单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 240 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
A survey of the mouse hindbrain in the fed and fasted states using single-nucleus RNA sequencing
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101240
PMID:33962048
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术对小鼠后脑在进食和禁食状态下的细胞组成和基因表达进行详细调查 | 首次在后脑区域进行单细胞水平的转录组学研究，揭示了禁食对少突胶质细胞转录组的特异性影响 | 仅研究了小鼠模型，未涉及其他物种；研究局限于后脑特定区域 | 研究后脑区域在营养信号感知和摄食行为调控中的细胞分子机制 | 小鼠后脑的极后区(AP)和孤束核(NTS)细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16,034个细胞（8,910个神经元和7,124个非神经元细胞） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
LGR6 marks nephron progenitor cells
2021-11, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.346
PMID:33848015
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研究论文 | 本研究鉴定LGR6作为肾脏祖细胞的标志物，并揭示其在肾脏发育过程中的分化轨迹 | 首次发现LGR6可作为肾脏祖细胞的标志物，填补了该领域缺乏MET过程中NPC标志物的空白 | 研究主要基于胚胎外植体和动物模型，人类肾脏发育中的验证仍需进一步研究 | 探索肾脏祖细胞的标志物及其在肾脏发育过程中的分化机制 | 肾脏祖细胞和肾脏发育过程 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 谱系追踪、共聚焦成像、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | 胚胎外植体和体内模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-07 |
Deep learning and alignment of spatially resolved single-cell transcriptomes with Tangram
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01264-7
PMID:34711971
|
研究论文 | 提出Tangram方法，将单细胞转录组数据与空间数据对齐，构建全基因组单细胞分辨率空间图谱 | 开发了能够将多种单细胞RNA测序数据与不同形式空间数据（包括MERFISH、STARmap、smFISH、空间转录组学和组织学图像）对齐的首个通用方法 | NA | 解决单细胞测序技术丢失空间信息与空间转录组技术分辨率有限的问题 | 健康小鼠脑组织视觉和体感运动区域 | 空间转录组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, MERFISH, STARmap, smFISH, SHARE-seq | 深度学习 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，多模态数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium | 空间转录组学技术 |
| 24 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome landscape of hepatocytes and non-parenchymal cells in healthy and NAFLD mouse liver
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103233
PMID:34755088
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中肝细胞及非实质细胞的转录组景观 | 发现了肝星状细胞在基因表达调控和向肌成纤维细胞转分化中的双重作用，识别了三种嵌合型非实质细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究非酒精性脂肪肝发病机制的细胞分子基础 | 健康和非酒精性脂肪肝小鼠肝脏中的肝细胞及非实质细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 82,168个单细胞转录组，涵盖不同NAFLD阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2024-08-09 |
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256
PMID:34001518
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209
PMID:34031030
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定系统性硬化症皮肤特异性T细胞反应 | 首次在系统性硬化症患者皮肤中鉴定出表达CXCL13的再循环T细胞亚群，该细胞群具有滤泡辅助T细胞样基因表达特征 | 样本量相对有限，仅包含27名患者和10名健康供体 | 解析系统性硬化症皮肤中T细胞介导的免疫反应机制 | 系统性硬化症患者和健康供体的皮肤活检样本 | 单细胞转录组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序，共聚焦免疫荧光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 3729个CD3+淋巴细胞（867个来自正常皮肤，2862个来自SSc皮肤），来自27名活动性SSc患者和10名健康供体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞测序技术 |
| 27 | 2025-10-07 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文探讨了PD-L1抑制性microRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及单细胞测序指导的生物相容性递送策略 | 首次系统综述了多种PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的作用，并提出了单细胞测序指导的生物相容性递送新策略 | 仅纳入了2021年3月17日前的文献，未进行定量meta分析 | 评估PD-L1抑制性miRNAs在结直肠癌治疗中的潜力及递送策略 | 结直肠癌细胞及PD-L1抑制性microRNAs | 生物医学 | 结直肠癌 | 单细胞测序，文献系统检索 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 28 | 2024-10-14 |
