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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Grafting of iPS cell-derived tenocytes promotes motor function recovery after Achilles tendon rupture
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25328-6
PMID:34408142
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研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞(iPSC)的技术,用于开发治疗肌腱损伤的新方法 | 首次使用iPSC衍生的肌腱细胞进行移植,促进肌腱损伤后的运动功能恢复 | NA | 开发一种新的治疗肌腱损伤的方法 | iPSC衍生的肌腱细胞及其在肌腱损伤修复中的应用 | 再生医学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
DL4-μbeads induce T cell lineage differentiation from stem cells in a stromal cell-free system
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25245-8
PMID:34408144
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研究论文 | 本文报道了一种无基质细胞的微珠基方法,支持从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞(PSCs)来源的CD34细胞高效体外分化为人类前T细胞和T系细胞 | DL4-μbeads与淋巴生成细胞因子一起,诱导从CD34细胞到CD34CD7CD5前T细胞再到CD3αβ T细胞的有序分化序列 | NA | 开发一种临床相关且易于扩展的系统,用于从造血干细胞/祖细胞(HSPCs)生成大量T系细胞 | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞(PSCs)来源的CD34细胞分化为人类前T细胞和T系细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞(PSCs)来源的CD34细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of immune cells from anticitrullinated peptide antibody positive and negative rheumatoid arthritis
2021-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25246-7
PMID:34404786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞,以揭示不同亚型的免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细比较了ACPA阳性和阴性RA患者的免疫细胞亚群,揭示了不同亚型RA的细胞和分子通路的差异 | NA | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的免疫发病机制 | ACPA阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自ACPA阳性和阴性RA患者的外周血或滑膜组织中的CD45造血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Spatially defined single-cell transcriptional profiling characterizes diverse chondrocyte subtypes and nucleus pulposus progenitors in human intervertebral discs
2021-Aug-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00163-z
PMID:34400611
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对来自年轻和成年健康人类椎间盘的三个主要部分(包括髓核、纤维环和软骨终板)的108个细胞进行了转录组图谱分析 | 首次在人类椎间盘中识别出多种软骨细胞亚型和髓核前体细胞,并揭示了细胞间信号网络在髓核微环境中的重要作用 | NA | 深入理解人类椎间盘的细胞异质性和分子机制,为椎间盘退行性变的临床治疗提供新策略 | 人类椎间盘的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 108个椎间盘细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
NGF-TrkA signaling dictates neural ingrowth and aberrant osteochondral differentiation after soft tissue trauma
2021-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25143-z
PMID:34400627
|
研究论文 | 本文研究了软组织创伤后神经生长因子(NGF)-TrkA信号传导在神经纤维侵入和异常软骨骨化分化中的作用 | 首次揭示了NGF-TrkA信号传导在软组织创伤后异常软骨骨化分化中的作用,并提出了其在治疗中的双重用途 | NA | 探讨软组织创伤后NGF-TrkA信号传导对神经纤维侵入和异常软骨骨化分化的影响 | 小鼠的严重肢体损伤模型 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 病理样本和数据库分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals pre-meiotic X-chromosome dosage compensation in Drosophila testis
2021-08, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009728
PMID:34403408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 发现X染色体在体细胞和前减数分裂细胞中与常染色体具有相同的转录活性,而在减数分裂和后减数分裂细胞中转录活性较低 | 研究主要集中在果蝇睾丸的单细胞RNA测序数据分析,未涉及其他物种或其他组织类型的研究 | 探讨果蝇睾丸中X染色体剂量补偿的时机和程度 | 果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个Drosophila melanogaster品系的睾丸单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals a critical role of novel pro-inflammatory EndMT in mediating adverse remodeling in coronary artery-on-a-chip
2021-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1694
PMID:34417174
|
研究论文 | 研究使用三维微工程人冠状动脉芯片模型,通过单细胞RNA测序揭示了低振荡剪切应力(OSS)诱导的促炎性内皮间质转化(EndMT)在促进不良血管重塑中的关键作用 | 首次揭示了OSS通过Notch1/p38 MAPK-NF-κB信号轴促进促炎性EndMT,并发现IL-37能抑制OSS诱导的促炎性EndMT,从而减轻血管病理生物学反应 | NA | 探究低振荡剪切应力诱导的促动脉粥样硬化变化机制,并评估抗炎方法在缓解血管病理生物学反应中的效果 | 人冠状动脉芯片模型中的内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Multifactorial Role of Mitochondria in Echinocandin Tolerance Revealed by Transcriptome Analysis of Drug-Tolerant Cells
2021-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01959-21
PMID:34372698
|
研究论文 | 本文通过转录组分析揭示了线粒体在伊曲康唑耐药性中的多因素作用,特别是通过单细胞RNA测序研究了耐药细胞的转录特征。 | 首次揭示了线粒体在伊曲康唑耐药性中的多因素作用,并发现了耐药细胞特有的转录特征。 | 研究主要集中在Candida glabrata这一特定病原体上,可能不适用于其他真菌。 | 探究伊曲康唑耐药性的机制,特别是线粒体在其中的作用。 | 耐伊曲康唑的Candida glabrata细胞及其线粒体功能。 | NA | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 耐伊曲康唑的Candida glabrata细胞子集 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
A reference-free approach for cell type classification with scRNA-seq
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102855
PMID:34381979
|
研究论文 | 本文提出了一种无需参考基因组和比对的方法scSimClassify,用于基于单细胞RNA测序数据的细胞类型分类 | scSimClassify利用-mer级别的特征和simhash方法识别的压缩-mer组(CKGs),提供了比基因表达特征更好的分类性能 | NA | 克服单细胞RNA测序数据稀疏性问题,提高细胞类型分类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA analysis identifies pre-migratory neural crest cells expressing markers of differentiated derivatives
2021-08-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66078
PMID:34397384
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,研究了斑马鱼躯干中神经嵴细胞在迁移早期的转录变化 | 本文发现了神经嵴细胞在迁移前就已经表达与分化后代相关的基因,特别是黄素细胞系,并识别了Rohon-Beard神经元的新遗传标记 | NA | 研究神经嵴细胞如何分化成多种细胞类型 | 斑马鱼躯干中的神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼躯干神经嵴细胞群体和Rohon-Beard神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution
2021-08-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abi4882
PMID:34385369
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为par-seqFISH的转录组成像方法,能够在单细胞和分子水平上记录基因表达和空间环境,并应用于机会性病原体的研究 | par-seqFISH方法能够在微尺度集合中以高分辨率记录基因表达和空间环境,为微生物群体的复杂动态研究提供了新的途径 | NA | 捕捉微生物群体在相关时空尺度上的异质表型 | 机会性病原体的浮游和生物膜培养中的微生物群体 | NA | NA | par-seqFISH (parallel sequential fluorescence in situ hybridization) | NA | 基因表达数据 | 约60万个体,跨越数十种条件 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Advances in single-cell sequencing: insights from organ transplantation
2021-08-13, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-021-00336-1
PMID:34389057
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在器官移植和排斥反应中的应用 | 该方法提供了特定组织中多种细胞群体的完整图谱,并提供了一种动态和暂时的无偏方法来探索移植物功能障碍的进展 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在器官移植和排斥反应中的应用 | 免疫系统在器官移植和排斥反应中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptomics reveal trans-differentiation of pancreatic beta cells following inactivation of the TFIID subunit Taf4
2021-08-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04067-y
PMID:34385420
|
研究论文 | 本文研究了TFIID亚基Taf4在成年小鼠胰腺β细胞中的失活对胰岛素信号传导调控的影响 | 首次揭示了Taf4失活后胰腺β细胞向α样细胞的跨分化现象 | NA | 探讨Taf4在胰腺β细胞中的功能及其对胰岛素信号传导的影响 | 成年小鼠胰腺β细胞 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
ICAM1 initiates CTC cluster formation and trans-endothelial migration in lung metastasis of breast cancer
2021-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25189-z
PMID:34381029
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质分析,研究了三阴性乳腺癌(TNBC)原发肿瘤细胞和肺转移的特征,发现ICAM1在肺转移中表达增加,并揭示了ICAM1在肿瘤细胞聚集和跨内皮迁移中的作用。 | 首次报道了ICAM1在三阴性乳腺癌肺转移中的作用,并揭示了ICAM1介导的肿瘤细胞聚集和跨内皮迁移的分子机制。 | 研究基于患者来源的异种移植模型,可能需要进一步的临床验证。 | 探究ICAM1在三阴性乳腺癌肺转移中的作用及其分子机制。 | 三阴性乳腺癌的原发肿瘤细胞和肺转移。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA序列 | 三个三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型(PDXs) | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
Molecular characteristics and spatial distribution of adult human corneal cell subtypes
2021-08-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94933-8
PMID:34381080
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了成人角膜细胞亚型的分子特征和空间分布 | 首次在全基因组转录水平上深入了解人类角膜的细胞亚型,揭示了与发育、功能和位置相关的新的细胞分组 | NA | 研究成人角膜细胞亚型的分子特征和空间分布 | 成人角膜细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个成人角膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell analysis revealed immune dynamics during Ad5-nCoV immunization
2021-Aug-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00300-2
PMID:34373443
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和V(D)J测序技术,分析了四名COVID-19疫苗试验参与者的外周血单个核细胞在免疫接种过程中的免疫动态变化 | 首次通过scRNA/V(D)J-seq方法揭示了免疫接种过程中细胞免疫和体液免疫的增强,并鉴定出几种潜在的结合抗体 | 研究样本量较小,仅包括四名疫苗试验参与者 | 评估疫苗的安全性和反应,并探索免疫接种过程中的免疫动态变化 | COVID-19疫苗试验参与者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 四名疫苗试验参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Ref-1 redox activity alters cancer cell metabolism in pancreatic cancer: exploiting this novel finding as a potential target
2021-Aug-10, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-02046-x
PMID:34376225
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研究论文 | 本研究探讨了红氧因子-1(Ref-1)在胰腺癌细胞代谢中的作用,并评估了其作为潜在治疗靶点的可能性。 | 首次揭示了Ref-1在低氧条件下对胰腺癌细胞代谢途径的影响,并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学验证了其作用机制。 | 研究主要集中在体外和动物模型中,需要进一步的临床试验来验证Ref-1抑制剂的疗效。 | 探索Ref-1在胰腺癌中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力。 | 胰腺癌细胞及其代谢途径。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 胰腺癌细胞在低氧条件下的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
MAAPER: model-based analysis of alternative polyadenylation using 3' end-linked reads
2021-08-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02429-5
PMID:34376236
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研究论文 | 本文介绍了一种基于概率模型的方法MAAPER,用于利用靠近多聚腺苷酸位点(PAS)的读取数据进行选择性多聚腺苷酸化(APA)分析 | MAAPER能够高准确度和敏感度地预测PAS,并能对不同类型的APA事件进行稳健的统计分析 | NA | 开发一种新的方法来分析APA isoform的丰度 | 选择性多聚腺苷酸化(APA)isoforms | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 概率模型 | 测序读取数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Chronological genome and single-cell transcriptome integration characterizes the evolutionary process of adult T cell leukemia-lymphoma
2021-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25101-9
PMID:34376672
|
研究论文 | 本文开发并利用基于捕获的测序面板,结合深度DNA测序和单细胞RNA测序,研究成人T细胞白血病-淋巴瘤(ATL)的克隆结构,并分析其基因组和转录组特征 | 首次整合基因组和单细胞转录组数据,以研究ATL的进化过程,揭示了与亚克隆扩张和转换相关的特征性基因组和转录组模式 | NA | 研究成人T细胞白血病-淋巴瘤的克隆结构和进化过程 | 成人T细胞白血病-淋巴瘤(ATL)及其前驱个体 | 数字病理学 | 成人T细胞白血病-淋巴瘤 | 基于捕获的测序 | NA | DNA序列和单细胞RNA序列 | 从ATL患者或前驱个体收集的多个时间点样本 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the dynamics of human immune cells during early fetal skin development
2021-08-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109524
PMID:34380039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类胎儿皮肤发育早期免疫细胞的转录组动态变化 | 首次揭示了人类胎儿皮肤发育过程中免疫细胞的动态变化和功能成熟过程 | NA | 探究人类胎儿皮肤发育过程中免疫细胞的发育动态 | 人类胎儿皮肤中的CD45造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13种免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |