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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
CoSTA: unsupervised convolutional neural network learning for spatial transcriptomics analysis
2021-Aug-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04314-1
PMID:34372758
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CoSTA的新方法，通过卷积神经网络（ConvNet）聚类学习基因表达矩阵之间的空间相似性 | CoSTA强调了空间模式而非像素级相关性，并提供了基因表达模式相似性的定量测量 | NA | 探索空间转录组学技术中基因调控的空间上下文，并提出新的分析方法 | 基因表达矩阵的空间相似性 | 机器学习 | NA | 卷积神经网络（ConvNet） | CNN | 矩阵 | 模拟和已发表的空间转录组学数据 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of intramedullary canal tissue to improve methods for studying fracture repair biology
2021-08, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0002
PMID:34374302
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研究论文 | 本文描述了一种从手术中刮取的骨髓腔组织中分离单个细胞进行单细胞RNA测序的技术，旨在详细说明收集和处理骨髓腔组织样本的挑战和解决方案，并展示了这种方法在预期研究中的可行性。 | 开发了一种新的技术，用于从骨髓腔组织中分离单个细胞进行单细胞RNA测序，以研究骨折修复生物学。 | NA | 研究骨折愈合失败的骨微环境，以发现骨折不愈合的生物标志物。 | 骨髓腔组织中的单个细胞。 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 新鲜和再激活的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Measles virus exits human airway epithelia within dislodged metabolically active infectious centers
2021-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009458
PMID:34383863
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研究论文 | 研究麻疹病毒在人类呼吸道上皮细胞中的复制过程，特别是其在脱落感染中心内的代谢活性 | 首次揭示了麻疹病毒在呼吸道上皮细胞中形成并脱落的感染中心，这些中心保持了代谢活性并可能通过咳嗽和打喷嚏传播病毒 | 研究主要集中在体外模型上，可能与真实人体内的病毒行为存在差异 | 探讨麻疹病毒在呼吸道上皮细胞中的复制机制及其传播方式 | 人类呼吸道上皮细胞及麻疹病毒 | NA | 麻疹 | 共聚焦显微镜、单细胞RNA测序、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷染色 | NA | 细胞 | 来自肺捐赠者的良好分化的人类呼吸道上皮细胞（HAE） | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Sc-compReg enables the comparison of gene regulatory networks between conditions using single-cell data
2021-08-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25089-2
PMID:34362918
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研究论文 | 提出了一种名为sc-compReg的方法，用于比较两种条件下使用单细胞基因表达和染色质可及性数据构建的基因调控网络 | 开发了sc-compReg软件，能够联合聚类和嵌入来自scRNA-seq和scATAC-seq的细胞，并构建两种条件下的差异调控网络 | NA | 比较疾病与健康个体或两种不同治疗之间的基因调控网络 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者与健康对照的基因调控网络 | 生物信息学 | 白血病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 单个CLL患者与健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Viral vector-mediated reprogramming of the fibroblastic tumor stroma sustains curative melanoma treatment
2021-08-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25057-w
PMID:34354077
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研究论文 | 研究通过病毒载体介导的纤维母细胞瘤基质重编程，探讨其在黑色素瘤治疗中的作用 | 首次展示了通过病毒载体表达黑色素细胞分化抗原，实现对黑色素瘤的长期控制，并揭示了特定纤维母细胞亚群在肿瘤微环境中的免疫刺激作用 | NA | 探讨病毒载体介导的纤维母细胞瘤基质重编程在黑色素瘤治疗中的作用 | 纤维母细胞瘤基质细胞和黑色素瘤 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Dysregulated hematopoiesis in bone marrow marks severe COVID-19
2021-Aug-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00296-9
PMID:34349096
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19患者骨髓单个核细胞，发现严重病例中存在造血干细胞G1期占优势且易凋亡，以及未成熟髓系祖细胞积累和淋巴系祖细胞显著减少的现象。 | 首次揭示了严重COVID-19患者骨髓中造血干细胞的异常状态及其对下游祖细胞分化的影响。 | 研究样本仅包括COVID-19患者，未涉及健康对照组的骨髓细胞分析。 | 探讨严重COVID-19患者中造血干细胞如何影响外周淋巴和髓系细胞的功能障碍。 | COVID-19患者的骨髓单个核细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Development and validation of an intra-tumor heterogeneity-related signature to predict prognosis of bladder cancer: a study based on single-cell RNA-seq
2021-08-02, Aging
DOI:10.18632/aging.203353
PMID:34339395
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，开发并验证了一种与膀胱癌内肿瘤异质性相关的预后标志物 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了与膀胱癌内肿瘤异质性相关的预后模型 | NA | 开发和验证一种新的预后标志物，用于预测膀胱癌的预后 | 膀胱癌的内肿瘤异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso和多元Cox回归模型 | 基因数据 | 分析了2075个细胞，评估了396个病例，并在训练和外部验证数据集中进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
Differential gene regulation in DAPT-treated Hydra reveals candidate direct Notch signalling targets
2021-08-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.258768
PMID:34346482
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和启动子分析，探讨了在Hydra中使用Notch抑制剂DAPT处理后基因表达的变化，以及Notch信号通路在头部模式形成和间质细胞分化中的分子机制 | 本研究首次在Hydra中识别出Notch信号通路的直接调控基因，并提出了Sp5和HyAlx作为潜在的直接Notch目标基因 | NA | 理解Notch信号通路在Hydra头部模式形成和间质细胞分化中的分子机制 | Hydra中的Notch信号通路及其调控基因 | 分子生物学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
SCITO-seq: single-cell combinatorial indexed cytometry sequencing
2021-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01222-3
PMID:34354295
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCITO-seq的工作流程，该流程利用splint寡核苷酸实现对DNA条形码抗体的组合索引单细胞测序 | SCITO-seq通过编码样品条形码到splint寡核苷酸中，实现了与质谱流式细胞术相当的细胞组成和表面蛋白表达的可靠估计，并扩展了其与商业DNA条形码抗体的兼容性以及同一细胞中转录组和表面蛋白的同时表达分析 | NA | 开发一种灵活且超高吞吐量的基于测序的单细胞蛋白和多模态分析平台 | 单细胞表面分子标记的蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序 | NA | 蛋白质表达数据 | 每个反应超过10个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
CRISPR Technique Incorporated with Single-Cell RNA Sequencing for Studying Hepatitis B Infection
2021-08-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02227
PMID:34328316
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术结合单细胞RNA测序，优化了对乙型肝炎病毒（HBV）感染肝细胞中稀有转录本的检测 | 通过CRISPR-Cas9技术优先富集稀有转录本，显著提高了HBV RNA在单细胞RNA测序中的检测率 | NA | 研究乙型肝炎病毒感染及干扰素治疗对肝细胞基因表达的影响 | 乙型肝炎病毒感染的肝细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 7370个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 activates lung epithelial cell proinflammatory signaling and leads to immune dysregulation in COVID-19 patients
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103500
PMID:34311326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者肺泡灌洗液样本中的细胞类型和免疫反应 | 发现SARS-CoV-2感染导致肺上皮细胞中ACE2和TMPRSS2表达显著增加，并激活了促炎基因和干扰素/细胞因子信号 | NA | 旨在解析SARS-CoV-2感染的细胞类型、宿主免疫反应及其在COVID-19患者肺部的相互作用 | COVID-19患者的肺泡灌洗液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名健康捐赠者、6名重症COVID-19患者和3名轻症康复患者 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Molecular architecture of the developing mouse brain
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03775-x
PMID:34321664
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研究论文 | 本文报道了从原肠胚形成到出生期间小鼠胚胎大脑的综合单细胞转录组图谱 | 首次全面描述了小鼠胚胎大脑发育过程中的近八百种细胞状态，揭示了大脑及其包膜的功能元素发育程序 | NA | 系统地表征大脑发育过程中整个时空范围内的细胞状态 | 小鼠胚胎大脑的细胞状态和发育基因的空间表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎大脑 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Heterogeneity of Monocyte-Derived and Peripheral Type-2 Conventional Dendritic Cells
2021-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100094
PMID:34282004
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人源单核细胞衍生的树突状细胞（moDCs）和血液树突状细胞的异质性 | 首次揭示了moDCs和外周cDC2s的七个亚型及其潜在的分化轨迹，并阐明了moDCs和cDC2s之间的转录组差异 | NA | 探究人源单核细胞衍生的树突状细胞和外周树突状细胞的异质性及其相互关系 | 人源单核细胞衍生的树突状细胞（moDCs）和血液树突状细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Expression characteristics of interferon-stimulated genes and possible regulatory mechanisms in lupus patients using transcriptomics analyses
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103477
PMID:34284174
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组学分析，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）患者中干扰素刺激基因（ISGs）的表达特征及其潜在的调控机制。 | 首次使用AUCell方法描述SLE患者中粒细胞的ISG活性，并探讨了Avacopan作为粒细胞抑制剂在治疗SLE中的潜在应用。 | NA | 研究SLE患者中ISGs的表达特征及其调控机制。 | SLE患者的PBMC细胞和肾脏组织。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 35,842个PBMC细胞，5名SLE患者和3名健康对照，以及来自GEO数据库的狼疮性肾炎患者肾脏转录组数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals meningeal leukocyte heterogeneity in the developing mouse brain
2021-08-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348190.120
PMID:34301765
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，首次生成了新生小鼠脑膜白细胞在正常条件和围产期脑损伤后的全面转录图谱 | 发现了新生儿与成年边界相关巨噬细胞的差异，并识别出可能参与白质发育的新型脑膜微胶质样细胞群体 | NA | 揭示脑膜在脑发育和病理中的重要性 | 新生小鼠脑膜白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Intrathecal activation of CD8+ memory T cells in IgG4-related disease of the brain parenchyma
2021-08-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202113953
PMID:34254741
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析脑脊液，揭示了IgG4相关疾病中T细胞的免疫病理生理机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了IgG4相关疾病中脑脊液和脑实质病变的T细胞反应，并阐明了CD8 T效应记忆细胞通过MIF-CD74信号和CCL5介导的招募机制驱动自身免疫 | 研究样本仅为单一病例，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探索IgG4相关疾病的免疫病理生理机制，并寻找新的治疗靶点 | IgG4相关疾病的脑脊液和脑实质病变中的T细胞反应 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2感染胰腺后促进血栓纤维化并与新发糖尿病相关的情况 | 首次报道了SARS-CoV-2在胰腺中的感染情况，并观察到胰腺纤维化和血栓形成的现象 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探究SARS-CoV-2感染胰腺与新发糖尿病之间的关系 | 胰腺中的ACE2和TMPRSS2表达，以及SARS-CoV-2在胰腺细胞中的免疫定位 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 8只非人类灵长类动物和5名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Inferring single cell expression profiles from overlapped pooling sequencing data with compressed sensing strategy
2021-08-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab581
PMID:34244789
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研究论文 | 本文提出了一种利用重叠池化和压缩感知策略从重叠池化测序数据中推断单细胞表达谱的方法 | 通过重叠池化和压缩感知策略，能够在保持基因检测灵敏度和个体特异性的同时，节省约一半的文库成本 | NA | 开发一种降低大规模单细胞表达数据获取成本的方法 | 单细胞表达谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 压缩感知 | 测序数据 | 54个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq revealed diverse cell types in the mouse placenta at mid-gestation
2021-08-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112715
PMID:34217714
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）揭示了E10.5小鼠胎盘中多样化的细胞类型及其在细胞组成和通讯上的差异 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了小鼠胎盘中的细胞异质性，并追踪了滋养层细胞和Hofbauer样细胞的发育轨迹 | NA | 研究旨在深入了解正常胎盘的细胞组成和通讯机制 | 小鼠胎盘中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠胎盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Key molecular alterations in endothelial cells in human glioblastoma uncovered through single-cell RNA sequencing
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.150861
PMID:34228647
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究人胶质母细胞瘤中内皮细胞的关键分子改变 | 构建了人脑内皮细胞的分子图谱，提供了对人类血脑屏障异质性及其在胶质母细胞瘤中分子改变的前所未有的分子洞察 | NA | 揭示人胶质母细胞瘤中内皮细胞的分子异质性及其在肿瘤中的改变 | 人胶质母细胞瘤中的内皮细胞及其配对的肿瘤周围组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新鲜分离的人胶质母细胞瘤内皮细胞及配对的肿瘤周围组织 | NA | NA | NA | NA |