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当前共找到 221 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
Hedgehog interacting protein-expressing lung fibroblasts suppress lymphocytic inflammation in mice
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.144575
PMID:34375314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HHIP基因表达肺成纤维细胞在COPD中抑制淋巴细胞炎症的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示HHIP基因在肺成纤维细胞亚群中调控CD8+ T细胞炎症反应的具体机制 | 研究基于小鼠模型，其与人类COPD的异同需进一步验证 | 探究HHIP基因在慢性阻塞性肺疾病炎症中的作用机制 | Hhip+/-小鼠和Hhip+/+小鼠的肺组织及肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄小鼠的完整肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2026-07-07 |
RNA-binding protein ELAVL2 plays post-transcriptional roles in the regulation of spermatogonia proliferation and apoptosis
2021-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13098
PMID:34296486
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研究论文 | 识别保守且富集于精原干细胞的RNA结合蛋白ELAVL2，并验证其在精原细胞增殖和凋亡中的转录后调控功能 | 首次从单细胞测序数据中鉴定出保守且富集于精原干细胞的RNA结合蛋白ELAVL2，并揭示其通过激活ERK和AKT通路促进增殖、抑制凋亡的转录后调控机制 | NA | 阐明RNA结合蛋白ELAVL2在精原干细胞增殖和凋亡中的功能及分子机制 | 人类和小鼠睾丸组织、C18-4和TCam-2细胞系 | 机器学习 | 非梗阻性无精子症 | 单细胞测序、RNA免疫沉淀测序、免疫沉淀-质谱分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-06-19 |
Th1 polarization defines the synovial fluid T cell compartment in oligoarticular juvenile idiopathic arthritis
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149185
PMID:34403374
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研究论文 | 通过免疫表型分析、转录组测序和表观遗传学方法，揭示少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞以Th1极化为特征，而Th17细胞并未富集 | 首次在单细胞水平揭示少关节型JIA滑液中Th1极化涵盖Treg细胞，且这些Th1样Treg仍保持调节功能和表观遗传特征，挑战了传统认为Treg在炎症环境中功能不稳定的观点 | 未提及具体限制 | 阐明少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞免疫应答的特征 | 少关节型幼年特发性关节炎患者的滑液T细胞（CD4+、CD8+、γδ T细胞及Treg细胞） | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析、Treg抑制实验 | NA | RNA测序数据、甲基化数据、流式细胞术数据 | 未明确说明样本量（涉及少关节型JIA患者滑液样本） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-06-19 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 探讨IFN-γ在巨噬细胞活化综合征肺泡巨噬细胞介导的肺部炎症中的关键作用 | 首次在TLR9小鼠模型中明确IFN-γ驱动MAS相关肺部炎症的机制，并发现复发MAS可重置肺泡巨噬细胞极化状态 | 基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类SJIA-LD的复杂性 | 阐明MAS模型中肺部炎症的免疫病理机制 | TLR9小鼠MAS模型中的肺部炎症和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 巨噬细胞活化综合征、全身性幼年特发性关节炎相关肺病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-06-18 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
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研究论文 | 该研究在Setd2基因敲除的小鼠急性髓系白血病模型中鉴定出两种具有不同转录组和耐药特性的白血病起始细胞亚群 | 首次在Setd2敲除AML模型中揭示了共存白血病起始细胞在转录组和化疗响应方面的异质性，并发现RAS通路激活与阿霉素耐药性相关 | 研究仅基于单一小鼠模型（Setd2-/-），未在人类AML样本中验证，且未深入探讨两种LIC亚群之间的相互作用机制 | 阐明白血病起始细胞在同一个体中的功能异质性，特别是药物响应的差异 | Setd2基因敲除小鼠急性髓系白血病模型中的白血病起始细胞（LICs） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA-seq,全基因组测序,流式细胞术 | NA | 转录组数据（bulk和单细胞）,基因组数据（全基因组测序） | 原代Setd2-/- AML小鼠脾细胞移植到C57BL/6受体小鼠，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-04-25 |
CD16+CD163+ monocytes traffic to sites of inflammation during necrotizing enterocolitis in premature infants
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200344
PMID:34269788
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研究论文 | 利用悬浮和成像质谱流式技术结合单细胞RNA测序，揭示了早产儿坏死性小肠结肠炎（NEC）中CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞从外周向炎症部位迁移的机制 | 首次鉴定出与NEC相关的CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞新亚型，并证明其从外周循环向肠道炎症组织迁移，为手术性NEC的生物标志物和治疗靶点开发提供新方向 | 未明确说明，但可能包括样本量有限及功能验证需进一步动物实验支持 | 阐明早产儿坏死性小肠结肠炎中炎症相关免疫细胞的亚型及迁移机制 | 早产儿坏死性小肠结肠炎患者的肠道黏膜组织和外周血中的免疫细胞（中性粒细胞、单核细胞/巨噬细胞） | 数字病理学 | 早产儿坏死性小肠结肠炎 | 悬浮质谱流式技术、成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式细胞图像数据 | NA（未明确说明患者数量） | NA | 单细胞RNA测序、质谱流式技术 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-11 |
