样细胞群体的特征 | 揭示了舌癌中具有干细胞特性的异质细胞群体与正常干细胞群体的不同特征,为开发新型分子靶向治疗提供了依据 | NA | 开发基于特定基因表达谱的舌癌分子靶向治疗 | 小鼠舌上皮类器官中的正常和癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 舌癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq highlights a specific carcinoembryonic cluster in ovarian cancer
2021-11-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04358-4
PMID:34775482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探索卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织的异质性,并识别关键的细胞簇和标记物,构建预测模型评估卵巢癌的预后 | 发现了与胚胎相似的卵巢癌恶性上皮细胞簇PEG10 EME,该细胞簇与不良生存率相关,并可能通过NOTCH通路影响癌症干细胞的自我更新和顺铂耐药性 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌的异质性,寻找有效的预后标志物和治疗策略 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类算法 | 基因表达数据 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Immune cell and TCR/BCR repertoire profiling in systemic lupus erythematosus patients by single-cell sequencing
2021-11-12, Aging
DOI:10.18632/aging.203695
PMID:34772824
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研究论文 | 本研究利用单细胞5' RNA测序和单细胞T细胞受体(TCR)/B细胞受体(BCR)测序技术,分析了系统性红斑狼疮(SLE)患者及其对照组的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 首次详细描述了SLE患者中免疫细胞的转录组和TCR/BCR免疫谱系特征 | 样本量较小,仅包括十名SLE患者及其对照组 | 探索SLE患者中免疫细胞及其TCR/BCR谱系的表达和分布,以更好地理解这一致命的自身免疫疾病 | 系统性红斑狼疮患者的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞5' RNA测序,单细胞TCR/BCR测序 | NA | RNA序列数据 | 10名SLE患者及其对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Ionizing irradiation-induced Fgr in senescent cells mediates fibrosis
2021-Nov-12, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00741-4
PMID:34772919
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研究论文 | 研究了辐射诱导的细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及其机制 | 首次揭示了辐射诱导的衰老细胞中Fgr激酶的上调在放射性肺纤维化中的作用 | 仅在体外和小鼠模型中进行了实验,需要进一步的人体研究验证 | 探讨细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及机制 | 辐射诱导的衰老tdTOMp16阳性间充质干细胞 | NA | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNAseq) | NA | RNA | 小鼠肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Deciphering intratumoral heterogeneity using integrated clonal tracking and single-cell transcriptome analyses
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26771-1
PMID:34764253
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研究论文 | 本文介绍了一种综合实验系统,通过整合单细胞转录组分析和基于DNA条形码的克隆追踪,研究肿瘤内异质性与癌细胞生长、转移和治疗反应的关系。 | 本文创新性地将单细胞转录组分析与DNA条形码克隆追踪相结合,以揭示肿瘤内异质性的分子和细胞基础。 | NA | 研究肿瘤内异质性与疾病进展和治疗抵抗的分子和细胞基础。 | 白血病细胞的基因表达与化疗反应的关系,以及特定基因表达细胞驱动的白血病扩展。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with single-cell RNA sequencing
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26770-2
PMID:34764257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了25名肺腺癌患者的268,471个细胞,揭示了肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性及其转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肺腺癌从癌前病变到侵袭性癌的细胞异质性和分子事件 | NA | 揭示肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性和转录特征 | 肺腺癌患者的细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 268,471个细胞,来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-Nov-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.10.023
PMID:34767776
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
IRF3 Knockout Results in Partial or Complete Rejection of Murine Mesothelioma
2021-Nov-07, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10215196
PMID:34768716
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研究论文 | 研究IRF3敲除对小鼠间皮瘤的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次探讨IRF3在间皮瘤中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | NA | 探索IRF3敲除对小鼠间皮瘤的治疗潜力及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 | NA | 间皮瘤 | 流式细胞术,scRNA-Seq | NA | mRNA表达数据 | 多种小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity and Functional Diversity of Lymphatic Endothelial Cells
2021-Nov-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111976
PMID:34769408
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示淋巴内皮细胞异质性和功能多样性方面的最新发现 | 结合单细胞RNA测序数据与成像和深入的功能实验,推进对健康和疾病中淋巴内皮细胞的了解 | 对慢性炎症疾病中淋巴内皮细胞异质性和功能多样性的知识有限 | 总结单细胞RNA测序在淋巴血管生物学领域的新发现,并探讨淋巴内皮细胞作为慢性炎症疾病新治疗靶点的可能性 | 淋巴内皮细胞的异质性、功能多样性及其与其他细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of Human Small Antral Follicles
2021-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111955
PMID:34769386
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析,研究了人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征 | 首次描述了小腔卵泡中卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征,并探讨了不同信号通路在卵母细胞和颗粒细胞间的双向配体-受体相互作用 | NA | 揭示小腔卵泡的多样性,并填补人类卵泡发育和卵子发生分子景观图谱的空白 | 人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学(SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 多个个体的小腔卵泡 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Activated but impaired IFN-γ production of mucosal-associated invariant T cells in patients with hepatocellular carcinoma
2021-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003685
PMID:34789552
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞)在肝细胞癌(HCC)患者中的功能和特征 | 首次详细描述了HCC患者中窦内MAIT细胞的功能和表型特征 | 研究仅限于外周血和肝脏样本,未涉及其他组织或器官 | 研究HCC患者中MAIT细胞的功能和表型变化 | HCC患者的外周血和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | HCC患者和健康对照者的外周血和肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Identification of astroglia-like cardiac nexus glia that are critical regulators of cardiac development and function
2021-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001444
PMID:34793438
|
research paper | 本文通过荧光时间流逝成像、命运图谱和突变生成在斑马鱼模型中,鉴定了一种神经嵴来源的胶质细胞,称为nexus胶质细胞,该细胞利用Meteorin信号通过Jak/Stat3途径驱动分化并调节心率和节律。 | 首次在斑马鱼模型中鉴定出一种神经嵴来源的nexus胶质细胞,并揭示其在心脏发育和功能中的关键作用。 | NA | 研究nexus胶质细胞在心脏发育和功能中的作用及其分子机制。 | nexus胶质细胞及其在心脏中的功能。 | NA | NA | confocal time-lapse imaging, fate mapping, single-cell sequencing | NA | image, sequencing data | 涉及人类和鼠类心脏的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA-seq reveals transcriptomic heterogeneity mediated by host-pathogen dynamics in lymphoblastoid cell lines
2021-Nov-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75422
PMID:34762045
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Modeling the ACVR1R206H mutation in human skeletal muscle stem cells
2021-11-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66107
PMID:34755602
|
研究论文 | 本研究通过分析ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的影响,探讨了ACVR1在骨骼肌修复中的作用 | 首次使用来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞(Hu-MuSCs)和诱导多能干细胞(iPSCs)衍生的肌肉干细胞/祖细胞(iMPCs)进行单细胞转录组分析,揭示了ACVR1突变对骨骼肌修复的影响 | NA | 阐明ACVR1突变如何影响骨骼肌修复 | ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的作用 | NA | 异位骨化 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞和诱导多能干细胞衍生的肌肉干细胞/祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Optimization of library preparation based on SMART for ultralow RNA-seq in mice brain tissues
2021-Nov-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08132-w
PMID:34758728
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研究论文 | 本文介绍了一种针对极低输入RNA测序的高灵敏度文库构建协议 | 使用Maxima H Minus反转录酶和rN修饰的TSO,以及所有m7G帽化的RNA模板,提高了测序灵敏度和低丰度基因检测能力 | NA | 优化文库准备方法,提高极低输入RNA测序的灵敏度和低丰度基因检测能力 | 小鼠脑组织中的极低输入RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从低至0.5 pg的总RNA样本中成功制备RNA-seq文库,并鉴定出超过2000个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals opposing roles of Shp2 in Myc-driven liver tumor cells and microenvironment
2021-11-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109974
PMID:34758313
|
research paper | 本研究揭示了Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中扮演相反角色 | 首次展示了Myc驱动的肝细胞癌在Shp2缺失的小鼠中加剧,并依赖于Shp2维持的Ras-Erk信号通路 | NA | 探讨Myc驱动的肝癌发生机制 | Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的作用 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和肝细胞癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Olig2-astrocytes express neutral amino acid transporter SLC7A10 (Asc-1) in the adult brain
2021-11-08, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-021-00874-8
PMID:34749773
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研究论文 | 研究报道了转录因子Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中表达中性氨基酸转运蛋白SLC7A10(Asc-1) | 首次揭示了Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中表达SLC7A10,并探讨了其在这些细胞中的特定功能 | NA | 探究Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中的特定功能 | 成年小鼠大脑中的Olig2标记星形胶质细胞和GFAP标记星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 激光显微切割, 定量逆转录PCR, 免疫组织化学 | NA | RNA | 来自成年小鼠大脑的Olig2和GFAP标记的星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Profiling cellular diversity in sponges informs animal cell type and nervous system evolution
2021-Nov-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj2949
PMID:34735222
|
研究论文 | 本研究通过在无神经系统和水肌动物海绵中进行全身单细胞RNA测序,揭示了18种不同的细胞类型,并探讨了动物细胞类型和神经系统的进化起源。 | 首次在海绵中发现并描述了与神经系统相关的细胞类型,如神经样细胞和收缩性扁平细胞,并展示了这些细胞在消化腔室中的组织和通信系统。 | NA | 探究动物细胞类型和神经系统的进化起源。 | 海绵中的细胞多样性及其在动物细胞类型和神经系统进化中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 一个海绵样本 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
OCT4-mediated inflammation induces cell reprogramming at the origin of cardiac valve development and calcification
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf7910
PMID:34739324
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研究论文 | 研究揭示了OCT4通过NFκB介导的炎症反应在心脏瓣膜发育和钙化中的作用 | 首次发现OCT4在成年瓣膜细胞中的表达导致钙化,并揭示了NFκB-和OCT4介导的炎症途径在瓣膜钙化中的新机制 | NA | 探讨细胞可塑性在心脏瓣膜发育和疾病中的作用 | 小鼠和人类的心脏瓣膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和人类的心脏瓣膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Fibromine is a multi-omics database and mining tool for target discovery in pulmonary fibrosis
2021-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01069-w
PMID:34741074
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研究论文 | 本文介绍了Fibromine数据库及其挖掘工具,用于肺纤维化中的靶点发现 | Fibromine是一个集成数据库和探索环境,包含重新分析和手动整理的转录组和蛋白质组肺纤维化数据集,提供动态数据探索和实时集成功能 | NA | 旨在通过比较分析和挖掘公开的肺纤维化相关数据集,验证和创建新的研究假设 | 肺纤维化的治疗靶点 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涵盖广泛的实验设计和患者及动物模型 | NA | NA | NA | NA |