单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
A hypothetical role for autophagy during the day/night rhythm-regulated melatonin synthesis in the rat pineal gland
2021-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12742
PMID:33960014
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了松果体中不同细胞群体背后的基因调控网络，并首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，表明自噬可能在调节松果体中的褪黑激素合成中起作用 | 首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，并提出了自噬在昼夜节律调节褪黑激素合成中的潜在作用 | NA | 探讨自噬在昼夜节律调节松果体中褪黑激素合成中的作用 | 大鼠松果体中的自噬流和褪黑激素合成 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠松果体中的单个细胞 |
| 162 | 2024-08-09 |
Variants in GCNA, X-linked germ-cell genome integrity gene, identified in men with primary spermatogenic failure
2021-Aug, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02287-y
PMID:33963445
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研究论文 | 本文通过基因组研究分析了精子发生失败（SPGF）的男性，发现X连锁的生殖细胞核抗原（GCNA）基因中的单核苷酸变异（SNV）与男性不育有关。 | 首次揭示GCNA基因在人类男性不育中的作用，该基因对维持生殖细胞基因组完整性至关重要。 | NA | 研究GCNA基因变异与男性不育之间的关系。 | GCNA基因在男性不育中的作用及其变异的影响。 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，计算建模 | NA | 基因组数据 | 初始分析样本量为176，后续研究样本量为2049。 |
| 163 | 2024-08-09 |
Novel therapeutic targets to improve IVF outcomes in endometriosis patients: a review and future prospects
2021-08-20, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmab014
PMID:33930149
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综述 | 本文综述了子宫内膜异位症患者不孕症的病理机制及现有治疗方案，旨在改善这些患者的体外受精（IVF）结果 | 探讨了子宫内膜异位症患者不孕症的分子机制，并提出了针对这些机制的治疗策略 | 尚未有明确的理论能完全解释子宫内膜异位症患者的不孕机制 | 探讨子宫内膜异位症导致不孕的病理机制及治疗方案，以改善IVF结果 | 子宫内膜异位症患者的不孕症及IVF结果 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 123篇文献 |
| 164 | 2024-08-09 |
Bayesian inference of gene expression states from single-cell RNA-seq data
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00875-x
PMID:33927416
|
研究论文 | 本文提出了一种基于贝叶斯推断的单细胞RNA测序数据归一化方法Sanity | Sanity方法直接从原始的唯一分子标识符（UMI）计数中估计表达值及其误差范围，无需可调参数，并能有效校正生物学和测量采样噪声 | 文章未提及Sanity方法的具体局限性 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据归一化方法，以提高下游分析任务的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 文章未提及具体样本数量 |
| 165 | 2024-08-09 |
Reactivation of the Hedgehog pathway in esophageal progenitors turns on an embryonic-like program to initiate columnar metaplasia
2021-08-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.019
PMID:33882290
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠模型、谱系追踪、单细胞RNA测序以及转录组和表观遗传学分析，发现Hedgehog通路在食管细胞中的激活改变了其在体内的分化状态，涉及向胚胎样食管祖细胞的去分化过程，并最终导致鳞状上皮向柱状上皮的完全转换。 | 首次证明食管祖细胞可以成为柱状化生的来源，并揭示了Hedgehog通路激活在食管细胞柱状化生中的作用机制。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探究食管细胞柱状化生的机制。 | 食管祖细胞及Hedgehog通路在柱状化生中的作用。 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传学数据 | 转基因小鼠模型 |
| 166 | 2024-08-09 |
How should we define mammary stem cells?
2021-08, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2021.03.012
PMID:33902986
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research paper | 本文重新审视了乳腺干细胞（MaSCs）的定义，强调了实验方法的创新和现有概念的重新评估。 | 采用了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、表观遗传分析、深层组织和活体成像以及先进的鼠模型等创新实验方法，提供了对干细胞和祖细胞的新见解。 | 关于MaSCs是单能性还是双/多能性的争议仍然存在。 | 重新评估乳腺干细胞的层次概念，并提出新的定义和研究方向。 | 乳腺干细胞（MaSCs）及其在细胞层次中的角色和功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、表观遗传分析、深层组织和活体成像 | NA | 细胞 | NA |
| 167 | 2024-08-09 |
A comprehensive transcriptome signature of murine hematopoietic stem cell aging
2021-08-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009729
PMID:33876187
|
研究论文 | 本研究通过分析16个已发表和未发表的数据集，探讨了衰老小鼠造血干细胞（HSC）中是否存在一致的转录失调模式 | 发现了核心且稳健的HSC衰老标志，并揭示了失调的衰老基因主要由膜相关转录本组成，包括许多先前未与HSC生物学相关联的细胞表面分子 | 研究中存在显著的个体研究间异质性 | 确定衰老小鼠造血干细胞中是否存在一致的转录失调模式 | 衰老小鼠的造血干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 16个数据集 |
| 168 | 2024-08-09 |
Spatial tissue profiling by imaging-free molecular tomography
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00879-7
PMID:33875865
|
研究论文 | 本文介绍了一种无需成像的分子断层扫描框架，通过将样本切成薄条并进行后续图像重建，实现组织内高通量读数的空间定位 | 提出了一种无需成像的空间转录组学技术（STRP-seq），并成功应用于小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组分析 | NA | 开发一种新的空间解析组学分析技术，无需特定检测策略或专业仪器 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑样本 |
| 169 | 2024-08-09 |
A single-cell view of the transcriptome during lateral root initiation in Arabidopsis thaliana
2021-08-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab101
PMID:33822225
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研究论文 | 研究使用单细胞测序方法捕捉拟南芥侧根原基在启动过程中的转录组变化 | 开发了一种方法来选择性抑制目标基因在木质部极皮层细胞中的转录，并发现这些目标基因的表达对正常根发育是必需的 | NA | 研究侧根发育的早期步骤 | 拟南芥侧根原基的转录组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 少量细胞 |
| 170 | 2024-08-09 |
A Beautiful Day in the Neighborhood: Application of Single-Cell Transcriptomics to Unravel Liver Cell Heterogeneity in Diseased Human Livers
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31827
PMID:33756021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-09 |
From Bite to Byte: Dental Structures Resolved at a Single-Cell Resolution
2021-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211001848
PMID:33764175
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）解析哺乳动物牙齿细胞组成的最新研究成果 | 揭示了小鼠门齿中前所未有的细胞类型目录，并发现了牙齿上皮和间质中的新型细胞类型及已知细胞类型的新标记物 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在牙科研究和牙科学中的潜在未来应用 | 哺乳动物牙齿的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 |
| 172 | 2024-08-09 |
Characterization of highly proliferative decidual precursor cells during the window of implantation in human endometrium
2021-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3367
PMID:33764639
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研究论文 | 本文研究了人类子宫内膜中高度增殖的间质前体细胞在胚胎植入窗口期的特征 | 发现了高度增殖的间质细胞（hPMC）作为新的蜕膜前体细胞，这些细胞可能来源于循环骨髓来源的间质干细胞/间质细胞，并在妊娠中对蜕膜的可塑性起关键作用 | NA | 研究人类子宫内膜中高度增殖的间质前体细胞在胚胎植入窗口期的特征及其在妊娠中的作用 | 人类子宫内膜中的高度增殖间质细胞（hPMC）及其在胚胎植入和妊娠中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 173 | 2024-08-09 |
Biomarker Technologies to Support Early Clinical Immuno-oncology Development: Advances and Interpretation
2021-08-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-2345
PMID:33766813
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综述 | 本文综述了支持早期临床免疫肿瘤学发展的生物标志物技术及其在临床中的应用 | 利用单细胞空间转录组学、高级组织组织学方法和新分子免疫分析工具等技术，提供肿瘤环境的分子细节，支持药物开发中的决策 | NA | 探讨生物标志物技术在临床中如何应用于揭示患者肿瘤-免疫生物学，并深入理解癌症对免疫肿瘤治疗的反应 | 癌症免疫治疗及其与宿主免疫系统的复杂相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 174 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of hepatic T cells reveals expansion of liver-resident naive-like CD4+ T cells in primary sclerosing cholangitis
2021-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.016
PMID:33774059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算分析，构建了原发性硬化性胆管炎（PSC）患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群。 | 首次构建了PSC患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群，这些细胞在PSC患者中显著扩增。 | NA | 旨在构建原发性硬化性胆管炎患者肝脏内T细胞的图谱，并深入研究这些细胞在疾病发病机制中的作用。 | 原发性硬化性胆管炎（PSC）患者和健康捐献者的肝脏内T细胞。 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PSC患者11例，健康捐献者4例，以及24例PSC患者和其他肝脏疾病对照组。 |
| 175 | 2024-08-09 |
Wake-up alarm: virtual time-lapse gene expression landscape illuminates mechanisms underlying dormancy breaking of germinating spores
2021-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-021-01177-0
PMID:33782714
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综述 | 本文综述了真菌孢子萌发过程中休眠打破的机制，并通过单细胞基因表达分析方法，探讨了基因表达随时间的变化 | 引入了单细胞RNA测序技术来分析孢子在休眠和萌发过程中的基因表达变化 | NA | 探讨孢子萌发过程中休眠打破的机制，并扩展对S. pombe萌发的研究 | 真菌孢子的萌发过程及其基因表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单孢子细胞 |
| 176 | 2024-08-09 |
Generation of Pulmonary Endothelial Progenitor Cells for Cell-based Therapy Using Interspecies Mouse-Rat Chimeras
2021-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0758OC
PMID:33705684
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研究论文 | 研究通过跨物种小鼠-大鼠嵌合体生成肺内皮祖细胞，用于治疗新生儿肺部疾病 | 首次通过跨物种嵌合体从多能胚胎干细胞中生成肺内皮祖细胞，并验证其在新生儿肺部疾病治疗中的功能 | NA | 研究肺内皮祖细胞的异质性及其从多能干细胞中的生成和功能 | 肺内皮祖细胞及其在新生儿肺部疾病治疗中的应用 | 细胞疗法 | 新生儿肺部疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和大鼠的肺组织样本 |
| 177 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis of somatosensory neurons uncovers temporal development of neuropathic pain
2021-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00479-9
PMID:33692491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠背根神经节（DRG）细胞在神经损伤后的转录组变化，揭示了神经病理性疼痛发展过程中的神经元类型变化及其分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示了神经损伤后DRG神经元的转录组变化，并发现了三种神经损伤诱导的神经元簇（SNIICs），这些簇在神经损伤后表现出特定的基因表达模式 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究神经损伤后神经病理性疼痛发展过程中的转录组变化及其分子机制 | 小鼠背根神经节（DRG）细胞在神经损伤后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠DRG细胞 |
| 178 | 2024-08-09 |
Sequential progenitor states mark the generation of pancreatic endocrine lineages in mice and humans
2021-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00486-w
PMID:33692492
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研究论文 | 本文通过生成新的鼠系并结合多种遗传工具，利用深度单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺内分泌细胞发育的完整路径，并比较了人类与小鼠胰腺内分泌细胞发育的异同 | 首次定义了小鼠内分泌前体细胞向特定内分泌细胞系的分化过程，并识别了ε细胞和中间细胞群作为独立生成α和PP细胞的独特前体 | NA | 揭示胰腺内分泌细胞的发育过程及其在人类和小鼠中的异同 | 胰腺内分泌细胞的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多种鼠系和人类胰腺样本 |
| 179 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of HSCs in a Mouse Model of NASH
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31743
PMID:33550587
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研究论文 | 本研究使用foz/foz小鼠模型，通过单细胞RNA测序详细描述了非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型中造血干细胞（HSC）的表型变化 | 揭示了在正常和损伤状态下HSC表型的意外异质性 | NA | 研究NASH模型中HSC的表型变化 | HSC的单细胞表达谱 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | foz/foz小鼠的正常肝脏和NASH肝脏样本 |
| 180 | 2024-08-09 |
scASK: A Novel Ensemble Framework for Classifying Cell Types Based on Single-cell RNA-seq Data
2021-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3050963
PMID:33434139
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASK的新型集成框架，用于基于单细胞RNA测序数据进行细胞类型分类 | scASK框架包含三个创新模块：DAS（数据自适应切片）、MCS（元分类器选择）和EMS（集成模式切换），这些模块有助于scASK在分类之外实现偏差-方差权衡 | NA | 旨在解决当前计算分析在大规模数据上性能不佳且对初始数据敏感的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成框架 | RNA测序数据 | 使用了13个真实的单细胞RNA测序数据集进行性能评估 |