单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 220 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-09-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.07.023
PMID:34352228
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和COVID-19患者的鼻咽拭子样本，揭示了SARS-CoV-2感染对呼吸道上皮细胞的影响及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染的宿主细胞类型和基因表达特征，并指出了不同严重程度COVID-19患者免疫反应的差异 | 研究样本量有限，且仅包括鼻咽拭子样本，可能无法全面反映所有受影响的细胞类型和组织 | 探讨SARS-CoV-2感染对呼吸道上皮细胞的影响及其与COVID-19严重程度的关系 | 健康和COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 58名健康和COVID-19参与者 |
| 142 | 2024-08-08 |
MP44-09 UNDERSTANDING PRUNE BELLY SYNDROME AT SINGLE CELL RESOLUTION
2021-09, The Journal of urology
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/JU.0000000000002065.09
PMID:34346772
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了普鲁恩贝尔综合征（PBS）患者的膀胱细胞类型组成和转录活性 | 首次在单细胞分辨率下解析了PBS患者的膀胱细胞异质性和基因表达网络 | NA | 揭示PBS患者膀胱细胞的异质性和基因表达网络 | PBS患者的膀胱细胞 | 数字病理学 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 2名PBS患者和6名非PBS对照患者的膀胱细胞 |
| 143 | 2024-08-08 |
NovoSpaRc: flexible spatial reconstruction of single-cell gene expression with optimal transport
2021-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00573-7
PMID:34349282
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研究论文 | 本文介绍了一种名为novoSpaRc的计算框架，用于基于单细胞RNA测序数据进行空间重构，以研究组织结构和空间基因表达模式 | novoSpaRc框架通过概率性地将细胞分配到组织位置，利用结构对应假设，即物理上接近的细胞共享相似的基因表达谱，进行空间重构 | NA | 开发一种新的计算框架，用于单细胞RNA测序数据的空间重构 | 单细胞RNA测序数据的空间重构 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 10,000个细胞映射到1,000个位置 |
| 144 | 2024-08-08 |
A preliminary investigation into the immune cell landscape of schistosome-associated liver fibrosis in humans
2021-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12490
PMID:34355810
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术初步分析了血吸虫相关肝纤维化患者的免疫细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了血吸虫相关肝纤维化中特定免疫细胞类型及其相关信号通路 | 样本量较小，仅包括三个患者组，可能影响结果的普遍性 | 探索血吸虫相关肝纤维化的免疫细胞组成及其在疾病发展中的作用 | 血吸虫相关肝纤维化患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括一个血吸虫病日本株组（n=1），一个慢性肝衰竭组（n=3）和一个健康对照组（n=2），共20,093个细胞 |
| 145 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing (scRNA-Seq) deciphering pathological alterations in streptozotocin-induced diabetic retinas
2021-09, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108718
PMID:34364890
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜的转录组图谱，以解析糖尿病视网膜病变的病理改变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了糖尿病视网膜病变的细胞和分子层面的病理改变 | NA | 解析糖尿病视网膜病变的病理改变，并为糖尿病视网膜病变的治疗提供潜在靶点 | 健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜的单细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 超过14,000个单细胞 |
| 146 | 2024-08-08 |
Memory and naïve gamma delta regulatory T-cell gene expression in the first 24-weeks of peanut oral immunotherapy
2021-09, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2021.108820
PMID:34365017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受花生口服免疫疗法的儿童在治疗前24周内调节性T细胞的基因表达变化 | 首次详细描述了花生口服免疫疗法前24周内调节性T细胞的免疫学变化，揭示了gdTreg细胞在维持免疫稳态中的作用 | 研究样本仅限于参与花生口服免疫疗法研究的5至12岁儿童，可能限制了结果的普遍性 | 阐明花生口服免疫疗法在早期诱导免疫变化的机制，以帮助理解其作用机理 | 接受花生口服免疫疗法的儿童的调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 参与研究的儿童样本在治疗开始后的0、6和24周进行收集，并与健康非花生过敏对照组进行比较 |
| 147 | 2024-08-08 |
The effect of low-dose IL-2 and Treg adoptive cell therapy in patients with type 1 diabetes
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147474
PMID:34324441
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的效果 | 结合多克隆Tregs和低剂量IL-2，以增强Treg的生存和扩增，并评估其对Treg群体和其他免疫细胞随时间的影响 | 研究仅限于第一阶段，需要进一步的研究来验证长期效果和安全性 | 评估低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的安全性和有效性 | 1型糖尿病患者 | NA | 1型糖尿病 | 流式细胞术，时间飞行细胞仪，10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of SARS-CoV-2 cell entry factors in the preconceptional human endometrium
2021-09-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab183
PMID:34329437
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNAseq）分析了人类月经周期中子宫内膜的SARS-CoV-2细胞进入因子表达情况，发现感染风险较低。 | 首次在单细胞水平上分析了人类子宫内膜中SARS-CoV-2细胞进入因子的表达情况，揭示了低感染风险。 | 所有样本均用于scRNAseq分析，无法进行蛋白质表达或空间转录组学分析；子宫内膜细胞的感染情况只能在病毒存在的情况下评估。 | 探究SARS-CoV-2细胞进入因子在人类月经周期中子宫内膜的表达情况。 | 人类子宫内膜细胞中的SARS-CoV-2细胞进入因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 73,181个人类子宫内膜细胞，来自27名捐赠者 |
| 149 | 2024-08-08 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 本文研究了干扰素-γ在巨噬细胞激活综合征（MAS）中对肺部炎症的作用，特别是在系统性幼年特发性关节炎（SJIA）相关的MAS中。 | 首次在TLR9小鼠模型中机制性地定义了MAS中的肺部炎症，并证实了干扰素-γ驱动的转录变化和MAS特异性巨噬细胞群体的存在。 | NA | 旨在机制性地定义MAS中肺部炎症的潜在新观察。 | 巨噬细胞激活综合征（MAS）中的肺部炎症。 | NA | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 150 | 2024-08-08 |
CellCall: integrating paired ligand-receptor and transcription factor activities for cell-cell communication
2021-09-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab638
PMID:34331449
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研究论文 | 本文开发了CellCall工具，通过整合配对的配体-受体和转录因子（TF）活性来推断细胞间和细胞内通信途径 | CellCall不仅能预测细胞间通信途径，还能分析特定细胞类型间的细胞间对话和内部TF活性 | NA | 旨在开发一种工具，用于基于scRNA-seq数据解码细胞间通信及相关内部调控信号 | 细胞间通信途径和转录因子活性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | scRNA-seq数据 | 人类睾丸细胞和肿瘤免疫微环境的scRNA-seq数据集 |
| 151 | 2024-08-08 |
Genomic and transcriptomic profiling of hepatoid adenocarcinoma of the stomach
2021-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01976-2
PMID:34326469
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research paper | 本文通过全外显子测序、转录组测序和单细胞RNA测序研究胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | 首次提供了胃肝样腺癌的综合基因组图谱，揭示了其起源于多能前体细胞，并具有高干细胞特性和高蛋氨酸循环活性 | NA | 研究胃肝样腺癌的分子特征，以促进其诊断、预后和治疗 | 胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | digital pathology | 胃癌 | 全外显子测序（WES）、转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 58个肿瘤样本及匹配的正常对照来自54名胃肝样腺癌患者，30个胃肝样腺癌肿瘤样本，1个胃肝样腺癌肿瘤的单细胞RNA测序 |
| 152 | 2024-08-08 |
Microglia in Alzheimer's disease at single-cell level. Are there common patterns in humans and mice?
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202717
PMID:34292312
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review | 本文综述了阿尔茨海默病（AD）中微胶质细胞在单细胞水平上的反应模式，并探讨了人类和小鼠之间的共性与差异 | 提出了所有报道的微胶质细胞群可能是单一模式或多种模式的组合，取决于聚类策略和疾病模型 | NA | 探讨微胶质细胞在AD发病机制中的作用，并比较人类和小鼠的转录组特征 | 微胶质细胞在AD中的反应模式 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Hepatitis B virus compartmentalization and single-cell differentiation in hepatocellular carcinoma
2021-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101036
PMID:34290079
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染导致的肝细胞癌（HCC）中病毒与宿主细胞的相互作用及其分子机制 | 揭示了HBV与HCC细胞分化之间的显著相关性，并发现了先前未知的病毒致癌途径 | NA | 研究HBV感染与肝细胞癌发展之间的分子机制 | HBV感染的肝细胞癌患者来源的癌细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者来源的HCC样本 |
| 154 | 2024-08-08 |
RNA-binding protein ELAVL2 plays post-transcriptional roles in the regulation of spermatogonia proliferation and apoptosis
2021-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13098
PMID:34296486
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研究论文 | 本文研究了RNA结合蛋白ELAVL2在调控精原细胞增殖和凋亡中的后转录作用 | 本文首次揭示了ELAVL2在精原干细胞中的功能和机制，通过单细胞测序数据识别出ELAVL2并验证了其在人类和小鼠中的表达 | NA | 研究ELAVL2在精原干细胞维持和分化中的作用及其机制 | RNA结合蛋白ELAVL2及其在精原细胞增殖和凋亡中的作用 | NA | NA | 单细胞测序, RNA免疫沉淀, 质谱 | NA | RNA | 人类和小鼠的精原干细胞 |
| 155 | 2024-08-08 |
Studying the History of Tumor Evolution from Single-Cell Sequencing Data by Exploring the Space of Binary Matrices
2021-09, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2020.0595
PMID:34297621
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序数据通过探索二元矩阵空间来重建肿瘤进化历史的计算方法 | 提出了一种新的树搜索策略，即在二元矩阵空间中进行搜索，直接从最大似然矩阵中获得最大似然树 | 缺乏对现有方法的理论背景和两种树搜索策略之间相关性的详细讨论 | 回顾基于二元矩阵空间搜索的肿瘤进化树推断方法的理论背景，并讨论这些方法在实际数据上的应用 | 单细胞DNA测序数据集 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
The Pandora's box of novel technologies that may revolutionize lung cancer
2021-09, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2021.06.022
PMID:34304051
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综述 | 本文综述了空间分析技术在非小细胞肺癌（NSCLC）组织样本分析中的最新进展，旨在为NSCLC提供新的治疗选择。 | 结合空间转录组学与高级成像技术，为深入理解NSCLC组织生物学提供可能。 | NA | 探索空间分析技术在NSCLC治疗中的应用。 | 非小细胞肺癌（NSCLC）组织样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Diverse Mechanisms of Resistance to EGFR Tyrosine Kinase Inhibitors in Lung Cancer
2021-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-2811
PMID:34247147
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，分析了肺癌中EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性的多样性机制 | 首次鉴定出CD74作为EGFR-TKI耐药的关键基因，并揭示了其在药物耐受状态中的作用 | 研究主要基于细胞模型和临床样本，可能需要更多临床数据验证 | 揭示肺癌中EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性的多样性机制 | EGFR-TKI耐药的肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 158 | 2024-08-08 |
Tumor cells generate astrocyte-like cells that contribute to SHH-driven medulloblastoma relapse
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202350
PMID:34254999
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研究论文 | 本文通过谱系追踪分析和单细胞RNA测序，证明了复发性髓母细胞瘤（MB）中的星形胶质细胞主要来源于肿瘤细胞的转分化，而非原发性MB。 | 首次揭示了髓母细胞瘤细胞通过转分化形成星形胶质细胞的机制，并发现骨形态发生蛋白（BMPs）通过诱导Sox9的磷酸化促进这一过程。 | NA | 研究髓母细胞瘤复发中星形胶质细胞的来源及其机制，探索预防和治疗髓母细胞瘤复发的新途径。 | 髓母细胞瘤及其复发中的星形胶质细胞。 | 数字病理学 | 儿童恶性脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 159 | 2024-08-08 |
CD16+CD163+ monocytes traffic to sites of inflammation during necrotizing enterocolitis in premature infants
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200344
PMID:34269788
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研究论文 | 本研究利用悬浮和成像质谱流式细胞术结合单细胞RNA测序，揭示了早产儿坏死性小肠结肠炎（NEC）中的严重炎症反应，并鉴定了一种与NEC相关的新型炎症单核细胞/巨噬细胞亚型。 | 首次鉴定出与NEC相关的CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞亚型，并发现其在NEC黏膜中的特异性富集，可能作为NEC的潜在生物标志物和治疗靶点。 | NA | 研究早产儿坏死性小肠结肠炎中的炎症反应机制，并探索潜在的生物标志物和治疗靶点。 | 早产儿坏死性小肠结肠炎患者的黏膜炎症反应和单核细胞/巨噬细胞亚型。 | NA | 早产儿坏死性小肠结肠炎 | 悬浮和成像质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个NEC患者的黏膜样本 |
| 160 | 2024-08-08 |
IDH Mutation Subgroup Status Associates with Intratumor Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101230
PMID:34250753
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研究论文 | 本研究通过外显子测序和批量RNA测序分析了14名肝内胆管癌患者的73个肿瘤区域，揭示了肝内胆管癌的多层面肿瘤内异质性（ITH）及其与IDH突变亚组状态和肿瘤微环境的关系 | 研究发现高ITH肿瘤与IDH突变亚组高度重叠，且IDH突变亚组显示出较低的T细胞浸润和T细胞毒性，表明其肿瘤微环境较冷 | NA | 探讨肝内胆管癌的肿瘤内异质性与IDH突变亚组状态及其对肿瘤微环境的影响 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 73个肿瘤区域, 17503个细胞, 来自14名患者 |