单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals antitumor characteristics of intratumoral immune cells in old mice
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002809
PMID:34642245
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和耦合T细胞受体（TCR）测序分析，揭示了老年小鼠肿瘤内浸润免疫细胞的抗肿瘤特性 | 发现老年小鼠肿瘤中效应免疫细胞比例显著较高，这些细胞有助于抵抗肿瘤进展 | NA | 深入理解老年个体如何防御肿瘤侵袭 | 年轻和老年小鼠的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的免疫细胞样本 |
| 122 | 2024-08-08 |
MET overexpression contributes to STAT4-PD-L1 signaling activation associated with tumor-associated, macrophages-mediated immunosuppression in primary glioblastomas
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002451
PMID:34667077
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研究论文 | 本文研究了MET过表达在原发性胶质母细胞瘤中通过STAT4-PD-L1信号通路激活与肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制的关系 | 首次详细探讨了MET基因在原发性胶质母细胞瘤中逃避免疫监视检查点的能力，并揭示了MET-STAT4-PD-L1轴与肿瘤相关巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 探讨MET表达与胶质瘤微环境的关系，并通过生存分析理解MET在临床实践中的潜在意义 | 原发性胶质瘤样本中的MET表达及其与PD-L1和STAT通路的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 多组学数据分析 | NA | RNA表达数据 | 1243个原发性胶质瘤样本 |
| 123 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals the importance of CXCL13/CXCR5 axis biology in lymphocyte-rich classic Hodgkin lymphoma
2021-10-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2105822118
PMID:34615710
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光技术，研究了淋巴细胞丰富的经典霍奇金淋巴瘤（LR-CHL）的肿瘤微环境（TME），并探讨了CXCL13/CXCR5轴及其在LR-CHL中的病理重要性。 | 首次在单细胞分辨率下对LR-CHL的肿瘤微环境进行表征，并发现CXCL13/CXCR5轴和PD-1CXCL13 T细胞在LR-CHL中的独特作用。 | 研究样本量相对较小，且未涉及长期随访数据。 | 探讨LR-CHL中CXCL13/CXCR5轴的生物学重要性及其作为治疗靶点的潜力。 | 淋巴细胞丰富的经典霍奇金淋巴瘤（LR-CHL）及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 8个LR-CHL细胞悬液样本，20个混合细胞性（MC）和结节性硬化（NS）亚型样本，以及5个反应性淋巴结对照样本。 |
| 124 | 2024-08-08 |
A short review on lymphatic endothelial cell heterogeneity
2021-Oct-11, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00183-6
PMID:34635187
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综述 | 本文综述了淋巴内皮细胞的异质性，基于单细胞RNA测序研究，探讨了其在不同物种中的基因表达模式及其潜在的适应性 | 揭示了淋巴内皮细胞在不同物种中的保守基因表达模式及其特有的基因集 | 尚未明确这种异质性对外部环境的适应程度，以及调控淋巴内皮细胞不同亚群的转录和调节途径 | 探讨淋巴内皮细胞的异质性及其基因表达模式 | 淋巴内皮细胞及其基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类样本 |
| 125 | 2024-08-08 |
A topology-preserving dimensionality reduction method for single-cell RNA-seq data using graph autoencoder
2021-10-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-99003-7
PMID:34625592
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研究论文 | 本文提出了一种名为单细胞图自编码器（scGAE）的降维方法，用于保留单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的拓扑结构 | scGAE方法能够同时保留scRNA-seq数据中的拓扑结构信息和特征信息，并在模拟数据和实际数据中显示出优于现有深度学习方法的性能 | NA | 开发一种能够保留单细胞RNA测序数据拓扑结构的降维方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 图自编码器 | RNA测序数据 | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell heterogeneity and transcriptome profile of breast cancer lymph node metastasis
2021-Oct-05, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-021-00355-6
PMID:34611125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了乳腺癌淋巴结转移的转录组特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了乳腺癌淋巴结转移的转录组图谱 | NA | 揭示乳腺癌淋巴结转移的分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤和腋窝淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 96,796个单细胞来自15对原发肿瘤和腋窝淋巴结样本 |
| 127 | 2024-08-08 |
An atlas of cortical arealization identifies dynamic molecular signatures
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03910-8
PMID:34616070
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了人类大脑在神经发生和早期胶质发生高峰期的十个主要结构和六个新皮层区域，揭示了早期皮层区域化的分子特征。 | 首次通过单细胞RNA测序和单分子荧光原位杂交技术，详细描述了新皮层区域在不同细胞类型中的基因表达差异及其动态变化。 | NA | 探讨早期大脑区域化和皮层区域化的分子机制。 | 人类大脑的十个主要结构和六个新皮层区域。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十个主要大脑结构和六个新皮层区域 |
| 128 | 2024-08-08 |
The landscape of tumor cell states and ecosystems in diffuse large B cell lymphoma
2021-10-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.08.011
PMID:34597589
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研究论文 | 本研究利用机器学习框架EcoTyper，通过整合转录组反卷积和单细胞RNA测序技术，对弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的肿瘤细胞状态和生态系统进行了系统性解析 | 首次大规模解析DLBCL中的肿瘤细胞状态及其临床相关性，并揭示了肿瘤微环境中的细胞状态交互作用 | NA | 解析弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，并识别治疗靶点 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的肿瘤细胞状态和生态系统 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 转录组反卷积和单细胞RNA测序 | 机器学习框架EcoTyper | 转录组数据 | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Resolving the intertwining of inflammation and fibrosis in human heart failure at single-cell level
2021-10-03, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-021-00897-1
PMID:34601654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和单T细胞受体测序，研究了人类扩张型心肌病和缺血性心肌病心脏中的炎症和纤维化机制 | 首次在单细胞水平上解析了炎症和纤维化在心力衰竭中的交织机制，并鉴定了一个新的转录因子AEBP1作为ACTA2肌成纤维细胞中的关键心脏纤维化调节因子 | NA | 旨在详细解码白细胞和非心肌细胞的基因表达扰动和细胞间相互作用，以理解心力衰竭中特定细胞类型的病理 | 人类扩张型心肌病和缺血性心肌病心脏中的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 200,615个细胞 |
| 130 | 2024-08-08 |
A single-cell interactome of human tooth germ from growing third molar elucidates signaling networks regulating dental development
2021-Oct-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00691-5
PMID:34600587
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正在生长的第三磨牙中的人类牙胚细胞互作网络，揭示了调控牙发育的关键信号通路 | 首次构建了人类牙胚细胞间的完整信号网络，为未来的牙再生工程和口腔病理学理解奠定了基础 | NA | 揭示调控牙发育的细胞间信号网络 | 人类牙胚细胞及其信号分子 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 正在生长的第三磨牙中的牙胚细胞 |
| 131 | 2024-08-08 |
Cancer cell states and emergent properties of the dynamic tumor system
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275308.121
PMID:34599005
|
研究论文 | 本文定义了癌症细胞状态，并探讨了这些状态在肿瘤系统中的起源、动态变化及其对整个肿瘤系统的影响 | 通过单细胞转录组学技术识别了不同癌症类型中的特定癌症细胞状态，并探讨了这些状态的功能相关性和对肿瘤系统的优势 | 尚未完全揭示癌症细胞状态的起源和动态变化的机制 | 揭示癌症细胞状态在肿瘤发生中的作用及其对肿瘤适应性的贡献，并寻找可用于治疗的弱点 | 癌症细胞状态及其在肿瘤系统中的功能和优势 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Dual checkpoint blockade of CD47 and PD-L1 using an affinity-tuned bispecific antibody maximizes antitumor immunity
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003464
PMID:34599020
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研究论文 | 本文开发了一种新型亲和力调节的双特异性抗体，针对CD47和PD-L1，以拮抗先天性和适应性免疫检查点途径，从而最大化抗肿瘤免疫 | 设计了一种针对CD47和PD-L1的双特异性抗体，具有对PD-L1的高亲和力和对CD47的中等亲和力，以实现对肿瘤微环境中表达PD-L1的肿瘤和骨髓细胞的优先结合 | 大多数患者对T细胞检查点免疫疗法仍然不响应 | 提高抗体选择性和治疗窗口，改善患者对免疫疗法的响应 | CD47和PD-L1双特异性抗体的设计、机制及其在肿瘤模型中的效果 | 免疫疗法 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 双特异性抗体 | RNA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Antitumor immune effects of preoperative sitravatinib and nivolumab in oral cavity cancer: SNOW window-of-opportunity study
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003476
PMID:34599023
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研究论文 | 本研究评估了术前使用sitravatinib和nivolumab在口腔癌中的免疫和分子效应 | sitravatinib与nivolumab联合使用在口腔癌中显示出深层的临床和病理反应，并揭示了患者具有不同的肿瘤生物学行为 | NA | 评估sitravatinib和nivolumab在口腔癌中的免疫和分子效应 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像 | 10名患者 |
| 134 | 2024-08-08 |
Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence
2021-10-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26065-6
PMID:34599190
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了体外胚胎干细胞向原始生殖细胞分化的过程中，增强子相关的H3K4甲基化在维持生殖能力中的作用 | 首次揭示了H3K4me1在增强子功能中的非必需性，但能促进增强子的（再）激活和基因表达程序的建立，特别是在特定的发育转变中 | NA | 探究增强子相关的H3K4甲基化在体外生殖能力维持中的作用 | 体外胚胎干细胞向原始生殖细胞分化的过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个阶段的体外PGCLC分化系统的细胞 |
| 135 | 2024-08-08 |
High-throughput single-cell transcriptomics reveals the female germline differentiation trajectory in Arabidopsis thaliana
2021-10-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02676-z
PMID:34599277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了拟南芥中雌性生殖细胞分化轨迹的分子基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了拟南芥雌性生殖细胞分化过程中的基因表达动态变化 | NA | 探究开花植物中雌性生殖细胞从体细胞分化为特化生殖器官的分子机制 | 拟南芥的雌性生殖细胞及其周围细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16,872个单细胞 |
| 136 | 2024-08-08 |
SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment
2021-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01276-3
PMID:34608315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEAM的空间单核代谢组学方法，该方法结合高空间分辨率成像质谱和一系列计算算法，能够显示多尺度和多色组织断层扫描，并通过单核的代谢指纹进行识别和聚类。 | SEAM方法能够探索单细胞水平的空间代谢特征和组织组织学，为理解组织代谢组织提供了更深入的视角。 | NA | 开发和验证一种新的空间单核代谢组学方法，以深入理解组织代谢组织。 | SEAM方法在野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏中的应用。 | 代谢组学 | NA | 成像质谱 | NA | 图像 | 包括多种野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏样本 |
| 137 | 2024-08-08 |
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199581
PMID:34550360
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 | 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 | NA | 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 | 内皮细胞（ECs）和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞 |
| 138 | 2024-08-08 |
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101224
PMID:34560099
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质（ECM）稳态的重要性 | 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联，并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 | 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），质谱/基质分析，原子力显微镜 | NA | 基因表达数据 | 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨 |
| 139 | 2024-08-08 |
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.acthis.2021.151789
PMID:34560403
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研究论文 | 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 | 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 | 样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 | 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征，为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA文库 | 共8888个细胞，来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织 |
| 140 | 2024-08-08 |
Transitions in development - an interview with Tom Nowakowski
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200084
PMID:34568895
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访谈 | 本文是对加州大学旧金山分校助理教授Tom Nowakowski的访谈，他利用单细胞测序技术研究神经发育 | NA | NA | 了解Tom Nowakowski的职业发展及其作为研究组长的未来计划 | Tom Nowakowski的职业生涯和研究方向 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |