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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2024-08-08 |
The Epithelial and Stromal Immune Microenvironment in Gastric Cancer: A Comprehensive Analysis Reveals Prognostic Factors with Digital Cytometry
2021-Oct-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215382
PMID:34771544
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研究论文 | 本文通过数字细胞计量技术分析胃癌中的上皮和间质免疫微环境，构建了一个新的特征矩阵，利用单细胞RNA测序数据集和细胞混合反卷积方法，从批量转录组数据中估计不同上皮、间质和免疫细胞的比例，并识别出胃癌的强预后因子。 | 本文构建了一个新的特征矩阵来解析上皮和间质信号，并应用细胞混合反卷积方法从批量转录组数据中估计细胞比例，识别出胃癌的独立预后因子STEM评分。 | NA | 研究胃癌中的上皮和间质免疫微环境，识别预后因子。 | 胃癌患者的上皮、间质和免疫细胞比例及其预后影响。 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 四个独立的胃癌队列（GSE62254, GSE15459, GSE84437, TCGA-STAD） | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
Epithelial-to-Mesenchymal Transition-Derived Heterogeneity in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2021-Oct-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215355
PMID:34771518
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综述 | 本文综述了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中由上皮间质转化（EMT）引起的异质性及其对治疗反应的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了与细胞周期、细胞应激、缺氧、上皮分化及部分上皮间质转化（pEMT）相关的RNA表达特征，这些特征与不良临床特征相关 | NA | 探讨HNSCC中分子异质性的机制及其对治疗反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的上皮间质转化（EMT）及其相关分子特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulation dynamics from static snapshots of gene expression variability
2021-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.104.044406
PMID:34781497
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研究论文 | 本文展示了如何利用基因表达变异性的静态群体快照来严格推断基因表达动力学的特性 | 本文提出了一种利用荧光蛋白不同成熟时间的双报告实验方法，将实验缺陷转化为分析特征，并推导出检测基因调控网络中闭环反馈调控存在的相关条件 | NA | 从单细胞测序或流式细胞术实验获得的细胞异质性数据中推断基因调控动力学 | 基因调控网络中的功能关系和基因表达动力学 | 系统生物学 | NA | 单细胞测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
Application of single-cell RNA sequencing technology in liver diseases: a narrative review
2021-Oct, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-4824
PMID:34790804
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肝脏疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术为健康和疾病肝脏提供了许多新的见解，有助于揭示肝脏发育、再生和疾病的分子机制 | NA | 总结单细胞转录组测序技术在肝脏疾病中的应用，并探讨其挑战和未来应用潜力 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Combined Mechanical and Enzymatic Dissociation of Mouse Brain Hippocampal Tissue
2021-10-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63007
PMID:34747412
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research paper | 本文介绍了一种结合机械和酶解的神经解离协议，用于优化小鼠海马组织处理，以便进行详细的下游分析如流式细胞术或单细胞测序 | 该方法通过结合自动化机械解离和酶解消化，能够持续产生高存活率（>90%）的单细胞悬液，克服了传统方法中获取高存活率单细胞悬液的困难 | 部分步骤需要手动操作，这可能增加样本处理和潜在的细胞损失 | 优化小鼠海马组织的解离过程，以便进行下游的单细胞分析 | 小鼠海马组织 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞悬液 | 小量神经组织 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis revealed that IL4I1 promoted ovarian cancer progression
2021-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03123-7
PMID:34717685
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了IL4I1在卵巢癌进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，构建了包含10个预后特异性基因的风险评分模型，并验证了IL4I1在卵巢癌进展中的重要作用 | NA | 探讨卵巢癌的遗传异质性及其对预后的影响 | 卵巢癌及其相关基因IL4I1 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归算法 | RNA测序数据 | 2397个恶性上皮基因，2个验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
A preliminary study of KAT2A on cGAS-related immunity in inflammation amplification of systemic lupus erythematosus
2021-10-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04323-1
PMID:34718330
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研究论文 | 本研究探讨了KAT2A在系统性红斑狼疮（SLE）炎症放大中与cGAS相关免疫的作用 | 首次探索了KAT2A在SLE中的作用及其与cGAS通路的关系，并揭示了KAT2A调控cGAS的机制 | NA | 研究KAT2A在SLE炎症放大中的作用及其与cGAS相关免疫的模式 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blot、免疫荧光、免疫组织化学、ELISA、质谱 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及SLE患者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Ectopic expression of Irx3 and Irx5 in the paraventricular nucleus of the hypothalamus contributes to defects in Sim1 haploinsufficiency
2021-Oct-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh4503
PMID:34705510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了下丘脑室旁核（PVH）神经元的分子特征，并探讨了Irx3和Irx5基因异位表达在Sim1单倍体不足中的作用。 | 首次揭示了Irx3和Irx5基因在PVH神经元中的异位表达对Sim1单倍体不足引起的缺陷的贡献。 | NA | 研究Sim1单倍体不足引起的PVH神经元功能障碍的分子机制。 | 下丘脑室旁核神经元及其在能量稳态调控中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Over 1000 tools reveal trends in the single-cell RNA-seq analysis landscape
2021-10-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02519-4
PMID:34715899
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研究论文 | 本文更新了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工具数据库的状态，并展示了该领域的演变趋势 | 本文首次记录了超过1000种scRNA-seq分析工具，并分析了该领域的演变和焦点变化 | NA | 研究scRNA-seq分析工具的发展趋势和领域焦点变化 | scRNA-seq分析工具及其在科学实践中的应用 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 超过1000种工具 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
BAMboozle removes genetic variation from human sequence data for open data sharing
2021-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26152-8
PMID:34711808
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研究论文 | 开发了一种名为BAMboozle的工具，用于从人类序列数据中移除敏感的遗传信息，以促进生命科学领域的开放数据共享 | BAMboozle工具能够有效地移除样本中的遗传序列变异，同时保留原始序列数据的其他重要方面，如基因表达特征和剪接动力学信息 | NA | 旨在解决人类遗传数据在开放共享时可能带来的重新识别风险问题 | 人类序列数据中的遗传变异信息 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
Characterization of hormone-producing cell types in the teleost pituitary gland using single-cell RNA-seq
2021-10-28, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-01058-8
PMID:34711832
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型进行了特征描述 | 首次通过单细胞测序技术详细定义了雌性和雄性硬骨鱼脑下垂体中的15和16种不同细胞类型 | NA | 揭示硬骨鱼脑下垂体中激素产生细胞类型的特征及其调控机制 | 硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2592个雌性样本和3804个雄性样本 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
Smoking Modulates Different Secretory Subpopulations Expressing SARS-CoV-2 Entry Genes in the Nasal and Bronchial Airways
2021-Oct-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-887718/v1
PMID:34729557
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研究论文 | 研究探讨了吸烟对鼻腔和支气管通道中表达SARS-CoV-2进入基因的分泌亚群的影响 | 首次全面分析了鼻腔和支气管样本中SARS-CoV-2进入基因（ACE2、TMPRSS2和CTSL）表达的相似性和差异性 | 研究仅基于肺部筛查或诊断工作中的个体样本，可能存在样本选择偏倚 | 探究吸烟如何影响鼻腔和支气管通道中SARS-CoV-2进入基因的表达 | 鼻腔和支气管通道中的SARS-CoV-2进入基因表达 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 793个鼻腔样本和1,673个支气管样本 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Myeloid cells in COVID-19 microenvironment
2021-10-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00792-0
PMID:34707085
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综述 | 本文综述了COVID-19患者外周血、肺组织和脑脊液的单细胞测序结果，并描述了患者中髓系细胞的分化轨迹及其异常分化促进疾病进展的功能和机制 | NA | NA | 探讨髓系细胞在COVID-19微环境中的作用及其在疾病进展中的机制 | COVID-19患者的髓系细胞及其在疾病中的作用 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 外周血、肺组织和脑脊液的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Structural and compositional diversity in the kainate receptor family
2021-10-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109891
PMID:34706237
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研究论文 | 本文研究了kainate受体家族的结构和组成多样性 | 首次解析了GluK1同聚体的结构，并利用单细胞RNA测序数据和单分子荧光技术研究了KAR亚单位的组合多样性和受体复合物的组成 | NA | 探讨kainate受体家族的亚单位组合和结构多样性 | kainate受体家族的亚单位及其组合 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单分子荧光技术 | NA | RNA序列，荧光图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
[A review on integration methods for single-cell data]
2021-Oct-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
DOI:10.7507/1001-5515.202104073
PMID:34713670
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综述 | 本文综述了单细胞数据整合的基本原理、方法及其应用 | 探讨了现有方法的优缺点，并对未来的发展进行了展望 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序实验中无法全面捕捉所有细胞和基因信息的问题 | 单细胞RNA测序数据和多模态单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Integrating single cell sequencing with a spatial quantitative systems pharmacology model spQSP for personalized prediction of triple-negative breast cancer immunotherapy response
2021-Oct, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.immuno.2021.100002
PMID:34708216
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研究论文 | 本文通过整合三阴性乳腺癌患者的全外显子测序和单细胞RNA测序数据，构建空间定量系统药理学模型（spQSP），用于个性化预测免疫治疗反应 | 首次将单细胞测序数据与空间定量系统药理学模型结合，用于预测个体化免疫治疗效果 | NA | 开发一种新的方法来预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 定量系统药理学模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Possible selection bias limits the interpretation of single-cell transcriptomics data of steroid-resistant asthma exacerbation
2021-10-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102858118
PMID:34686592
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Reply to Dutta et al.: Understanding scRNA-seq data in the context of the tissue microenvironment requires clinical relevance
2021-10-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109159118
PMID:34686602
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy
2021-Oct-26, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-021-00359-2
PMID:34697289
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了接受手术及术前化疗的食管鳞状细胞癌患者的分子和细胞重编程模式 | 首次详细分析了接受术前化疗的食管鳞状细胞癌患者的单细胞转录组网络，揭示了肿瘤微环境中的细胞间相互作用和分子特征 | 研究仅基于10名患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究食管鳞状细胞癌患者在接受术前化疗后的分子和细胞重编程模式 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 113,581个细胞，来自10名食管鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Exploring the oncostatin M (OSM) feed-forward signaling of glioblastoma via STAT3 in pan-cancer analysis
2021-Oct-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02260-9
PMID:34702277
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研究论文 | 本研究基于TCGA和GTEx数据库，对Oncostatin M（OSM）在泛癌分析中的肿瘤相关功能及其与肿瘤微环境中特定分子和细胞的关联进行了探讨，并特别关注了胶质母细胞瘤（GBM）中OSM诱导的信号通路和细胞间通讯。 | 首次系统评估了OSM在多种癌症中的作用，并揭示了其在肿瘤微环境中的广泛通讯能力，特别是在GBM中发现了OSM通过Jak-STAT和NF-κB通路促进肿瘤进展的关键作用。 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且样本量可能不足以全面代表所有癌症类型。 | 探讨OSM在肿瘤发展中的调控作用及其在肿瘤微环境中的机制。 | Oncostatin M（OSM）在泛癌分析中的作用及其与胶质母细胞瘤（GBM）的关系。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GTEx数据库的多种癌症样本 | NA | NA | NA | NA |