Single cell functional genomics reveals plasticity of subcutaneous white adipose tissue (WAT) during early postnatal development
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101307
PMID:34298199
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠皮下白色脂肪组织（iWAT）在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 首次通过单细胞转录组学（scRNA-seq）和表观基因组学（snATAC-seq）技术，详细描述了小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞亚型及其动态变化 | NA | 研究小鼠皮下白色脂肪组织在出生后早期发育阶段的细胞复杂性和可塑性 | 小鼠皮下白色脂肪组织（iWAT）的脂肪基质细胞（ASC）和脂肪细胞核 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq）和表观基因组学（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 小鼠皮下白色脂肪组织在出生后第6天、第18天和第56天的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-09-30 |
Single-cell multi-omics sequencing: application trends, COVID-19, data analysis issues and prospects
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab229
PMID:34111889
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综述 | 本文综述了单细胞多组学测序技术的最新进展及其在理解复杂疾病（特别是COVID-19）中的应用，并总结了用于分析多层异质数据的相关机器学习和生物信息学技术 | 本文介绍了变分推断和基于图的学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用，并讨论了Seurat V3等常用工具在处理缺失变量和标签中的作用 | 本文主要讨论了数据一致性和多样性问题，以及数据对错误校正和数据插补方法的关注，但未深入探讨具体的解决方案 | 综述单细胞多组学测序技术的发展及其在复杂疾病研究中的应用，并探讨相关的数据分析问题和未来展望 | 单细胞多组学测序技术及其在COVID-19等复杂疾病中的应用 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞多组学测序 | NA | 多层异质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-09-16 |
Whole-animal multiplexed single-cell RNA-seq reveals transcriptional shifts across Clytia medusa cell types
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh1683
PMID:34826233
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研究论文 | 本文介绍了水螅水母的整个生物体的转录组细胞图谱，并描述了其组成细胞类型对扰动的响应 | 本文引入了高分辨率、全生物体、多重单细胞基因组学的工作流程，适用于其他传统或非传统模式生物 | NA | 研究水螅水母细胞类型对扰动的响应 | 水螅水母的细胞类型及其对扰动的响应 | 基因组学 | NA | 多重单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个水螅水母样本，包括对照和扰动条件 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-09-10 |
Early IFN-α signatures and persistent dysfunction are distinguishing features of NK cells in severe COVID-19
2021-11-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.09.002
PMID:34592166
|
研究论文 | 研究分析了205名COVID-19患者中自然杀伤细胞（NK细胞）的单细胞转录组和蛋白质组学特征，发现早期严重COVID-19中IFN-α水平升高与NK细胞功能障碍相关 | 首次详细描述了严重COVID-19中NK细胞的早期IFN-α信号特征及其与疾病结果的关联 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的COVID-19病例类型 | 探讨COVID-19中先天免疫系统的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的自然杀伤细胞（NK细胞） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 基因表达数据和蛋白质数据 | 205名患者，403个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-25 |
Myeloid Heterogeneity in Kidney Disease as Revealed through Single-Cell RNA Sequencing
2021-11-25, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0003682021
PMID:35372996
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示肾脏疾病中髓系细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术，能够以前所未有的分辨率和通量分析单个细胞的转录组，并生成细胞图谱 | NA | 探讨髓系细胞在肾脏健康和疾病中的作用，以及scRNA-seq技术在髓系细胞和肾脏研究中的应用 | 髓系细胞在肾脏疾病中的异质性 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-23 |
Joint Clustering of Single-Cell Sequencing and Fluorescence In Situ Hybridization Data for Reconstructing Clonal Heterogeneity in Cancers
2021-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0255
PMID:34612714
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研究论文 | 本文开发了一种联合聚类方法，结合单细胞测序和荧光原位杂交数据，以更好地解析肿瘤进化中的染色体倍性变化 | 提出了一种概率框架，通过马尔可夫链蒙特卡洛采样和线性回归优化，以最大化给定预聚类数据集的潜在变量的概率 | 现有的方法在通过倍性变化解析肿瘤进化方面能力有限 | 旨在通过结合单细胞测序和荧光原位杂交数据，更好地解析肿瘤进化中的染色体倍性变化 | 单细胞测序和荧光原位杂交数据 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞DNA测序（scSeq）和多重间期荧光原位杂交（miFISH） | 马尔可夫链蒙特卡洛采样和线性回归 | 单细胞测序和荧光原位杂交数据 | 使用模拟数据和一个胶质母细胞瘤（GBM）病例进行验证，并在两个GBM病例中应用该方法 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-19 |
A transposon expression burst accompanies the activation of Y-chromosome fertility genes during Drosophila spermatogenesis
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27136-4
PMID:34824217
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据，量化了果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达，并开发了一种方法来识别转座子和宿主基因表达模块 | 发现了在果蝇精子发生过程中，转座子表达爆发与Y染色体生育基因激活的关联，并揭示了特定细胞群中转座子表达的特异性 | NA | 研究果蝇睾丸中转座子活动和宿主沉默机制 | 果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 公开数据集中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-19 |
Cell type identification from single-cell transcriptomes in melanoma
2021-11-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01118-3
PMID:34784909
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞基因和长非编码RNA表达水平的计算框架，用于从单细胞转录组中识别黑色素瘤中的细胞类型 | 该方法充分考虑了细胞脱落特性，通过定义细胞的脱落特征和脱落簇，构建差异共表达网络并识别差异模块，最终基于这些差异模块识别细胞类型 | NA | 探索黑色素瘤相关的关键细胞类型的分子机制，为黑色素瘤研究提供见解 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 应用该方法于单细胞黑色素瘤数据，识别出八种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential cell cycle activity in key cell populations during nephrogenesis
2021-11-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01790-6
PMID:34789782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胚胎期14.5天小鼠肾脏发育过程中的基因表达，揭示了关键细胞群体中细胞周期活动的差异 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了肾脏发育过程中“准备”和“自我更新”的肾单位前体细胞亚群之间的细胞周期活动差异，并发现了不成熟远端小管中细胞周期相关基因的增强表达 | NA | 深入理解驱动肾脏发育的分子机制，为设计增强肾脏修复和再生的策略提供依据 | 小鼠胚胎期14.5天的肾脏发育过程 | 数字病理学 | 儿童慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期14.5天的小鼠肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-19 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 本研究利用已知的肠道病毒（轮状病毒），该病毒损害绒毛顶端的上皮细胞但不直接损害肠道干细胞，探索了肠道上皮在单细胞水平上的再生转录反应 | 发现特定的细胞亚群表现出增加的细胞周期频率，与上皮隐窝的显著扩张相关，并伴随着未成熟肠细胞数量的增加。意外地发现轮状病毒感染了簇状细胞，并通过干扰素相关途径响应病毒感染 | NA | 理解上皮修复和再生在损伤后的机制，以开发促进快速愈合和恢复正常肠道功能的疗法 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 消化疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-18 |
Six Shades of Vascular Smooth Muscle Cells Illuminated by KLF4 (Krüppel-Like Factor 4)
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316600
PMID:34470477
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review | 本文综述了血管平滑肌细胞（vSMCs）的六种表型及其在血管疾病中的作用 | 通过单细胞RNA测序研究，本文首次分类了六种vSMC表型，并探讨了表型转换对血管病理的影响 | 目前关于vSMC表型的共识尚未形成，研究结果可能受限于当前数据和分类方法 | 旨在详细描述vSMC的表型并识别表型转换的触发因素，以揭示不同表型在血管疾病中的相关性 | 血管平滑肌细胞（vSMCs）及其在血管疾病中的表型转换 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
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研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 | NA | NA | NA | NA |