APOΕ4 lowers energy expenditure in females and impairs glucose oxidation by increasing flux through aerobic glycolysis
2021-09-06, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00483-y
PMID:34488832
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了APOE4等位基因在年轻女性中降低能量消耗并损害葡萄糖氧化的机制，与阿尔茨海默病相关的脑葡萄糖代谢减退有关 | 首次结合单细胞RNA测序和稳定同位素解析代谢组学，在星形胶质细胞、脑组织、小鼠和人类中系统定义了APOE4相关的代谢重编程，并发现年轻女性携带者中明显的能量消耗降低 | 研究主要关注年轻女性亚组，样本量可能有限，且机制在男性或其他年龄组中的普适性需进一步验证 | 探究APOE4等位基因如何影响脑葡萄糖代谢及全身能量代谢，以阐明阿尔茨海默病早期代谢变化的机制 | 表达人类APOE的转基因小鼠、年轻及中年人类参与者（包括APOE4携带者和非携带者） | 代谢组学与神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、稳定同位素解析代谢组学（SIRM）、间接热量测定 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、生理测量数据 | 小鼠脑组织及星形胶质细胞、人类参与者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-04-10 |
Deep learning of gene relationships from single cell time-course expression data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab142
PMID:33876191
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的模型，用于从单细胞时间序列表达数据中预测基因间的相互作用 | 提出了一种新颖的单细胞RNA-Seq表达数据编码方法，并利用3D张量表示结合卷积和循环神经网络进行时间序列深度学习，以准确识别基因间的因果和调控关系 | 未明确提及具体的数据集大小或模型泛化能力的详细限制 | 从单细胞时间序列基因表达数据中推断基因间的调控和信号关系 | 基因间的相互作用，包括因果和调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-Seq | CNN, LSTM | 基因表达数据 | 在五个不同的时间序列单细胞RNA-Seq数据集上进行了测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-02-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程，重构了细胞周期进展和发育群体感应 | 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子，并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 | 研究基于体外诱导分化模型，可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 | 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei） | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 8,599个寄生虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-02-13 |
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology
IF:2.1Q2
DOI:10.1017/S003118202100041X
PMID:33678213
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用，包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 | 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力，并提供了实验设计和数据分析的实用指导 | 主要基于现有文献综述，缺乏原创实验数据，且技术应用仍处于早期阶段 | 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 | 动质体寄生虫（包括利什曼原虫、锥虫等）及其宿主相互作用 | 单细胞组学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-02 |
Insights Into Systemic Sclerosis from Gene Expression Profiling
2021-Sep, Current treatment options in rheumatology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s40674-021-00183-0
PMID:41614080
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综述 | 本文综述了基因表达谱分析在系统性硬化症研究中的应用，特别是通过转录组学揭示疾病异质性、病因及治疗靶点 | 利用转录组学（包括bulk和单细胞技术）量化系统性硬化症的分子异质性，为个性化治疗提供数据驱动见解 | 疾病轨迹预测仍具挑战性，需进一步研究靶组织中的细胞和分子动态 | 通过基因表达谱分析提升对系统性硬化症分子异质性和治疗策略的理解 | 系统性硬化症患者 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-16 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本文揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下促进心肌细胞适应性生长和心脏功能维持的关键作用 | 首次明确了心脏驻留巨噬细胞来源的IGF-1在高血压诱导的心脏适应性生长中的绝对必要性，并识别了人类心肌病中保守的IGF-1表达巨噬细胞亚群 | 研究主要基于动物模型，人类数据仅通过单细胞转录组学识别相关巨噬细胞亚群，未进行功能验证 | 探究免疫细胞在高血压应激下心脏适应性生长中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
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研究论文 | 开发了一种名为MRtree的算法，用于从单细胞RNA测序数据构建细胞类型层次结构 | 提出了一种高度灵活的树构建算法，能够从多个分辨率的平面聚类结果生成聚类层次结构 | 需要依赖现有的平面聚类算法，可能受到这些算法固有局限性的影响 | 解决单细胞RNA测序数据分析中分辨率参数选择困难和细胞簇演化特征难以比较的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树构建算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
EZH2 identifies the precursors of human natural killer cells with trained immunity
2021-Sep-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了具有训练免疫能力的人类自然杀伤细胞前体，并发现EZH2是其关键表观遗传标志物 | 首次使用单细胞RNA测序结合TotalSeq™技术追踪训练免疫诱导过程中NK细胞的异质性，识别出CD57-NKG2A+EZH2+IFNG+MKI67+IL12R+IL15R+IL18R+ NK细胞独特亚群作为训练免疫前体 | 传统发育标记无法识别训练免疫前体细胞，需要依赖更先进的单细胞测序技术 | 识别产生训练免疫的人类NK细胞亚群，探索药物干预的潜在调控靶点 | 人类自然杀伤细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, TotalSeq™技术, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151621
PMID:34428183
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胰岛α和β细胞中转录因子组合表达模式，预测高功能成熟细胞亚群 | 首次基于组合转录因子表达谱对人类胰岛细胞进行分层，发现ARX/MAFB（α细胞）和MAFA/MAFB（β细胞）共表达亚群具有更强的葡萄糖感知和激素分泌功能 | 研究仅限于正常人类胰岛细胞，未涉及糖尿病病理状态下的变化 | 定义胰岛细胞中转录因子异质性及其对细胞功能的影响 | 人类胰岛α和β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, Patch-Seq | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 超过40,000个正常人类胰岛细胞，来自多个供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
The Distinct Immune Nature of the Fetal Inflammatory Response Syndrome Type I and Type II
2021-09-14, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100047
PMID:34521696
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析揭示了胎儿炎症反应综合征I型和II型在免疫机制上的本质差异 | 首次系统阐明FIRS I型和II型在分子水平上的免疫特征差异，发现I型主要由先天免疫驱动，II型则类似于半同种异体移植排斥反应 | 样本量有限且为早产儿，产后诊断困难可能影响样本准确性 | 探究胎儿炎症反应综合征I型和II型的分子基础和免疫机制差异 | 诊断为FIRS I型或II型的早产儿脐带血样本 | 生物医学 | 胎儿炎症反应综合征 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早产儿脐带血样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.06.065
PMID:34217973
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸脱氢酶A亚型在人类胰岛α细胞中的特异性表达及其在2型糖尿病中的上调现象 | 首次系统证实LDHA主要定位于人类胰岛α细胞而非β细胞，并在2型糖尿病条件下发生特异性上调 | 研究主要基于体外实验和病理样本观察，缺乏在体功能验证 | 探究LDHA在人类胰岛细胞中的表达特征及其在2型糖尿病病理过程中的作用 | 人类胰岛细胞（重点关注α细胞和β细胞）及2型糖尿病患者胰腺组织 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫标记，显微镜分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据，代谢产物数据 | 公共单细胞RNA-seq数据库，慢性高糖处理的人类胰岛，2型糖尿病患者尸检胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
A harmonized atlas of mouse spinal cord cell types and their spatial organization
2021-09-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25125-1
PMID:34588430
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据构建了小鼠脊髓细胞类型的统一图谱，揭示了细胞类型的层次结构和空间分布 | 首次将多个小鼠脊髓单细胞数据集整合到统一参考框架中，开发了细胞类型分类器SeqSeek，验证了神经元细胞类型的组合标记代码和空间分布 | 研究主要基于已发表的单细胞数据集，可能受限于原始数据的技术差异和覆盖范围 | 构建统一的小鼠脊髓细胞类型图谱并解析其分子组织和空间结构 | 小鼠脊髓细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表数据集的整合 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Morphological Features Extracted by AI Associated with Spatial Transcriptomics in Prostate Cancer
2021-Sep-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194837
PMID:34638322
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研究论文 | 开发了一种结合人工智能和空间转录组学分析前列腺癌形态学特征与分子模式关联的新方法 | 首次将预训练卷积神经网络集成应用于H&E图像形态特征提取，并与空间转录组学数据建立关联分析的工作流程 | 仅基于7个前列腺切除切片样本，样本量有限 | 探索前列腺癌形态学变化与分子模式之间的关联 | 多灶性前列腺癌患者的H&E染色切片 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，H&E染色 | CNN，集成学习 | 图像，基因表达数据 | 7个前列腺切除切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
2021-Sep-27, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-021-00180-3
PMID:34579780
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综述 | 本文概述了海洋多毛类动物Platynereis dumerilii作为模式生物的研究现状和应用领域 | 揭示了Nereid幼体在全身体积电子显微镜和单细胞测序方面的独特优势，能够追踪所有神经元并构建多模式细胞图谱 | NA | 促进对Platynereis这一独特模式生物的兴趣并扩大研究社区 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii | 发育生物学 | NA | 全身体积电子显微镜，单细胞测序 | NA | 电子显微镜图像，基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA |