单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Plant single-cell solutions for energy and the environment
2021-08-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02477-4
PMID:34385583
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研究论文 | 本文探讨了单细胞技术在能源和环境科学中的应用，并提出了在植物、真菌和藻类研究中面临的挑战和机遇 | 强调了开发更全面单细胞技术和分析工具的必要性，以及创建一个集中、开放访问的植物单细胞数据库的重要性 | 目前单细胞方法在植物、真菌、藻类等环境生物中的应用仍受限于多糖壁的挑战 | 推动能源和环境科学的发展，通过深入研究特定模型物种和捕捉植物界的多样性 | 植物、真菌和藻类等环境生物 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Virus Infection Variability by Single-Cell Profiling
2021-08-09, Viruses
DOI:10.3390/v13081568
PMID:34452433
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单分子RNA荧光原位杂交（FISH）和铜(I)催化的叠氮-炔环加成（点击）化学等技术，分析人类和小鼠细胞中病毒感染变异性的研究进展 | 引入了“细胞状态”概念，并介绍了单细胞同时测量染色质可及性和mRNA计数的高通量技术 | NA | 探讨病毒感染变异性的机制及其对疾病发生和发展的影响 | 人类和小鼠细胞中的病毒感染变异性 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单分子RNA荧光原位杂交（FISH）、铜(I)催化的叠氮-炔环加成（点击）化学 | NA | RNA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
YY1 Silencing Induces 5-Fluorouracil-Resistance and BCL2L15 Downregulation in Colorectal Cancer Cells: Diagnostic and Prognostic Relevance
2021-Aug-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168481
PMID:34445183
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研究论文 | 研究YY1沉默对结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶的耐药性和BCL2L15下调的影响，并探讨其在结直肠癌诊断和预后中的相关性 | 首次探讨YY1表达水平对结直肠癌细胞治疗反应的影响，并识别相关转录靶点 | 研究仅涉及四种不同基因型的结直肠癌细胞，可能需要更广泛的细胞系验证 | 研究YY1在结直肠癌中的作用及其作为诊断和预后标志物的潜力 | 结直肠癌细胞及患者的YY1表达水平和治疗反应 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及四种不同基因型的结直肠癌细胞及结直肠癌患者数据 |
| 44 | 2024-08-07 |
Specific splice junction detection in single cells with SICILIAN
2021-08-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02434-8
PMID:34353340
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SICILIAN的新方法，用于在单细胞RNA测序数据中精确检测剪接接头，并为其分配统计置信度 | SICILIAN方法能够提高剪接接头检测的精确度，并在模拟数据上实现高准确性，增强单细胞与批量数据集之间的一致性，以及生物重复样本之间的一致性 | NA | 开发一种新方法以提高单细胞RNA测序数据中剪接接头检测的精确度 | 单细胞RNA测序数据中的剪接接头 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Reconstruction of lateral root formation through single-cell RNA sequencing reveals order of tissue initiation
2021-08-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2021.05.028
PMID:34062316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了拟南芥侧根形成过程中组织初始化的顺序 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了侧根原基的发育过程，揭示了组织初始化的顺序和细胞命运的重编程 | 未检测到类似表皮或根冠的细胞，暗示外部组织可能在侧根出现之前形成 | 探究植物侧根形成过程中的组织初始化和细胞命运 | 拟南芥侧根形成过程中的细胞和组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及拟南芥侧根形成的前四个阶段的细胞 |
| 46 | 2024-08-07 |
Iterative single-cell multi-omic integration using online learning
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00867-x
PMID:33875866
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研究论文 | 本文介绍了一种名为在线集成非负矩阵分解（iNMF）的算法，用于整合大规模、多样化的单细胞数据集 | 该算法能够处理任意数量的细胞数据，使用固定内存，并能迭代地整合新产生的数据集，允许多用户通过互联网流式传输同时分析一个大型数据集 | NA | 开发一种通用且可扩展的计算方法，用于整合大规模单细胞基因表达、染色质可及性和DNA甲基化数据集 | 单细胞基因表达、染色质可及性和DNA甲基化数据集 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞数据 | 超过100万个细胞 |
| 47 | 2024-08-07 |
A deep convolutional neural network for segmentation of whole-slide pathology images identifies novel tumour cell-perivascular niche interactions that are associated with poor survival in glioblastoma
2021-08, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-021-01394-x
PMID:33927352
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研究论文 | 本文使用深度卷积神经网络对胶质母细胞瘤的数字化病理切片进行分割，并分析了不同肿瘤区域的基因特征与患者生存率的关系 | 首次在空间上解析了胶质母细胞瘤中不同肿瘤区域的基因特征，并揭示了肿瘤细胞与微环境细胞的相互作用对患者生存率的影响 | NA | 研究胶质母细胞瘤中不同肿瘤区域的基因特征与患者生存率的关系 | 胶质母细胞瘤的数字化病理切片 | 数字病理学 | 脑癌 | 深度卷积神经网络 | DCNN | 图像 | 来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数字化胶质母细胞瘤病理切片 |
| 48 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the human developing spinal cord reveals a conserved genetic programme with human-specific features
2021-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199711
PMID:34351410
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研究论文 | 本研究利用单细胞mRNA测序技术，对人类胚胎发育中的脊髓进行转录组分析，揭示了脊髓发育中细胞多样性和复杂性，并与小鼠脊髓发育进行比较 | 发现了人类脊髓发育中特有的特征，并重建了特定神经元亚型的分化路径 | NA | 探究人类神经管发育中细胞的多样性和复杂性 | 人类胚胎的脊髓 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 四个不同发育阶段的人类胚胎 |
| 49 | 2024-08-07 |
PI3Kα inhibitor CYH33 triggers antitumor immunity in murine breast cancer by activating CD8+T cells and promoting fatty acid metabolism
2021-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003093
PMID:34373258
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研究论文 | 研究PI3Kα抑制剂CYH33通过激活CD8+T细胞和促进脂肪酸代谢在乳腺癌小鼠模型中触发抗肿瘤免疫的作用 | 首次探讨了PI3Kα抑制剂CYH33对肿瘤微环境的影响，并发现其与脂肪酸合成酶抑制剂C75联合使用可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要在免疫健全的小鼠模型中进行，需要进一步在人体中验证 | 探讨PI3Kα抑制剂CYH33对肿瘤微环境的影响及其在乳腺癌治疗中的应用 | 乳腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序和多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | 多个小鼠肿瘤模型 |
| 50 | 2024-08-07 |
Stochastic gene expression drives mesophyll protoplast regeneration
2021-Aug, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg8466
PMID:34380624
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研究论文 | 研究探讨了植物叶肉原生质体再生过程中细胞多能性的机制 | 发现了两个转录因子在原生质体再生中的促进作用，并揭示了原生质体分离后基因表达变异增加的现象 | NA | 揭示植物细胞多能性的分子机制 | 植物叶肉原生质体及其再生过程 | NA | NA | 活体成像和单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 单个叶肉原生质体 |
| 51 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal heterogeneity of high-grade serous ovarian carcinoma
2021-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.500
PMID:34459128
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的异质性和分子基础 | 本研究发现了具有高增殖和药物抗性潜力的侵袭性上皮细胞亚群，并鉴定了几个在卵巢癌细胞生长和迁移中起作用的新标记物 | NA | 探讨高级别浆液性卵巢癌的异质性和分子基础 | 高级别浆液性卵巢癌的原始和转移样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 13,571个细胞 |
| 52 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogeneity in embryonal rhabdomyosarcoma
2021-Aug-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000026775
PMID:34397824
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析胚胎型横纹肌肉瘤的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胚胎型横纹肌肉瘤的细胞异质性和进化轨迹 | NA | 探究胚胎型横纹肌肉瘤的异质性、起源和病因 | 胚胎型横纹肌肉瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 儿童软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤组织细胞 |
| 53 | 2024-08-07 |
Functional microRNA targetome undergoes degeneration-induced shift in the retina
2021-08-31, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00478-9
PMID:34465369
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研究论文 | 本研究探讨了视网膜退化过程中微小RNA（miRNA）目标组的改变，并分析了其在健康和退化视网膜中的相互作用。 | 研究揭示了视网膜退化过程中miRNA目标组的活性变化，特别是在炎症途径中的miRNA富集。 | 研究主要基于啮齿动物模型和公开的单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 识别健康和退化视网膜中miRNA/mRNA相互作用，以深入了解miRNA在疾病发病机制中的调控作用，并探索潜在的治疗靶点。 | 研究对象包括健康和退化视网膜中的miRNA及其目标mRNA。 | 数字病理学 | 老年性黄斑变性 | AGO2 HITS-CLIP, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究使用了啮齿动物模型，具体样本数量未详细说明。 |
| 54 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Core Regulatory Programs That Determine the Heterogeneity of Circulating and Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells
2021-08-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10082143
PMID:34440912
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，研究了组织驻留记忆CD8+ T细胞与其他循环记忆细胞的转录组和调控因子，揭示了急性感染期间TRM细胞的异质性和新的转录调控因子。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小肠中TRM细胞的异质性及其潜在的转录调控因子。 | NA | 研究急性感染期间CD8+ T细胞记忆亚群的转录调控机制，以期为疫苗接种和免疫治疗提供新的途径。 | 组织驻留记忆CD8+ T细胞与其他循环记忆细胞的转录组和调控因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 55 | 2024-08-07 |
Gli1+ progenitors mediate bone anabolic function of teriparatide via Hh and Igf signaling
2021-08-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109542
PMID:34407400
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示了Gli1+元骨髓间充质前体细胞（MMPs）对特立帕肽的反应及其在骨形成中的作用 | 首次发现并证实了特立帕肽通过Hh和Igf信号通路刺激MMPs的增殖和成骨分化，特别是发现了一种新的软骨细胞样成骨前体细胞（COP） | 研究主要集中在生长中的小鼠模型，其结果在人类或其他年龄段的动物中的适用性有待进一步研究 | 探讨特立帕肽在骨形成中的细胞靶点和信号通路 | Gli1+元骨髓间充质前体细胞（MMPs）及其对特立帕肽的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个细胞簇 |
| 56 | 2024-08-07 |
Metabolic modeling of single Th17 cells reveals regulators of autoimmunity
2021-08-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.045
PMID:34216539
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Compass的算法，用于基于单细胞RNA测序和通量平衡分析来表征细胞的代谢状态，并应用于Th17细胞的代谢状态与其功能变异性（致病潜力）的关联研究 | Compass算法能够预测Th17致病性与精氨酸及下游多胺代谢的关联，并通过实验验证了这一预测 | NA | 研究单个Th17细胞的代谢模型，揭示自身免疫的调控因子 | Th17细胞的代谢状态及其与功能变异性的关联 | NA | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | Compass算法 | RNA测序数据 | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
MondoA-Thioredoxin-Interacting Protein Axis Maintains Regulatory T-Cell Identity and Function in Colorectal Cancer Microenvironment
2021-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.04.041
PMID:33901495
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研究论文 | 本文研究了MondoA-硫氧还蛋白相互作用蛋白轴在结直肠癌微环境中对肿瘤内调节性T细胞（Tregs）身份和功能的影响 | 揭示了MondoA-TXNIP轴在结直肠癌微环境中对Tregs代谢和功能的调控作用，并提出其作为癌症治疗的新靶点 | NA | 探究MondoA在结直肠癌浸润Tregs中对葡萄糖限制的响应作用 | 结直肠癌中的肿瘤内调节性T细胞（Tregs） | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠和人类结直肠癌组织进行研究 |
| 58 | 2024-08-07 |
Glucocorticoids and Androgens Protect From Gastric Metaplasia by Suppressing Group 2 Innate Lymphoid Cell Activation
2021-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.04.075
PMID:33971182
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研究论文 | 本文探讨了糖皮质激素和雄激素通过抑制第二组先天淋巴细胞（ILC2s）的激活来保护胃免受化生性损伤的机制 | 揭示了糖皮质激素和雄激素在调节胃炎症中的重叠作用，并阐明了雄激素信号在ILC2s中防止其病理性激活的作用 | NA | 研究性别对胃炎症调节的影响 | 小鼠的胃炎症和化生性损伤 | NA | 胃疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本 |
| 59 | 2024-08-07 |
Normalization of single-cell RNA-seq counts by log(x + 1)† or log(1 + x)†
2021-Aug-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab085
PMID:33676365
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03634-9
PMID:34381231
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综述 | 本文综述了空间转录组技术及其在生物学研究中的应用 | 介绍了空间转录组技术在探索组织结构中的创新应用 | NA | 探讨基因活动如何调控多细胞生物中的复杂细胞排列 | 空间转录组技术在神经科学、发育生物学、植物生物学及疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |