单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 141 | 2024-08-08 |
High-throughput single-cell transcriptomics reveals the female germline differentiation trajectory in Arabidopsis thaliana
2021-10-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02676-z
PMID:34599277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了拟南芥中雌性生殖细胞分化轨迹的分子基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了拟南芥雌性生殖细胞分化过程中的基因表达动态变化 | NA | 探究开花植物中雌性生殖细胞从体细胞分化为特化生殖器官的分子机制 | 拟南芥的雌性生殖细胞及其周围细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16,872个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment
2021-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01276-3
PMID:34608315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEAM的空间单核代谢组学方法，该方法结合高空间分辨率成像质谱和一系列计算算法，能够显示多尺度和多色组织断层扫描，并通过单核的代谢指纹进行识别和聚类。 | SEAM方法能够探索单细胞水平的空间代谢特征和组织组织学，为理解组织代谢组织提供了更深入的视角。 | NA | 开发和验证一种新的空间单核代谢组学方法，以深入理解组织代谢组织。 | SEAM方法在野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏中的应用。 | 代谢组学 | NA | 成像质谱 | NA | 图像 | 包括多种野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199581
PMID:34550360
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 | 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 | NA | 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 | 内皮细胞（ECs）和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101224
PMID:34560099
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质（ECM）稳态的重要性 | 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联，并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 | 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），质谱/基质分析，原子力显微镜 | NA | 基因表达数据 | 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.acthis.2021.151789
PMID:34560403
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研究论文 | 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 | 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 | 样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 | 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征，为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA文库 | 共8888个细胞，来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Transitions in development - an interview with Tom Nowakowski
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200084
PMID:34568895
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访谈 | 本文是对加州大学旧金山分校助理教授Tom Nowakowski的访谈，他利用单细胞测序技术研究神经发育 | NA | NA | 了解Tom Nowakowski的职业发展及其作为研究组长的未来计划 | Tom Nowakowski的职业生涯和研究方向 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Proteomics Reveal Neonatal Ileum Dynamic Developmental Potentials
2021-Oct-26, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00725-21
PMID:34546071
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和蛋白质组学分析，揭示了新生期回肠动态发育的潜力 | 发现了先前未知的发育变化，包括未分化细胞的特定增加、独特的肠细胞分化以及分泌细胞的时间依赖性减少 | NA | 探讨新生期小肠发育和成熟过程中的细胞分化和分子相互作用 | 新生期猪回肠的40,186个回肠上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 40,186个回肠上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Microfluidic single-cell transcriptomics: moving towards multimodal and spatiotemporal omics
2021-10-12, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00607j
PMID:34541590
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review | 本文综述了微流控单细胞转录组学的最新进展，重点介绍了其方法学和技术趋势 | 文章讨论了微流控技术在单细胞转录组学中的应用，特别是向多模态和时空组学的转变，以及单细胞空间转录组学和时间转录组学的新进展 | 文章提到了当前微流控单细胞转录组学面临的挑战，包括需要解决的技术问题和未来的发展方向 | 综述微流控单细胞转录组学的方法和技术，探讨其未来发展 | 微流控单细胞转录组学技术及其在生物学中的应用 | digital pathology | NA | 微流控技术 | NA | 转录组数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Tunable and Contamination-Free Injection with Microfluidics by Stepinjection
2021-10-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02721
PMID:34546041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为stepinjection的微流控技术，通过改进T型接头设计，有效避免了传统皮克注射器中的交叉污染问题。 | stepinjection技术通过在T型接头中采用阶梯通道设计，增大了扩散缓冲区，从而增加了液滴与注射通道入口之间的压力差，有效防止了交叉污染。 | NA | 展示stepinjection技术在污染敏感的酶学检测中的应用能力。 | 使用stepinjection技术将酪蛋白荧光素异硫氰酸酯（FITC-casein）注入含有savinase和无savinase（标记为红色荧光染料）的液滴混合物中，观察是否有交叉污染。 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Genes related to SNPs identified by Genome-wide association studies of age-related hearing loss show restriction to specific cell types in the adult mouse cochlea
2021-10, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2021.108347
PMID:34536825
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研究论文 | 研究通过全基因组关联研究识别与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在成年小鼠耳蜗中的表达 | 发现与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗细胞亚型中的广泛且不同的表达模式，以及与阿尔茨海默病和细胞极性及囊泡循环相关的基因集的重叠 | NA | 确定与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗中的表达 | 年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因及其在耳蜗细胞亚型中的表达 | 基因组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠耳蜗细胞亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Type I Interferon signaling controls the accumulation and transcriptomes of monocytes in the aged lung
2021-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13470
PMID:34547174
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研究论文 | 本文揭示了衰老导致肺部干扰素信号增强和趋化因子浓度升高，进而引起单核细胞向肺实质的浸润 | 发现了一种依赖于I型干扰素信号的新型单核细胞亚群（MO-ifn），该亚群在衰老过程中上调IFNAR1表达并表现出更大的转录组变化 | NA | 探讨生理性衰老过程中肺部免疫细胞的机制 | 衰老肺部的单核细胞及其转录组变化 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.273300.120
PMID:34548323
|
research paper | 本研究构建了一个单细胞肿瘤免疫图谱，用于精确肿瘤学 | 提出了一个综合的单细胞肿瘤免疫细胞图谱，并开发了一个自动细胞注释系统和空间转录组学工具 | NA | 旨在提高肿瘤预后和免疫治疗的分层方法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其空间定位 | digital pathology | NA | single-cell and spatial transcriptomics | NA | single-cell data | 超过500,000个细胞，来自217名患者和13种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Disease pathology in fibrotic interstitial lung disease: is it all about usual interstitial pneumonia?
2021-10-16, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(21)01961-9
PMID:34499865
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综述 | 本文综述了间质性肺疾病中的纤维化病理及其与进行性纤维化表型的关系 | 探讨了免疫组化和单细胞RNA测序等技术在间质性肺疾病病理分类中的应用 | NA | 探讨间质性肺疾病的病理特征及其与进行性纤维化的关系 | 间质性肺疾病的病理特征和进行性纤维化 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Self-Renewing Islet TCF1+ CD8 T Cells Undergo IL-27-Controlled Differentiation to Become TCF1- Terminal Effectors during the Progression of Type 1 Diabetes
2021-10-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100362
PMID:34507949
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了NOD小鼠胰岛中浸润的CD8 T细胞的表型复杂性，并揭示了在1型糖尿病进展过程中，胰岛TCF1+ CD8 T细胞通过IL-27信号调控分化为TCF1-终末效应细胞的机制。 | 首次揭示了胰岛TCF1+ CD8 T细胞具有自我更新能力，并通过IL-27信号调控分化为终末效应细胞，为1型糖尿病的发病机制提供了新的见解。 | NA | 探究1型糖尿病进展过程中胰岛CD8 T细胞的维持机制。 | NOD小鼠胰岛中的CD8 T细胞。 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Single-genome sequencing reveals within-host evolution of human malaria parasites
2021-10-13, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2021.08.009
PMID:34492224
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，对低寄生虫血症感染的11名患者进行了406个接近完整的单个恶性疟原虫基因组的测序，揭示了疟原虫在宿主体内的进化过程 | 首次使用单细胞测序技术研究低寄生虫血症感染患者的疟原虫基因组，揭示了疟原虫在宿主体内的进化和选择压力 | NA | 探究疟原虫在宿主体内的进化过程及其对基因和通路水平的影响 | 恶性疟原虫和间日疟原虫的单细胞基因组 | 基因组学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 11名患者中的406个恶性疟原虫基因组和15名患者中的315个间日疟原虫基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Single-cell heterogeneity analysis and CRISPR screens in MIN6 cell line reveal transcriptional regulators of insulin
2021-10, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2021.1969204
PMID:34494921
|
研究论文 | 本文通过在MIN6细胞系中结合单细胞RNA测序和CRISPR筛选，研究了胰岛素转录调控因子 | 本研究首次在MIN6细胞系中发现了与胰岛素转录相关的未特征化长非编码RNA GM26917，并揭示了复杂的内部网络 | NA | 探索糖尿病相关胰岛素调控因子的转录机制 | MIN6细胞系中的胰岛素转录调控因子 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), CRISPR筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
UICPC: Centrality-based clustering for scRNA-seq data analysis without user input
2021-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2021.104820
PMID:34508973
|
研究论文 | 本文提出了一种基于中心性的聚类方法UICPC，用于无需用户输入的scRNA-seq数据分析，并通过与9种最先进的聚类方法在11个真实世界scRNA-seq数据集上的比较，展示了其有效性和实用性 | UICPC方法无需用户输入，且在NMI、Purity和ARI等方面表现出优异的性能 | UICPC方法需要设置阈值，这些阈值在广泛实验后进行基准测试 | 开发一种无需用户输入的scRNA-seq数据分析聚类方法 | scRNA-seq数据集中的细胞分组 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 聚类方法 | scRNA-seq数据 | 11个真实世界的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis to characterize cells and gene expression landscapes in atrial septal defect
2021-10, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16914
PMID:34514716
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序技术分析房间隔缺损（ASD）患者的细胞类型和基因表达谱 | 使用单细胞RNA测序技术在单细胞水平上研究感兴趣的细胞亚群中的差异表达基因（DEG） | NA | 研究房间隔缺损（ASD）患者的细胞类型和基因表达谱 | 房间隔缺损（ASD）患者的细胞和基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | 18,411个基因在6487个细胞中 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
FRMC: a fast and robust method for the imputation of scRNA-seq data
2021-10-15, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2021.1960688
PMID:34459719
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FRMC的新型单细胞RNA测序数据插补软件，采用快速准确的奇异值阈值近似方法 | FRMC软件创新性地采用了快速准确的奇异值阈值近似方法，能够精确区分‘真实零值’与丢失事件，并正确插补由技术噪声引起的缺失值 | NA | 开发一种更快速、稳定且准确的插补方法，以解决单细胞RNA测序数据中高缺失值的问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因-细胞表达矩阵 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
ADGRG1 enriches for functional human hematopoietic stem cells following ex vivo expansion-induced mitochondrial oxidative stress
2021-10-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI148329
PMID:34464351
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研究论文 | 本研究探讨了体外扩增诱导的线粒体氧化应激条件下，人类造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HPCs）的异质性 | 首次证明ADGRG1在体外扩增应激下富集功能性人类HSCs，为HSC扩增激动剂的药物筛选提供了可靠靶点 | NA | 研究体外扩增诱导的线粒体氧化应激对人类HSCs和HPCs功能的影响 | 人类造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 脐带血（CB）CD34+ HSCs和HPCs | NA | NA | NA | NA |