单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 241 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Temporal single-cell transcriptomes of zebrafish spinal cord pMN progenitors reveal distinct neuronal and glial progenitor populations
2021-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.07.010
PMID:34303700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼脊髓pMN前体细胞，揭示了神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼脊髓pMN前体细胞中神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体，并鉴定了标记基因gsx2 | NA | 识别运动神经元和少突胶质前体细胞的发育起源和转录组特征 | 斑马鱼胚胎脊髓pMN细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Tissue factor expression, extracellular vesicles, and thrombosis after infection with the respiratory viruses influenza A virus and coronavirus
2021-11, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15509
PMID:34418279
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综述 | 本文综述了组织因子（TF）在流感A病毒（IAV）和冠状病毒感染后的表达、TF阳性外泌体（EVs）的释放、凝血激活及血栓形成的研究 | 强调了TF表达在IAV和致病性冠状病毒感染患者中与血栓形成的关系 | NA | 探讨病毒感染后组织因子表达与血栓形成的关系 | 流感A病毒和冠状病毒感染后的组织因子表达及血栓形成 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和COVID-19患者的样本 |
| 63 | 2024-08-07 |
Molecular and Cellular Dynamics of Aortic Aneurysms Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315852
PMID:34615376
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review | 本文综述了单细胞转录组测序在揭示主动脉瘤的分子和细胞动态方面的最新发现 | 单细胞RNA测序提供了血管细胞类型异质性、每个细胞类型的全面分子特征以及这些细胞群体之间表型相互关系的新见解 | 讨论了单细胞RNA测序在研究主动脉生物学和疾病中的挑战和未来方向 | 总结单细胞RNA测序分析在细胞异质性、细胞转换、细胞群体间通信和血管壁关键转录因子方面的发现，并探讨其对血管疾病发病机制的理解 | 主动脉瘤的分子和细胞动态 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Deletion of Abi3 gene locus exacerbates neuropathological features of Alzheimer's disease in a mouse model of Aβ amyloidosis
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3954
PMID:34731000
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研究论文 | 本研究探讨了ABI3基因缺失对5XFAD小鼠模型中阿尔茨海默病病理特征的影响 | 首次提供了ABI3功能丧失可能通过影响Aβ积累和神经炎症增加阿尔茨海默病风险的体内功能证据 | NA | 探究ABI3基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 5XFAD小鼠模型中的ABI3基因缺失对阿尔茨海默病病理特征的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Genetic ancestry effects on the response to viral infection are pervasive but cell type specific
2021-Nov-26, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abg0928
PMID:34822289
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了欧洲和非洲血统男性在流感感染后外周血单核细胞的反应差异 | 发现遗传血统对病毒感染反应的影响普遍存在但具有细胞类型特异性，且与COVID-19疾病严重性相关的基因富集 | NA | 探究遗传血统对病毒感染免疫反应的影响 | 欧洲和非洲血统男性的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 欧洲和非洲血统男性 |
| 66 | 2024-08-08 |
SCAN-IT: Domain segmentation of spatial transcriptomics images by graph neural network
2021-Nov, BMVC : proceedings of the British Machine Vision Conference. British Machine Vision Conference
PMID:36227018
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的方法SCAN-IT，通过将空间域识别问题转化为图像分割问题，利用图神经网络对空间转录组图像进行域分割 | SCAN-IT方法结合了几何建模、图神经网络和DeepGraphInfomax信息学方法，能够处理来自不同空间转录组技术的数据，包括高空间分辨率低基因覆盖率和低空间分辨率高基因覆盖率的数据 | NA | 开发一种新的方法用于空间转录组图像的域分割，以更好地理解和控制生物功能 | 复杂生物组织的空间和功能域分割 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络 | 图像 | NA |
| 67 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatial heterogeneity and immune evasion of circulating tumor cells
2021-11-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-08 |
Mitochondrial inhibitors circumvent adaptive resistance to venetoclax and cytarabine combination therapy in acute myeloid leukemia
2021-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00264-y
PMID:35122057
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研究论文 | 本文定义了一个'MitoScore'特征，识别AML患者体内高线粒体氧化磷酸化，并研究了线粒体抑制剂如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 发现了AML细胞对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性与线粒体氧化磷酸化、电子传递链复合体及TP53通路的变化有关，并提出了使用线粒体抑制剂来延迟复发的新策略 | NA | 研究如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 急性髓系白血病（AML）细胞及其对特定治疗的抗药性 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 69 | 2024-08-08 |
CrossTalkeR: analysis and visualization of ligand-receptorne tworks
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab370
PMID:35032393
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研究论文 | CrossTalkeR框架用于分析和可视化配体-受体网络交互，特别关注于对比两种生物表型（如疾病与稳态）时细胞间通讯的变化 | CrossTalkeR能够识别导致细胞通讯变化的相关配体、受体和细胞类型，并提供特定细胞类型、配体或受体的聚焦分析 | 当前方法通常只提供推断的配体-受体交互列表，且多数方法无法量化两种生物表型间细胞间通讯的变化 | 开发一种新的框架来分析和可视化配体-受体网络交互，以更好地理解细胞间通讯在不同生物表型中的变化 | 配体、受体和细胞类型在两种生物表型（如疾病与稳态）中细胞通讯的变化 | 生物信息学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 涉及人类骨髓增殖性肿瘤的单细胞RNA-seq数据 |
| 70 | 2024-08-08 |
Single-cell reconstruction with spatial context of migrating neural crest cells and their microenvironments during vertebrate head and neck formation
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199468
PMID:35020873
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研究论文 | 本文通过无标记、未分类的单细胞RNA测序技术，保留空间信息，研究了迁移中的神经嵴细胞及其微环境的转录状态，以及前四个鸡头至心脏的鳃弓（BA1-4）的细胞景观。 | 本文首次识别了迁移神经嵴细胞的新标记物和266个普遍存在于BA1-4流的入侵基因，并通过扰动分析和时间流逝成像揭示了这些基因的功能角色。 | NA | 阐明多能神经嵴细胞在脊椎动物胚胎中的分化和入侵动态。 | 迁移中的神经嵴细胞及其微环境，以及前四个鸡头至心脏的鳃弓（BA1-4）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及前四个鸡头至心脏的鳃弓（BA1-4）的细胞。 |
| 71 | 2024-08-08 |
COVID-19 Specific Immune Markers Revealed by Single Cell Phenotypic Profiling
2021-Nov-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9121794
PMID:34944610
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者外周血单核细胞中的免疫细胞功能相关表面标记物，揭示了COVID-19特异性免疫标记物的变化 | 发现了COVID-19患者中特异性表达的新型免疫受体，这些受体影响免疫功能并与临床结果相关 | NA | 揭示COVID-19特异性免疫标记物及其对疾病进展的影响 | COVID-19患者的外周血单核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 50名COVID-19患者和27名健康供体 |
| 72 | 2024-08-08 |
Preparation and Transfection of Populus tomentosa Mesophyll Protoplasts
2021-Nov-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4220
PMID:34909441
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研究论文 | 本文详细介绍了一种简单且高效的方法来制备和转染毛白杨叶肉原生质体 | 提出了一种新的方法来克服木本植物中由于细胞壁富含果胶而难以分离叶肉原生质体的难题 | NA | 开发一种适用于木本植物的叶肉原生质体制备和转染技术 | 毛白杨叶肉原生质体 | NA | NA | 转染技术 | NA | 原生质体 | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
Loss of PRC2 subunits primes lineage choice during exit of pluripotency
2021-11-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27314-4
PMID:34848733
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研究论文 | 本研究探讨了Polycomb抑制复合物2（PRC2）在胚胎干细胞（ESCs）中的两种不同形式PRC2.1和PRC2.2在谱系特化和承诺中的作用 | 揭示了MTF2和JARID2在PRC2复合物中的不同作用，以及它们在平衡谱系特异性基因激活中的重要性 | NA | 研究PRC2在胚胎干细胞谱系选择和承诺中的作用 | MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞及其衍生的胚胎体 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞的胚胎体 |
| 74 | 2024-08-08 |
ScLRTC: imputation for single-cell RNA-seq data via low-rank tensor completion
2021-Nov-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08101-3
PMID:34844559
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研究论文 | 本文提出了一种基于低秩张量补全的方法scLRTC，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | scLRTC方法利用单细胞间的相似性构建三阶低秩张量，并通过张量分解去噪，采用低秩张量补全算法重建细胞表达，恢复基因间和细胞间的相关性 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的缺失数据和噪声问题，以提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩张量补全 | 基因-细胞表达矩阵 | 不同数据规模的模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 75 | 2024-08-08 |
Subclone-specific microenvironmental impact and drug response in refractory multiple myeloma revealed by single-cell transcriptomics
2021-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26951-z
PMID:34845188
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了20名复发/难治性多发性骨髓瘤（RRMM）患者治疗前后肿瘤细胞及其与骨髓微环境（BME）的复杂相互作用网络 | 揭示了具有1q染色体增益的亚克隆在治疗期间频繁扩增，并通过上调炎症细胞因子和与骨髓细胞紧密相互作用，塑造了一个免疫抑制的BME | NA | 解析RRMM中亚克隆的转录特征和微环境重编程机制，为临床决策提供依据 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20名复发/难治性多发性骨髓瘤患者 |
| 76 | 2024-08-08 |
Germline biallelic mutation affecting the transcription factor Helios causes pleiotropic defects of immunity
2021-Nov-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe3981
PMID:34826259
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研究论文 | 本文研究了一个患有反复呼吸道感染和低丙种球蛋白血症的患者，发现其存在编码转录因子Helios的种系同合子错义突变，并探讨了Helios在人类免疫稳态中的作用及其调控机制 | 首次发现Helios的种系突变导致免疫缺陷，揭示了Helios在人类免疫稳态中的细胞特异性表观遗传调控作用 | NA | 探究Helios在人类免疫稳态中的作用及其调控机制 | 患有反复呼吸道感染和低丙种球蛋白血症的患者 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个患者的外周血单个核细胞 |
| 77 | 2024-08-08 |
Stroke subtype-dependent synapse elimination by reactive gliosis in mice
2021-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27248-x
PMID:34836962
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研究论文 | 本研究利用小鼠缺血性和出血性中风模型，探讨了反应性神经胶质增生区域中微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在吞噬突触中的不同作用 | 通过特异性删除MEGF10和MERTK吞噬受体，发现抑制微胶质细胞/巨噬细胞或星形胶质细胞的吞噬作用可以改善神经行为结果并减轻脑损伤 | NA | 探讨反应性神经胶质增生在中枢神经系统修复中的病理作用 | 微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在反应性神经胶质增生区域中吞噬突触的作用 | NA | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠缺血性和出血性中风模型 |
| 78 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies dynamic gene expression networks that govern B cell development and transformation
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27232-5
PMID:34824268
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学/蛋白质组学技术，分析了B细胞发育过程中的动态基因表达网络，并将其与B细胞白血病的亚型相关联 | 本文发现了独特的转录特征，将前B细胞扩张阶段细分为前BCR依赖和前BCR独立增殖阶段，并揭示了转录因子EBF1和RNA结合蛋白YBX3的表达变化与这些阶段的相关性 | NA | 研究B细胞发育和转化过程中的基因表达网络 | B细胞发育过程中的基因表达网络及其与B细胞白血病的关系 | 数字病理学 | B细胞白血病 | 单细胞转录组学/蛋白质组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Effects of poor sleep on the immune cell landscape as assessed by single-cell analysis
2021-11-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02859-8
PMID:34824394
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了睡眠不足对人类免疫细胞景观的影响 | 首次综合分析了睡眠不足对免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路、转录调控网络和细胞间相互作用的影响 | NA | 探讨睡眠不足对免疫细胞景观的细胞和分子机制 | 人类免疫细胞在睡眠不足条件下的变化 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未提及 |
| 80 | 2024-08-08 |
[Advances and applications of organoids: a review]
2021-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.200764
PMID:34841798
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综述 | 本文综述了类器官的分类、特性、当前应用、与其他技术的结合使用及未来展望 | 类器官作为一种新型模型系统，能够更精确地模拟人体生理现象，并可与基因编辑、芯片器官和单细胞RNA测序等技术结合，突破传统模型的局限 | NA | 探讨类器官在疾病建模、药物研究、精准医学和再生医学中的应用 | 类器官及其与其他技术的结合应用 | NA | NA | 基因编辑、器官芯片、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |