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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2907-3
PMID:33184512
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研究论文 | 本研究使用Patch-seq技术结合膜片钳记录、生物素染色和单细胞RNA测序,分析了成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经元的转录组和形态电生理特性 | 首次在同一组细胞中同时研究了神经元的转录组和形态电生理多样性,揭示了神经元类型在皮层中并非总是形成离散实体,而是在家族级别上形成连续且相关的转录组和形态电生理景观 | 研究仅限于成年小鼠的初级运动皮层,可能需要进一步研究其他脑区和不同发育阶段的神经元类型 | 探讨神经元类型的转录组和形态电生理多样性及其在皮层中的组织方式 | 成年小鼠初级运动皮层中的神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过1,300个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
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研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射,并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Association between particulate matter containing EPFRs and neutrophilic asthma through AhR and Th17
2021-Oct-26, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01867-w
PMID:34702270
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研究论文 | 本研究探讨了含有EPFRs的颗粒物与中性粒细胞性哮喘之间的关系,以及通过AhR和Th17途径的作用机制 | 本研究首次揭示了颗粒物通过AhR激活诱导Th17免疫反应,进而导致中性粒细胞性哮喘的机制 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究颗粒物与中性粒细胞性哮喘之间的关联及其分子机制 | 含有EPFRs的颗粒物对呼吸系统的影响及其免疫反应机制 | NA | 哮喘 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
The Parkinson's-disease-associated mutation LRRK2-G2019S alters dopaminergic differentiation dynamics via NR2F1
2021-10-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109864
PMID:34686322
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研究论文 | 研究帕金森病相关突变LRRK2-G2019S如何通过NR2F1改变多巴胺能神经元的分化动力学 | 首次揭示了LRRK2-G2019S突变通过影响NR2F1表达,改变多巴胺能神经元分化的初始阶段,加速细胞周期退出和细胞死亡 | NA | 探究帕金森病模型中多巴胺能神经元的发育异常 | 人源神经上皮干细胞(NESCs)向多巴胺能神经元的分化过程 | 神经科学 | 帕金森病 | 高通量图像分析和单细胞RNA测序 | NA | 图像和RNA序列 | 包括LRRK2-G2019S突变的NESCs、神经元和脑中脑类器官,以及NR2F1缺陷的小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Efficient stimulation of retinal regeneration from Müller glia in adult mice using combinations of proneural bHLH transcription factors
2021-10-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109857
PMID:34686336
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研究论文 | 本文研究了在成年小鼠视网膜中使用bHLH转录因子组合促进Müller胶质细胞再生神经元的效率 | 发现Ascl1与Atoh1组合能显著提高神经发生效率,即使在无视网膜损伤的情况下也能生成多种视网膜神经元类型 | 仅有一部分Ascl1表达的Müller胶质细胞能生成新神经元,过程效率不高 | 探索促进神经系统内源性修复的方法,以替代因退行性疾病而丧失的神经元 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
An interactive single cell web portal identifies gene and cell networks in COVID-19 host responses
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103115
PMID:34522848
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据,开发了一个交互式单细胞网络门户ToppCell,用于探索和比较细胞特征,以发现新的基因和细胞网络。 | 本文创新性地开发了一个交互式网络门户ToppCell,允许用户探索和比较不同条件下的单细胞转录组数据,从而发现新的基因和细胞网络。 | NA | 开发一个数据挖掘工具,使用户能够比较和探索细胞特征,以获得洞察并发展新的假设。 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | 多个COVID-19和其他对照条件的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Lack of CD8+ T cell effector differentiation during priming mediates checkpoint blockade resistance in non-small cell lung cancer
2021-Oct-29, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abi8800
PMID:34714687
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研究论文 | 本研究使用正位非小细胞肺癌小鼠模型,探讨了免疫检查点阻断(ICB)耐药性的机制,发现肺癌特异性肿瘤浸润CD8 T细胞在克隆扩增过程中缺乏效应和耗竭T细胞反应相关基因的表达,表明其经历了一个与传统T细胞耗竭不同的分化程序。 | 首次揭示了非小细胞肺癌中CD8 T细胞在初级阶段缺乏效应分化,导致对免疫检查点阻断治疗的耐药性。 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨非小细胞肺癌中免疫检查点阻断耐药性的机制。 | 非小细胞肺癌中的CD8 T细胞反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本及非小细胞肺癌患者CD8 T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Thyroid Hormone Effectors in the Human Fetal Neocortex: Expression of SLCO1C1, DIO2, and THRB in Specific Cell Types
2021-10, Thyroid : official journal of the American Thyroid Association
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/thy.2021.0057
PMID:34114484
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了人胎脑新皮质中甲状腺激素效应蛋白SLCO1C1、DIO2和THRB在特定细胞类型中的表达 | 发现甲状腺激素效应蛋白在特定细胞类型中的独特表达模式,特别是在中间神经元中的表达,这一发现具有新的病理生理意义 | NA | 填补关于人胎脑中甲状腺激素作用的知识的空白 | 人胎脑新皮质中的甲状腺激素效应蛋白 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 分析了来自三个不同研究的公开单细胞转录组数据集,涉及393至近40,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-08 |
Pseudotime Ordering Single-Cell Transcriptomic of β Cells Pancreatic Islets in Health and Type 2 Diabetes
2021-Oct, Phenomics (Cham, Switzerland)
DOI:10.1007/s43657-021-00024-z
PMID:36939754
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据,构建了健康和2型糖尿病中胰腺β细胞的伪时间轨迹,以探索β细胞在疾病中的转录变化 | 首次通过伪时间分析揭示了β细胞在健康和2型糖尿病中的不同状态,并识别了相关的生物标志物基因 | NA | 研究β细胞在健康和2型糖尿病中的转录异质性及其在疾病中的作用 | 胰腺β细胞在健康和2型糖尿病中的转录变化 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | Monocle2 | 转录组数据 | 使用了公开可用的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-08 |
Deconvolution of Focal Segmental Glomerulosclerosis Pathophysiology Using Transcriptomics Techniques
2021-Oct, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000518404
PMID:36751384
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研究论文 | 本文利用转录组学技术对局灶节段性肾小球硬化症的病理生理进行了解卷积分析 | 文章介绍了新的转录组学技术,如下一代测序技术,包括RNA测序和单细胞转录组学,这些技术有助于发现新的临床应用生物标志物 | NA | 旨在通过转录组学技术识别可应用于临床实践的基因表达生物标志物 | 局灶节段性肾小球硬化症患者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Computational tools for analyzing single-cell data in pluripotent cell differentiation studies
2021-10-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100087
PMID:35474899
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综述 | 本文综述了用于分析单细胞数据以研究多能细胞分化的计算方法 | 探讨了单细胞技术在多能细胞分化研究中的应用,特别是在优化分化协议、验证、鲁棒性和使用方面的潜力 | NA | 旨在讨论计算方法在单细胞组学和成像数据分析中的应用,以解决多能细胞分化过程中的一些主要挑战 | 单细胞组学和成像数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 组学数据,成像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
[Circulating tumor cells in the diagnosis and treatment of early and advanced prostate cancer]
2021-10-20, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:34914273
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综述 | 本文总结了循环肿瘤细胞(CTC)技术在前列腺癌(PCa)诊断和治疗中的研究进展 | CTC检测已从简单的计数发展到表型分类,甚至结合特定基因表达(如AR, AR-V7等)和单细胞测序 | CTC技术在早期PCa诊断中的意义有限,主要价值在于晚期药物敏感性和预后评估 | 探讨CTC技术在PCa诊断和治疗中的应用及进展预测风险 | 循环肿瘤细胞(CTC)和前列腺癌(PCa) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
The Metabolic Control of Myeloid Cells in the Tumor Microenvironment
2021-10-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10112960
PMID:34831183
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research paper | 本文讨论了肿瘤微环境中髓系细胞的代谢控制及其在肿瘤发生中的免疫代谢交叉对话机制 | 利用高维单细胞方法如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了髓系细胞在不同癌症中的表型多样性及其在抗肿瘤免疫与免疫抑制和逃避中的作用 | NA | 探讨髓系细胞的代谢程序及其在癌症免疫治疗中的潜在作用 | 肿瘤微环境中的髓系细胞及其代谢途径 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | single-cell | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Extensive GJD2 Expression in the Song Motor Pathway Reveals the Extent of Electrical Synapses in the Songbird Brain
2021-Oct-25, Biology
DOI:10.3390/biology10111099
PMID:34827092
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研究论文 | 本文通过原位杂交技术展示了GJD2 mRNA在控制鸣禽鸣叫产生的两个核HVC和RA中的表达情况,揭示了电突触在鸣禽大脑中的广泛分布 | 首次探索了鸣禽前运动神经网络中的电突触及其分子身份,并展示了GJD2 mRNA在不同细胞类型和鸣禽核中的分布 | NA | 研究电突触在鸣禽运动技能学习和产生中的作用 | 鸣禽的鸣叫行为及其控制神经网络 | 神经科学 | NA | 原位杂交技术,单细胞测序 | NA | mRNA表达数据 | 包括金丝雀和斑胸草雀的HVC和RA核 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
Single-Cell Approaches to Deconvolute the Development of HSCs
2021-10-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10112876
PMID:34831099
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综述 | 本文综述了造血干细胞(HSCs)发育领域的最新进展,并介绍了单细胞RNA测序、空间转录组学和分子条形码等先进技术在解析HSC生成中缺失信息方面的应用 | 引入了单细胞RNA测序、空间转录组学和分子条形码等先进技术来帮助获取关于HSC生成的缺失信息 | 文中讨论了未解决的问题,这些问题可能阻碍HSC的生产 | 旨在通过解析HSC的发育过程,促进基于HSC的免疫疗法的发展 | 造血干细胞(HSCs)的发育过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、分子条形码 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory-Associated Molecular Classification of Osteosarcoma
2021-10-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12111685
PMID:34828292
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研究论文 | 本研究旨在探讨骨肉瘤细胞的分化轨迹,并构建具有各自特征的分子亚型,生成预测预后的多基因签名 | 通过综合单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序和微阵列数据,识别与骨肉瘤肿瘤干细胞相关的基因(OSCGs),并基于这些基因对骨肉瘤患者进行分子分型,成功预测了总体生存率、肿瘤微环境和免疫浸润状态 | NA | 研究骨肉瘤细胞的分化轨迹及其在肿瘤预后和微环境中的作用 | 骨肉瘤细胞及其分子亚型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 使用来自骨肉瘤样本的多种数据进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Accurate Single-Cell Clustering through Ensemble Similarity Learning
2021-10-22, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12111670
PMID:34828276
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞聚类算法,通过有效减少零膨胀噪声和准确估计细胞间相似性,能够在大规模单细胞测序数据中准确预测单细胞聚类 | 提出了一种基于不同相似性估计的集成相似性网络构建方法,并使用随机游走重启框架减少人工噪声 | 未提及具体限制 | 开发一种有效的计算方法,以准确预测单细胞聚类 | 单细胞测序数据中的单细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 集成相似性网络 | 单细胞测序数据 | 大规模单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Using Machine Learning Techniques and Its Application to Medical Research
2021-Oct-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9111513
PMID:34829742
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综述 | 本文综述了机器学习技术在单细胞分析中的应用及其在医学研究中的重要性 | 介绍了机器学习技术如何解决单细胞分析中的批次效应和转录噪音等问题,并展示了其在单细胞多组学分析中的应用 | 未明确提及具体的研究限制 | 探讨机器学习技术在单细胞分析中的应用及其对医学研究的贡献 | 单细胞分析技术及其在癌症研究中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习技术 | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Identification of Differentially Expressed Genes in Different Glioblastoma Regions and Their Association with Cancer Stem Cell Development and Temozolomide Response
2021-Oct-20, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11111047
PMID:34834399
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研究论文 | 本研究旨在识别与替莫唑胺(TMZ)耐药和胶质母细胞瘤(GBM)复发相关的潜在靶基因 | 通过基因集富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络,识别了与肿瘤复发和TMZ耐药相关的新基因集 | 研究主要基于TCGA和本地队列的数据,可能存在样本选择的偏倚 | 识别与胶质母细胞瘤复发和替莫唑胺耐药相关的基因,为治疗提供新的分子策略 | 胶质母细胞瘤患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 脑癌 | 基因表达谱分析 | 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 包括TCGA的154个原发和13个复发肿瘤样本,本地队列的29个原发和4个复发肿瘤样本,以及Gene Expression Omnibus数据集的3589个单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Transcriptional Differences in Lipid-Metabolizing Enzymes in Murine Sebocytes Derived from Sebaceous Glands of the Skin and Preputial Glands
2021-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111631
PMID:34769061
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序方法比较了来自皮肤皮脂腺和包皮腺的小鼠皮脂细胞,揭示了两者在脂质代谢酶表达水平上的显著差异 | 发现了皮肤皮脂腺和包皮腺皮脂细胞在特定脂质类生物合成途径中基因表达的显著差异,特别是涉及甲羟戊酸途径和鞘脂回收途径的酶编码基因 | 使用包皮腺作为皮肤皮脂腺的研究模型存在局限性,需要在实验设计前仔细考虑两者之间的差异 | 比较皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞,揭示两者之间的相似性和差异 | 小鼠皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |