单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 183 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-08 |
Cascaded filter deterministic lateral displacement microchips for isolation and molecular analysis of circulating tumor cells and fusion cells
2021-08-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00360g
PMID:34219135
|
研究论文 | 本文介绍了一种级联过滤确定性横向位移微芯片，用于循环肿瘤细胞和融合细胞的分离及分子分析 | 提出了一种新的过滤确定性横向位移概念，通过级联微流体设计实现了高吞吐量和无堵塞的分离 | NA | 实现循环肿瘤细胞的高效分离和高纯度，以支持癌症研究和个性化治疗 | 循环肿瘤细胞和肿瘤细胞-白细胞融合细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 确定性横向位移 | NA | 细胞 | 来自肺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
Unveiling the neuroimaging-genetic intersections in the human brain
2021-08-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000952
PMID:34227572
|
研究论文 | 本研究旨在介绍结合神经影像学和遗传数据的不同方法学途径 | 利用新的公开脑部和单细胞转录组数据集，将神经影像学发现与遗传数据关联起来 | NA | 探索神经影像学与遗传数据之间的交叉点 | 人类大脑 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 影像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals neuroinflammation in severe COVID-19
2021-08, Nature reviews. Neurology
DOI:10.1038/s41582-021-00536-2
PMID:34234324
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Dissecting human trophoblast cell transcriptional heterogeneity in preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2021-08, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1730
PMID:34212522
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的转录异质性 | 首次展示了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的发展轨迹，并揭示了其基因表达的改变 | NA | 探讨子痫前期胎盘在病理发生中的作用 | 子痫前期和健康妊娠胎盘中的滋养层细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自子痫前期和健康妊娠的胎盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Endothelial Recovery in Bare Metal Stents and Drug-Eluting Stents on a Single-Cell Level
2021-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316472
PMID:34162228
|
研究论文 | 本研究使用兔髂动脉模型分析了裸金属支架（BMS）和药物洗脱支架（DES）在单细胞水平上的内皮化差异 | 通过单细胞RNA测序揭示了BMS和DES内皮细胞的转录组特征差异，为理解支架植入后的内皮再生提供了新的视角 | 研究主要集中在30天后的内皮化情况，长期效果和临床应用的直接关联需要进一步研究 | 探讨裸金属支架和药物洗脱支架在血管内皮化过程中的分子机制差异 | 裸金属支架和药物洗脱支架的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了兔髂动脉模型进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Prioritization of cell types responsive to biological perturbations in single-cell data with Augur
2021-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00561-x
PMID:34172974
|
研究论文 | 本文介绍了Augur工具，用于在单细胞数据中优先处理对生物扰动有响应的细胞类型 | 开发了Augur工具，能够在单细胞RNA-seq数据中对细胞类型进行优先排序，以识别对实验扰动最敏感的细胞类型 | NA | 开发和应用Augur工具，以优先处理在复杂组织中对实验扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含约20,000个基因和20种细胞类型的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-08 |
Integrin β7 Inhibits Colorectal Cancer Pathogenesis via Maintaining Antitumor Immunity
2021-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0879
PMID:34131019
|
研究论文 | 本文研究了整合素β7（ITGB7）在结直肠癌发病机制中的作用，发现ITGB7通过维持抗肿瘤免疫抑制结直肠癌的发生和发展 | 首次详细探讨了ITGB7在结直肠癌发病机制中的作用及其通过维持抗肿瘤免疫的机制 | NA | 探讨ITGB7在结直肠癌发病机制中的作用及其对患者生存和免疫治疗反应的影响 | ITGB7在结直肠癌中的表达及其对肿瘤微环境中免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 使用公共平台的大量RNA表达数据和公共单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Progressive Cellular Senescence Mediates Renal Dysfunction in Ischemic Nephropathy
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020091373
PMID:34135081
|
研究论文 | 本文研究了细胞衰老在缺血性肾病中导致肾功能障碍的作用 | 首次揭示了细胞衰老与慢性缺血性肾损伤之间的关联，并提出了使用溶衰老药物策略来延缓这种损伤的可能性 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要在人类中进一步验证 | 探讨细胞衰老在缺血性肾病中的作用及其对肾功能的影响 | 通过转基因INK-ATTAC和野生型C57BL/6小鼠模型研究肾功能和组织损伤 | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了转基因INK-ATTAC和野生型C57BL/6小鼠以及人类狭窄肾的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Microglial heterogeneity in chronic pain
2021-08, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2021.06.005
PMID:34139287
|
综述 | 本文综述了中枢神经系统及性别如何影响健康中微胶质细胞功能的现有临床前证据，并强调了转录组学分析在疾病相关微胶质细胞状态表征中的最新进展。 | 提出了未来研究可能揭示与慢性疼痛条件相关的独特微胶质细胞转录组特征的可能性，并建议使用scRNA-seq、空间转录组学等新技术来更全面地表征慢性疼痛中微胶质细胞的功能、转录组和结构。 | NA | 探讨神经免疫相互作用在慢性疼痛中的作用，并提出使用新技术来深化对微胶质细胞功能的理解。 | 微胶质细胞在慢性疼痛中的功能和转录组特征。 | NA | 慢性疼痛 | scRNA-seq, 空间转录组学, CYTOF, 透射电子显微镜 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Therapies to prevent post-infarction remodelling: From repair to regeneration
2021-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了心肌梗死后重塑的预防疗法，从修复到再生 | 最近单细胞测序分析提供了关于特定细胞群体在受影响区域最终纤维沉积中的作用的见解 | 目前还没有任何细胞或非细胞为基础的治疗方法导致当前与经皮冠状动脉介入治疗或冠状动脉旁路移植术结合使用的药物或设备 | 评估缺血、炎症、纤维化、血管生成、细胞应激以及基本的细胞和分子成分作为治疗靶点，并探讨当前领域内的趋势和未探索的可行转化研究方法 | 心肌梗死后的心肌组织重塑过程 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
|
研究论文 | 本文通过分析TCGA和CGGA数据库中的转录组数据和单细胞测序数据，筛选出与胶质母细胞瘤（GBM）预后相关的差异表达基因（DEGs），并构建了一个综合的GBM预后模型 | 首次结合转录组和单细胞测序数据，构建了一个综合的GBM预后模型，并在老年GBM患者中验证了其良好的性能 | NA | 揭示潜在的GBM预后标记基因，阐明其功能，并构建一个有效的GBM患者预后模型 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用TCGA和CGGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
Network biology to uncover functional and structural properties of the plant immune system
2021-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102057
PMID:34102601
|
综述 | 本文综述了网络科学在植物免疫系统功能和结构特性发现中的应用 | 探讨了单细胞测序和多组学数据整合在揭示植物免疫系统复杂性中的新前沿 | NA | 旨在通过网络分析和多维数据整合全面理解植物-病原体相互作用 | 植物免疫系统的功能和结构特性 | 生物信息学 | NA | 网络科学 | 动态网络模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
SC1: A Tool for Interactive Web-Based Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2021-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0051
PMID:34115950
|
research paper | 本文介绍了一种基于网络的高度交互式单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据分析工具SC1 | 该工具实现了一种基于词频逆文档频率得分的新方法来选择信息基因，并提供了一系列的聚类、差异表达分析、基因富集、交互式可视化和细胞周期分析方法 | NA | 开发一种交互式的网络工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the Pan-Cancer Immune Microenvironment and scTIME Portal
2021-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-1026
PMID:34117085
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术构建了泛癌症免疫微环境（TIME）的单细胞参考图谱，并开发了scTIME门户网站，用于分析和展示TIME的特征及其在免疫治疗中的潜在机制 | 首次进行了泛癌症的单细胞免疫微环境分析，识别了新的细胞类型特异性转录因子，并开发了scTIME门户网站，提供特定的分析模块和统一的细胞注释 | NA | 研究泛癌症免疫微环境的特征及其在免疫治疗中的分子和细胞机制 | 泛癌症免疫微环境中的细胞类型、细胞状态和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及多种肿瘤类型的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
Cell-type diversity in the bed nucleus of the stria terminalis to regulate motivated behaviors
2021-08-06, Behavioural brain research
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.bbr.2021.113401
PMID:34090941
|
综述 | 本文综述了终纹床核（BNST）中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据揭示了BNST中多种遗传可识别的细胞类型簇 | 由于BNST神经元内高度分子异质性，该区域如何精确调节不同动机状态的机制仍不清楚 | 探讨BNST中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的功能角色 | 终纹床核（BNST）中的神经元亚群及其在调节动机行为中的作用 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing detects persistent cell type- and methylmercury exposure paradigm-specific effects in a human cortical neurodevelopmental model
2021-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2021.112288
PMID:34089799
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序（scRNAseq）评估了发育期甲基汞暴露在人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型中的持久效应 | 首次展示了甲基汞在人发育皮质神经元中引起的基因表达变化，这些变化在暴露停止后仍然存在，并且这些变化是细胞类型、发育阶段和暴露范式特异性的 | NA | 评估发育期甲基汞暴露对人类皮质神经发育的持久影响 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 暴露于0.1和1.0 μM甲基汞浓度的人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Integrating multiple references for single-cell assignment
2021-08-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab380
PMID:34037791
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为mtSC的灵活单细胞分配框架，该框架基于多任务深度度量学习，旨在整合多个参考数据源以提高单细胞分配的准确性 | mtSC框架专门设计用于处理多参考数据源中的数据异质性问题，通过多任务深度度量学习提高细胞类型识别的准确性 | NA | 提高单细胞测序数据分析中的单细胞分配效率 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 多任务深度度量学习 | 深度学习模型 | 单细胞测序数据 | 使用公开可用的综合基准数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Unique Monocyte Population in Bronchoalveolar Lavage Cells of Mice Challenged With Afghanistan Particulate Matter and Allergen
2021-08-03, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfab065
PMID:34051097
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了暴露于阿富汗颗粒物和过敏原的小鼠支气管肺泡灌洗细胞中独特的单核细胞群体 | 发现了一种仅在同时暴露于阿富汗颗粒物和过敏原的小鼠中诱导的独特单核细胞群体，并验证了其与过敏性哮喘相关基因Alox15的表达 | NA | 定义暴露于阿富汗沙漠颗粒物和屋尘螨的小鼠肺白细胞的转录组反应 | 暴露于阿富汗颗粒物和过敏原的小鼠肺白细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠，每组15只 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-09 |
Role of pharmacogenomics in T-cell hypersensitivity drug reactions
2021-08-01, Current opinion in allergy and clinical immunology
IF:3.0Q3
DOI:10.1097/ACI.0000000000000754
PMID:34039850
|
研究论文 | 本文更新了与T细胞介导的延迟超敏反应相关的药物遗传学风险因素 | 本文介绍了与免疫发病机制和临床实践相关的新HLA关联，如HLA-B∗13:01与复方磺胺甲噁唑诱导的SCAR，以及HLA-A∗32:01与万古霉素诱导的DRESS | HLA作为风险因素对于大多数T细胞介导的反应是必要但不充分的，且研究主要集中在已易于进行研究的人群中，对全球相关且研究不足的人群风险关注不足 | 更新与T细胞介导的延迟超敏反应相关的药物遗传学风险因素 | T细胞介导的延迟超敏反应的药物遗传学风险因素 | 药物遗传学 | NA | 单细胞测序 | NA | 遗传数据 | 大型人群匹配队列 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-09 |
Inferring gene regulatory network from single-cell transcriptomic data by integrating multiple prior networks
2021-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文开发了一种名为iMPRN的新计算方法，通过整合多个先验网络来推断基因调控网络 | iMPRN方法采用线性回归、图嵌入和弹性网络优化每个先验网络，并基于B分数评估调控边的置信度，最终整合这些优化后的网络 | NA | 重建基因调控网络以理解特定细胞环境中的基因功能 | 恶性与非恶性头颈部肿瘤细胞的基因调控网络 | 生物信息学 | 头颈部肿瘤 | scRNA-seq | 线性回归、图嵌入、弹性网络 | 转录组数据 | 模拟数据集和真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |