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当前共找到 221 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute Kawasaki disease patients
2021-09-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25771-5
PMID:34521850
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了急性川崎病患者的周围血单个核细胞，并探讨了免疫反应的变化及其潜在的生物学过程。 | 首次通过单细胞RNA测序全面揭示了急性川崎病患者免疫细胞的转录组变化，特别是在单核细胞和B细胞中的差异表达基因。 | 研究样本量较小，仅包括7名急性川崎病患者和3名健康对照，可能影响结果的普遍性。 | 旨在深入理解急性川崎病的免疫反应及其治疗机制。 | 急性川崎病患者的周围血单个核细胞及其在治疗前后的变化。 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名急性川崎病患者和3名年龄匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Multipotent progenitors and hematopoietic stem cells arise independently from hemogenic endothelium in the mouse embryo
2021-09-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109675
PMID:34525376
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研究论文 | 本研究通过克隆分析和单细胞转录组学方法，证明了在小鼠胚胎早期，具有造血干细胞（HSC）潜力的稀有内皮细胞（HE）与具有多系造血潜力的更丰富的HE是不同的 | 本研究提出了一个修订的发育性造血模型，其中多能祖细胞和HSC最初从具有不同表型和转录特征的HE独立产生 | NA | 探究在小鼠胚胎发育过程中，多能祖细胞和造血干细胞是否从共同的内皮细胞（HE）产生 | 小鼠胚胎中的内皮细胞（HE）及其分化出的多能祖细胞和造血干细胞（HSC） | 血液学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
RCA2: a scalable supervised clustering algorithm that reduces batch effects in scRNA-seq data
2021-09-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab632
PMID:34320202
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RCA2的可扩展监督聚类算法，该算法能有效减少scRNA-seq数据中的批次效应 | RCA2是首个结合参考投影（提高批次效应稳健性）和基于图的聚类（提高可扩展性）的算法，并提供了一个用户友好的框架，集成了多种常用的下游分析模块 | NA | 开发一种能有效减少批次效应并适用于大规模单细胞数据集的监督聚类算法 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 基于图的聚类算法 | 转录组数据 | 涉及人类骨髓、健康PBMCs及COVID-19患者PBMCs的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Modelling the impact of decidual senescence on embryo implantation in human endometrial assembloids
2021-09-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69603
PMID:34487490
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研究论文 | 研究通过建立和表征子宫内膜集合体，探讨了基底蜕膜化对胚胎植入的影响及其潜在机制 | 首次展示了急性衰老在腺上皮中驱动多种典型植入因子的分泌，而在基质中则调节抗炎蜕膜细胞和促炎衰老蜕膜细胞的出现 | 研究主要集中在体外模型，可能与体内实际情况存在差异 | 探究蜕膜衰老对胚胎植入的影响及其潜在机制 | 子宫内膜集合体，包括腺体样类器官和初级基质细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 多个子宫内膜集合体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Single-cell genome sequencing of protozoan parasites
2021-09, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2021.05.013
PMID:34172399
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研究论文 | 本文介绍了针对寄生原生动物如疟原虫和利什曼原虫的单细胞基因组测序方法及其在理解寄生虫生物学中的应用 | 开发并定制了针对特定宿主-寄生虫系统的单细胞测序方法，能够解析复杂寄生虫群体中的遗传多样性和亲缘关系，并捕捉从头开始的遗传变异 | 大多数寄生虫基因组测序研究集中于由数百万细胞组成的批量样本，这偏向于主导基因型，掩盖了细胞间的变异和稀有变异 | 探讨单细胞测序技术在寄生原生动物基因组研究中的应用 | 寄生原生动物如疟原虫和利什曼原虫 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the ascending aortas of normal and high-fat diet-fed mice
2021-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00671-2
PMID:34548614
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了正常饮食和高脂饮食喂养的小鼠升主动脉中的细胞异质性 | 首次全面评估了高脂饮食下升主动脉的细胞异质性和细胞组成 | NA | 阐明升主动脉的细胞组成性质和范围，增进对主动脉炎症疾病发展和进展的理解 | 正常饮食和高脂饮食喂养的小鼠升主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 24,001个升主动脉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in Drosophila: Technologies and applications
2021-09, Wiley interdisciplinary reviews. Developmental biology
DOI:10.1002/wdev.396
PMID:32940008
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在果蝇中的应用及其技术方法和生物学应用 | 单细胞RNA测序技术的发展使得其在生物医学实验室中变得经济可行且实验上实用 | 讨论了当前使用单细胞RNA测序技术在果蝇中进行研究的挑战和未来机遇 | 总结近期在果蝇中进行的单细胞RNA测序研究，并探讨其技术方法和生物学应用 | 果蝇作为研究组织发育、成体细胞功能、疾病和衰老的细胞和分子机制的模型生物 | 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
ATR Inhibition Induces CDK1-SPOP Signaling and Enhances Anti-PD-L1 Cytotoxicity in Prostate Cancer
2021-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1010
PMID:34168048
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法联合使用在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的分子机制 | 发现ATR抑制剂直接抑制ATR-CHK1信号通路，激活CDK1-SPOP轴，导致PD-L1蛋白不稳定，从而增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 揭示ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法在CRPC中的相互作用机制，为临床试验提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞和模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了前列腺癌细胞系和同基因的雄激素不敏感前列腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data
2021-09-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab552
PMID:34226941
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研究论文 | 本文介绍了一种名为K2Taxonomer的新型无监督递归分区算法及其相关的R包，该算法利用集成学习在类似分类结构的层次中识别稳健的子组 | K2Taxonomer算法能够适应不同的数据范式，适用于批量和单细胞转录组学以及其他‘组学’数据的分析 | NA | 开发一种新算法以在大型生物医学项目中高效识别分子亚型 | 批量和单细胞转录组学数据 | 组学 | 乳腺癌 | 转录组学 | 集成学习 | 转录组数据 | 包括模拟数据和人类组织数据，具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Dysbalance of ACE2 levels - a possible cause for severe COVID-19 outcome in COPD
2021-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.224
PMID:33978304
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研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）患者中ACE2及其相关辅助因子的表达水平，以及这些变化如何影响SARS-CoV-2感染的风险 | 首次揭示了COPD患者肺组织中ACE2和TMPRSS2表达增加，同时循环sACE2水平降低，这些变化可能增加COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性 | 研究未涉及这些变化与肺部血流动力学变化之间的关联 | 探究COPD患者中ACE2及其相关辅助因子的表达变化及其对SARS-CoV-2感染的影响 | COPD、特发性肺动脉高压（IPAH）和肺纤维化（PF）患者的肺组织样本及健康对照组样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 定量PCR、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | COPD患者28例，IPAH患者10例，PF患者10例，健康对照组10例 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Marginating transitional B cells modulate neutrophils in the lung during inflammation and pneumonia
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210409
PMID:34313733
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现肺循环中存在八种具有独特基因调控网络的IgM+ B细胞亚群，主要由过渡型1 B和过渡型2 B（T2B）细胞主导，并揭示了T2B细胞在肺部炎症期间通过脂氧素A4（LXA4）调节中性粒细胞反应的机制。 | 首次揭示了过渡型IgM+ B细胞在肺部炎症中的调节作用，特别是T2B细胞通过CD49e、CXCL13和CXCR5在肺毛细血管中边缘化，并通过脂氧素A4（LXA4）减轻过度中性粒细胞炎症。 | NA | 研究肺部炎症和肺炎期间过渡型B细胞对中性粒细胞的调节作用。 | 过渡型IgM+ B细胞及其在肺部炎症中的作用机制。 | 免疫学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个IgM+ B细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
Evaluation of some aspects in supervised cell type identification for single-cell RNA-seq: classifier, feature selection, and reference construction
2021-09-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02480-2
PMID:34503564
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研究论文 | 本文系统评估了监督式细胞类型识别方法中的关键因素，包括特征选择、分类器选择和参考数据集构建 | 提出了使用多层感知器（MLP）作为分类器和F检验作为特征选择方法的建议，并建议合并所有可用数据集来构建参考数据集 | NA | 评估监督式细胞类型识别方法中的关键策略 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多层感知器（MLP） | RNA序列数据 | 涉及多个真实数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome of early hematopoiesis guides arterial endothelial-enhanced functional T cell generation from human PSCs
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi9787
PMID:34516916
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了人类多能干细胞（hPSCs）向血液细胞分化的过程中细胞命运选择和基因表达模式，并发现通过在体外定向分化过程中应用低氧条件，可以有效促进具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞（HPCs）的生成。 | 本研究首次展示了通过低氧条件在体外定向分化过程中促进动脉特异性程序的发展，从而生成具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞。 | NA | 研究旨在深入理解人类造血起源，并指导体外生成功能性T细胞以应用于临床。 | 人类多能干细胞（hPSCs）的造血分化过程及其生成的血液细胞的功能性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
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研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发，该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂，能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应，确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Targeting epigenetic modifiers to reprogramme macrophages in non-resolving inflammation-driven atherosclerosis
2021-Sep, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeab022
PMID:35919269
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综述 | 本文综述了表观遗传修饰在非消退性炎症驱动下的动脉粥样硬化中重编程巨噬细胞的作用 | 探讨了表观遗传修饰在动脉粥样硬化和相关炎症中的作用，并提出了针对这些修饰的潜在抗炎治疗策略 | 对表观遗传修饰在动脉粥样硬化中的研究仍处于初级阶段 | 探讨表观遗传修饰在动脉粥样硬化发病和进展中非控制性炎症的机制 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其表观遗传修饰 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Cortical overgrowth in a preclinical forebrain organoid model of CNTNAP2-associated autism spectrum disorder
2021-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24358-4
PMID:34471112
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研究论文 | 本研究利用从患有综合征型自闭症谱系障碍（ASD）的患者诱导多能干细胞生成的前脑类器官，研究了CNTNAP2基因突变对胚胎期皮层发育的影响 | 首次使用前脑类器官模型研究CNTNAP2突变对ASD的影响，并成功利用CRISPR-Cas9技术纠正突变以恢复类器官的生长表型 | NA | 研究CNTNAP2基因突变对自闭症谱系障碍患者胚胎期皮层发育的影响 | 前脑类器官及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从患有CNTNAP2基因突变的ASD患者中获取的诱导多能干细胞生成的前脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Interrogating RNA and protein spatial subcellular distribution in smFISH data with DypFISH
2021-09-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100068
PMID:35474672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DypFISH的方法，用于定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | DypFISH结合了单分子RNA荧光杂交（smFISH）数据和蛋白质免疫标记，能够研究分子聚集模式、mRNA-蛋白质亚细胞定位与微管组织中心方向的关系以及mRNA-蛋白质空间分布的相互依赖性 | NA | 定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | RNA和蛋白质的亚细胞定位 | 分子生物学 | NA | smFISH | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Non-parametric Vignetting Correction for Sparse Spatial Transcriptomics Images
2021 Sep-Oct, Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention
DOI:10.1007/978-3-030-87237-3_45
PMID:35274110
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研究论文 | 本文介绍了一种新颖的非参数渐晕校正工具，用于空间转录组图像，通过高效的迭代切片直方图归一化程序估计光照场和背景 | 提出了一种非参数渐晕校正方法，该方法在光照和背景场估计方面优于现有技术，并且需要更少的输入图像进行充分估计 | NA | 开发一种新的渐晕校正工具，以提高空间转录组图像的分析质量 | 空间转录组图像中的渐晕效应 | 数字病理学 | NA | 迭代切片直方图归一化 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Landscape of Cell Communication in Human Dental Pulp
2021-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100747
PMID:34928049
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙髓中的细胞群体及其相互通信情况 | 首次详细描绘了人类牙髓中细胞间的通信网络 | NA | 揭示人类牙髓中细胞群体的相互作用及其通信机制 | 人类牙髓中的干细胞、牙髓细胞、T细胞、巨噬细胞、内皮细胞和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Gene regulatory network analysis identifies key genes and regulatory mechanisms involved in acute myocardial infarction using bulk and single cell RNA-seq data
2021-09-09, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021386
PMID:34814275
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据分析基因调控网络，识别急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 本研究首次结合批量和单细胞RNA测序数据构建基因调控网络和细胞间通信网络，揭示了PLAUR在心肌细胞响应缺氧中的重要作用 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平或其他生物标志物的验证 | 识别急性心肌梗死的分子生物标志物，为诊断和预后提供候选关键调控基因 | 急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 基因调控网络 | RNA测序数据 | STEMI和NSTEMI患者的全血样本 | NA | NA | NA | NA |