单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 240 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Deletion of pancreas-specific miR-216a reduces beta-cell mass and inhibits pancreatic cancer progression in mice
2021-11-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100434
PMID:34841287
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研究论文 | 该研究揭示了胰腺特异性miR-216a在调节β细胞质量和胰腺癌进展中的关键作用 | 首次发现miR-216a作为胰腺特异性miRNA，同时调控胰岛和腺泡细胞功能，并揭示其在胰腺癌诊断中的潜在生物标志物价值 | 未说明 | 探究胰腺特异性miR-216a在β细胞质量和胰腺癌进展中的功能 | 胰腺miR-216a基因敲除小鼠和胰腺癌易感小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠和胰腺癌模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2026-07-10 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq揭示成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性，并发现Smad4调控成年星形胶质细胞生成 | 首次在单细胞水平揭示间脑星形胶质细胞的分子异质性，并发现成年间脑存在低水平星形胶质细胞生成，且由Smad4调控 | 未提及 | 探索星形胶质细胞在单细胞水平上的一般功能与区域特异性功能的协调机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq，ACSA-2介导的磁性活化细胞分选（MACS） | NA | 单细胞基因表达数据 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 3 | 2026-07-10 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析小鼠子宫接受性胚胎植入的细胞和分子机制 | 首次以单细胞分辨率揭示小鼠子宫接受期与非接受期的细胞类型多样性及基因表达变化，并预测细胞间信号互作 | 未提供具体局限性信息，可能包括单细胞数据验证范围有限、未涉及人类子宫直接比较等 | 在单细胞水平阐明小鼠子宫接受胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫（接受期和非接受期） | 机器学习 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠子宫样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 4 | 2026-07-10 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示蜕膜基质微环境缺陷导致复发性流产 | 首次在单细胞水平揭示蜕膜基质细胞的异质性及其在复发性流产中的关键作用，发现TWEAK和FASLG信号通路过度激活与基质细胞死亡及妊娠失败密切相关 | 未明确说明研究限制 | 探究母体蜕膜细胞异质性在复发性流产中的作用机制 | 复发性流产患者和健康对照的蜕膜组织 | 计算机视觉 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 66,078个单细胞，来自复发性流产患者和健康对照的蜕膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 5 | 2026-05-04 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 利用单细胞测序技术探究轮状病毒感染后肠道上皮的细胞特异性修复机制及簇细胞的感染情况 | 首次发现轮状病毒感染可感染簇细胞，并揭示簇细胞通过干扰素相关通路应对病毒感染；同时发现特定细胞亚群增殖频率增加并伴随隐窝扩张和不成熟肠细胞增多 | 未阐明簇细胞感染在肠道修复中的具体功能角色，且仅基于轮状病毒模型，其他病原体相关修复机制需进一步验证 | 在单细胞水平上探索轮状病毒引起的肠道上皮损伤后再生修复的转录反应 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞（包括簇细胞、肠干细胞、不成熟肠细胞等特定亚群） | 数字病理学 | 轮状病毒感染相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 轮状病毒感染小鼠的肠道上皮细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 6 | 2026-04-24 |
Autoreactive T cell receptors with shared germline-like α chains in type 1 diabetes
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151349
PMID:34806648
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序鉴定1型糖尿病患者中共享种系样α链的自身反应性T细胞受体 | 首次发现1型糖尿病中一类共享TCRα链的“公共”T细胞受体，这些受体具有种系约束性抗原识别特性，并且部分展现出对不同胰岛抗原肽的交叉反应性 | 未明确说明局限性 | 研究1型糖尿病中自身反应性T细胞的T细胞受体特征及其在发病机制中的作用 | 健康供体、新发T1D供体和已确诊T1D供体的外周血CD4+记忆T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从多个供体中分离的2767个单个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用多重CD154富集法分离IAR T细胞后进行scRNA-Seq |
| 7 | 2026-04-16 |
Spatial transcriptomics analysis of uterine gene expression in enhancer of zeste homolog 2 conditional knockout mice†
2021-11-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab147
PMID:34344022
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫基因表达变化 | 首次应用空间转录组学方法探究Ezh2在子宫上皮和间质细胞中的特异性基因调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类子宫内膜疾病中直接验证 | 阐明EZH2在子宫组织中对基因表达的空间特异性调控机制 | 子宫特异性Ezh2条件性敲除小鼠的子宫组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年去势野生型和Ezh2cKO小鼠子宫组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牛尾椎间盘细胞图谱，发现具有不同稳态功能的异质性细胞群体 | 首次创建牛尾椎间盘单细胞转录组图谱，识别出15个独特细胞簇并发现新型细胞标记物 | 研究仅基于牛模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 解析椎间盘的细胞异质性以促进再生治疗发展 | 牛尾椎间盘组织 | 单细胞生物学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
NK and CD8+ T cell phenotypes predict onset and control of CMV viremia after kidney transplant
2021-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153175
PMID:34609965
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研究论文 | 本研究通过分析肾移植受者中NK细胞和CD8+ T细胞的表型特征，预测巨细胞病毒病毒血症的发生和控制 | 首次在肾移植受者中纵向表征CMV特异性免疫反应，发现未成熟CD56bright NK细胞与病毒血症发生相关，而记忆NK细胞和NK样CD28-CD8+ T细胞与病毒控制相关 | 样本量较小（31例患者），仅针对肾移植受者，结果可能不适用于其他器官移植类型 | 研究肾移植后CMV病毒血症的免疫预测因子和控制机制 | 31例肾移植受者（包括CMV病毒血症患者和匹配的非病毒血症患者） | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, Luminex多重蛋白检测, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 细胞表型数据 | 31例肾移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多重蛋白检测 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Adenine base editing reduces misfolded protein accumulation and toxicity in alpha-1 antitrypsin deficient patient iPSC-hepatocytes
2021-11-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2021.06.021
PMID:34217893
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研究论文 | 本研究应用腺嘌呤碱基编辑器纠正AATD患者iPSC和肝细胞中的Z突变，减少错误折叠蛋白积累 | 首次在AATD患者iPSC来源的肝细胞中应用腺嘌呤碱基编辑技术纠正致病突变 | 研究未通过全基因组测序发现脱靶突变，但可能存在其他未知限制 | 探索碱基编辑技术纠正α-1抗胰蛋白酶缺乏症致病突变的可行性 | AATD患者诱导多能干细胞及其分化的肝细胞 | 基因编辑 | α-1抗胰蛋白酶缺乏症 | 腺嘌呤碱基编辑,单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 患者来源的iPSC和分化肝细胞 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Germline biallelic mutation affecting the transcription factor Helios causes pleiotropic defects of immunity
2021-Nov-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe3981
PMID:34826259
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研究论文 | 本研究首次发现影响转录因子Helios的种系双等位基因突变会导致免疫多效性缺陷 | 首次鉴定出Helios种系纯合错义突变(p.Ile325Val)导致的人类先天免疫错误，并揭示其通过影响表观遗传调控导致T细胞稳态失衡的机制 | 研究仅基于单例患者，需要更大样本验证；Helios调控其他T细胞亚群的具体机制仍需进一步研究 | 探究Helios转录因子在人类免疫稳态中的作用机制 | 携带Helios突变的免疫缺陷患者及其免疫细胞 | 免疫学 | 先天免疫错误 | 单细胞RNA测序，表观遗传分析 | NA | 基因组数据，转录组数据，表观遗传数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
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研究论文 | 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病中通过选择性多聚腺苷酸化调控α1-抗胰蛋白酶表达的分子机制 | 首次发现SERPINA1基因3'UTR远端多聚腺苷酸化位点的使用增加导致mRNA翻译效率显著降低，并鉴定出QKI作为调控该过程的关键RNA结合蛋白 | 研究主要基于体外实验和测序数据分析，需要进一步在体功能验证 | 探究非A1AT缺乏个体中α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺疾病中的调控机制 | 人类原代肺组织、肝组织和各种免疫细胞类型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, eCLIP, 纳米荧光素酶报告实验, shRNA敲低, 核质分离, RNA结构探测 | NA | RNA测序数据, 蛋白质结合数据, 荧光素酶活性数据 | 82例COPD患者和64例对照（发现队列），376例COPD和267例对照（验证队列） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
KLF17 promotes human naïve pluripotency but is not required for its establishment
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199378
PMID:34661235
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研究论文 | 本研究探讨转录因子KLF17在人类初始多能性建立中的作用 | 首次揭示KLF17足以诱导但非必需于人类初始多能性的建立，发现其与其他KLF旁系同源物可能存在功能冗余 | 研究仅限于体外实验条件，未验证体内生理环境下的功能 | 解析KLF17在人类初始多能性转录调控中的具体功能 | 人类囊胚、初始态和始发态人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, CRISPR-Cas9基因敲除, 功能获得与缺失分析 | NA | 转录组数据 | 人类胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
CD4+ T cells contribute to neurodegeneration in Lewy body dementia
2021-Nov-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf7266
PMID:34648304
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研究论文 | 本研究揭示了CD4+ T细胞通过CXCR4-CXCL12信号通路参与路易体痴呆神经退行性病变的机制 | 首次发现CD4+ T细胞在路易体痴呆中通过CXCR4-CXCL12信号通路介导神经退行性病变，并证实磷酸化α-突触核蛋白表位可刺激CD4+ T细胞克隆扩增 | 研究基于死后脑组织样本，无法动态观察疾病进程；样本量未明确说明 | 探究T细胞在路易体痴呆神经退行性病变中的具体作用机制 | 路易体痴呆患者死后脑组织、脑脊液样本和CD4+ T细胞 | 神经免疫学 | 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
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研究论文 | 本研究揭示了细胞因子制瘤素M在炎症性瘙痒中对感觉神经元的敏化作用机制 | 首次发现制瘤素M不直接激活感觉神经元，而是通过增强神经元对瘙痒原的反应和神经元兴奋性来敏化瘙痒感觉 | 主要基于小鼠模型研究，人类临床验证仍需进一步研究 | 探索炎症性瘙痒的分子机制和潜在治疗靶点 | 感觉神经元、皮肤T细胞和单核细胞 | 神经科学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序、基因敲除、药理学拮抗 | NA | 基因表达数据、行为学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Non-parametric modelling of temporal and spatial counts data from RNA-seq experiments
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab486
PMID:34213536
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研究论文 | 开发了一个名为GPcounts的软件包，用于对RNA-seq实验中的时间和空间计数数据进行非参数建模 | 实现了基于负二项似然函数的高斯过程回归方法，通过变分贝叶斯推断提高计算效率，能够处理单细胞和空间转录组学产生的大规模数据集 | 论文未明确说明方法在处理超大规模数据集时的具体性能限制 | 开发能够有效建模RNA-seq计数数据中时间和空间变化的计算方法 | RNA-seq计数数据，包括单细胞RNA-seq数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 高斯过程回归，负二项分布模型，零膨胀负二项模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
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研究论文 | 本研究揭示了XIAP通过调节潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应来抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调的机制 | 首次阐明XIAP缺陷通过TLR5和TNFR1/2信号通路协同作用导致潘氏细胞功能障碍和树突状细胞丢失的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证有限 | 探究XIAP缺陷导致肠道炎症和菌群失调的分子机制 | XIAP缺陷小鼠、肠道潘氏细胞、树突状细胞、XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,肠道类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | XIAP缺陷小鼠模型和XLP2患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Macrophages orchestrate the expansion of a proangiogenic perivascular niche during cancer progression
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg9518
PMID:34730997
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤相关巨噬细胞中Lyve-1阳性亚群通过调控血管周围间充质细胞扩张促进肿瘤血管生成的作用机制 | 首次发现Lyve-1阳性TAMs亚群通过血小板衍生生长因子-CC依赖的方式调控血管周围间充质细胞增殖，形成促血管生成微环境 | 研究基于自发小鼠乳腺腺癌模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展过程中对血管生成微环境的调控作用 | 小鼠乳腺腺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和血管周围间充质细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，光标记技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 自发小鼠乳腺腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示非心肌细胞在斑马鱼心脏再生中的功能协调机制 | 首次构建了心脏再生过程中非心肌细胞的细胞状态图谱，开发了Topologizer算法映射功能状态间的拓扑关系，发现巨噬细胞在诱导成纤维细胞和内皮细胞亚群中的关键作用 | 研究局限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索非心肌细胞在心脏再生过程中的细胞多样性、分子特征和细胞间相互作用 | 成年斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞转录组数据 | 61,977个非心肌细胞单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
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研究论文 | 开发了一种可诱导细胞分裂计数器(iCOUNT)来追踪复杂组织中单个细胞的细胞分裂历史 | 首次开发了能够报告体内外细胞分裂事件的可诱导细胞分裂计数器，并应用于分析神经干/祖细胞的分裂历史 | NA | 研究单个干细胞的分裂潜力及其分子后果 | 人类和小鼠组织中的神经干/祖细胞(NSPCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发育中小鼠皮层和前脑区域化人类类器官的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |