单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2024-08-08 |
Study of cellular heterogeneity and differential dynamics of autophagy in human embryonic kidney development by single-cell RNA sequencing
2021-Aug-30, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02154-w
PMID:34461918
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了人类胚胎肾脏发育过程中细胞异质性和自噬的差异动力学 | 首次揭示了自噬相关基因在人类胚胎肾脏发育过程中的表达变化，并分析了细胞异质性对自噬调控的影响 | 研究主要集中在胚胎肾脏发育的特定阶段，未来研究可以扩展到更多发育阶段和不同类型的细胞 | 探讨自噬在人类胚胎肾脏发育中的作用及其与细胞异质性的关系 | 人类胚胎肾脏细胞及其自噬相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36,151个人类肾脏细胞，来自9-18周孕期的胚胎肾脏 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
Durable tracking anti-SARS-CoV-2 antibodies in cancer patients recovered from COVID-19
2021-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-96195-w
PMID:34462453
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研究论文 | 本研究追踪了53名来自武汉的癌症患者在感染SARS-CoV-2后抗SARS-CoV-2抗体的持久性 | 发现化疗和放疗可能有助于延长抗SARS-CoV-2 IgG的持续时间 | NA | 探讨癌症患者在COVID-19康复后抗SARS-CoV-2抗体的持久性 | 53名感染SARS-CoV-2的癌症患者 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 53名癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Profiling Transcription Initiation in Peripheral Leukocytes Reveals Severity-Associated Cis-Regulatory Elements in Critical COVID-19
2021-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.08.24.457187
PMID:34462742
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研究论文 | 本文通过分析外周白细胞中活性顺式调控元件，揭示了与COVID-19严重程度相关的转录调控程序 | 首次全面分析了COVID-19患者外周白细胞中的活性顺式调控元件，识别了与疾病严重程度相关的转录因子基序和调控网络 | NA | 研究转录因子及其调控程序在COVID-19免疫反应中的作用及其与疾病结果的关系 | COVID-19患者的严重程度与外周白细胞中的转录调控元件 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
CXCR6 is required for antitumor efficacy of intratumoral CD8+ T cell
2021-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003100
PMID:34462326
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研究论文 | 研究探讨了CXCR6在肿瘤内CD8+ T细胞中的表达及其在抗肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次揭示了CXCR6+CD8+ T细胞在肿瘤免疫治疗中的重要作用，并提出CXCR6可能作为免疫治疗的有效生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体试验验证 | 准确识别具有高效抗肿瘤效应的细胞毒性T淋巴细胞亚群 | CXCR6在肿瘤内CD8+ T细胞中的表达及其功能 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、转录组测序数据和多参数流式细胞技术 | NA | RNA | 使用Cxcr6-/-小鼠和骨髓嵌合体进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
A novel method for predicting cell abundance based on single-cell RNA-seq data
2021-Aug-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04187-4
PMID:34433409
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研究论文 | 本文提出了一种名为DCap的新方法，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞丰度 | DCap方法通过非负最小二乘法考虑了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据的测量噪声和计算误差，并通过加权迭代最小二乘法进行计算，从而减少了测量误差和不同样本中相同类型细胞表达基因数的差异导致的误差 | NA | 解决细胞类型丰度预测中的反卷积问题，并提供更好的疾病组织中细胞比例变化的研究 | 细胞类型丰度预测方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负最小二乘法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Current Epigenetic Insights in Kidney Development
2021-08-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081281
PMID:34440455
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综述 | 本文综述了与肾脏发育相关的表观遗传机制，包括主要基因和信号通路，以及单细胞RNA测序技术在肾脏发育研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和单细胞表观基因组学技术，有助于进一步理解胚胎和成人肾脏发育中早期细胞谱系特化的表观遗传修饰 | NA | 探讨表观遗传机制在肾脏发育中的作用 | 肾脏发育中的表观遗传机制 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Hepatic Stellate Cells in Fibrogenesis of the Liver: Insights from Single-Cell Transcriptomic Analysis in Liver Injury
