单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 220 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of CNS border compartment leukocytes reveals that B cells and their progenitors reside in non-diseased meninges
2021-09, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00880-y
PMID:34253922
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了中枢神经系统（CNS）边界组织中白细胞的特定位置组成和表达谱，特别是在硬脑膜中发现大量B细胞及其前体细胞。 | 首次详细描述了CNS边界组织中淋巴细胞的组成，特别是在硬脑膜中发现B细胞及其前体细胞，这些细胞在正常状态下具有慢周转和长期组织居留特性。 | NA | 研究CNS边界组织中白细胞的组成和功能，特别是B细胞及其前体细胞的分布和特性。 | 中枢神经系统边界组织中的白细胞，特别是B细胞及其前体细胞。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和大鼠的硬脑膜样本 |
| 162 | 2024-08-08 |
Patterns of T-Cell Phenotypes in Rheumatic Diseases From Single-Cell Studies of Tissue
2021-Sep, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11296
PMID:34255929
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综述 | 本文综述了从单细胞研究中获得的关于风湿性疾病中T细胞表型的关键观察结果 | 单细胞RNA测序分析揭示了T细胞状态的多个维度，并帮助揭示了炎症组织中的新效应子亚群 | 这些分析通常没有显示出典型的T细胞效应子亚群（如Th1、Th2和Th17细胞）的明显集群 | 进一步表征积累在目标组织中的T细胞群体，以更精确地靶向生物疗法并加速开发更具体的生物标志物 | 风湿性疾病中的T细胞 | NA | 风湿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 163 | 2024-08-08 |
Forebrain Neural Precursor Cells Are Differentially Vulnerable to Zika Virus Infection
2021 Sep-Oct, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0108-21.2021
PMID:34272257
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研究论文 | 本研究使用了一种新型的小鼠模型，通过脑室内感染和细胞类型特异性电穿孔（IUE）来识别ZIKV感染的时间进程和在皮层神经发生期间最初感染或幸免的细胞身份 | 首次揭示了ZIKV在胎儿大脑中感染的时间和细胞细节，特别是发现一类优先表达假定ZIKV进入受体的aRGCs更易受感染 | NA | 探讨ZIKV感染对大脑前体细胞的影响及其机制 | 大脑前体细胞对ZIKV感染的脆弱性 | NA | 先天性Zika综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎 |
| 164 | 2024-08-08 |
Generating and Using Transcriptomically Based Retinal Cell Atlases
2021-09-15, Annual review of vision science
IF:5.0Q1
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research paper | 本文介绍了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术生成和使用基于转录组学的视网膜细胞图谱的实验和计算方法 | 利用scRNA-seq技术生成跨多个脊椎动物物种的视网膜细胞图谱，扩展到整个眼睛和大脑视觉中心的研究 | NA | 探讨视网膜发育、细胞对损伤的反应、与视网膜疾病相关的基因表达模式以及细胞类型的进化 | 视网膜细胞及其在多个脊椎动物物种中的多样性 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个脊椎动物物种的视网膜细胞 |
| 165 | 2024-08-08 |
Retinal organoids on-a-chip: a micro-millifluidic bioreactor for long-term organoid maintenance
2021-09-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00011j
PMID:34236056
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研究论文 | 本研究设计了一种无剪切应力的微型微流控生物反应器，用于近乎无需人工的视网膜类器官维护 | 开发了一种自动化微型微流控设备，显著减少了剪切应力，用于生产与传统静态培养质量相当的视网膜类器官 | NA | 标准化视网膜类器官的生产和维护 | 视网膜类器官 | 生物工程 | 视网膜退化 | 立体光刻（SLA）3D打印 | NA | 细胞 | 在三个不同分化阶段（第41天、88天和128天）成功培养视网膜类器官超过一个月 |
| 166 | 2024-08-08 |
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.06.065
PMID:34217973
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研究论文 | 本文研究了乳酸脱氢酶A型（LDHA）在人胰岛α细胞中的表达及其在2型糖尿病中的上调情况 | 首次揭示了LDHA在人胰岛α细胞中的主要定位及其在2型糖尿病中的上调现象 | 药物抑制LDHA在分离的人胰岛中增强了胰岛素分泌，但在糖尿病条件下未能显著纠正胰岛素或胰高血糖素的分泌失调 | 探讨LDHA在人胰岛细胞中的表达及其在糖尿病条件下的变化 | 人胰岛α细胞和β细胞中的LDHA表达 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA seq） | NA | RNA | 涉及慢性高血糖处理的人胰腺胰岛和来自2型糖尿病患者的尸检胰腺样本 |
| 167 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Stage Transition under Temperature Stress in Synchronized Plasmodium falciparum Cells
2021-09-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/Spectrum.00008-21
PMID:34232098
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了在温度胁迫下同步化的恶性疟原虫细胞的细胞异质性和阶段转变 | 研究发现了在温度处理下，恶性疟原虫中一小部分群体的性发育主调控基因上调，并识别出在正常生长条件下上调应激反应途径的异质性应激响应子群 | NA | 探究恶性疟原虫在人体宿主内的细胞异质性 | 恶性疟原虫细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约12,000个同步化的细胞 |
| 168 | 2024-08-08 |
Time-Series Single-Cell Sequencing Reveals Tumor Clonal Dynamics
2021-09, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2021-095
PMID:34215631
|
研究论文 | 本文通过时间序列单细胞测序揭示肿瘤克隆动态 | NA | NA | 研究肿瘤克隆的适应性景观及其在突变和治疗影响下的变化 | 肿瘤克隆 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Identification of a special cell type as a determinant of the kidney tropism of SARS-CoV-2
2021-09, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16114
PMID:34228902
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和尿液蛋白质组学分析，识别出一种名为PT-3的特殊细胞类型，该细胞类型在肾脏中对SARS-CoV-2感染具有易感性 | 首次识别出PT-3细胞作为SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型，并发现其在不同肾脏疾病中的分布差异 | NA | 探究SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型及其机制 | PT-3细胞及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），尿液蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，尿液蛋白质组数据 | 正常人肾脏和已有疾病肾脏的单细胞RNA测序数据，COVID-19患者和健康个体的尿液样本 |
| 170 | 2024-08-08 |
Multiplexing Methods for Simultaneous Large-Scale Transcriptomic Profiling of Samples at Single-Cell Resolution
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101229
PMID:34240574
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综述 | 本文综述了基于DNA的样本多重标记方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的应用 | 详细比较了四种主要条码策略，并提供了根据个性化需求选择最合适条码技术的指南 | NA | 探讨样本多重标记技术在scRNA-seq中的应用及未来发展 | 单细胞RNA测序中的样本多重标记方法 | 测序技术 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 171 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies unique chondrocyte subsets and reveals involvement of ferroptosis in human intervertebral disc degeneration
2021-09, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.06.010
PMID:34242803
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类椎间盘退变中的软骨细胞亚群，并揭示了铁死亡在椎间盘退变中的作用 | 首次报道了椎间盘髓核中的七个软骨细胞亚群，其中四个亚群（C1-C4）为新发现的亚群，并发现铁死亡途径在椎间盘退变中的富集 | NA | 探索椎间盘退变过程中髓核中细胞亚群及其生物学过程 | 人类椎间盘退变中的髓核组织 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat包 | 基因表达数据 | 正常对照组和椎间盘退变模型组的髓核组织各6个样本 |
| 172 | 2024-08-08 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
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研究论文 | 本研究探讨了Setd2-/-小鼠急性髓系白血病（AML）中白血病起始细胞（LICs）的转录和化学抗性特性的内在异质性。 | 本研究首次揭示了Setd2-/- AML模型中LICs的转录和功能异质性，并发现了不同类型LICs共存导致的多样药物反应。 | NA | 旨在阐明AML中LICs的内在异质性，以帮助预测白血病行为并开发更有效的治疗方法。 | Setd2-/-小鼠的AML模型中的白血病起始细胞（LICs）。 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术、全基因组测序、RNA测序、限制性稀释分析、小分子抑制剂筛选 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Setd2-/- AML小鼠的脾细胞 |
| 173 | 2024-08-08 |
AP-2α-Mediated Activation of E2F and EZH2 Drives Melanoma Metastasis
2021-09-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0772
PMID:34210752
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研究论文 | 本文研究了AP-2α转录因子在黑色素瘤转移中的作用，发现AP-2α通过激活E2F和EZH2途径促进黑色素瘤转移 | 首次揭示了AP-2α通过抑制NuRD抑制复合体来上调E2F途径基因，从而驱动黑色素瘤转移 | NA | 探讨AP-2α在黑色素瘤转移中的作用及其机制 | AP-2α转录因子及其在黑色素瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了转移性黑色素瘤小鼠模型 |
| 174 | 2024-08-08 |
Single-Cell Mapping of GLP-1 and GIP Receptor Expression in the Dorsal Vagal Complex
2021-09, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi21-0003
PMID:34176785
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综述 | 本文综述了单细胞方法在检测背侧迷走复合体（DVC）中GLP-1和GIP受体表达细胞分子特征方面的应用 | 讨论了单细胞转录组学、表观遗传学、空间转录组学和电路图谱技术在进一步研究后脑中肠降血糖素受体电路方面的潜力 | NA | 理解肠降血糖素如何通过中枢机制改变代谢和能量平衡 | 背侧迷走复合体（DVC）中的GLP-1和GIP受体表达细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学、表观遗传学、空间转录组学、电路图谱技术 | NA | 分子特征 | NA |
| 175 | 2024-08-08 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multi-resolution Reconciled Tree (MRtree)的树构建算法，用于从不同分辨率的平面聚类结果中生成细胞类型层次结构 | MRtree算法能够结合大多数scRNA-seq聚类算法，继承平面聚类的鲁棒性和多功能性，同时保持细胞的层次结构 | NA | 克服单一分辨率聚类结果难以比较和描述细胞集群演化的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型层次结构 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集，包括胎儿脑细胞 |
| 176 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics and proteomics technologies for deconvoluting the tumor microenvironment
2021-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202100041
PMID:34125481
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综述 | 本文综述了用于解析肿瘤微环境的空间转录组学和蛋白质组学技术 | 介绍了多种新兴的空间分辨高复用分子分析技术，如10X Visium、GeoMx DSP等，这些技术能够在保持空间信息的同时进行高复用蛋白质和RNA分析 | NA | 探讨如何利用新兴的空间技术深入理解肿瘤微环境 | 肿瘤微环境及其在肿瘤发生、转移和药物抗性中的作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学技术 | NA | 蛋白质和RNA数据 | NA |
| 177 | 2024-08-08 |
Negative electroretinograms: genetic and acquired causes, diagnostic approaches and physiological insights
2021-09, Eye (London, England)
DOI:10.1038/s41433-021-01604-z
PMID:34127841
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综述 | 本文综述了负向视网膜电图（ERG）的遗传和获得性原因、诊断方法及生理学见解 | NA | NA | 探讨负向视网膜电图的生理基础、流行病学、成因及临床处理 | 负向视网膜电图及其在遗传和获得性疾病中的表现 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-08 |
Cross-species integration of single-cell RNA-seq resolved alveolar-epithelial transitional states in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-09-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00594.2020
PMID:34132117
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研究论文 | 本文通过跨物种的单细胞RNA测序分析，揭示了特发性肺纤维化中肺泡上皮过渡状态的关键细胞状态。 | 本文通过比较和跨物种的单细胞转录组学分析，进一步描绘了从AT2到AT1以及AT2到/细胞状态的分化轨迹，并观察到人类IPF中的AT1细胞保留了小鼠过渡细胞状态的转录特征。 | NA | 研究特发性肺纤维化中肺泡上皮细胞的分化过程及其在疾病中的作用。 | 肺泡上皮细胞的分化状态及其在特发性肺纤维化中的作用。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 七项人类和小鼠IPF模型的单细胞RNA测序研究数据 |
| 179 | 2024-08-08 |
What a difference ADA2 makes: Insights into the pathophysiology of ADA2 deficiency from single-cell RNA sequencing of monocytes
2021-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5CE0421-186R
PMID:34137068
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了ADA2缺乏症患者中单核细胞的病理生理机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示ADA2缺乏症患者中非经典单核细胞的增加及其炎症反应特征 | NA | 探讨ADA2缺乏症的病理生理机制 | ADA2缺乏症患者中的单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 180 | 2024-08-08 |
Cardiac fibrosis: Pathobiology and therapeutic targets
2021-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2021.110066
PMID:34146658
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综述 | 本文综述了心脏纤维化的病理生物学机制及其潜在的治疗靶点 | 通过谱系追踪研究和单细胞RNA测序研究提供了关于心脏成纤维细胞起源和异质性的新见解 | 目前没有直接针对细胞外基质的批准疗法 | 探讨心脏纤维化的病理生物学机制及寻找新的治疗靶点以减缓或逆转纤维化重塑 | 心脏纤维化及其治疗靶点 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |