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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2024-08-08 |
CRISPR Technique Incorporated with Single-Cell RNA Sequencing for Studying Hepatitis B Infection
2021-08-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02227
PMID:34328316
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术结合单细胞RNA测序,优化了对乙型肝炎病毒(HBV)感染肝细胞中稀有转录本的检测 | 通过CRISPR-Cas9技术优先富集稀有转录本,显著提高了HBV RNA在单细胞RNA测序中的检测率 | NA | 研究乙型肝炎病毒感染及干扰素治疗对肝细胞基因表达的影响 | 乙型肝炎病毒感染的肝细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 7370个细胞 |
122 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 activates lung epithelial cell proinflammatory signaling and leads to immune dysregulation in COVID-19 patients
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103500
PMID:34311326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者肺泡灌洗液样本中的细胞类型和免疫反应 | 发现SARS-CoV-2感染导致肺上皮细胞中ACE2和TMPRSS2表达显著增加,并激活了促炎基因和干扰素/细胞因子信号 | NA | 旨在解析SARS-CoV-2感染的细胞类型、宿主免疫反应及其在COVID-19患者肺部的相互作用 | COVID-19患者的肺泡灌洗液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名健康捐赠者、6名重症COVID-19患者和3名轻症康复患者 |
123 | 2024-08-08 |
Molecular architecture of the developing mouse brain
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03775-x
PMID:34321664
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研究论文 | 本文报道了从原肠胚形成到出生期间小鼠胚胎大脑的综合单细胞转录组图谱 | 首次全面描述了小鼠胚胎大脑发育过程中的近八百种细胞状态,揭示了大脑及其包膜的功能元素发育程序 | NA | 系统地表征大脑发育过程中整个时空范围内的细胞状态 | 小鼠胚胎大脑的细胞状态和发育基因的空间表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎大脑 |
124 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Heterogeneity of Monocyte-Derived and Peripheral Type-2 Conventional Dendritic Cells
2021-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100094
PMID:34282004
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人源单核细胞衍生的树突状细胞(moDCs)和血液树突状细胞的异质性 | 首次揭示了moDCs和外周cDC2s的七个亚型及其潜在的分化轨迹,并阐明了moDCs和cDC2s之间的转录组差异 | NA | 探究人源单核细胞衍生的树突状细胞和外周树突状细胞的异质性及其相互关系 | 人源单核细胞衍生的树突状细胞(moDCs)和血液树突状细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
125 | 2024-08-08 |
Expression characteristics of interferon-stimulated genes and possible regulatory mechanisms in lupus patients using transcriptomics analyses
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103477
PMID:34284174
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组学分析,探讨了系统性红斑狼疮(SLE)患者中干扰素刺激基因(ISGs)的表达特征及其潜在的调控机制。 | 首次使用AUCell方法描述SLE患者中粒细胞的ISG活性,并探讨了Avacopan作为粒细胞抑制剂在治疗SLE中的潜在应用。 | NA | 研究SLE患者中ISGs的表达特征及其调控机制。 | SLE患者的PBMC细胞和肾脏组织。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 35,842个PBMC细胞,5名SLE患者和3名健康对照,以及来自GEO数据库的狼疮性肾炎患者肾脏转录组数据。 |
126 | 2024-08-08 |
Transcriptional programs of neoantigen-specific TIL in anti-PD-1-treated lung cancers
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03752-4
PMID:34290408
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序,分析了新辅助抗PD-1治疗非小细胞肺癌中突变相关新抗原特异性肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的转录程序 | 首次识别并分析了突变相关新抗原特异性TIL的转录程序,揭示了这些细胞在肿瘤微环境中的独特特征 | 研究主要集中在非小细胞肺癌,可能不适用于其他类型的肺癌或其他癌症类型 | 探讨抗PD-1治疗中突变相关新抗原特异性TIL的转录程序及其在克服PD-1阻断抗性中的作用 | 非小细胞肺癌中的突变相关新抗原特异性TIL | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
127 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals meningeal leukocyte heterogeneity in the developing mouse brain
2021-08-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348190.120
PMID:34301765
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,首次生成了新生小鼠脑膜白细胞在正常条件和围产期脑损伤后的全面转录图谱 | 发现了新生儿与成年边界相关巨噬细胞的差异,并识别出可能参与白质发育的新型脑膜微胶质样细胞群体 | NA | 揭示脑膜在脑发育和病理中的重要性 | 新生小鼠脑膜白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
128 | 2024-08-08 |
Intrathecal activation of CD8+ memory T cells in IgG4-related disease of the brain parenchyma
2021-08-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202113953
PMID:34254741
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研究论文 | 通过单细胞测序分析脑脊液,揭示了IgG4相关疾病中T细胞的免疫病理生理机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了IgG4相关疾病中脑脊液和脑实质病变的T细胞反应,并阐明了CD8 T效应记忆细胞通过MIF-CD74信号和CCL5介导的招募机制驱动自身免疫 | 研究样本仅为单一病例,可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探索IgG4相关疾病的免疫病理生理机制,并寻找新的治疗靶点 | IgG4相关疾病的脑脊液和脑实质病变中的T细胞反应 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单一病例 |
129 | 2024-08-08 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
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研究论文 | 本研究采用系统疫苗学方法,全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗(BNT162b2)后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应,并展示了加强接种后先天免疫反应的显著增强 | NA | 研究mRNA疫苗如何刺激人体免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名健康志愿者接种BNT162b2 mRNA疫苗后的免疫反应 | 疫苗学 | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 免疫细胞和分子数据 | 56名健康志愿者 |
130 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2感染胰腺后促进血栓纤维化并与新发糖尿病相关的情况 | 首次报道了SARS-CoV-2在胰腺中的感染情况,并观察到胰腺纤维化和血栓形成的现象 | 样本量较小,需要进一步的大规模研究验证 | 探究SARS-CoV-2感染胰腺与新发糖尿病之间的关系 | 胰腺中的ACE2和TMPRSS2表达,以及SARS-CoV-2在胰腺细胞中的免疫定位 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 8只非人类灵长类动物和5名COVID-19患者 |
131 | 2024-08-08 |
Inferring single cell expression profiles from overlapped pooling sequencing data with compressed sensing strategy
2021-08-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab581
PMID:34244789
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研究论文 | 本文提出了一种利用重叠池化和压缩感知策略从重叠池化测序数据中推断单细胞表达谱的方法 | 通过重叠池化和压缩感知策略,能够在保持基因检测灵敏度和个体特异性的同时,节省约一半的文库成本 | NA | 开发一种降低大规模单细胞表达数据获取成本的方法 | 单细胞表达谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 压缩感知 | 测序数据 | 54个单细胞 |
132 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq revealed diverse cell types in the mouse placenta at mid-gestation
2021-08-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112715
PMID:34217714
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)揭示了E10.5小鼠胎盘中多样化的细胞类型及其在细胞组成和通讯上的差异 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了小鼠胎盘中的细胞异质性,并追踪了滋养层细胞和Hofbauer样细胞的发育轨迹 | NA | 研究旨在深入了解正常胎盘的细胞组成和通讯机制 | 小鼠胎盘中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠胎盘样本 |
133 | 2024-08-08 |
Key molecular alterations in endothelial cells in human glioblastoma uncovered through single-cell RNA sequencing
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.150861
PMID:34228647
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究人胶质母细胞瘤中内皮细胞的关键分子改变 | 构建了人脑内皮细胞的分子图谱,提供了对人类血脑屏障异质性及其在胶质母细胞瘤中分子改变的前所未有的分子洞察 | NA | 揭示人胶质母细胞瘤中内皮细胞的分子异质性及其在肿瘤中的改变 | 人胶质母细胞瘤中的内皮细胞及其配对的肿瘤周围组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新鲜分离的人胶质母细胞瘤内皮细胞及配对的肿瘤周围组织 |
134 | 2024-08-08 |
Cascaded filter deterministic lateral displacement microchips for isolation and molecular analysis of circulating tumor cells and fusion cells
2021-08-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00360g
PMID:34219135
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研究论文 | 本文介绍了一种级联过滤确定性横向位移微芯片,用于循环肿瘤细胞和融合细胞的分离及分子分析 | 提出了一种新的过滤确定性横向位移概念,通过级联微流体设计实现了高吞吐量和无堵塞的分离 | NA | 实现循环肿瘤细胞的高效分离和高纯度,以支持癌症研究和个性化治疗 | 循环肿瘤细胞和肿瘤细胞-白细胞融合细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 确定性横向位移 | NA | 细胞 | 来自肺癌患者的样本 |
135 | 2024-08-08 |
Unveiling the neuroimaging-genetic intersections in the human brain
2021-08-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000952
PMID:34227572
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研究论文 | 本研究旨在介绍结合神经影像学和遗传数据的不同方法学途径 | 利用新的公开脑部和单细胞转录组数据集,将神经影像学发现与遗传数据关联起来 | NA | 探索神经影像学与遗传数据之间的交叉点 | 人类大脑 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 影像数据 | NA |
136 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals neuroinflammation in severe COVID-19
2021-08, Nature reviews. Neurology
DOI:10.1038/s41582-021-00536-2
PMID:34234324
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
137 | 2024-08-08 |
Dissecting human trophoblast cell transcriptional heterogeneity in preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2021-08, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1730
PMID:34212522
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的转录异质性 | 首次展示了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的发展轨迹,并揭示了其基因表达的改变 | NA | 探讨子痫前期胎盘在病理发生中的作用 | 子痫前期和健康妊娠胎盘中的滋养层细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自子痫前期和健康妊娠的胎盘样本 |
138 | 2024-08-08 |
Endothelial Recovery in Bare Metal Stents and Drug-Eluting Stents on a Single-Cell Level
2021-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316472
PMID:34162228
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研究论文 | 本研究使用兔髂动脉模型分析了裸金属支架(BMS)和药物洗脱支架(DES)在单细胞水平上的内皮化差异 | 通过单细胞RNA测序揭示了BMS和DES内皮细胞的转录组特征差异,为理解支架植入后的内皮再生提供了新的视角 | 研究主要集中在30天后的内皮化情况,长期效果和临床应用的直接关联需要进一步研究 | 探讨裸金属支架和药物洗脱支架在血管内皮化过程中的分子机制差异 | 裸金属支架和药物洗脱支架的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了兔髂动脉模型进行分析 |
139 | 2024-08-08 |
Prioritization of cell types responsive to biological perturbations in single-cell data with Augur
2021-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00561-x
PMID:34172974
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研究论文 | 本文介绍了Augur工具,用于在单细胞数据中优先处理对生物扰动有响应的细胞类型 | 开发了Augur工具,能够在单细胞RNA-seq数据中对细胞类型进行优先排序,以识别对实验扰动最敏感的细胞类型 | NA | 开发和应用Augur工具,以优先处理在复杂组织中对实验扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含约20,000个基因和20种细胞类型的数据集 |
140 | 2024-08-08 |
Integrin β7 Inhibits Colorectal Cancer Pathogenesis via Maintaining Antitumor Immunity
2021-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0879
PMID:34131019
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研究论文 | 本文研究了整合素β7(ITGB7)在结直肠癌发病机制中的作用,发现ITGB7通过维持抗肿瘤免疫抑制结直肠癌的发生和发展 | 首次详细探讨了ITGB7在结直肠癌发病机制中的作用及其通过维持抗肿瘤免疫的机制 | NA | 探讨ITGB7在结直肠癌发病机制中的作用及其对患者生存和免疫治疗反应的影响 | ITGB7在结直肠癌中的表达及其对肿瘤微环境中免疫细胞浸润的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 使用公共平台的大量RNA表达数据和公共单细胞RNA测序数据 |