单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Regulatory Mechanisms of Retinal Photoreceptors Development at Single Cell Resolution
2021-Aug-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168357
PMID:34445064
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综述 | 本文综述了人眼视网膜光感受器细胞的类型，总结了单细胞分辨率下其发育调控机制的最新发现，并展望了该领域的未来发展 | 利用单细胞测序技术研究光感受器发育的新方法 | NA | 探讨视网膜光感受器细胞发育的调控机制 | 视网膜光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
miQC: An adaptive probabilistic framework for quality control of single-cell RNA-sequencing data
2021-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009290
PMID:34428202
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研究论文 | 本文提出了一种名为miQC的自适应概率框架，用于单细胞RNA测序数据的质量控制 | miQC通过联合模型同时考虑线粒体DNA编码基因的读取比例和检测到的基因数量，以概率框架预测低质量细胞，相较于传统方法更具数据驱动性 | NA | 开发一种新的数据驱动质量控制方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的低质量细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 基因表达数据 | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Arhgef2 regulates mitotic spindle orientation in hematopoietic stem cells and is essential for productive hematopoiesis
2021-08-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002539
PMID:34406376
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研究论文 | 研究探讨了造血干细胞（HSCs）的细胞分裂轴协调及其对干细胞驱动的造血作用的重要性，并发现ARHGEF2在调控HSCs的有丝分裂纺锤体方向中起关键作用。 | 首次揭示了ARHGEF2在调控造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的有丝分裂纺锤体方向中的作用，及其对造血功能的重要性。 | 研究主要集中在ARHGEF2的功能缺失对HSPCs的影响，未探讨其在其他细胞类型中的作用。 | 探究造血干细胞的分裂轴协调及其对造血作用的影响。 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）。 | NA | 骨髓衰竭综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 患者样本 |
| 84 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of glycan and RNA in single cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102882
PMID:34401666
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研究论文 | 本文首次将单细胞测序技术应用于同时分析糖链和RNA，通过scGR-seq方法揭示了细胞异质性和糖链在多细胞系统中的生物学作用 | 首次实现了单细胞水平上糖链和RNA的联合分析 | NA | 探索单细胞水平上糖链和RNA的联合分析方法及其在细胞异质性和生物学功能中的应用 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞过程中的糖链和RNA | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 糖链和RNA数据 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞的单细胞样本 |
| 85 | 2024-08-08 |
NANOS2 suppresses the cell cycle by repressing mTORC1 activators in embryonic male germ cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102890
PMID:34401671
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研究论文 | 本文探讨了NANOS2蛋白在胚胎雄性生殖细胞中通过抑制mTORC1激活因子来抑制细胞周期的机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了NANOS2在野生型和KO小鼠睾丸中每个生殖细胞的细胞周期状态，并识别了NANOS2可能通过后转录方式抑制mTORC1活性的机制 | NANOS2调控细胞周期的详细机制仍不清楚 | 研究NANOS2在胚胎雄性生殖细胞中抑制细胞周期的机制 | NANOS2蛋白及其在胚胎雄性生殖细胞中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和KO小鼠的睾丸生殖细胞 |
| 86 | 2024-08-08 |
CeTF: an R/Bioconductor package for transcription factor co-expression networks using regulatory impact factors (RIF) and partial correlation and information (PCIT) analysis
2021-Aug-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07918-2
PMID:34416858
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研究论文 | 开发了一个名为CeTF的R/Bioconductor包，用于通过RIF和PCIT分析转录因子共表达网络 | CeTF包整合了PCIT和RIF算法，用于从微阵列、RNA-seq或单细胞RNA-seq数据中识别转录因子 | NA | 识别基因表达数据挖掘中基因-基因相互作用和主要的转录因子 | 转录因子在共表达网络中的作用 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA的胃癌RNA-seq数据 |
| 87 | 2024-08-08 |
BCL9 regulates CD226 and CD96 checkpoints in CD8+ T cells to improve PD-1 response in cancer
2021-08-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00730-0
PMID:34417435
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研究论文 | 研究通过基因敲除和药物抑制BCL9，发现BCL9抑制可减少肿瘤生长，促进CD8 T细胞浸润，并增强对PD-1抑制剂的反应 | 首次揭示BCL9在调节肿瘤免疫微环境中的作用，特别是对CD226和CD96检查点的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用及其对PD-1反应的影响 | BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用机制及其对CD226和CD96检查点的影响 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠结肠癌模型 |
| 88 | 2024-08-08 |
Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2021-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01392-w
PMID:34412644
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术检测实体瘤中的循环肿瘤细胞 | 通过单细胞测序技术，避免了肿瘤异质性的干扰，提供了理解肿瘤生物过程的新视角 | NA | 探索循环肿瘤细胞的基因组特征及其在肿瘤生物学中的应用 | 循环肿瘤细胞及其在肿瘤类型、转移分析、进展检测和辅助治疗中的应用 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
|
研究论文 | 本文介绍了墨尔本泌尿研究联盟（MURAL）收集的前列腺癌患者来源的异种移植模型（PDXs），旨在通过这些临床前模型加速发现和评估候选治疗方案 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX集合，涵盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并展示了肿瘤间的异质性 | NA | 建立一个重要的前列腺癌PDX资源，用于快速系统地评估候选治疗方案 | 前列腺癌的PDX模型及其在临床前研究中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 |
| 90 | 2024-08-08 |
Single-cell evaluation reveals shifts in the tumor-immune niches that shape and maintain aggressive lesions in the breast
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25240-z
PMID:34408137
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和多参数成像技术，在乳腺癌小鼠模型中揭示了肿瘤-免疫微环境的特征，这些特征塑造并维持了乳腺中的侵袭性病变。 | 研究首次揭示了侵袭性肿瘤微环境中基底样细胞群的扩张、肿瘤亚群的特化以及可能作为腔内和基底表型过渡状态的混合谱系肿瘤细胞。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类乳腺癌中的适用性需要进一步验证。 | 旨在区分乳腺病变中的惰性和侵袭性，以指导个性化治疗。 | 研究对象包括乳腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | 研究涉及小鼠乳腺癌模型 |
| 91 | 2024-08-08 |
Grafting of iPS cell-derived tenocytes promotes motor function recovery after Achilles tendon rupture
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25328-6
PMID:34408142
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞（iPSC）的技术，用于开发治疗肌腱损伤的新方法 | 首次使用iPSC衍生的肌腱细胞进行移植，促进肌腱损伤后的运动功能恢复 | NA | 开发一种新的治疗肌腱损伤的方法 | iPSC衍生的肌腱细胞及其在肌腱损伤修复中的应用 | 再生医学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 |
| 92 | 2024-08-08 |
DL4-μbeads induce T cell lineage differentiation from stem cells in a stromal cell-free system
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25245-8
PMID:34408144
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研究论文 | 本文报道了一种无基质细胞的微珠基方法，支持从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞高效体外分化为人类前T细胞和T系细胞 | DL4-μbeads与淋巴生成细胞因子一起，诱导从CD34细胞到CD34CD7CD5前T细胞再到CD3αβ T细胞的有序分化序列 | NA | 开发一种临床相关且易于扩展的系统，用于从造血干细胞/祖细胞（HSPCs）生成大量T系细胞 | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞分化为人类前T细胞和T系细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞 |
| 93 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of immune cells from anticitrullinated peptide antibody positive and negative rheumatoid arthritis
2021-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25246-7
PMID:34404786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞，以揭示不同亚型的免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细比较了ACPA阳性和阴性RA患者的免疫细胞亚群，揭示了不同亚型RA的细胞和分子通路的差异 | NA | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的免疫发病机制 | ACPA阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自ACPA阳性和阴性RA患者的外周血或滑膜组织中的CD45造血细胞 |
| 94 | 2024-08-08 |
Spatially defined single-cell transcriptional profiling characterizes diverse chondrocyte subtypes and nucleus pulposus progenitors in human intervertebral discs
2021-Aug-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00163-z
PMID:34400611
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自年轻和成年健康人类椎间盘的三个主要部分（包括髓核、纤维环和软骨终板）的108个细胞进行了转录组图谱分析 | 首次在人类椎间盘中识别出多种软骨细胞亚型和髓核前体细胞，并揭示了细胞间信号网络在髓核微环境中的重要作用 | NA | 深入理解人类椎间盘的细胞异质性和分子机制，为椎间盘退行性变的临床治疗提供新策略 | 人类椎间盘的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 108个椎间盘细胞 |
| 95 | 2024-08-08 |
NGF-TrkA signaling dictates neural ingrowth and aberrant osteochondral differentiation after soft tissue trauma
2021-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25143-z
PMID:34400627
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研究论文 | 本文研究了软组织创伤后神经生长因子（NGF）-TrkA信号传导在神经纤维侵入和异常软骨骨化分化中的作用 | 首次揭示了NGF-TrkA信号传导在软组织创伤后异常软骨骨化分化中的作用，并提出了其在治疗中的双重用途 | NA | 探讨软组织创伤后NGF-TrkA信号传导对神经纤维侵入和异常软骨骨化分化的影响 | 小鼠的严重肢体损伤模型 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 病理样本和数据库分析 | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals pre-meiotic X-chromosome dosage compensation in Drosophila testis
2021-08, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009728
PMID:34403408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 发现X染色体在体细胞和前减数分裂细胞中与常染色体具有相同的转录活性，而在减数分裂和后减数分裂细胞中转录活性较低 | 研究主要集中在果蝇睾丸的单细胞RNA测序数据分析，未涉及其他物种或其他组织类型的研究 | 探讨果蝇睾丸中X染色体剂量补偿的时机和程度 | 果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个Drosophila melanogaster品系的睾丸单细胞RNA测序数据 |
| 97 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals a critical role of novel pro-inflammatory EndMT in mediating adverse remodeling in coronary artery-on-a-chip
2021-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1694
PMID:34417174
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研究论文 | 研究使用三维微工程人冠状动脉芯片模型，通过单细胞RNA测序揭示了低振荡剪切应力（OSS）诱导的促炎性内皮间质转化（EndMT）在促进不良血管重塑中的关键作用 | 首次揭示了OSS通过Notch1/p38 MAPK-NF-κB信号轴促进促炎性EndMT，并发现IL-37能抑制OSS诱导的促炎性EndMT，从而减轻血管病理生物学反应 | NA | 探究低振荡剪切应力诱导的促动脉粥样硬化变化机制，并评估抗炎方法在缓解血管病理生物学反应中的效果 | 人冠状动脉芯片模型中的内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Multifactorial Role of Mitochondria in Echinocandin Tolerance Revealed by Transcriptome Analysis of Drug-Tolerant Cells
2021-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01959-21
PMID:34372698
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研究论文 | 本文通过转录组分析揭示了线粒体在伊曲康唑耐药性中的多因素作用，特别是通过单细胞RNA测序研究了耐药细胞的转录特征。 | 首次揭示了线粒体在伊曲康唑耐药性中的多因素作用，并发现了耐药细胞特有的转录特征。 | 研究主要集中在Candida glabrata这一特定病原体上，可能不适用于其他真菌。 | 探究伊曲康唑耐药性的机制，特别是线粒体在其中的作用。 | 耐伊曲康唑的Candida glabrata细胞及其线粒体功能。 | NA | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 耐伊曲康唑的Candida glabrata细胞子集 |
| 99 | 2024-08-08 |
A reference-free approach for cell type classification with scRNA-seq
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102855
PMID:34381979
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研究论文 | 本文提出了一种无需参考基因组和比对的方法scSimClassify，用于基于单细胞RNA测序数据的细胞类型分类 | scSimClassify利用-mer级别的特征和simhash方法识别的压缩-mer组（CKGs），提供了比基因表达特征更好的分类性能 | NA | 克服单细胞RNA测序数据稀疏性问题，提高细胞类型分类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA analysis identifies pre-migratory neural crest cells expressing markers of differentiated derivatives
2021-08-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66078
PMID:34397384
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了斑马鱼躯干中神经嵴细胞在迁移早期的转录变化 | 本文发现了神经嵴细胞在迁移前就已经表达与分化后代相关的基因，特别是黄素细胞系，并识别了Rohon-Beard神经元的新遗传标记 | NA | 研究神经嵴细胞如何分化成多种细胞类型 | 斑马鱼躯干中的神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼躯干神经嵴细胞群体和Rohon-Beard神经元 |