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当前共找到 220 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2024-08-07 |
Evaluation of some aspects in supervised cell type identification for single-cell RNA-seq: classifier, feature selection, and reference construction
2021-09-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02480-2
PMID:34503564
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研究论文 | 本文系统评估了监督式细胞类型识别方法中的关键因素，包括特征选择、分类器选择和参考数据集构建 | 提出了使用多层感知器（MLP）作为分类器和F检验作为特征选择方法的建议，并建议合并所有可用数据集来构建参考数据集 | NA | 评估监督式细胞类型识别方法中的关键策略 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多层感知器（MLP） | RNA序列数据 | 涉及多个真实数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome of early hematopoiesis guides arterial endothelial-enhanced functional T cell generation from human PSCs
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi9787
PMID:34516916
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了人类多能干细胞（hPSCs）向血液细胞分化的过程中细胞命运选择和基因表达模式，并发现通过在体外定向分化过程中应用低氧条件，可以有效促进具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞（HPCs）的生成。 | 本研究首次展示了通过低氧条件在体外定向分化过程中促进动脉特异性程序的发展，从而生成具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞。 | NA | 研究旨在深入理解人类造血起源，并指导体外生成功能性T细胞以应用于临床。 | 人类多能干细胞（hPSCs）的造血分化过程及其生成的血液细胞的功能性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
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研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发，该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂，能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应，确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Targeting epigenetic modifiers to reprogramme macrophages in non-resolving inflammation-driven atherosclerosis
2021-Sep, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeab022
PMID:35919269
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综述 | 本文综述了表观遗传修饰在非消退性炎症驱动下的动脉粥样硬化中重编程巨噬细胞的作用 | 探讨了表观遗传修饰在动脉粥样硬化和相关炎症中的作用，并提出了针对这些修饰的潜在抗炎治疗策略 | 对表观遗传修饰在动脉粥样硬化中的研究仍处于初级阶段 | 探讨表观遗传修饰在动脉粥样硬化发病和进展中非控制性炎症的机制 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其表观遗传修饰 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Th1 polarization defines the synovial fluid T cell compartment in oligoarticular juvenile idiopathic arthritis
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149185
PMID:34403374
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、bulk RNA-Seq、单细胞RNA-Seq（scRNA-Seq）、DNA甲基化研究和Treg抑制试验，对寡关节炎性幼年特发性关节炎（oligo JIA）中的滑液T细胞进行了免疫表型分析 | 发现oligo JIA中滑液T细胞表现出Th1偏倚，包括Tregs，并且这些Th1样Tregs保持了Treg特异性甲基化模式和抑制功能 | NA | 旨在理解oligo JIA中的免疫反应 | oligo JIA中的滑液T细胞 | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 流式细胞术, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, DNA甲基化研究 | NA | 细胞, 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Cortical overgrowth in a preclinical forebrain organoid model of CNTNAP2-associated autism spectrum disorder
2021-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24358-4
PMID:34471112
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研究论文 | 本研究利用从患有综合征型自闭症谱系障碍（ASD）的患者诱导多能干细胞生成的前脑类器官，研究了CNTNAP2基因突变对胚胎期皮层发育的影响 | 首次使用前脑类器官模型研究CNTNAP2突变对ASD的影响，并成功利用CRISPR-Cas9技术纠正突变以恢复类器官的生长表型 | NA | 研究CNTNAP2基因突变对自闭症谱系障碍患者胚胎期皮层发育的影响 | 前脑类器官及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从患有CNTNAP2基因突变的ASD患者中获取的诱导多能干细胞生成的前脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-08 |
Interrogating RNA and protein spatial subcellular distribution in smFISH data with DypFISH
2021-09-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100068
PMID:35474672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DypFISH的方法，用于定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | DypFISH结合了单分子RNA荧光杂交（smFISH）数据和蛋白质免疫标记，能够研究分子聚集模式、mRNA-蛋白质亚细胞定位与微管组织中心方向的关系以及mRNA-蛋白质空间分布的相互依赖性 | NA | 定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | RNA和蛋白质的亚细胞定位 | 分子生物学 | NA | smFISH | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-08 |
Non-parametric Vignetting Correction for Sparse Spatial Transcriptomics Images
2021 Sep-Oct, Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention
DOI:10.1007/978-3-030-87237-3_45
PMID:35274110
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研究论文 | 本文介绍了一种新颖的非参数渐晕校正工具，用于空间转录组图像，通过高效的迭代切片直方图归一化程序估计光照场和背景 | 提出了一种非参数渐晕校正方法，该方法在光照和背景场估计方面优于现有技术，并且需要更少的输入图像进行充分估计 | NA | 开发一种新的渐晕校正工具，以提高空间转录组图像的分析质量 | 空间转录组图像中的渐晕效应 | 数字病理学 | NA | 迭代切片直方图归一化 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-08 |
Landscape of Cell Communication in Human Dental Pulp
2021-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100747
PMID:34928049
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙髓中的细胞群体及其相互通信情况 | 首次详细描绘了人类牙髓中细胞间的通信网络 | NA | 揭示人类牙髓中细胞群体的相互作用及其通信机制 | 人类牙髓中的干细胞、牙髓细胞、T细胞、巨噬细胞、内皮细胞和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-08 |
Gene regulatory network analysis identifies key genes and regulatory mechanisms involved in acute myocardial infarction using bulk and single cell RNA-seq data
2021-09-09, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021386
PMID:34814275
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据分析基因调控网络，识别急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 本研究首次结合批量和单细胞RNA测序数据构建基因调控网络和细胞间通信网络，揭示了PLAUR在心肌细胞响应缺氧中的重要作用 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平或其他生物标志物的验证 | 识别急性心肌梗死的分子生物标志物，为诊断和预后提供候选关键调控基因 | 急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 基因调控网络 | RNA测序数据 | STEMI和NSTEMI患者的全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Discovery and construction of prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on single-cell and bulk transcriptome analysis
2021-Sep, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-581
PMID:34733651
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量转录组分析，发现并构建了透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 本研究整合了单细胞和批量转录组数据，发现了两种具有不同生物学特性的透明细胞肾细胞癌亚型及两个潜在的生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | NA | 发现透明细胞肾细胞癌的新生物标志物并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 5,933个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
Identification of the distinctive role of DPT in dilated cardiomyopathy: a study based on bulk and single-cell transcriptomic analysis
2021-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2913
PMID:34733953
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，识别了DPT在扩张型心肌病中的独特作用 | 首次揭示了DPT在扩张型心肌病中的关键作用，并提出了DPT+成纤维细胞作为心脏重塑过程的新调节因子 | NA | 旨在通过批量和单细胞转录组分析，寻找扩张型心肌病中的潜在关键基因和调节因子 | 扩张型心肌病中的关键基因和调节因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | LASSO回归, SVM-RFE, PPI网络 | 转录组数据 | 使用了三个微阵列数据集（GSE57338, GSE42955, GSE79962）和一个验证数据集（GSE116250），以及两个单细胞RNA测序数据集（GSE109816和GSE121893） | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
Improved SNV Discovery in Barcode-Stratified scRNA-seq Alignments
2021-09-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12101558
PMID:34680953
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研究论文 | 本文评估了从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现单核苷酸变异（SNV）的信息增益 | 通过在单细胞水平上对齐数据进行变异调用，识别的SNV数量至少是池化scRNA-seq的两倍，且这些SNV富含新的变异和终止密码子及错义替代 | NA | 评估从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现SNV的信息增益 | MCF7细胞系在抗癌治疗期间的数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 公开可用的MCF7细胞系数据 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Tutorial: Guidelines for Single-Cell RT-qPCR
