单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
scLINE: A multi-network integration framework based on network embedding for representation of single-cell RNA-seq data
2021-10, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2021.103899
PMID:34481921
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLINE的新方法，用于学习单细胞RNA测序数据的低维表示，该方法基于网络嵌入模型，综合考虑多个基因-基因相互作用网络 | scLINE方法通过联合考虑多个基因-基因相互作用网络，有效地整合了先验生物学知识，提高了信号提取的准确性 | NA | 开发一种新的方法来处理和分析单细胞RNA测序数据中的高稀疏性和变异性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络嵌入模型 | 基因表达数据 | 八个单细胞数据集 |
| 162 | 2024-08-08 |
Prrx1b restricts fibrosis and promotes Nrg1-dependent cardiomyocyte proliferation during zebrafish heart regeneration
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.198937
PMID:34486669
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼心脏再生过程中Prrx1b转录因子的作用，发现Prrx1b限制纤维化并促进Nrg1依赖的心肌细胞增殖，从而实现无瘢痕再生。 | 首次揭示了Prrx1b在斑马鱼心脏无瘢痕再生中的关键作用，通过限制TGFβ配体表达和胶原蛋白产生，促进心肌细胞增殖。 | NA | 探究斑马鱼心脏再生过程中纤维化和无瘢痕再生的机制。 | 斑马鱼心脏再生过程中的Prrx1b转录因子及其对纤维化和心肌细胞增殖的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
Attenuated activation of pulmonary immune cells in mRNA-1273-vaccinated hamsters after SARS-CoV-2 infection
2021-10-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI148036
PMID:34449440
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研究论文 | 研究了mRNA-1273疫苗在感染SARS-CoV-2的仓鼠中的免疫反应和保护效果 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了mRNA-1273疫苗接种仓鼠肺组织中的免疫细胞反应 | 研究仅限于仓鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 评估mRNA-1273疫苗在仓鼠模型中的免疫反应和保护效果 | 仓鼠接种mRNA-1273疫苗后的免疫细胞和病毒复制情况 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 164 | 2024-08-08 |
An in vitro platform supports generation of human innate lymphoid cells from CD34+ hematopoietic progenitors that recapitulate ex vivo identity
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.019
PMID:34453879
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研究论文 | 本文开发了一种体外平台，能够从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞生成人类先天淋巴细胞（ILCs），并验证了其在体外生成的ILC亚型的身份。 | 本文首次系统性地探索了人类ILC的生成，并展示了通过特定细胞因子和Notch信号的组合可以生成不同的ILC亚型。 | NA | 开发一种可靠的体外平台，用于生成和研究人类先天淋巴细胞（ILCs）。 | 人类先天淋巴细胞（ILCs）及其亚型。 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达、功能性检测、全局和单细胞转录组分析 | 从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞 |
| 165 | 2024-08-08 |
Restoring mammary gland structures and functions with autogenous cell therapy
2021-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文通过化学诱导方法将山羊耳成纤维细胞转化为具有泌乳功能的化学诱导乳腺上皮细胞，并研究了其在裸鼠中再生正常乳腺结构的能力 | 首次通过化学诱导方法实现了成纤维细胞直接转化为具有泌乳功能的乳腺上皮细胞，绕过了多能状态 | NA | 探索通过自体细胞疗法恢复乳腺结构和功能的新策略 | 山羊耳成纤维细胞和化学诱导乳腺上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Cellular origins and lineage relationships of the intestinal epithelium
2021-10-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00188.2021
PMID:34431400
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研究论文 | 本文描述了肠道上皮细胞的分化和发展轨迹，重点介绍了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在理解肠道上皮细胞系谱关系中的应用。 | 本文采用了最新的单细胞RNA测序技术，以更精细的方式解析了肠道上皮细胞的发展和系谱关系。 | 文章指出单细胞RNA测序技术虽然提供了详细的细胞类型和系谱信息，但其应用仍受限于技术和数据的解释。 | 研究肠道上皮细胞的起源和系谱关系，以更好地理解其在损伤和疾病中的扰动及治疗潜力。 | 肠道上皮细胞及其在稳态和损伤诱导再生模型中的动态变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 167 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Endothelial Cell Transcriptome Heterogeneity Under Homeostatic Laminar Flow
2021-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316797
PMID:34433297
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和荧光显微镜分析了在稳态层流条件下人内皮细胞的RNA和蛋白质基因表达水平的异质性 | 首次揭示了稳态层流条件下内皮细胞RNA表达水平的整体异质性增加，而选定蛋白质的表达异质性并未紧密跟随RNA异质性的变化 | 研究仅分析了特定基因的RNA和蛋白质表达异质性，未涵盖所有内皮细胞基因 | 探讨内皮细胞在稳态层流条件下的转录组异质性及其对成熟血管功能的影响 | 人内皮细胞在稳态层流条件下的RNA和蛋白质基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
Suppressive Monocytes Impair MAIT Cells Response via IL-10 in Patients with Severe COVID-19
2021-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100228
PMID:34452933
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术全面分析了健康对照组和COVID-19患者的外周免疫细胞，发现重症COVID-19患者中HLA-DR单核细胞数量显著增加，而黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）数量大幅减少，且功能受损。 | 首次揭示了重症COVID-19患者中通过IFN/IL-10途径，抑制性HLA-DR单核细胞导致MAIT细胞功能障碍的免疫调节模式。 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果。 | 探讨重症COVID-19患者中免疫细胞反应的变化及其免疫调节机制。 | COVID-19患者（包括轻症、重症及无症状携带者）和健康对照组的外周免疫细胞。 | NA | COVID-19 | 质谱流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 免疫细胞 | 23名轻症COVID-19患者，22名重症COVID-19患者，6名无症状COVID-19携带者，44名健康对照者 |
| 169 | 2024-08-08 |
Construction of Synthetic Nanobody Library in Mammalian Cells by dsDNA-Based Strategies*
2021-10-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202100286
PMID:34411391
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研究论文 | 本文开发了两种新方法，通过基于dsDNA的策略在哺乳动物细胞中构建纳米抗体库 | 本文提出了两种新颖的方法（dsDNA-HR和体外连接法）来构建纳米抗体库，并通过高通量测序验证了其多样性 | NA | 开发在哺乳动物细胞中构建高多样性纳米抗体库的方法 | 纳米抗体库的构建及其在哺乳动物细胞中的表达 | NA | NA | PCR, 同源重组, 限制酶消化, 连接反应, 高通量测序 | NA | DNA | 超过一百万个独特的纳米抗体序列 |
| 170 | 2024-08-08 |
Mitogen-activated protein kinase activity drives cell trajectories in colorectal cancer
2021-10-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202114123
PMID:34409732
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了结直肠癌患者的肿瘤和匹配的非癌组织，定义了结直肠癌细胞的转录状态和控制其发展的信号 | 首次揭示了结直肠癌细胞沿着丝裂原活化蛋白激酶活性梯度组织的发展轨迹，并展示了靶向治疗对细胞发展轨迹的重塑作用 | 研究仅限于12名结直肠癌患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 定义结直肠癌细胞的转录状态和控制其发展的信号 | 结直肠癌细胞及其发展轨迹 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 12名结直肠癌患者的肿瘤和匹配的非癌组织 |
| 171 | 2024-08-08 |
Spinal Cord Injury Induces Permanent Reprogramming of Microglia into a Disease-Associated State Which Contributes to Functional Recovery
2021-10-06, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0860-21.2021
PMID:34417326
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了雌性小鼠脊髓损伤后免疫细胞的时间动态变化，发现脊髓损伤导致基线小胶质细胞永久性转录重编程，形成一种与疾病相关的小胶质细胞亚型，并增强后肢运动功能的恢复。 | 本研究首次揭示了脊髓损伤后小胶质细胞的来源及其在急性损伤过程中的作用，并通过小胶质细胞耗竭模型证明了疾病相关小胶质细胞在脊髓损伤中的来源和增强恢复的作用。 | NA | 探讨脊髓损伤后小胶质细胞的转录重编程及其在功能恢复中的作用。 | 脊髓损伤后的免疫细胞和小胶质细胞。 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性小鼠 |
| 172 | 2024-08-08 |
ZFP91 disturbs metabolic fitness and antitumor activity of tumor-infiltrating T cells
2021-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI144318
PMID:34403361
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研究论文 | 本文揭示了锌指蛋白91（ZFP91）调控机制如何破坏肿瘤浸润T细胞的代谢途径和抗肿瘤活性 | 首次阐明了ZFP91在肿瘤微环境中对T细胞代谢程序和功能的干扰机制 | NA | 探讨ZFP91在肿瘤微环境中对T细胞代谢和功能的影响 | 肿瘤浸润T细胞的代谢途径和抗肿瘤活性 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自结直肠癌患者的组织样本 |
| 173 | 2024-08-08 |
The Ratio of Exhausted to Resident Infiltrating Lymphocytes Is Prognostic for Colorectal Cancer Patient Outcome
2021-10, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0137
PMID:34413087
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别结直肠癌浸润淋巴细胞中的驻留和耗竭特征，并探讨这些特征与患者生存结果的关系 | 首次在结直肠癌浸润淋巴细胞中识别出CD4 T细胞和NK细胞的驻留和耗竭特征，并将其应用于患者生存结果的预测 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和TCGA数据，未涉及临床试验验证 | 探讨结直肠癌浸润淋巴细胞的驻留和耗竭特征与患者生存结果的关系 | 结直肠癌浸润淋巴细胞，包括CD8、CD4和NK细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 两个独立的转录组数据集来自结直肠癌患者 |
| 174 | 2024-08-08 |
Neuroinflammatory astrocyte subtypes in the mouse brain
2021-10, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00905-6
PMID:34413515
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠大脑皮质星形胶质细胞在急性炎症刺激后转录组的变化及其随时间和性别的异质性 | 首次在单细胞分辨率下分析了星形胶质细胞在炎症刺激后的快速转录组变化，并揭示了不同亚型的星形胶质细胞具有特定的转录组特征 | NA | 研究星形胶质细胞在急性炎症刺激后的转录组变化及其异质性 | 小鼠大脑皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 原位杂交 | NA | 转录组数据 | 约80,000个星形胶质细胞 |
| 175 | 2024-08-08 |
Hybrid material mimics a hypoxic environment to promote regeneration of peripheral nerves
2021-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究开发了一种模拟缺氧环境的复合材料，用于促进周围神经的再生 | 该研究挑战了缺氧仅参与周围神经再生的观点，并提供了一种潜在有价值的临床候选材料 | NA | 探索缺氧环境在神经再生中的作用及开发相关功能材料 | 周围神经缺陷及其再生过程中的细胞和组织结构 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 176 | 2024-08-08 |
Quality control in scRNA-Seq can discriminate pacemaker cells: the mtRNA bias
2021-Oct, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03916-5
PMID:34427691
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中质量控制参数对心脏组织分析的影响 | 提出在心血管应用中应避免使用固定的5%线粒体转录本阈值，以防止对起搏细胞的错误排除 | 文章主要关注于质量控制参数的影响，未涉及其他可能影响scRNA-seq结果的因素 | 研究scRNA-seq质量控制参数对心脏组织分析的准确性 | 心脏组织中的起搏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 包括体外生成的诱导窦房体（iSABs）和从胚胎小鼠窦房结组织分离的细胞 |
| 177 | 2024-08-08 |
Characterizing Macrophage Diversity in Metastasis-Bearing Lungs Reveals a Lipid-Associated Macrophage Subset
2021-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0101
PMID:34389631
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了携带原位乳腺肿瘤的小鼠肺部巨噬细胞的多样性，并识别出一种与脂质相关的巨噬细胞亚群 | 本研究首次在肺转移瘤中鉴定出一种与脂质相关的巨噬细胞亚群，该亚群在肿瘤携带小鼠肺部显著增多，并表现出与脂质代谢、细胞外基质重塑和免疫抑制相关基因的富集 | NA | 研究巨噬细胞在肿瘤转移过程中的复杂性和异质性变化 | 携带原位乳腺肿瘤的小鼠肺部巨噬细胞 | NA | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自携带原位乳腺肿瘤的小鼠肺部的巨噬细胞 |
| 178 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals unanticipated cell type complexity in Drosophila ovaries
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.274340.120
PMID:34389661
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对果蝇卵巢中的干细胞和早期卵泡细胞类型进行了全面的细胞类型特征分析 | 揭示了果蝇卵巢中未预料到的细胞类型复杂性，特别是护送细胞的多样性及其在不同解剖位置的表达模式 | NA | 研究果蝇卵巢中细胞类型的分子功能及其在器官功能中的作用 | 果蝇卵巢中的干细胞和早期卵泡细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 34种卵巢细胞类型和亚型 |
| 179 | 2024-08-08 |
There and back again: malaria parasite single-cell transcriptomics comes full circle
2021-10, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2021.07.011
PMID:34391665
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研究论文 | 本文介绍了疟疾细胞图谱（MCA）项目，该项目旨在以单细胞分辨率全面分析疟原虫生命周期中基因表达的强度和异质性，并完成了最具毒性的疟原虫——恶性疟原虫的传播阶段的添加。 | 首次将恶性疟原虫的传播阶段纳入疟疾细胞图谱，增强了该资源的应用性。 | NA | 全面分析疟原虫生命周期中的基因表达。 | 疟原虫生命周期中的基因表达。 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 180 | 2024-08-08 |
hiPSC Modeling of Lineage-Specific Smooth Muscle Cell Defects Caused by TGFBR1A230T Variant, and Its Therapeutic Implications for Loeys-Dietz Syndrome
2021-10-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过使用人诱导多能干细胞（hiPSC）模型，探讨了TGFBR1A230T变异导致的特定谱系平滑肌细胞缺陷及其对Loeys-Dietz综合征（LDS）的治疗意义 | 首次揭示了TGFBR1变异导致的特定谱系平滑肌细胞缺陷，并提出了使用激活素A和雷帕霉素联合治疗作为潜在的药物策略 | 研究主要集中在CPC-SMC和神经嵴干细胞-SMC的分子缺陷上，未涉及其他可能受影响的细胞类型 | 探讨TGFBR1A230T变异导致的特定谱系平滑肌细胞缺陷及其对LDS的治疗意义 | TGFBR1A230T变异对平滑肌细胞功能的影响及其治疗策略 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序 | 来自LDS家族的多个样本 |