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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
|
研究论文 | 本研究揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下调节心肌细胞适应性生长的关键机制 | 首次证明特定心脏驻留巨噬细胞亚群通过产生IGF-1直接调控心肌细胞的适应性生长,而非传统认为的免疫细胞仅参与炎症反应 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 | 探究免疫细胞在高血压引起的心脏适应性生长过程中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞命运示踪, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常血压和高血压动物模型,人类心肌病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
|
研究论文 | 开发了一种名为MRtree的算法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞类型层次结构 | 提出了一种高度灵活的树构建算法,能够从多个分辨率的平面聚类结果生成聚类层次结构 | 需要依赖现有的平面聚类算法,可能受到这些算法固有局限性的影响 | 解决单细胞RNA测序数据分析中分辨率参数选择困难和细胞簇演化特征难以比较的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树构建算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
EZH2 identifies the precursors of human natural killer cells with trained immunity
2021-Sep-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了具有训练免疫能力的人类自然杀伤细胞前体,并发现EZH2是其关键表观遗传标志物 | 首次使用单细胞RNA测序结合TotalSeq™技术追踪训练免疫诱导过程中NK细胞的异质性,识别出CD57-NKG2A+EZH2+IFNG+MKI67+IL12R+IL15R+IL18R+ NK细胞独特亚群作为训练免疫前体 | 传统发育标记无法识别训练免疫前体细胞,需要依赖更先进的单细胞测序技术 | 识别产生训练免疫的人类NK细胞亚群,探索药物干预的潜在调控靶点 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, TotalSeq™技术, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胰岛α和β细胞中转录因子组合表达模式,预测高功能成熟细胞亚群 | 首次基于组合转录因子表达谱对人类胰岛细胞进行分层,发现ARX/MAFB(α细胞)和MAFA/MAFB(β细胞)共表达亚群具有更强的葡萄糖感知和激素分泌功能 | 研究仅限于正常人类胰岛细胞,未涉及糖尿病病理状态下的变化 | 定义胰岛细胞中转录因子异质性及其对细胞功能的影响 | 人类胰岛α和β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, Patch-Seq | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 超过40,000个正常人类胰岛细胞,来自多个供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型在免疫机制上的本质差异 | 首次系统阐明FIRS I型和II型在分子水平上的免疫特征差异,发现I型主要由先天免疫驱动,II型则类似于半同种异体移植排斥反应 | 样本量有限且为早产儿,产后诊断困难可能影响样本准确性 | 探究胎儿炎症反应综合征I型和II型的分子基础和免疫机制差异 | 诊断为FIRS I型或II型的早产儿脐带血样本 | 生物医学 | 胎儿炎症反应综合征 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早产儿脐带血样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.06.065
PMID:34217973
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸脱氢酶A亚型在人类胰岛α细胞中的特异性表达及其在2型糖尿病中的上调现象 | 首次系统证实LDHA主要定位于人类胰岛α细胞而非β细胞,并在2型糖尿病条件下发生特异性上调 | 研究主要基于体外实验和病理样本观察,缺乏在体功能验证 | 探究LDHA在人类胰岛细胞中的表达特征及其在2型糖尿病病理过程中的作用 | 人类胰岛细胞(重点关注α细胞和β细胞)及2型糖尿病患者胰腺组织 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫标记,显微镜分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,代谢产物数据 | 公共单细胞RNA-seq数据库,慢性高糖处理的人类胰岛,2型糖尿病患者尸检胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
A harmonized atlas of mouse spinal cord cell types and their spatial organization
2021-09-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25125-1
PMID:34588430
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据构建了小鼠脊髓细胞类型的统一图谱,揭示了细胞类型的层次结构和空间分布 | 首次将多个小鼠脊髓单细胞数据集整合到统一参考框架中,开发了细胞类型分类器SeqSeek,验证了神经元细胞类型的组合标记代码和空间分布 | 研究主要基于已发表的单细胞数据集,可能受限于原始数据的技术差异和覆盖范围 | 构建统一的小鼠脊髓细胞类型图谱并解析其分子组织和空间结构 | 小鼠脊髓细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表数据集的整合 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Morphological Features Extracted by AI Associated with Spatial Transcriptomics in Prostate Cancer
2021-Sep-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194837
PMID:34638322
|
研究论文 | 开发了一种结合人工智能和空间转录组学分析前列腺癌形态学特征与分子模式关联的新方法 | 首次将预训练卷积神经网络集成应用于H&E图像形态特征提取,并与空间转录组学数据建立关联分析的工作流程 | 仅基于7个前列腺切除切片样本,样本量有限 | 探索前列腺癌形态学变化与分子模式之间的关联 | 多灶性前列腺癌患者的H&E染色切片 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学,H&E染色 | CNN,集成学习 | 图像,基因表达数据 | 7个前列腺切除切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
2021-Sep-27, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-021-00180-3
PMID:34579780
|
综述 | 本文概述了海洋多毛类动物Platynereis dumerilii作为模式生物的研究现状和应用领域 | 揭示了Nereid幼体在全身体积电子显微镜和单细胞测序方面的独特优势,能够追踪所有神经元并构建多模式细胞图谱 | NA | 促进对Platynereis这一独特模式生物的兴趣并扩大研究社区 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii | 发育生物学 | NA | 全身体积电子显微镜,单细胞测序 | NA | 电子显微镜图像,基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Antibiotic-induced disturbances of the gut microbiota result in accelerated breast tumor growth
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103012
PMID:34522855
|
研究论文 | 本研究揭示抗生素扰乱肠道微生物群会通过增加肿瘤基质中肥大细胞数量而加速乳腺癌进展 | 首次发现乳腺癌与肠道微生物群的相互作用机制不同于其他癌症,并鉴定出特定细菌和肥大细胞在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究肠道微生物群对乳腺癌进展的影响机制 | 乳腺癌小鼠模型 | 肿瘤微生物组学 | 乳腺癌 | 宏基因组学, 单细胞转录组学, 组织学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 组织图像 | 多个乳腺癌小鼠模型 | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Current approaches to fate mapping and lineage tracing using image data
2021-09-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.198994
PMID:34498046
|
综述 | 本文综述了利用图像数据进行细胞谱系追踪和命运映射的当前方法 | 整合了光学显微镜、标记策略和计算方法的最新进展,结合基因组学和单细胞转录组学的新技术 | NA | 探讨发育生物学中细胞谱系追踪的方法和应用 | 发育胚胎中的细胞谱系 | 计算机视觉 | NA | 活体成像、基因组学、单细胞转录组学 | NA | 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Limited access to antigen drives generation of early B cell memory while restraining the plasmablast response
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.017
PMID:34525339
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究早期B细胞对T细胞依赖性抗原的应答机制 | 揭示了抗原可及性在调控早期B细胞记忆生成和浆母细胞应答中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,灵长类数据有限 | 探究早期B细胞活化过程中的细胞命运决定机制 | 小鼠和灵长类的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
The Warburg effect is necessary to promote glycosylation in the blastema during zebrafish tail regeneration
2021-Sep-13, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-021-00163-x
PMID:34518542
|
研究论文 | 本研究揭示斑马鱼尾部再生过程中Warburg效应通过促进糖基化作用对再生芽形成的关键作用 | 首次证明代谢重编程通过特异性为氨基己糖生物合成途径提供葡萄糖来支持再生芽形成 | 研究基于斑马鱼幼虫模型,在成年动物或其他物种中的适用性需要进一步验证 | 探究代谢重编程在组织再生过程中的作用机制 | 斑马鱼幼虫尾部再生模型 | 发育生物学 | 组织损伤与再生 | 单细胞RNA测序,遗传消融 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Single cell analysis of M. tuberculosis phenotype and macrophage lineages in the infected lung
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210615
PMID:34292313
|
研究论文 | 开发了一种结合细菌适应性荧光报告株与单细胞RNA测序的新方法,用于同时分析宿主转录组、表面标志物表达和细菌表型 | 首次将细菌荧光报告株与scRNA-seq结合,实现感染细胞中宿主和病原体信息的同步获取 | 方法主要针对结核分枝杆菌感染,对其他病原体的适用性需要进一步验证 | 解析结核分枝杆菌感染肺组织中巨噬细胞的功能异质性 | 小鼠和人类肺泡巨噬细胞(AMs)和间质巨噬细胞(IMs) | 单细胞生物学 | 结核病 | scRNA-seq, 荧光报告系统 | NA | 单细胞转录组数据, 表面标志物表达数据, 细菌表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Rare variants in the endocytic pathway are associated with Alzheimer's disease, its related phenotypes, and functional consequences
2021-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009772
PMID:34516545
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序数据分析,揭示了内吞通路中罕见变异与阿尔茨海默病风险及进展的关联 | 首次系统研究内吞通路中罕见变异对阿尔茨海默病的贡献,并在独立数据集中成功验证 | 研究样本主要来自欧洲裔人群,可能存在人群特异性限制 | 探究内吞通路中罕见变异对阿尔茨海默病及其相关表型的影响 | 阿尔茨海默病患者和正常对照人群 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序,RNA-Seq,单细胞RNA-Seq | 罕见变异基因集负荷分析 | 基因组数据,转录组数据 | 3000多名欧洲裔个体(WGS),600多份脑组织(bulk RNA-Seq),48份死后脑样本(scRNA-Seq) | NA | 全基因组测序,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Pulmonary Aerosol Delivery of Let-7b microRNA Confers a Striking Inhibitory Effect on Lung Carcinogenesis through Targeting the Tumor Immune Microenvironment
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202100629
PMID:34236760
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研究论文 | 本研究通过气溶胶递送let-7b microRNA抑制肺癌发生,并揭示其通过调节肿瘤免疫微环境发挥作用的机制 | 首次采用气溶胶递送let-7b microRNA进行肺癌预防,并发现其通过下调PD-L1和PD-1表达增强抗肿瘤免疫的新机制 | 未明确说明研究样本量及具体实验模型细节 | 评估气溶胶递送let-7b miRNA在肺癌预防中的效果及作用机制 | B[a]P诱导的肺腺瘤模型及肿瘤浸润T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression
2021-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00913-z
PMID:34475573
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研究论文 | 通过大规模cis-和trans-eQTL分析鉴定调控血液基因表达的数千个遗传位点和多基因评分 | 在31,684名个体中进行了大规模cis-和trans-eQTL分析,建立了大型eQTL资源库,并通过单细胞RNA-seq数据优先识别细胞内trans-eQTL | 远端trans-eQTL的重复率较低,部分原因是重复能力不足和细胞类型组成的混杂影响 | 研究基因表达的遗传调控机制及其与复杂表型的关系 | 血液来源的基因表达数据 | 基因组学 | NA | 表达数量性状位点分析,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 31,684名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Cells of the human intestinal tract mapped across space and time
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03852-1
PMID:34497389
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类肠道细胞在发育和不同年龄阶段的时空图谱 | 首次在人类肠道中发现转录独特的BEST4上皮细胞,揭示肠道簇细胞的IgG感知功能,并识别驱动次级淋巴组织形成的关键细胞 | 样本来源仅限于特定解剖区域(发育期5个区域,健康儿童和成人11个区域) | 全面绘制人类肠道细胞谱系及其在发育、稳态和疾病中的变化 | 人类肠道发育期、儿童期和成年期的近50万个细胞 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠病、赫希施普龙病 | 单细胞RNA测序、抗原受体分析 | 系统生物学方法 | 单细胞转录组数据 | 近50万个细胞,来自发育期最多5个解剖区域和健康期最多11个解剖区域 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Temporal multi-omics identifies LRG1 as a vascular niche instructor of metastasis
2021-Sep, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe6805
PMID:34516824
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研究论文 | 本研究通过时序多组学分析发现LRG1是转移前血管微环境的关键调控因子 | 首次系统描绘早期原发性肿瘤诱导的血管变化图谱,并鉴定LRG1作为转移治疗新靶点 | 主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步研究 | 探索肿瘤转移过程中血管微环境的分子调控机制 | 肺转移模型中的内皮细胞和血清蛋白 | 多组学分析 | 癌症转移 | 单细胞转录组测序, bulk转录组测序, 血清蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 肺转移手术模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Hepatitis B virus compartmentalization and single-cell differentiation in hepatocellular carcinoma
2021-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101036
PMID:34290079
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究乙型肝炎病毒在肝细胞癌中的区室化和单细胞分化特征 | 首次在单细胞水平揭示HBV读段与癌细胞分化的显著相关性,发现病毒诱导的E2F和MYC靶标以及脂肪生成等新的致癌通路 | 对HBV致癌分子机制的理解仍不完全 | 研究HBV-HCC宿主细胞相互作用机制 | 患者来源的肝细胞癌组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 计算分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 两种互补的单细胞RNA测序方案 |