2021-09-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10102607
PMID:34685587
|
教程 | 本文提供单细胞反转录定量PCR（scRT-qPCR）方法的全面总结，包括单细胞收集方法的局限性、反转录的重要性、预扩增和引物设计的建议，以及数据处理步骤的总结 | scRT-qPCR方法适用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）实验前的有效筛选或高吞吐量方法假设的验证 | 讨论了单细胞收集方法的局限性 | 提供scRT-qPCR方法的全面指南，使任何研究人员都能进行高标准的scRT-qPCR测量 | 单细胞基因表达分析 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
Combining Multiple RNA-Seq Data Analysis Algorithms Using Machine Learning Improves Differential Isoform Expression Analysis
2021-Sep-27, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps4040068
PMID:34698224
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研究论文 | 本文开发了一种结合多种RNA测序数据分析算法的新方法，利用机器学习技术提高差异性剪接表达分析的准确性 | 提出了一种新的综合方法，通过机器学习技术整合多种算法，以提高差异性剪接表达分析的性能 | NA | 旨在提高RNA测序数据中差异性剪接表达分析的准确性 | RNA测序数据中的差异性剪接表达 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 机器学习 | RNA测序数据 | 基于多种生物的模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Cell-Cell Communication Networks in Tissue: Toward Quantitatively Linking Structure with Function
2021-Sep, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2021.05.002
PMID:34693081
|
综述 | 本文综述了利用前沿技术如多重组织成像、活体显微镜和单细胞RNA测序等，量化细胞类型丰度、共定位及受体和配体全局水平的方法，并探讨了构建计算模型以更全面理解细胞间通信网络动态运作的重要性 | 强调了将高级统计方法与低级物理化学机制结合的潜在价值 | 目前仍难以将这些量化数据转化为对细胞间通信网络动态运作的更全面理解 | 旨在通过构建计算模型，更全面地理解细胞间通信网络的功能 | 细胞间通信网络在组织中的动态运作 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Circulating Tumor Cell Neoplastic Subpopulations Outlined by Single-Cell Transcriptomics
2021-Sep-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194885
PMID:34638368
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法分析了转移性乳腺癌患者循环肿瘤细胞（CTCs）的异质性 | 本研究首次通过单细胞转录组学方法识别了CTCs中的多种免疫细胞群和具有独特基因表达特征的细胞群 | 研究仅涉及三名转移性乳腺癌患者，样本量较小 | 揭示循环肿瘤细胞的异质性和转移倾向，以改进治疗策略 | 转移性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三名转移性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Clinical Significance of Circulating Tumor Cell Induced Epithelial-Mesenchymal Transition in Patients with Metastatic Colorectal Cancer by Single-Cell RNA-Sequencing
2021-Sep-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194862
PMID:34638346
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨循环肿瘤细胞（CTCs）在转移性结直肠癌（mCRC）患者中的表型特征及其临床意义 | 首次在单细胞水平上使用RNA测序技术对mCRC中的CTCs进行表征，并探讨了EMT相关基因表达的CTCs的预后价值 | 研究样本量较小，仅涉及27名mCRC患者 | 验证通过单细胞RNA测序技术检测和分离单个CTCs的能力，并识别其在单个CTC水平上的临床意义 | 转移性结直肠癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 27名转移性结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Complex Organ Construction from Human Pluripotent Stem Cells for Biological Research and Disease Modeling with New Emerging Techniques
2021-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms221910184
PMID:34638524
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综述 | 本文综述了利用人多能干细胞（hPSCs）构建复杂器官及其在疾病模型和药物发现中的应用 | 介绍了新兴技术如三维类器官、生物工程和器官芯片技术在构建多细胞组织和功能器官中的应用，以及单细胞转录组学、空间转录组学和人工智能在分析复杂组织中的作用 | 文章未明确提及具体的研究局限 | 探讨利用hPSCs构建复杂器官及其在生物研究和疾病模型中的应用前景 | 人多能干细胞（hPSCs）及其衍生的复杂器官 | 生物工程 | NA | 三维类器官技术、器官芯片技术、单细胞转录组学、空间转录组学、人工智能 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq unravels alterations of the human spermatogonial stem cell compartment in patients with impaired spermatogenesis
2021-09-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100395
PMID:34622232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了在精子发生受损的患者中，人类精原干细胞隔室的改变 | 发现了精原干细胞隔室中的主要改变，包括最未分化精原细胞数量的增加和转录因子表达的改变 | NA | 探索正常和受损精子发生中人类生殖细胞功能的调控机制 | 人类精原干细胞隔室在精子发生受损患者中的改变 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 超过30,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |