单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling of tumor-infiltrating TCF1/TCF7+ T cells reveals a T lymphocyte subset associated with tertiary lymphoid structures/organs and a superior prognosis in oral cancer
2021-08, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，探讨了TCF1/TCF7+ T细胞在口腔鳞状细胞癌中的作用及其与三级淋巴结构和预后的关系 | 首次详细报道了TCF1/TCF7+ T细胞在口腔鳞状细胞癌中的作用及其与预后的关联，并提出了其作为治疗靶点和预后标志物的潜力 | NA | 探讨TCF1/TCF7+ T细胞在口腔鳞状细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 口腔鳞状细胞癌中的TCF1/TCF7+ T细胞及其与三级淋巴结构的关系 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-09 |
Category encoding method to select feature genes for the classification of bulk and single-cell RNA-seq data
2021-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9015
PMID:34028849
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研究论文 | 本文提出了一种类别编码（CAEN）方法，用于选择特征基因以分类批量和单细胞RNA-seq数据 | CAEN方法通过使用每个类别中基因序列样本的排名进行类别编码，并考虑样本排名和新的类别排名的相关系数，选择最高基因相关系数作为特征基因 | NA | 改进批量和单细胞RNA-seq数据的分类性能并节省计算时间 | 批量和单细胞RNA-seq数据中的特征基因选择 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-09 |
Characterization of Global Research Trends and Prospects on Single-Cell Sequencing Technology: Bibliometric Analysis
2021-08-10, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/25789
PMID:34014832
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研究论文 | 本文通过文献计量分析方法，研究了单细胞测序技术领域的全球合作网络和发展趋势 | 分析了单细胞测序技术在免疫学应用中的潜在研究热点 | NA | 展示单细胞测序方法领域的合作情况，并探索关键主题和未来方向 | 单细胞测序技术 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 文献 | 2489篇文献，涉及14,202位作者，1970个机构，61个国家 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-09 |
Genome medicine in male infertility: From karyotyping to single-cell analysis
2021-Aug, The journal of obstetrics and gynaecology research
IF:1.6Q3
DOI:10.1111/jog.14828
PMID:33998107
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研究论文 | 本文探讨了从核型分析到单细胞分析的男性不育基因组医学进展 | 文章介绍了通过微阵列技术和下一代测序（NGS）技术，超越传统的核型和聚合酶链反应分析，发现越来越多的遗传异常导致生精障碍，并引入了单细胞转录组分析以更全面地理解睾丸病理 | 文章指出大多数基因突变，如克莱因费尔特综合征、无精子因子微缺失或先天性双侧输精管缺失，并不遵循一个基因-一个表型的模式 | 旨在通过结合表型数据和大量生物信息学数据，更全面地理解男性不育的病理生理学，从而不仅有助于诊断，还能指导不育治疗的选择和新治疗方式的开发 | 研究对象为男性不育症，特别是非阻塞性无精子症（NOA） | 基因组学 | 男性不育症 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组数据 | 使用人类睾丸样本进行单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-09 |
NK cell and ILC heterogeneity in colorectal cancer. New perspectives from high dimensional data
2021-08, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2021.100967
PMID:33941383
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综述 | 本文综述了自然杀伤细胞（NK细胞）和先天性淋巴细胞（ILCs）在结直肠癌（CRC）中的异质性及其在疾病发生发展中的作用 | 利用下一代测序技术和单细胞RNA测序方法，结合多维流式细胞术分析，揭示了ILC系统在稳态和病理状态下的复杂性和异质性 | NA | 探讨NK细胞和ILCs在CRC发病机制中的保护性和有害作用 | NK细胞和ILCs在CRC中的表型和转录修饰 | NA | 结直肠癌 | 下一代测序技术，单细胞RNA测序 | NA | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-09 |
A hypothetical role for autophagy during the day/night rhythm-regulated melatonin synthesis in the rat pineal gland
2021-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12742
PMID:33960014
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了松果体中不同细胞群体背后的基因调控网络，并首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，表明自噬可能在调节松果体中的褪黑激素合成中起作用 | 首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，并提出了自噬在昼夜节律调节褪黑激素合成中的潜在作用 | NA | 探讨自噬在昼夜节律调节松果体中褪黑激素合成中的作用 | 大鼠松果体中的自噬流和褪黑激素合成 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠松果体中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-09 |
Novel therapeutic targets to improve IVF outcomes in endometriosis patients: a review and future prospects
2021-08-20, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmab014
PMID:33930149
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综述 | 本文综述了子宫内膜异位症患者不孕症的病理机制及现有治疗方案，旨在改善这些患者的体外受精（IVF）结果 | 探讨了子宫内膜异位症患者不孕症的分子机制，并提出了针对这些机制的治疗策略 | 尚未有明确的理论能完全解释子宫内膜异位症患者的不孕机制 | 探讨子宫内膜异位症导致不孕的病理机制及治疗方案，以改善IVF结果 | 子宫内膜异位症患者的不孕症及IVF结果 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 123篇文献 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Bayesian inference of gene expression states from single-cell RNA-seq data
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00875-x
PMID:33927416
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研究论文 | 本文提出了一种基于贝叶斯推断的单细胞RNA测序数据归一化方法Sanity | Sanity方法直接从原始的唯一分子标识符（UMI）计数中估计表达值及其误差范围，无需可调参数，并能有效校正生物学和测量采样噪声 | 文章未提及Sanity方法的具体局限性 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据归一化方法，以提高下游分析任务的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 文章未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-09 |
A comprehensive transcriptome signature of murine hematopoietic stem cell aging
2021-08-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009729
PMID:33876187
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研究论文 | 本研究通过分析16个已发表和未发表的数据集，探讨了衰老小鼠造血干细胞（HSC）中是否存在一致的转录失调模式 | 发现了核心且稳健的HSC衰老标志，并揭示了失调的衰老基因主要由膜相关转录本组成，包括许多先前未与HSC生物学相关联的细胞表面分子 | 研究中存在显著的个体研究间异质性 | 确定衰老小鼠造血干细胞中是否存在一致的转录失调模式 | 衰老小鼠的造血干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 16个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-09 |
Spatial tissue profiling by imaging-free molecular tomography
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00879-7
PMID:33875865
|
研究论文 | 本文介绍了一种无需成像的分子断层扫描框架，通过将样本切成薄条并进行后续图像重建，实现组织内高通量读数的空间定位 | 提出了一种无需成像的空间转录组学技术（STRP-seq），并成功应用于小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组分析 | NA | 开发一种新的空间解析组学分析技术，无需特定检测策略或专业仪器 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑的空间转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑和澳大利亚鬃狮蜥大脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-09 |
A single-cell view of the transcriptome during lateral root initiation in Arabidopsis thaliana
2021-08-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab101
PMID:33822225
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研究论文 | 研究使用单细胞测序方法捕捉拟南芥侧根原基在启动过程中的转录组变化 | 开发了一种方法来选择性抑制目标基因在木质部极皮层细胞中的转录，并发现这些目标基因的表达对正常根发育是必需的 | NA | 研究侧根发育的早期步骤 | 拟南芥侧根原基的转录组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 少量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-09 |
A Beautiful Day in the Neighborhood: Application of Single-Cell Transcriptomics to Unravel Liver Cell Heterogeneity in Diseased Human Livers
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31827
PMID:33756021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-09 |
From Bite to Byte: Dental Structures Resolved at a Single-Cell Resolution
2021-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211001848
PMID:33764175
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）解析哺乳动物牙齿细胞组成的最新研究成果 | 揭示了小鼠门齿中前所未有的细胞类型目录，并发现了牙齿上皮和间质中的新型细胞类型及已知细胞类型的新标记物 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在牙科研究和牙科学中的潜在未来应用 | 哺乳动物牙齿的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-09 |
Biomarker Technologies to Support Early Clinical Immuno-oncology Development: Advances and Interpretation
2021-08-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-2345
PMID:33766813
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综述 | 本文综述了支持早期临床免疫肿瘤学发展的生物标志物技术及其在临床中的应用 | 利用单细胞空间转录组学、高级组织组织学方法和新分子免疫分析工具等技术，提供肿瘤环境的分子细节，支持药物开发中的决策 | NA | 探讨生物标志物技术在临床中如何应用于揭示患者肿瘤-免疫生物学，并深入理解癌症对免疫肿瘤治疗的反应 | 癌症免疫治疗及其与宿主免疫系统的复杂相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of hepatic T cells reveals expansion of liver-resident naive-like CD4+ T cells in primary sclerosing cholangitis
2021-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.03.016
PMID:33774059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算分析，构建了原发性硬化性胆管炎（PSC）患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群。 | 首次构建了PSC患者肝脏内T细胞的图谱，并发现了一种新的肝脏驻留型幼稚样CD4+ T细胞群，这些细胞在PSC患者中显著扩增。 | NA | 旨在构建原发性硬化性胆管炎患者肝脏内T细胞的图谱，并深入研究这些细胞在疾病发病机制中的作用。 | 原发性硬化性胆管炎（PSC）患者和健康捐献者的肝脏内T细胞。 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | PSC患者11例，健康捐献者4例，以及24例PSC患者和其他肝脏疾病对照组。 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-09 |
Wake-up alarm: virtual time-lapse gene expression landscape illuminates mechanisms underlying dormancy breaking of germinating spores
2021-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-021-01177-0
PMID:33782714
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综述 | 本文综述了真菌孢子萌发过程中休眠打破的机制，并通过单细胞基因表达分析方法，探讨了基因表达随时间的变化 | 引入了单细胞RNA测序技术来分析孢子在休眠和萌发过程中的基因表达变化 | NA | 探讨孢子萌发过程中休眠打破的机制，并扩展对S. pombe萌发的研究 | 真菌孢子的萌发过程及其基因表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单孢子细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis of somatosensory neurons uncovers temporal development of neuropathic pain
2021-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00479-9
PMID:33692491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠背根神经节（DRG）细胞在神经损伤后的转录组变化，揭示了神经病理性疼痛发展过程中的神经元类型变化及其分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示了神经损伤后DRG神经元的转录组变化，并发现了三种神经损伤诱导的神经元簇（SNIICs），这些簇在神经损伤后表现出特定的基因表达模式 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究神经损伤后神经病理性疼痛发展过程中的转录组变化及其分子机制 | 小鼠背根神经节（DRG）细胞在神经损伤后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠DRG细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-09 |
Sequential progenitor states mark the generation of pancreatic endocrine lineages in mice and humans
2021-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00486-w
PMID:33692492
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研究论文 | 本文通过生成新的鼠系并结合多种遗传工具，利用深度单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺内分泌细胞发育的完整路径，并比较了人类与小鼠胰腺内分泌细胞发育的异同 | 首次定义了小鼠内分泌前体细胞向特定内分泌细胞系的分化过程，并识别了ε细胞和中间细胞群作为独立生成α和PP细胞的独特前体 | NA | 揭示胰腺内分泌细胞的发育过程及其在人类和小鼠中的异同 | 胰腺内分泌细胞的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多种鼠系和人类胰腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of HSCs in a Mouse Model of NASH
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31743
PMID:33550587
|
研究论文 | 本研究使用foz/foz小鼠模型，通过单细胞RNA测序详细描述了非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型中造血干细胞（HSC）的表型变化 | 揭示了在正常和损伤状态下HSC表型的意外异质性 | NA | 研究NASH模型中HSC的表型变化 | HSC的单细胞表达谱 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | foz/foz小鼠的正常肝脏和NASH肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-09 |
scASK: A Novel Ensemble Framework for Classifying Cell Types Based on Single-cell RNA-seq Data
2021-08, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3050963
PMID:33434139
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scASK的新型集成框架，用于基于单细胞RNA测序数据进行细胞类型分类 | scASK框架包含三个创新模块：DAS（数据自适应切片）、MCS（元分类器选择）和EMS（集成模式切换），这些模块有助于scASK在分类之外实现偏差-方差权衡 | NA | 旨在解决当前计算分析在大规模数据上性能不佳且对初始数据敏感的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成框架 | RNA测序数据 | 使用了13个真实的单细胞RNA测序数据集进行性能评估 | NA | NA | NA | NA |