单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-07 |
Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.012
PMID:34508661
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和质谱流式技术鉴定人类皮肤中两种稳态和两种激活状态的朗格汉斯细胞亚群 | 首次发现人类朗格汉斯细胞存在功能迥异的LC1和LC2亚群，并揭示其不同的发育调控机制 | NA | 探究人类朗格汉斯细胞的异质性及其发育调控机制 | 人类皮肤表皮中的朗格汉斯细胞和CD34造血干细胞来源的朗格汉斯细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-07 |
Multi-omic evaluation of metabolic alterations in multiple sclerosis identifies shifts in aromatic amino acid metabolism
2021-10-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100424
PMID:34755135
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研究论文 | 本研究通过多组学方法评估多发性硬化症中的代谢改变，重点分析了芳香族氨基酸代谢的变化 | 首次在多发性硬化症患者中发现芳香族氨基酸代谢的显著异常，并揭示了这些代谢变化与疾病残疾程度的相关性 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究多发性硬化症的代谢组学特征及其与疾病病理生理的关系 | 多发性硬化症患者和健康对照者的血液样本 | 代谢组学 | 多发性硬化症 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞RNA测序数据 | 多发性硬化症患者637个样本，健康对照317个样本 | NA | 单细胞RNA-seq，代谢组学分析 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-07 |
Defining the nature of human pluripotent stem cell-derived interneurons via single-cell analysis
2021-10-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.08.006
PMID:34506726
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研究论文 | 通过单细胞分析比较人类多能干细胞来源的中间神经元与体内中间神经元的异同 | 首次应用单核和单细胞转录组学直接比较体外培养与体内来源的人类中间神经元 | 干细胞来源的中间神经元仅能模拟妊娠中期前的发育阶段，且仅代表脑内潜在亚型的一小部分 | 评估体外培养方法生成人类中间神经元的完整性和相似性 | 人类皮质中间神经元和多能干细胞来源的中间神经元 | 单细胞分析 | NA | 单核转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2024-09-30 |
[Liuwei Buqi capsule modulates immune function by targeting multiple immune cell subsets in lung tissue of patients with COPD]
2021-Oct-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 研究了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者肺组织中免疫细胞亚群的特征，并探讨了六味补气胶囊调节COPD免疫和炎症失衡的机制 | 首次构建了六味补气胶囊-免疫细胞亚群-靶基因网络，并通过KEGG富集分析确定了关键基因和信号通路 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，缺乏人体临床试验数据 | 探讨COPD患者肺组织中免疫细胞亚群的特征及六味补气胶囊的免疫调节机制 | COPD患者肺组织中的免疫细胞亚群及六味补气胶囊的作用机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | COPD患者和健康对照组的肺组织样本，以及COPD大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-09-06 |
Mapping and modeling the genomic basis of differential RNA isoform expression at single-cell resolution with LR-Split-seq
2021-10-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02505-w
PMID:34620214
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研究论文 | 开发并表征了一种名为LR-Split-seq的长读长单细胞RNA测序技术，用于在单细胞分辨率下识别全长转录本异构体 | LR-Split-seq结合了组合条形码技术，能够在相对经济和设计灵活的情况下对单细胞进行长读长测序 | NA | 研究单细胞分辨率下RNA异构体表达的基因组基础 | C2C12肌生成系统中的单细胞 | 基因组学 | NA | LR-Split-seq | NA | RNA序列 | C2C12肌生成系统中的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-27 |
Inference of high-resolution trajectories in single-cell RNA-seq data by using RNA velocity
2021-10-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100095
PMID:35474895
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellPath的方法，通过整合单细胞基因表达和RNA速度信息来推断细胞轨迹 | CellPath方法能够发现多条高分辨率的轨迹，不受轨迹结构的限制，并能自动检测每条轨迹路径的方向 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹推断的准确性和细节 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-22 |
Monocytes and Macrophages in Kidney Transplantation and Insights from Single Cell RNA-Seq Studies
2021-10-28, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0003842021
PMID:35372970
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肾移植中对单核细胞和巨噬细胞的命名、起源和功能的研究，特别关注了肾移植领域的新发现。 | scRNA-seq技术提供了无偏见的转录组学方法，揭示了巨噬细胞的起源和功能，这是传统方法无法实现的。 | 目前关于这一主题的发表研究较少。 | 探讨单细胞RNA测序在肾移植中对免疫细胞景观和同种异体免疫反应的研究。 | 单核细胞和巨噬细胞在肾移植中的作用。 | NA | 肾移植 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-19 |
Conventional type I dendritic cells maintain a reservoir of proliferative tumor-antigen specific TCF-1+ CD8+ T cells in tumor-draining lymph nodes
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.026
PMID:34534439
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研究论文 | 研究探讨了在肺腺癌自发性模型中，常规I型树突状细胞如何在肿瘤引流淋巴结中维持肿瘤抗原特异性TCF-1+ CD8+ T细胞的增殖库 | 发现常规I型树突状细胞在肿瘤引流淋巴结中维持TCF-1 CD8 T细胞库，通过Flt3L+anti-CD40治疗恢复SlamF6 T细胞频率并减轻肿瘤负担 | 研究仅限于肺腺癌的自发性模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 探究在肿瘤环境中，TCF-1 CD8 T细胞的维持机制及其对免疫检查点阻断反应的影响 | 肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞及其在肿瘤引流淋巴结中的动态变化 | 免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 涉及肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-18 |
Comprehensive investigations revealed consistent pathophysiological alterations after vaccination with COVID-19 vaccines
2021-Oct-26, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00329-3
PMID:34697287
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研究论文 | 本研究报告了在接受灭活SARS-CoV-2疫苗接种的健康志愿者中，除了产生中和抗体外，还观察到血红蛋白A1c、血清钠和钾水平、凝血谱和肾功能的一致性改变 | 通过单细胞mRNA测序揭示了接种疫苗后免疫细胞类型的基因表达变化，以及NF-κB信号通路的增加和I型干扰素反应的减少 | 研究主要集中在健康志愿者中，对于有预先存在的临床条件的人群的具体影响需要进一步研究 | 探讨COVID-19疫苗接种后的生理变化，并评估其对特定人群的影响 | 健康志愿者接种COVID-19疫苗后的生理变化 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-18 |
Large-scale analysis of imprinting in naive human pluripotent stem cells reveals recurrent aberrations and a potential link to FGF signaling
2021-10-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.002
PMID:34597600
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研究论文 | 本文研究了人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达情况，并探讨了其与FGF信号通路的可能关联 | 首次在大规模样本中分析了原始人类多能干细胞中的印记丢失（LOI）现象，并揭示了不同转化协议导致的LOI程度差异与FGF信号通路的紧密关联 | NA | 探讨人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达及其与FGF信号通路的关联 | 原始和激活的人类多能干细胞 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 大量批量和单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-17 |
Single-Cell RNA-Seq of T Cells in B-ALL Patients Reveals an Exhausted Subset with Remarkable Heterogeneity
2021-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101447
PMID:34365737
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者和健康个体的外周血T细胞，发现了患者中具有显著异质性的耗竭T细胞亚群 | 首次揭示了B-ALL患者中耗竭T细胞的异质性及其亚群特征，并探讨了其可能的起源 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示B-ALL患者中T细胞的功能集群，为免疫治疗和临床反应预测提供策略 | B-ALL患者和健康个体的外周血T细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康个体和B-ALL患者的T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-17 |
CD177 modulates the function and homeostasis of tumor-infiltrating regulatory T cells
2021-10-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26091-4
PMID:34599187
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析肾透明细胞癌患者的免疫细胞，发现肿瘤浸润调节T细胞（TI Treg）存在两种不同的转录命运，其中Fate-1与较差的预后相关，并发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，阻断CD177可减少Treg细胞的抑制活性，为TI Treg特异性免疫治疗提供新靶点 | 首次发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，并揭示其对Treg细胞功能和肿瘤生长的影响 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步在临床试验中验证 | 探索肿瘤浸润调节T细胞的功能和潜在治疗靶点 | 肾透明细胞癌患者的免疫细胞及肿瘤浸润调节T细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾透明细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-17 |
Escape of hair follicle stem cells causes stem cell exhaustion during aging
2021-10, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00103-w
PMID:37118327
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研究论文 | 本研究探讨了衰老过程中毛囊干细胞（HF-SCs）耗竭的机制 | 首次在活体动物中观察到衰老过程中毛囊干细胞的耗竭过程，并揭示了上皮细胞从毛囊干细胞微环境中逃逸的新机制 | NA | 阐明衰老过程中毛囊干细胞耗竭的机制及其对组织退化的影响 | 衰老小鼠的毛囊干细胞及其上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 细胞 | 衰老小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
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研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-05 |
Identification of cell-type-specific marker genes from co-expression patterns in tissue samples
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab257
PMID:33904573
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研究论文 | 本文提出了一种新算法，通过分析组织样本中的共表达模式来识别细胞特异性标志基因 | 提出了一种半监督算法，结合已知标志基因的信息和大规模转录组数据来精确识别标志基因 | 研究依赖于已发表的可能标志基因的信息，可能影响算法的准确性 | 识别组织样本中特定细胞类型的标志基因 | 组织样本中的细胞类型标志基因 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | 半监督算法 | 大规模转录组数据 | 多个组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-05 |
Automated quality control and cell identification of droplet-based single-cell data using dropkick
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271908.120
PMID:33837131
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研究论文 | 开发了一种名为dropkick的全自动软件工具，用于单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞识别 | dropkick能够自动确定数据集特定的训练标签，并学习真实细胞和环境噪声的基因表示，从而提高细胞识别的准确性和效率 | 在特定情况下，dropkick的性能可能受到数据集的技术噪声和背景变化的影响 | 研究单细胞RNA测序数据的质量控制和细胞筛选方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的真正细胞与非信息条形码的区分 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 弱监督模型 | 模拟和真实的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-05 |
Comprehensive RNA analysis of CSF reveals a role for CEACAM6 in lung cancer leptomeningeal metastases
2021-Oct-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00228-6
PMID:34625644
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研究论文 | 本研究综合使用单细胞RNA测序和游离RNA分析，揭示了CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用。 | 将单细胞RNA-seq与cfRNA分析结合，为NSCLC脑膜转移的诊断和机制提供了新的视角。 | 由于CSF中的癌细胞数量稀少，样本量有限，难以全面代表所有患者情况。 | 研究CEACAM6在肺癌脑膜转移中的作用及其基因表达特征。 | 怀疑有脑膜转移的非小细胞肺癌患者的脑脊液样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq，qPCR | NA | 细胞学，RNA数据 | 总共21个样本（14个脑膜转移患者，7个非肿瘤对照） | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
TIMEx: tumor-immune microenvironment deconvolution web-portal for bulk transcriptomics using pan-cancer scRNA-seq signatures
2021-Oct-25, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab244
PMID:33901274
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研究论文 | 本文介绍了TIMEx，一种新的肿瘤免疫微环境（TIME）反卷积方法，用于使用泛癌单细胞RNA-seq特征的批量转录组学估计浸润性免疫细胞 | 开发了TIMEx，一种新的TIME反卷积方法，强调使用泛癌单细胞RNA-seq特征估计浸润性免疫细胞 | NA | 开发和实现一种新的肿瘤免疫微环境反卷积方法 | 肿瘤免疫微环境中的异质细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 反卷积方法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells
2021-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00927-2
PMID:34083792
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASAP-seq的新工具，能够在单细胞水平上同时分析染色质可及性和蛋白质水平 | ASAP-seq结合了scATAC-seq数据和多种细胞表面及细胞内蛋白质标记物的检测，以及可选的线粒体DNA捕获，实现了单细胞中三种不同模态的同步分析 | NA | 展示系统性多组学分析在揭示基因调控中心法则中染色质、RNA和表面蛋白质协调及不同变化方面的应用 | 染色质可及性、基因表达和蛋白质水平在单细胞中的变化 | 基因组学 | NA | scATAC-seq, ASAP-seq | NA | 染色质可及性数据、蛋白质标记物数据、线粒体DNA | NA | NA | NA | NA | NA |