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当前共找到 220 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Applying Machine Learning to Stem Cell Culture and Differentiation
2021-Sep, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.261
PMID:34529356
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研究论文 | 本文详细介绍了机器学习技术在干细胞培养和分化中的应用 | 本文首次系统地介绍了机器学习在干细胞研究中的应用，并提供了具体的实例和方法 | NA | 旨在帮助干细胞生物学家理解和设计机器学习工作流程 | 干细胞的培养和分化 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序和基于图像的方法 | 回归、分类和无监督聚类 | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
Transcriptomic entropy benchmarks stem cell-derived cardiomyocyte maturation against endogenous tissue at single cell level
2021-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009305
PMID:34534204
|
研究论文 | 本文通过转录组熵量化多能干细胞（PSC）衍生的心肌细胞（CM）成熟度，并与内源性组织进行单细胞水平的比较 | 开发了一种新的方法来量化PSC衍生的心肌细胞成熟度，通过转录组熵，该方法在不同数据集间具有鲁棒性，不受分离协议、文库准备和其他潜在批次效应的影响 | NA | 建立一个跨研究、跨物种的心肌细胞成熟度参考，并直接比较PSC衍生的心肌细胞与体内发育轨迹 | 多能干细胞衍生的心肌细胞成熟度 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 分析了超过45个scRNA-seq数据集和超过52,000个心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
The establishment of variant surface glycoprotein monoallelic expression revealed by single-cell RNA-seq of Trypanosoma brucei in the tsetse fly salivary glands
2021-09, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009904
PMID:34543350
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了舌蝇唾液腺中布氏锥虫的发育过程，特别是变异表面糖蛋白（VSG）单等位基因表达的建立。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了布氏锥虫在舌蝇唾液腺中VSG单等位基因表达的动态过程，并提出了转录竞赛模型来解释这一现象。 | NA | 深入理解布氏锥虫在舌蝇唾液腺中变异表面糖蛋白单等位基因表达的建立过程。 | 布氏锥虫在舌蝇唾液腺中的发育过程及其变异表面糖蛋白的表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 多个布氏锥虫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Single-cell exome sequencing reveals multiple subclones in metastatic colorectal carcinoma
2021-09-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00962-3
PMID:34507604
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研究论文 | 本研究通过分析7名结直肠癌（CRC）患者的原发性和转移性肿瘤的批量和单细胞外显子测序数据，揭示了转移性CRC的进化模式 | 单细胞外显子测序（scWES）数据揭示了批量外显子测序（WES）未能检测到的罕见突变，并定义了两种不同的细胞群体，表明原发性和转移性肿瘤细胞之间存在多样的进化轨迹 | NA | 研究结直肠癌的转移机制及其进化模式 | 结直肠癌患者的原发性和转移性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞外显子测序（scWES） | NA | 基因组数据 | 7名结直肠癌患者，其中4名进行了单细胞测序 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
Smoking shifts human small airway epithelium club cells toward a lesser differentiated population
2021-Sep-08, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-021-00237-1
PMID:34497273
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了健康非吸烟者和吸烟者的小气道上皮细胞（SAE）中的杯状细胞亚群 | 揭示了吸烟如何影响人类小气道上皮细胞中杯状细胞的分化，并发现了三种不同的杯状细胞亚群 | NA | 探究吸烟对人类小气道上皮细胞中杯状细胞分化和功能的影响 | 健康非吸烟者和吸烟者的小气道上皮细胞中的杯状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康非吸烟者和吸烟者的小气道上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
scRNA-seq of human vitiligo reveals complex networks of subclinical immune activation and a role for CCR5 in Treg function
2021-Sep-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abd8995
PMID:34516831
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了白癜风患者的受影响和未受影响皮肤以及健康对照的皮肤，以确定每种细胞类型在疾病进展中协调自身免疫的作用 | 发现了CCR5在调节T细胞功能中的新作用，并揭示了CCL5-CCR5信号通路在效应CD8 T细胞和调节T细胞之间的化学信号环路 | NA | 探究白癜风的发病机制并发现潜在的治疗干预机会 | 白癜风患者的皮肤细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 白癜风患者和健康对照的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Adipocyte heterogeneity revealed by spatial transcriptomics of human adipose tissue: Painting and more
2021-09-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.08.011
PMID:34496228
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研究论文 | 本文利用空间转录组学技术揭示了人类脂肪组织中脂肪细胞的异质性 | 首次通过空间转录组学技术展示了人类脂肪组织的结构，并识别出具有特定代谢特征的不同脂肪细胞亚群 | NA | 探索人类脂肪组织中脂肪细胞的异质性及其代谢特征 | 人类脂肪组织中的脂肪细胞及其亚群 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
SCN2A contributes to oligodendroglia excitability and development in the mammalian brain
2021-09-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109653
PMID:34496232
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与全细胞膜片钳记录相结合的方法，探讨了哺乳动物大脑中表达电压激活钠通道和钾通道的未成熟少突胶质细胞（称为放电少突胶质细胞）的分子特征 | 首次揭示了SCN2A在放电少突胶质细胞中的特异性表达，并阐明了其在少突胶质细胞放电和发育中的关键作用 | NA | 研究SCN2A在哺乳动物大脑中少突胶质细胞兴奋性和发育中的作用 | 少突胶质细胞及其前体细胞的分子特征和发育过程 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学，全细胞膜片钳记录 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 小鼠和橄榄狒狒的脑干和 cerebellum 中的少突胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Tumor-initiating stem cell shapes its microenvironment into an immunosuppressive barrier and pro-tumorigenic niche
2021-09-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109674
PMID:34496236
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研究论文 | 研究肿瘤起始干细胞（TSCs）与其微环境（TME）之间的相互调控关系，并探讨了化疗放疗（CRT）对肠道腺瘤的影响 | 发现了TSCs与TME之间的双向交流，并揭示了TSCs如何塑造TME以促进免疫抑制和肿瘤生长 | NA | 探讨肿瘤起始干细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 肿瘤起始干细胞（TSCs）和肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 肠道腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
APOΕ4 lowers energy expenditure in females and impairs glucose oxidation by increasing flux through aerobic glycolysis
2021-09-06, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00483-y
PMID:34488832
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和稳定同位素解析代谢组学，探讨了APOE4在表达该基因的星形胶质细胞、脑组织、小鼠和人类中的代谢重编程机制。 | 首次揭示了APOE4在年轻女性中降低能量消耗并损害葡萄糖氧化的机制，表现为增加有氧糖酵解的通量。 | 研究主要集中在年轻女性和APOE4表达的小鼠模型上，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他年龄和性别的人群。 | 探讨APOE4对大脑葡萄糖代谢的影响及其潜在机制。 | 星形胶质细胞、脑组织、小鼠和人类。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、稳定同位素解析代谢组学（SIRM） | NA | RNA、代谢物 | 包括表达APOE4的小鼠和人类的年轻及中年参与者。 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Analytic Pearson residuals for normalization of single-cell RNA-seq UMI data
2021-09-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02451-7
PMID:34488842
|
研究论文 | 本文探讨了两种用于单细胞RNA-seq UMI数据归一化的统计计数模型之间的理论和实证联系，并比较了它们对下游处理的影响 | 提出了一个简化的分析解决方案，并发现Hafemeister和Satija模型的过度指定导致参数估计噪声较大，而更简约的模型与Townes等人的模型等价 | 文章中未明确提及具体的局限性 | 研究不同归一化方法在单细胞RNA-seq数据处理中的效果 | 单细胞RNA-seq UMI数据的归一化方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 广义线性模型（GLM） | UMI数据 | 未具体提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Learning interpretable cellular and gene signature embeddings from single-cell transcriptomic data
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25534-2
PMID:34489404
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞嵌入主题模型（scETM），用于从单细胞转录组数据中学习可解释的细胞和基因特征嵌入 | scETM利用可转移的神经网络编码器和通过矩阵三因子分解的可解释线性解码器，同时学习编码网络以推断细胞类型混合以及一组高度可解释的基因嵌入、主题嵌入和批次效应线性截距 | NA | 解决单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据大规模整合分析中的批次效应和现有计算方法的局限性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 神经网络 | 转录组数据 | 超过10万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
Brown adipose tissue monocytes support tissue expansion
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25616-1
PMID:34489438
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研究论文 | 本研究聚焦于单核细胞在棕色脂肪组织（BAT）重塑过程中的特征及其对BAT功能的影响 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了BAT免疫细胞中丰富的单核细胞和巨噬细胞多样性，并发现BAT巨噬细胞池需要单核细胞的不断补充 | NA | 探究单核细胞在棕色脂肪组织重塑中的作用 | 棕色脂肪组织中的单核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术分析了血液中的布氏锥虫，重建了细胞周期进程和发育群体感应 | 本研究首次使用单细胞转录组学技术（scRNA-seq）分析了布氏锥虫从复制型'纤细'到可传播型'粗短'的渐进发育过程，并详细描述了生物事件的相对顺序、动态基因表达模式及潜在调控因子 | NA | 研究布氏锥虫的生命周期中从复制型到非复制型的转变过程 | 布氏锥虫的细胞周期和发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 8,599个寄生虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Targeting S1PR1 May Result in Enhanced Migration of Cancer Cells in Bladder Carcinoma
2021-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13174474
PMID:34503284
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研究论文 | 本研究通过分析临床数据库、肿瘤纯度和免疫细胞浸润模拟以及膀胱癌的组织学表型数据库，结合单细胞测序技术，探讨了S1PR1在膀胱癌中的分布和功能 | 首次揭示了S1PR1在膀胱癌中的表达与细胞迁移能力的负相关性，并探讨了FTY-720对膀胱癌细胞转移能力的影响 | 研究主要基于数据库分析和单细胞测序，未进行体内实验验证 | 探究S1PR1在膀胱癌中的表达及其对患者预后的影响 | 膀胱癌组织、正常组织及膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个临床数据库和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Single-cell Ribo-seq reveals cell cycle-dependent translational pausing
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03887-4
PMID:34497418
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞核糖体测序技术，该技术结合机器学习方法，能够在单个细胞水平上实现单密码子分辨率的翻译监测 | 本文开发了一种新的单细胞核糖体测序技术，显著提高了检测灵敏度，并结合机器学习实现了单密码子分辨率 | 尽管技术进步，但在非限制条件下检测到的现象仍需进一步验证和解释 | 研究细胞周期依赖的翻译暂停现象及其对细胞多样性的贡献 | 单细胞中的翻译过程及其与细胞周期的关系 | 基因组学 | NA | 单细胞核糖体测序 | 机器学习 | 序列数据 | 涉及多种细胞类型，包括稀有的初级肠内分泌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Transcriptional progression during meiotic prophase I reveals sex-specific features and X chromosome dynamics in human fetal female germline
2021-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009773
PMID:34499650
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研究论文 | 本研究通过分析人类胎儿生殖细胞的单细胞转录组数据，揭示了女性减数分裂前期的转录进展及其性别特异性特征和X染色体动态变化 | 首次比较了人类卵母细胞和精母细胞在减数分裂前期的不同阶段，并揭示了性别间的保守和特异性特征 | NA | 研究人类女性减数分裂前期的转录进展及其性别特异性特征和X染色体动态变化 | 人类胎儿生殖细胞的单细胞转录组数据 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome identifies FCGR3B upregulated subtype of alveolar macrophages in patients with critical COVID-19
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103030
PMID:34458692
|
研究论文 | 本研究利用大规模单细胞转录组学分析了来自危重COVID-19患者的多种组织样本，并与健康对照组进行比较，鉴定出一种由单核细胞衍生的肺泡巨噬细胞亚型，其相关基因在危重病例的支气管肺泡灌洗液中显著上调 | 本研究首次鉴定出一种特定的单核细胞衍生的肺泡巨噬细胞亚型，可能作为COVID-19的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 揭示疾病机制中的宿主细胞异质性 | 危重COVID-19患者的肺泡巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个来自危重COVID-19患者的组织样本及健康对照组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Semicoordinated allelic-bursting shape dynamic random monoallelic expression in pregastrulation embryos
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102954
PMID:34458702
|
研究论文 | 本研究探讨了预原肠胚阶段胚胎中动态随机单等位基因表达（aRME）的普遍性和起源 | 首次展示了等位基因爆发并非完全独立，而是以半协调的方式发生，这种半协调的等位基因爆发特别是低爆发频率的基因，导致频繁的异步等位基因爆发，从而促进动态aRME | NA | 研究动态aRME在预原肠胚阶段的普遍性和起源，并探讨其在早期发育中的相关性 | 预原肠胚阶段胚胎中的动态随机单等位基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同谱系的预原肠胚阶段胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of diffuse large B cells in cerebrospinal fluid of central nervous system lymphoma
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102972
PMID:34471864
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研究论文 | 研究通过Smart-seq2单细胞RNA测序技术分析了六名中枢神经系统大B细胞淋巴瘤患者的脑脊液中大B细胞的转录组，以探索这些细胞的表型状态 | 研究发现了脑脊液中大B细胞的内在异质性，主要表现在细胞周期状态、癌睾丸抗原表达和基于单细胞生发中心B细胞特征的分类，以及16个上调基因可能与中枢神经系统大B细胞淋巴瘤向软脑膜的归巢效应有关 | NA | 探索中枢神经系统淋巴瘤软脑膜侵犯的诊断和治疗潜力 | 脑脊液中的弥漫性大B细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过一千个脑脊液中大B细胞样本，来自六名患者 | NA | NA | NA | NA |