单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 241 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Discriminative feature of cells characterizes cell populations of interest by a small subset of genes
2021-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009579
PMID:34797848
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研究论文 | 本文提出了一种新的细胞识别特征（DFC）方法，用于通过一小部分基因来表征感兴趣的细胞群体 | DFC方法通过使用带有自适应LASSO惩罚的逻辑回归进行二元分类和变量选择，能够优先考虑具有非独立表达的基因对，并有效捕捉细胞类型特异性标记 | DFC方法主要针对单细胞分析中的大样本量问题，可能不适用于所有类型的细胞分类任务 | 提出一种新的细胞识别方法，以替代传统的基于差异表达基因（DEG）的分析方法 | 研究对象为细胞群体及其特异性标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 文中未明确提及具体样本数量 |
| 102 | 2024-08-08 |
Müller glial responses compensate for degenerating photoreceptors in retinitis pigmentosa
2021-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00693-w
PMID:34799683
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，探讨了视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠中各主要视网膜细胞类型的细胞反应 | 发现Müller胶质细胞/星形胶质细胞簇中与视网膜维持相关的基因表达显著增加，表明Müller胶质细胞通过调整其转录组来支持视网膜细胞，这可能成为保护视网膜免于退化的潜在治疗靶点 | NA | 研究视网膜色素变性中视网膜细胞对视网膜细胞异常的反应 | 视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠 |
| 103 | 2024-08-08 |
Landscape of Hopx expression in cells of the immune system
2021-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2021.e08311
PMID:34805566
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研究论文 | 本文报道了在稳态条件下，多种免疫细胞中Hopx表达的综合模式 | 首次全面描述了Hopx在特定免疫细胞亚群中的组成性表达 | Hopx在常规树突状细胞和嗜酸性粒细胞中的表达未被研究 | 阐明Hopx在免疫细胞中的表达模式及其在多种免疫条件下的潜在作用 | CD4和CD8 T细胞、B细胞、自然杀伤细胞、NKT细胞和髓系细胞中的Hopx表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术分析 | NA | RNA | 多种类型的免疫细胞 |
| 104 | 2024-08-08 |
Desmosterol suppresses macrophage inflammasome activation and protects against vascular inflammation and atherosclerosis
2021-11-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2107682118
PMID:34782454
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研究论文 | 本文研究了胆固醇生物合成中间产物脱氢表雄酮在巨噬细胞中的作用，及其对血管炎症和动脉粥样硬化的保护作用 | 首次揭示了脱氢表雄酮在动脉粥样硬化病变中作为整合胆固醇稳态和免疫反应的关键分子，通过调节巨噬细胞功能来抑制炎症 | NA | 探讨脱氢表雄酮在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 巨噬细胞和动脉粥样硬化病变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 脂质组学和转录组学分析 | NA | 细胞 | 从动脉粥样硬化斑块中分离的CD45CD11b细胞 |
| 105 | 2024-08-08 |
Characterization of normal and cancer stem-like cell populations in murine lingual epithelial organoids using single-cell RNA sequencing
2021-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01783-5
PMID:34785704
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠舌上皮类器官中正常和癌症干细胞样细胞群体的特征 | 揭示了舌癌中具有干细胞特性的异质细胞群体与正常干细胞群体的不同特征，为开发新型分子靶向治疗提供了依据 | NA | 开发基于特定基因表达谱的舌癌分子靶向治疗 | 小鼠舌上皮类器官中的正常和癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 舌癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq highlights a specific carcinoembryonic cluster in ovarian cancer
2021-11-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04358-4
PMID:34775482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织的异质性，并识别关键的细胞簇和标记物，构建预测模型评估卵巢癌的预后 | 发现了与胚胎相似的卵巢癌恶性上皮细胞簇PEG10 EME，该细胞簇与不良生存率相关，并可能通过NOTCH通路影响癌症干细胞的自我更新和顺铂耐药性 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌的异质性，寻找有效的预后标志物和治疗策略 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类算法 | 基因表达数据 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织样本 |
| 107 | 2024-08-08 |
Immune cell and TCR/BCR repertoire profiling in systemic lupus erythematosus patients by single-cell sequencing
2021-11-12, Aging
DOI:10.18632/aging.203695
PMID:34772824
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研究论文 | 本研究利用单细胞5' RNA测序和单细胞T细胞受体(TCR)/B细胞受体(BCR)测序技术，分析了系统性红斑狼疮(SLE)患者及其对照组的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 首次详细描述了SLE患者中免疫细胞的转录组和TCR/BCR免疫谱系特征 | 样本量较小，仅包括十名SLE患者及其对照组 | 探索SLE患者中免疫细胞及其TCR/BCR谱系的表达和分布，以更好地理解这一致命的自身免疫疾病 | 系统性红斑狼疮患者的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞5' RNA测序，单细胞TCR/BCR测序 | NA | RNA序列数据 | 10名SLE患者及其对照组 |
| 108 | 2024-08-08 |
Ionizing irradiation-induced Fgr in senescent cells mediates fibrosis
2021-Nov-12, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00741-4
PMID:34772919
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研究论文 | 研究了辐射诱导的细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及其机制 | 首次揭示了辐射诱导的衰老细胞中Fgr激酶的上调在放射性肺纤维化中的作用 | 仅在体外和小鼠模型中进行了实验，需要进一步的人体研究验证 | 探讨细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及机制 | 辐射诱导的衰老tdTOMp16阳性间充质干细胞 | NA | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNAseq) | NA | RNA | 小鼠肺部样本 |
| 109 | 2024-08-08 |
Deciphering intratumoral heterogeneity using integrated clonal tracking and single-cell transcriptome analyses
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26771-1
PMID:34764253
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研究论文 | 本文介绍了一种综合实验系统，通过整合单细胞转录组分析和基于DNA条形码的克隆追踪，研究肿瘤内异质性与癌细胞生长、转移和治疗反应的关系。 | 本文创新性地将单细胞转录组分析与DNA条形码克隆追踪相结合，以揭示肿瘤内异质性的分子和细胞基础。 | NA | 研究肿瘤内异质性与疾病进展和治疗抵抗的分子和细胞基础。 | 白血病细胞的基因表达与化疗反应的关系，以及特定基因表达细胞驱动的白血病扩展。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠模型 |
| 110 | 2024-08-08 |
Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with single-cell RNA sequencing
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26770-2
PMID:34764257
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了25名肺腺癌患者的268,471个细胞，揭示了肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性及其转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肺腺癌从癌前病变到侵袭性癌的细胞异质性和分子事件 | NA | 揭示肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性和转录特征 | 肺腺癌患者的细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 268,471个细胞，来自25名患者 |
| 111 | 2024-08-08 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-Nov-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.10.023
PMID:34767776
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
IRF3 Knockout Results in Partial or Complete Rejection of Murine Mesothelioma
2021-Nov-07, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10215196
PMID:34768716
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研究论文 | 研究IRF3敲除对小鼠间皮瘤的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次探讨IRF3在间皮瘤中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | NA | 探索IRF3敲除对小鼠间皮瘤的治疗潜力及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 | NA | 间皮瘤 | 流式细胞术，scRNA-Seq | NA | mRNA表达数据 | 多种小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 |
| 113 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity and Functional Diversity of Lymphatic Endothelial Cells
2021-Nov-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111976
PMID:34769408
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示淋巴内皮细胞异质性和功能多样性方面的最新发现 | 结合单细胞RNA测序数据与成像和深入的功能实验，推进对健康和疾病中淋巴内皮细胞的了解 | 对慢性炎症疾病中淋巴内皮细胞异质性和功能多样性的知识有限 | 总结单细胞RNA测序在淋巴血管生物学领域的新发现，并探讨淋巴内皮细胞作为慢性炎症疾病新治疗靶点的可能性 | 淋巴内皮细胞的异质性、功能多样性及其与其他细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of Human Small Antral Follicles
2021-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111955
PMID:34769386
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征 | 首次描述了小腔卵泡中卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征，并探讨了不同信号通路在卵母细胞和颗粒细胞间的双向配体-受体相互作用 | NA | 揭示小腔卵泡的多样性，并填补人类卵泡发育和卵子发生分子景观图谱的空白 | 人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（SmartSeq2） | NA | 转录组数据 | 多个个体的小腔卵泡 |
| 115 | 2024-08-08 |
Activated but impaired IFN-γ production of mucosal-associated invariant T cells in patients with hepatocellular carcinoma
2021-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003685
PMID:34789552
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在肝细胞癌（HCC）患者中的功能和特征 | 首次详细描述了HCC患者中窦内MAIT细胞的功能和表型特征 | 研究仅限于外周血和肝脏样本，未涉及其他组织或器官 | 研究HCC患者中MAIT细胞的功能和表型变化 | HCC患者的外周血和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | HCC患者和健康对照者的外周血和肝脏样本 |
| 116 | 2024-08-08 |
Identification of astroglia-like cardiac nexus glia that are critical regulators of cardiac development and function
2021-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001444
PMID:34793438
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research paper | 本文通过荧光时间流逝成像、命运图谱和突变生成在斑马鱼模型中，鉴定了一种神经嵴来源的胶质细胞，称为nexus胶质细胞，该细胞利用Meteorin信号通过Jak/Stat3途径驱动分化并调节心率和节律。 | 首次在斑马鱼模型中鉴定出一种神经嵴来源的nexus胶质细胞，并揭示其在心脏发育和功能中的关键作用。 | NA | 研究nexus胶质细胞在心脏发育和功能中的作用及其分子机制。 | nexus胶质细胞及其在心脏中的功能。 | NA | NA | confocal time-lapse imaging, fate mapping, single-cell sequencing | NA | image, sequencing data | 涉及人类和鼠类心脏的单细胞测序数据 |
| 117 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome landscape of hepatocytes and non-parenchymal cells in healthy and NAFLD mouse liver
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103233
PMID:34755088
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和非酒精性脂肪肝（NAFLD）小鼠肝脏中肝细胞和非实质细胞的转录组图谱 | 发现了肝星状细胞在基因表达调控和向肌成纤维细胞转化中的双重作用，以及库普弗细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在NAFLD进展中的不同表达谱 | NA | 旨在获得NAFLD发病机制的细胞水平解析 | 健康和NAFLD小鼠肝脏中的肝细胞和非实质细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 82,168个单细胞 |
| 118 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA-seq reveals transcriptomic heterogeneity mediated by host-pathogen dynamics in lymphoblastoid cell lines
2021-Nov-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75422
PMID:34762045
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Modeling the ACVR1R206H mutation in human skeletal muscle stem cells
2021-11-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66107
PMID:34755602
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研究论文 | 本研究通过分析ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的影响，探讨了ACVR1在骨骼肌修复中的作用 | 首次使用来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞（Hu-MuSCs）和诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的肌肉干细胞/祖细胞（iMPCs）进行单细胞转录组分析，揭示了ACVR1突变对骨骼肌修复的影响 | NA | 阐明ACVR1突变如何影响骨骼肌修复 | ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的作用 | NA | 异位骨化 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞和诱导多能干细胞衍生的肌肉干细胞/祖细胞 |
| 120 | 2024-08-08 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
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研究论文 | 研究探讨了细胞因子oncostatin M（OSM）在慢性瘙痒中的作用及其机制 | 首次揭示了OSM作为瘙痒神经调节剂的作用，并提出OSM信号转导作为抗瘙痒治疗的新靶点 | NA | 探究慢性瘙痒的分子成分和机制 | 慢性瘙痒及相关皮肤病 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | NA | 小鼠模型 |