单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 220 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals markers of disease progression in primary cutaneous T-cell lymphoma
2021-09-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01419-2
PMID:34583709
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了原发性皮肤T细胞淋巴瘤中疾病进展的标志物 | 发现了与疾病进展相关的特定生物标志物面板，这些标志物的表达变化可能解释了晚期MF临床表型的转变 | NA | 揭示原发性皮肤T细胞淋巴瘤中疾病进展的生物标志物 | 早期和晚期MF患者的皮肤样本，以及非病变MF和健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
Multi-species single-cell transcriptomic analysis of ocular compartment regulons
2021-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25968-8
PMID:34584087
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研究论文 | 本文构建了人类和小猪眼部的首个单细胞图谱，并研究了视网膜的种间差异，识别了虹膜组织中的假定成体干细胞，创建了眼部各部分疾病相关的基因图谱，并探讨了不同细胞群的调控网络。 | 首次构建了人类和小猪眼部的单细胞图谱，识别了虹膜中的假定成体干细胞，创建了眼部疾病基因图谱，并揭示了眼部细胞类型间的独特信号传导。 | NA | 研究跨物种视网膜的整合性研究，并探讨眼部不同细胞群的调控网络。 | 人类和小猪的眼部组织，特别是视网膜和虹膜。 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小猪的眼部组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Confronting false discoveries in single-cell differential expression
2021-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25960-2
PMID:34584091
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学中差异表达分析方法的性能及其对生物学重复变异的考虑 | 揭示了不同方法在考虑生物学重复变异方面的差异，并指出了广泛使用的方法在缺乏生物学差异时可能产生大量假阳性的问题 | 文章未明确提及具体的方法局限性 | 旨在阐明单细胞差异表达分析中统计方法的性能和区分原则 | 研究对象为受伤的小鼠脊髓中的差异表达基因 | 单细胞转录组学 | NA | 差异表达分析 | NA | 转录组数据 | 研究未明确提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
Integration and gene co-expression network analysis of scRNA-seq transcriptomes reveal heterogeneity and key functional genes in human spermatogenesis
2021-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-98267-3
PMID:34580317
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研究论文 | 本研究通过整合多个正常生精过程的scRNA-seq数据集，分析了超过33,000个睾丸细胞的单细胞转录组，以揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，通过加权基因共表达网络分析揭示了精子发生过程中不同阶段的关键基因，为男性不育提供了新的见解 | NA | 揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 人类精子发生过程中的睾丸细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过33,000个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Nuclei Isolation from Adult Mouse Kidney for Single-Nucleus RNA-Sequencing
2021-09-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62901
PMID:34605813
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠肾脏中分离细胞核并进行单核RNA测序的方法 | 该方法避免了传统酶解组织分离方法的局限，如需要新鲜组织、引入转录应激反应以及过度代表肾皮质细胞等问题 | NA | 旨在改进肾脏研究中单细胞转录组学的标准化方法 | 成年小鼠肾脏细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 从包含皮质、外髓和内髓的中央小鼠肾脏部分分离的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Synthesized HMGB1 peptide attenuates liver inflammation and suppresses fibrosis in mice
2021-Sep-27, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00177-4
PMID:34565478
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研究论文 | 本文评估了合成HMGB1肽对CCl诱导的肝硬化小鼠模型的治疗效果，发现其能减轻肝脏炎症并抑制纤维化 | 提出了一种新的无细胞治疗方法，使用HMGB1肽诱导抗炎巨噬细胞，用于治疗肝硬化 | 体外分析未能证实HMGB1肽对单核细胞/巨噬细胞的直接影响 | 评估HMGB1肽对肝纤维化的治疗效果 | CCl诱导的肝硬化小鼠模型 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq data and bulk gene profiles reveal a novel signature of disease progression in multiple myeloma
2021-Sep-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02190-6
PMID:34563174
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和批量基因表达谱，揭示了多发性骨髓瘤（MM）发展过程中的新型分子特征 | 本文建立了一个20基因的特征，作为MM的独立生物标志物，并成功预测了接受硼替佐米治疗患者的临床结果 | NA | 揭示多发性骨髓瘤发展的分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 597个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal DHX9 in mature B cell as a dynamic network biomarker before lymph node metastasis in CRC
2021-Sep-24, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.06.004
PMID:34553035
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成熟B细胞中的DHX9在结直肠癌（CRC）淋巴结转移前的动态网络生物标志物作用 | 首次发现DHX9在成熟B细胞中作为CRC淋巴结转移前的关键动态网络生物标志物 | NA | 开发预测性生物标志物，以检测CRC淋巴结转移前成熟B细胞的关键转变点 | 结直肠癌患者的邻近组织中的成熟B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 动态网络生物标志物（DNB）方法 | 转录组数据 | 725个来自结直肠癌的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Reconstructing and counting genomic fragments through tagmentation-based haploid phasing
2021-09-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97852-w
PMID:34556684
|
研究论文 | 本文通过基于标签化的单倍体分型技术，展示了通过新型生物信息学算法重建和计数基因组片段的概念 | 提出了一种新的生物信息学算法，用于检测基因组的离散性质，以准确确定基因拷贝数变化 | 该方法依赖于样本，调用敏感性因样本的倍性而异，并对测序数据中的噪声敏感 | 提高单细胞测序中基因拷贝数变化的准确性，以更好地追踪和理解肿瘤发生 | 癌症细胞的异质性和基因拷贝数变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Epicardial differentiation drives fibro-fatty remodeling in arrhythmogenic cardiomyopathy
2021-Sep-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf2750
PMID:34550725
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研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的心脏培养物、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和移植的人ACM心脏研究了ACM中纤维脂肪重塑的心外膜贡献 | 首次揭示了TFAP2A通过促进上皮间质转化（EMT）介导心外膜分化，从而在ACM中驱动纤维脂肪重塑的关键作用 | NA | 探讨心律失常性心肌病（ACM）中心外膜对纤维脂肪重塑的贡献及其分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞、单细胞RNA测序数据和ACM患者移植心脏 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 来自ACM患者和健康供体的人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞及ACM患者移植心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
CCR2 deficiency alters activation of microglia subsets in traumatic brain injury
2021-09-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109727
PMID:34551293
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研究论文 | 研究探讨了CCR2缺乏对创伤性脑损伤中微胶质细胞亚群激活的影响 | 使用无偏倚的单细胞RNA测序方法揭示了创伤性脑损伤和正常脑中的25种微胶质细胞、单核/巨噬细胞和树突状细胞亚群，并发现CCR2缺乏的创伤性脑损伤小鼠与野生型创伤性脑损伤小鼠相比，微胶质细胞亚群的转录谱发生改变 | NA | 定义创伤性脑损伤中微胶质细胞和巨噬细胞表型的异质性，并探索CCR2缺乏对这些细胞的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在创伤性脑损伤中的作用 | NA | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和CCR2缺乏小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
Integrative Transcriptome Profiling Reveals SKA3 as a Novel Prognostic Marker in Non-Muscle Invasive Bladder Cancer
2021-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13184673
PMID:34572901
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析，揭示了SKA3作为非肌肉浸润性膀胱癌的新型预后标志物 | 发现SKA3与非肌肉浸润性膀胱癌的病理生理和不良生存相关，并可能通过抑制其表达来降低膀胱癌进展的风险 | NA | 提高非肌肉浸润性膀胱癌患者临床结果的诊断准确性 | 非肌肉浸润性膀胱癌及其向肌肉浸润性膀胱癌的进展 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个膀胱癌患者队列的公共数据集以及人类肿瘤组织的RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulatory networks from single-cell RNA-seq temporal snapshot data requires higher-order moments
2021-Sep-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100332
PMID:34553172
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研究论文 | 本文探讨了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）时间快照数据推断基因调控网络（GRN）的方法，强调了高阶统计量的重要性 | 提出了一种基于高阶统计量的方法来推断基因调控网络，并强调了数据预处理对保留这些统计量的重要性 | 目前的数据预处理可能无法保留这些统计量，且需要计算密集型的最小化解算器 | 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 时间快照数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
2021-09-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62857
PMID:34570087
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研究论文 | 本文提供了一个全面的协议，用于准备人肠道类器官以感染肠道病原体，并考虑感染侧（顶端 vs. 基底侧）进行单细胞RNA测序，以表征细胞类型特异性的宿主/病原体相互作用。 | 本文创新地提出了在生物安全三级（BSL-3）条件下，通过考虑感染侧来准备人肠道类器官以进行单细胞RNA测序的方法。 | 本文未明确提及研究的具体限制。 | 研究肠道病原体感染的细胞类型特异性宿主/病原体相互作用。 | 人肠道类器官及其对肠道病原体感染的反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11090940
PMID:34575089
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研究论文 | 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法，用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型，并包括一组定性分类标准（生物标志物）和各种规则 | 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法，识别非小细胞肺癌的细胞标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 | 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林分类器和决策树 | 转录组数据 | 720个特征用于随机森林分类器，1880个特征用于决策树 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals distinct immune response in asymptomatic COVID-19 patients
2021-09-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00753-7
PMID:34531370
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T/B细胞受体测序，分析了无症状COVID-19患者与中度患者的免疫反应差异 | 首次揭示了无症状COVID-19患者与中度患者在免疫反应上的显著差异，包括NK细胞和干扰素-γ的上调以及TCR克隆扩增的增强 | 研究样本量较小，且仅包括外周血单个核细胞样本，可能无法全面反映所有免疫细胞的反应 | 旨在识别无症状与中度COVID-19患者之间的免疫反应差异 | 无症状、中度和重度COVID-19患者以及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序，TCR/BCR测序 | NA | 细胞 | 37份纵向收集的外周血单个核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity and immune subtypes associated with disease activity in human myasthenia gravis
2021-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00314-w
PMID:34521820
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了39,243个细胞的转录组，揭示了与疾病活动相关的人类重症肌无力中的转录异质性和免疫亚型 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了重症肌无力患者的细胞转录组，发现了与疾病活动相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于新发重症肌无力患者和健康对照，未涉及长期或慢性重症肌无力患者 | 深入理解重症肌无力发病机制中的细胞异质性 | 重症肌无力患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39,243个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory and proliferative microglia drive progression of glioblastoma
2021-09-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109718
PMID:34525361
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，全面绘制了胶质母细胞瘤中的细胞群体，并揭示了SETD2突变型胶质母细胞瘤细胞与肿瘤微环境之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了一种特定的高级别胶质瘤相关小胶质细胞（HGG-AM），并阐明了其通过TGF-β1激活后表现出促炎和增殖特征，进而促进肿瘤进展的机制。 | NA | 旨在深入理解胶质母细胞瘤微环境及其分子基础，以开发更有效的治疗策略。 | 胶质母细胞瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
ASGARD: A Single-cell Guided pipeline to Aid Repurposing of Drugs
2021-Sep-14, ArXiv
PMID:34545335
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASGARD的新型药物推荐系统，该系统利用单细胞RNA测序技术来解决细胞间异质性问题，以促进精准医学 | ASGARD通过考虑所有细胞集群来定义一种新的药物评分，以预测药物，从而解决每个患者内部的细胞间异质性问题 | NA | 开发一种新的药物再利用推荐工具，以促进个性化医学 | ASGARD系统在多种疾病中的应用，包括乳腺癌、急性淋巴细胞白血病和COVID-19 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 涉及多种疾病的患者样本，包括三阴性乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Understanding the pathogenesis of infectious diseases by single-cell RNA sequencing
2021-Sep-06, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2021.09.759
PMID:34527720
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了感染性疾病的发病机制，并讨论了该技术在研究宿主与病原体相互作用中的应用及未来治疗潜力 | 介绍了单细胞RNA测序技术在分析细胞多样性、免疫反应异质性及感染性疾病分子机制中的最新进展 | NA | 揭示感染性疾病的发病机制，并探索新的干预和治疗方法 | 细菌、病毒、真菌和寄生虫引起的感染性疾病 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |