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当前共找到 216 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression
2021-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01338-7
PMID:34244611
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA克隆进化 | 首次在AML起始细胞中发现RNA克隆进化现象，而非传统的DNA突变进化 | 研究样本量有限，需要更大队列验证发现 | 探索AML疾病复发过程中白血病起始细胞的转录组变化机制 | 急性髓系白血病患者的匹配诊断和复发样本中的白血病起始细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 匹配的诊断和复发AML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Single-cell trajectories of melanoma cell resistance to targeted treatment
2021-Oct-01, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤细胞对靶向治疗的耐药性发展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示黑色素瘤对单药和双药治疗的耐药发展轨迹，发现不同耐药机制的特异性基因程序 | 研究仅基于细胞系模型，未涉及体内肿瘤微环境的影响 | 探索黑色素瘤细胞对靶向治疗的耐药机制 | BRAFV600E突变黑色素瘤细胞系 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, 自组织映射 | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤细胞系在不同处理条件下的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci
2021-Oct-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abh3768
PMID:34623901
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和表观基因组学分析人类扁桃体免疫细胞，揭示自身免疫风险位点与生发中心的强相关性 | 首次构建人类扁桃体单细胞转录组和表观基因组图谱，揭示自身免疫遗传变异在生发中心相关细胞群体中具有最强调控潜力 | 研究仅基于扁桃体组织，未验证其他淋巴组织或自身免疫疾病患者样本 | 解析生发中心反应的基因调控原理及其在自身免疫疾病中的作用机制 | 人类扁桃体中的免疫细胞亚群 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞表观基因组学 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
A joint deep learning model enables simultaneous batch effect correction, denoising, and clustering in single-cell transcriptomics
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271874.120
PMID:34035047
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研究论文 | 提出一种联合深度学习模型CarDEC，可同时实现单细胞转录组数据的批次效应校正、去噪和聚类 | 首次在基因表达空间和嵌入空间同时校正批次效应，且能同时进行去噪和聚类分析 | 未提及模型在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 开发单细胞RNA-seq数据分析方法，解决批次效应问题 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
The hepatocyte growth factor/c-met pathway is a key determinant of the fibrotic kidney local microenvironment
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103112
PMID:34622165
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研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了肝细胞生长因子/c-met信号通路在调控纤维化肾脏局部微环境形成中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和数学建模结合条件性基因敲除小鼠验证，系统阐明了c-met信号通路在肾脏纤维化微环境调控中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类慢性肾脏病中的直接适用性需要进一步验证 | 探索肝细胞生长因子/c-met信号通路在肾脏纤维化微环境形成中的调控作用 | 慢性肾脏病模型中的肾小管上皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序，数学建模，条件性基因敲除 | 数学预测模型，基因敲除动物模型 | 单细胞转录组数据 | 多种慢性肾脏病模型小鼠的回顾性单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271288.120
PMID:34035045
|
研究论文 | 开发了一种名为MERINGUE的计算框架，用于分析空间分辨单细胞转录组数据中的空间基因表达异质性 | 首个能够考虑组织内细胞类型固有3D空间组织和非均匀细胞密度的可扩展计算方法 | NA | 识别空间异质性表达基因、推断细胞间通讯、进行空间感知的细胞聚类 | 空间分辨转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间自相关和互相关分析 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,多重误差稳健荧光原位杂交,Slide-seq,原位杂交 | MERFISH,空间转录组学,Slide-seq,ISH | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth
2021-10-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63043
PMID:34779437
|
研究论文 | 开发了一种从小鼠和人类牙齿中快速分离单细胞的方案，适用于单细胞转录组测序 | 提出了一种快速、温和的组织处理方法，显著缩短了从动物处死到单细胞分析的时间，减少了基因表达的人为变化 | 未明确说明样本数量和处理时间的具体数据 | 开发适用于富含细胞外基质组织的快速单细胞分离方案 | 小鼠和人类牙齿中的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of suprachiasmatic nuclei reveal a Prokineticin-driven circadian network
2021-10-18, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108614
PMID:34487375
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示视交叉上核中由Prokineticin驱动的昼夜节律网络 | 首次在昼夜节律时间尺度上鉴定出11个不同的神经元亚群，构建了神经肽特异性网络拓扑并发现其时间可塑性 | 研究基于器官型切片模型，可能与在体环境存在差异 | 揭示视交叉上核的细胞组成和网络结构如何调控哺乳动物昼夜节律 | 小鼠视交叉上核的时钟细胞 | 单细胞组学 | 昼夜节律紊乱 | 单细胞RNA测序，实时成像，交叉遗传学 | NA | 单细胞转录组数据，实时成像数据 | 约20,000个时钟细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Combined presentation and immunogenicity analysis reveals a recurrent RAS.Q61K neoantigen in melanoma
2021-10-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129466
PMID:34651586
|
研究论文 | 通过数据驱动方法鉴定出HLA-A*01:01与RAS.Q61K组合衍生的复发性新抗原及其免疫特性 | 首次系统鉴定并验证了RAS.Q61K突变在HLA-A*01:01背景下的内源性呈递和天然免疫原性，发现新抗原特异性T细胞克隆具有跨患者相似性且能交叉识别RAS.Q61R变异 | 样本量有限（10个肿瘤样本的HLA肽组学分析，2例患者的TIL反应验证） | 鉴定复发性新抗原并分析其免疫原性特征 | 黑色素瘤患者肿瘤样本和肿瘤浸润淋巴细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | HLA肽组学、TCR测序、TCR过表达、功能测定、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、序列数据 | 大规模患者队列分析，10个肿瘤样本的HLA肽组学验证，2例患者的TIL反应确认 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Microbiota triggers STING-type I IFN-dependent monocyte reprogramming of the tumor microenvironment
2021-10-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.09.019
PMID:34624222
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物通过STING-I型干扰素通路调控肿瘤微环境中单核细胞重编程的机制 | 首次发现微生物来源的STING激动剂通过诱导I型干扰素产生调节巨噬细胞极化和NK细胞-DC互作 | 研究主要聚焦于黑色素瘤模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索微生物组如何调控肿瘤微环境免疫组分及其对癌症治疗的影响 | 肿瘤微环境中的单核吞噬细胞、树突状细胞、NK细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，粪便微生物移植 | NA | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤患者和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
NF-κB activation in cardiac fibroblasts results in the recruitment of inflammatory Ly6Chi monocytes in pressure-overloaded hearts
2021-Oct-12, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.abe4932
PMID:34637330
|
研究论文 | 本研究揭示了压力超负荷下心脏成纤维细胞通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 首次发现特定心脏成纤维细胞亚群通过NF-κB通路激活CCL2表达，驱动炎症单核细胞招募 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类心脏组织中验证 | 探索压力超负荷心脏中炎症细胞招募的细胞机制 | 小鼠心脏成纤维细胞和Ly6C单核细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，假时序分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | 压力超负荷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Targeting integrated epigenetic and metabolic pathways in lethal childhood PFA ependymomas
2021-Oct-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abc0497
PMID:34613815
|
研究论文 | 本研究揭示了儿童PFA室管膜瘤中表观遗传与代谢通路的整合机制，并验证了二甲双胍通过调控EZHIP蛋白和H3K27me3抑制肿瘤生长的治疗潜力 | 首次发现EZHIP过表达通过H3K27ac表观遗传修饰激活糖酵解和TCA循环代谢，并证实二甲双胍可逆转这一过程 | 研究主要基于患者来源细胞和小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 探索儿童PFA室管膜瘤的表观遗传与代谢异常机制及治疗策略 | 儿童后颅窝A组室管膜瘤患者样本、患者来源细胞、小鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 室管膜瘤 | 单细胞RNA测序, 代谢成像, 表观遗传分析 | 小鼠异种移植模型 | 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | 患者来源肿瘤样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢成像 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Characterization of human FDCs reveals regulation of T cells and antigen presentation to B cells
2021-10-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210790
PMID:34424268
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和微阵列技术首次定义了人类滤泡树突状细胞的转录组特征 | 首次系统表征人类FDCs的转录组，发现MRC细胞而非FDCs表达BAFF，揭示FDCs表达TLR4并能响应PAMPs调节抗原可用性 | NA | 阐明人类滤泡树突状细胞的分子特征及其在免疫调节中的功能 | 人类滤泡树突状细胞、T细胞、B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列, 流式细胞术, 显微镜 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
B-cells are abnormal in psychosocial stress and regulate meningeal myeloid cell activation
2021-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2021.08.002
PMID:34371135
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研究论文 | 本研究揭示心理社会压力下B细胞异常并通过调节脑膜髓系细胞活化影响行为 | 首次发现心理社会压力下脾脏B细胞活化增强并分泌IL-10，同时脑膜B细胞减少而单核细胞增多，通过单细胞RNA测序揭示B细胞先天免疫转录程序诱导 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中验证；B细胞影响行为的具体机制仍需进一步探索 | 探究心理社会压力下免疫细胞特别是B细胞对脑功能和行为的影响 | 小鼠的脾脏B细胞、脑膜B细胞和髓系细胞 | 免疫神经学 | 情绪障碍 | 单细胞RNA测序 | Cd19基因缺陷小鼠模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Prrx1b restricts fibrosis and promotes Nrg1-dependent cardiomyocyte proliferation during zebrafish heart regeneration
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.198937
PMID:34486669
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Prrx1b在斑马鱼心脏再生过程中抑制纤维化并促进心肌细胞增殖的关键作用 | 首次发现Prrx1b通过限制TGFβ配体表达和刺激Nrg1表达来平衡纤维化与再生过程 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类临床应用前需要进一步验证 | 探索斑马鱼心脏无瘢痕再生的分子机制 | 斑马鱼心脏再生过程、心外膜来源细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体外实验、体内拯救实验 | 动物模型（斑马鱼） | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Combining an Alarmin HMGN1 Peptide with PD-L1 Blockade Results in Robust Antitumor Effects with a Concomitant Increase of Stem-Like/Progenitor Exhausted CD8+ T Cells
2021-10, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0265
PMID:34344641
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研究论文 | 本研究通过联合使用警报素HMGN1肽段与PD-L1阻断剂，在荷瘤小鼠中诱导了持久的肿瘤消退，并揭示了其通过增加成熟树突状细胞和干细胞样/祖细胞耗竭CD8+ T细胞发挥抗肿瘤作用的机制 | 首次鉴定出HMGN1的免疫刺激结构域并开发为治疗性肽段minP1，证明其与PD-L1阻断联合可协同增强肿瘤内Tstem/Tpex细胞数量 | 研究仅限于小鼠肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索联合HMGN1肽段与PD-L1阻断在肿瘤免疫治疗中的协同效应及机制 | B16F10、LLC、Colon26和EO771荷瘤小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 高维流式细胞术、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据、RNA测序数据 | 多种荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Interferon-Gamma-Producing CD8+ Tissue Resident Memory T Cells Are a Targetable Hallmark of Immune Checkpoint Inhibitor-Colitis
2021-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.06.025
PMID:34147519
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研究论文 | 本研究揭示干扰素-γ产生的CD8+组织驻留记忆T细胞是免疫检查点抑制剂结肠炎的关键病理特征和潜在治疗靶点 | 首次确定CD8+ TRM细胞是ICI结肠炎的主要活化T细胞亚群，并证明其可作为JAK抑制剂治疗的靶点 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 阐明免疫检查点抑制剂结肠炎的发病机制并确定新的治疗靶点 | ICI结肠炎患者、接受ICI治疗但未发生结肠炎的患者、特发性溃疡性结肠炎患者和健康对照 | 免疫学 | 免疫相关结肠炎 | 多参数流式细胞术、光谱流式细胞术、光谱免疫荧光显微镜、靶向基因panel、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 多组患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Loss of function of the mitochondrial peptidase PITRM1 induces proteotoxic stress and Alzheimer's disease-like pathology in human cerebral organoids
2021-10, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0807-4
PMID:32632204
|
研究论文 | 本研究通过PITRM1基因敲除的人源诱导多能干细胞衍生的脑类器官，揭示了线粒体肽酶功能缺失导致蛋白质毒性应激和阿尔茨海默病样病理的机制 | 首次在人类脑类器官模型中证明PITRM1缺陷通过激活线粒体未折叠蛋白反应和线粒体清除机制，自发诱导阿尔茨海默病病理特征 | 研究主要基于体外类器官模型，未在完整生物体中进行验证 | 探究线粒体前序列加工缺陷的致病机制及其与神经退行性疾病的关系 | PITRM1敲除的人源诱导多能干细胞衍生的皮质神经元和脑类器官 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | 脑类器官模型 | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Multiomics: unraveling the panoramic landscapes of SARS-CoV-2 infection
2021-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00754-0
PMID:34471261
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综述 | 本文系统回顾了通过多组学技术研究SARS-CoV-2感染在病毒学、免疫学和致病机制方面的主要进展 | 整合多种组学技术（基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学）实现对病原体和疾病的全景式快速解析 | 基于已建立队列的研究，需要更多验证性研究支持 | 快速识别和理解新兴传染病的病原体、风险因素、宿主免疫反应和致病机制 | SARS-CoV-2病毒及其引起的COVID-19疾病 | 多组学分析 | COVID-19 | 多组学技术，包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-07 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 开发从小鼠颈动脉管腔分离内皮细胞的方法用于单细胞多组学研究 | 建立了通过管腔消化法富集动脉内皮细胞的新方法，解决了内皮细胞在动脉壁细胞中占比低的技术难题 | 方法中仍存在平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞等污染，且尚未在人类动脉样本中验证 | 研究血流动力学对内皮细胞转录组和表观基因组的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 单细胞多组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠部分颈动脉结扎模型，左颈动脉为实验组，右颈动脉为对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics微流体系统 |