2021-08-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10082129
PMID:34440898
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了肝星状细胞（HSC）在肝损伤中的纤维化机制 | 发现了多个HSC亚群，其中一个亚群表达高水平的细胞周期调控基因，并揭示了HSC向肌成纤维细胞转化的动态过程 | NA | 阐明肝星状细胞激活的机制及其在肝损伤中的纤维化过程 | 肝星状细胞及其在肝损伤中的功能异质性 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 使用了LRAT-Cre:Rosa26mT/mG小鼠模型，通过流式细胞仪分离出激活的GFP阳性HSC细胞群，共鉴定出8个HSC亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
EmptyNN: A neural network based on positive and unlabeled learning to remove cell-free droplets and recover lost cells in scRNA-seq data
2021-Aug-13, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100311
PMID:34430929
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研究论文 | 介绍了一种名为EmptyNN的新型细胞识别算法，该算法基于正未标记学习训练神经网络，用于改进条形码过滤，以区分无细胞和含细胞的液滴 | EmptyNN算法能够准确移除无细胞液滴并恢复丢失的细胞群集，其性能优于当前最先进的细胞识别算法 | NA | 提高基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）的质量控制分析 | 基于液滴的单细胞RNA测序数据中的无细胞和含细胞液滴 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
Clinical Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing
2021-08-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom11081161
PMID:34439827
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在癌症精准医疗中的应用及其临床意义 | 单细胞基因组学能够解决肿瘤内异质性和微环境成分对治疗反应和抵抗的影响 | 单细胞基因组学在临床相关性的探索上仍处于早期阶段，需要进一步创新以广泛应用于临床 | 探索单细胞RNA测序技术在癌症精准医疗中的应用 | 癌症细胞的异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on the Therapeutic Potentiality of PD-L1-Inhibiting MicroRNAs for Triple-Negative Breast Cancer: Toward Single-Cell Sequencing-Guided Biomimetic Delivery
2021-08-04, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081206
PMID:34440380
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综述 | 本文是一篇系统综述，旨在探讨PD-L1抑制性微小RNA（miRs）在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中的潜在应用，特别是基于单细胞测序引导的仿生递送策略。 | 本文提出了基于单细胞测序技术的仿生递送策略，以提高miR递送的特异性、效力和减少传统方法的毒性，为患者提供个性化癌症治疗。 | NA | 旨在全面且无偏见地综合当前关于PD-L1抑制性miRs恢复对TNBC发展和肿瘤微环境影响的证据。 | 研究对象为三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
Regulatory Mechanisms of Retinal Photoreceptors Development at Single Cell Resolution
2021-Aug-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168357
PMID:34445064
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综述 | 本文综述了人眼视网膜光感受器细胞的类型，总结了单细胞分辨率下其发育调控机制的最新发现，并展望了该领域的未来发展 | 利用单细胞测序技术研究光感受器发育的新方法 | NA | 探讨视网膜光感受器细胞发育的调控机制 | 视网膜光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
miQC: An adaptive probabilistic framework for quality control of single-cell RNA-sequencing data
2021-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009290
PMID:34428202
|
研究论文 | 本文提出了一种名为miQC的自适应概率框架，用于单细胞RNA测序数据的质量控制 | miQC通过联合模型同时考虑线粒体DNA编码基因的读取比例和检测到的基因数量，以概率框架预测低质量细胞，相较于传统方法更具数据驱动性 | NA | 开发一种新的数据驱动质量控制方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的低质量细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
Arhgef2 regulates mitotic spindle orientation in hematopoietic stem cells and is essential for productive hematopoiesis
2021-08-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002539
PMID:34406376
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研究论文 | 研究探讨了造血干细胞（HSCs）的细胞分裂轴协调及其对干细胞驱动的造血作用的重要性，并发现ARHGEF2在调控HSCs的有丝分裂纺锤体方向中起关键作用。 | 首次揭示了ARHGEF2在调控造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的有丝分裂纺锤体方向中的作用，及其对造血功能的重要性。 | 研究主要集中在ARHGEF2的功能缺失对HSPCs的影响，未探讨其在其他细胞类型中的作用。 | 探究造血干细胞的分裂轴协调及其对造血作用的影响。 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）。 | NA | 骨髓衰竭综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of glycan and RNA in single cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102882
PMID:34401666
|
研究论文 | 本文首次将单细胞测序技术应用于同时分析糖链和RNA，通过scGR-seq方法揭示了细胞异质性和糖链在多细胞系统中的生物学作用 | 首次实现了单细胞水平上糖链和RNA的联合分析 | NA | 探索单细胞水平上糖链和RNA的联合分析方法及其在细胞异质性和生物学功能中的应用 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞过程中的糖链和RNA | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 糖链和RNA数据 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
NANOS2 suppresses the cell cycle by repressing mTORC1 activators in embryonic male germ cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102890
PMID:34401671
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研究论文 | 本文探讨了NANOS2蛋白在胚胎雄性生殖细胞中通过抑制mTORC1激活因子来抑制细胞周期的机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了NANOS2在野生型和KO小鼠睾丸中每个生殖细胞的细胞周期状态，并识别了NANOS2可能通过后转录方式抑制mTORC1活性的机制 | NANOS2调控细胞周期的详细机制仍不清楚 | 研究NANOS2在胚胎雄性生殖细胞中抑制细胞周期的机制 | NANOS2蛋白及其在胚胎雄性生殖细胞中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和KO小鼠的睾丸生殖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
CeTF: an R/Bioconductor package for transcription factor co-expression networks using regulatory impact factors (RIF) and partial correlation and information (PCIT) analysis
2021-Aug-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07918-2
PMID:34416858
|
研究论文 | 开发了一个名为CeTF的R/Bioconductor包，用于通过RIF和PCIT分析转录因子共表达网络 | CeTF包整合了PCIT和RIF算法，用于从微阵列、RNA-seq或单细胞RNA-seq数据中识别转录因子 | NA | 识别基因表达数据挖掘中基因-基因相互作用和主要的转录因子 | 转录因子在共表达网络中的作用 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA的胃癌RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
BCL9 regulates CD226 and CD96 checkpoints in CD8+ T cells to improve PD-1 response in cancer
2021-08-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00730-0
PMID:34417435
|
研究论文 | 研究通过基因敲除和药物抑制BCL9，发现BCL9抑制可减少肿瘤生长，促进CD8 T细胞浸润，并增强对PD-1抑制剂的反应 | 首次揭示BCL9在调节肿瘤免疫微环境中的作用，特别是对CD226和CD96检查点的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用及其对PD-1反应的影响 | BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用机制及其对CD226和CD96检查点的影响 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠结肠癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2021-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01392-w
PMID:34412644
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术检测实体瘤中的循环肿瘤细胞 | 通过单细胞测序技术，避免了肿瘤异质性的干扰，提供了理解肿瘤生物过程的新视角 | NA | 探索循环肿瘤细胞的基因组特征及其在肿瘤生物学中的应用 | 循环肿瘤细胞及其在肿瘤类型、转移分析、进展检测和辅助治疗中的应用 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了墨尔本泌尿研究联盟（MURAL）收集的前列腺癌患者来源的异种移植模型（PDXs），旨在通过这些临床前模型加速发现和评估候选治疗方案 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX集合，涵盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并展示了肿瘤间的异质性 | NA | 建立一个重要的前列腺癌PDX资源，用于快速系统地评估候选治疗方案 | 前列腺癌的PDX模型及其在临床前研究中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Single-cell evaluation reveals shifts in the tumor-immune niches that shape and maintain aggressive lesions in the breast
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25240-z
PMID:34408137
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和多参数成像技术，在乳腺癌小鼠模型中揭示了肿瘤-免疫微环境的特征，这些特征塑造并维持了乳腺中的侵袭性病变。 | 研究首次揭示了侵袭性肿瘤微环境中基底样细胞群的扩张、肿瘤亚群的特化以及可能作为腔内和基底表型过渡状态的混合谱系肿瘤细胞。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类乳腺癌中的适用性需要进一步验证。 | 旨在区分乳腺病变中的惰性和侵袭性，以指导个性化治疗。 | 研究对象包括乳腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | 研究涉及小鼠乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |