本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-09 |
Cellular components of the hematopoietic niche and their regulation of hematopoietic stem cell function
2021-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000656
PMID:33966008
|
综述 | 本文综述了造血干细胞(HSC)功能的调控机制,特别是骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | 利用转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学和活体动物成像等新技术,揭示了HSC在骨内的位置及维持微环境所需的信号分子 | NA | 探讨造血干细胞的发育和功能如何被造血微环境中的多种细胞成分调控 | 骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | NA | NA | 转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学、活体动物成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics: Molecular Maps of the Mammalian Brain
2021-07-08, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在神经解剖学中的应用及其对大脑分子图谱构建的影响 | 空间转录组学开启了神经解剖学的新时代,通过无监督和无偏见地探索组织结构的分子特征,推动新一代大脑图谱的产生 | NA | 探讨空间转录组学如何通过基因表达谱对大脑区域进行分子分类,从而超越主观的神经解剖学定义 | 哺乳动物大脑的分子图谱 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-09 |
Expression map of entry receptors and infectivity factors for pan-coronaviruses in preimplantation and implantation stage human embryos
2021-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-021-02192-3
PMID:33913101
|
研究论文 | 本文分析了公开的单细胞RNA测序数据,研究了人类胚胎在植入前和植入阶段对多种冠状病毒的易感性 | 首次分析了人类胚胎中多种冠状病毒的进入受体和感染因子的表达图谱 | NA | 预测发育中的人类胚胎是否对多种冠状病毒易感 | 人类胚胎在植入前和植入阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同发育阶段的人类胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-09 |
ChrNet: A re-trainable chromosome-based 1D convolutional neural network for predicting immune cell types
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.037
PMID:33932523
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于染色体的可重训练一维卷积神经网络(ChrNet),用于预测免疫细胞类型 | ChrNet利用基因在染色体上的位置信息,提高了细胞类型分类的性能 | NA | 提高肿瘤微环境中免疫细胞类型的识别准确性,以改善癌症的临床预后和治疗管理 | 免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 一维卷积神经网络(1D-CNN) | CNN | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analyses of dairy cattle ruminal epithelial cells during weaning
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.039
PMID:33933592
|
研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium Controller获取了断奶前后两个荷斯坦小牛瘤胃上皮组织的单细胞RNA测序数据,并分析了细胞类型及其标记基因 | 首次在牛中实施单细胞转录组分析,揭示了瘤胃上皮细胞类型及其在断奶期间的发展 | NA | 研究断奶期间瘤胃上皮细胞的类型及其发展 | 荷斯坦小牛瘤胃上皮细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 5064个断奶前细胞和1372个断奶后细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-09 |
Novel antigens of CAR T cell therapy: New roads; old destination
2021-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101079
PMID:33862524
|
综述 | 本文综述了针对新型肿瘤抗原的CAR-T细胞疗法的最新进展及其在临床上的抗肿瘤成就 | 利用生物信息学和细胞生物学的新技术,如单细胞RNA测序,发现新的肿瘤抗原,为CAR-T疗法在实体瘤治疗中提供新的靶点 | CAR-T疗法在实体瘤治疗中仍面临肿瘤抗原不明确、免疫抑制性肿瘤微环境和CAR-T细胞浸润不良等挑战 | 探讨和总结针对新型肿瘤抗原的CAR-T疗法的开发及其临床应用 | CAR-T细胞疗法及其在治疗复发/难治性B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤和套细胞淋巴瘤中的应用 | 免疫治疗 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-09 |
Activation of Sympathetic Signaling in Macrophages Blocks Systemic Inflammation and Protects against Renal Ischemia-Reperfusion Injury
2021-Jul, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020121723
PMID:33875568
|
研究论文 | 本研究探讨了交感神经系统信号在巨噬细胞中的激活对LPS诱导的脓毒症和肾脏缺血再灌注损伤的影响 | 发现β2-肾上腺素能受体信号在巨噬细胞中的激活通过诱导Tim3表达,引起抗炎表型改变,从而保护肾脏免受缺血再灌注损伤 | NA | 研究交感神经系统信号在巨噬细胞中的作用及其对炎症性疾病的影响 | 巨噬细胞中的交感神经系统信号、LPS诱导的脓毒症、肾脏缺血再灌注损伤 | NA | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠巨噬细胞系进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-09 |
In silico analysis of the potential mechanism of a preventive Chinese medicine formula on coronavirus disease 2019
2021-Jul-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2021.114098
PMID:33831468
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA表达谱分析、分子对接和回顾性研究,探索了预防性中药方剂XG-1对COVID-19的潜在预防机制 | 本研究结合多种分析方法,包括网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接和回顾性研究,以全面探索XG-1的预防机制 | NA | 探索XG-1对COVID-19的潜在预防机制 | XG-1中药方剂对COVID-19的预防效果及其机制 | 中医药 | COVID-19 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、回顾性研究 | NA | 基因表达数据、化学成分数据 | 47名密切接触者 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine
2021-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.04314-2020
PMID:33833036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-09 |
Transcriptome Regulation by Oncogenic ALK Pathway in Mammalian Cortical Development Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2021-07-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhab058
PMID:33791755
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了致癌ALK通路在哺乳动物大脑皮质发育中的转录组调控作用 | 首次揭示了ALK在哺乳动物大脑发育中的作用,并识别了由ALK调控的不同发育阶段的不同表达基因(DEGs) | NA | 探讨致癌ALK通路在神经发育中的关键作用及其对细胞类型特异性转录组的调控 | ALK在哺乳动物大脑发育中的作用及其对神经细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用人脑类器官进行scRNA-seq分析 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-09 |
Human Primary Airway Basal Cells Display a Continuum of Molecular Phases from Health to Disease in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2021-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0464OC
PMID:33789072
|
研究论文 | 本研究优化了基于流式细胞术的细胞分选协议,用于分离人类气道基底细胞,并通过单细胞RNA测序揭示了从健康到慢性阻塞性肺病(COPD)不同阶段的基底细胞分子特征。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了健康与COPD患者气道基底细胞的分子连续性,并识别了可能指示COPD的上调基因。 | 研究主要集中在COPD晚期阶段,可能需要进一步研究其他疾病阶段以获得更全面的理解。 | 揭示气道基底细胞在COPD和其他肺部疾病中的作用,并发现新的治疗靶点。 | 人类气道基底细胞及其在健康和COPD中的分子特征。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康捐赠者和COPD IV期患者的气道基底细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-09 |
Modelling hereditary diffuse gastric cancer initiation using transgenic mouse-derived gastric organoids and single-cell sequencing
2021-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5675
PMID:33797756
|
研究论文 | 本研究利用转基因小鼠衍生的胃类器官和单细胞测序技术,模拟遗传性弥漫性胃癌(HDGC)的初始阶段。 | 首次通过单细胞RNA测序探索了HDGC小鼠类器官模型中的转录组景观,揭示了CDH1缺失在早期肿瘤发生中的影响。 | NA | 研究CDH1基因缺失如何启动遗传性弥漫性胃癌的机制。 | 遗传性弥漫性胃癌(HDGC)的初始阶段。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics dissects hematopoietic cell destruction and T-cell engagement in aplastic anemia
2021-07-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020008966
PMID:33763704
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,揭示了再生障碍性贫血中造血干细胞和祖细胞(HSPCs)与T细胞之间的分子相互作用 | 首次在单细胞水平上解析了再生障碍性贫血中HSPCs和T细胞的转录组变化,并识别了细胞类型特异性的配体-受体相互作用 | 研究主要受限于技术手段和骨髓衰竭背景下HSPCs的稀少性 | 探究再生障碍性贫血中HSPCs与T细胞的复杂关系及其分子机制 | 再生障碍性贫血患者的残留HSPCs和T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing technology in tumor research
2021-Jul, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2021.03.013
PMID:33766554
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其在肿瘤诊断和临床治疗中的重要性 | 单细胞测序技术解决了传统批量组织测序无法揭示稀有细胞独特基因表达的问题 | NA | 探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤诊断和治疗的贡献 | 肿瘤细胞的异质性及其在分子层面的复杂变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序(SCS) | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-09 |
Robust integration of multiple single-cell RNA sequencing datasets using a single reference space
2021-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00859-x
PMID:33767393
|
research paper | 本文介绍了一种使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架的算法,用于整合多个单细胞RNA测序数据集 | 提出了Reference Principal Component Integration (RPCI)方法,该方法通过使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架,以实现多个单细胞RNA测序数据集的整合 | NA | 开发一种新的算法,用于更准确地整合多个单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集的整合方法 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了模拟数据集和真实数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-09 |
Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing
2021-07-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.024
PMID:33730555
|
研究论文 | 本文描述了使用3D器官培养条件和单细胞测序技术探索人类泪腺的研究 | 建立了长期3D器官培养条件,并使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑揭示了泪腺细胞分化的主要调控因子 | NA | 研究泪腺的(病)生理学 | 人类和鼠类的泪腺 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR-Cas9 | 器官 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-09 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal the metabolic heterogeneity in human breast cancers
2021-07-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2021.03.003
PMID:33677091
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多个包含基因组学、转录组学、代谢组学和单细胞转录组数据集,揭示了乳腺癌能量相关代谢特征的异质性 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了乳腺癌细胞的代谢状态及其与肿瘤微环境的相互作用,为基于患者或细胞类型特异性癌症代谢的治疗策略提供了新见解 | NA | 揭示乳腺癌能量代谢的异质性及其对预后和治疗的影响 | 乳腺癌的能量相关代谢特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 三个独立的大样本队列 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in translational cancer research and challenges to meet clinical diagnostic needs
2021-07, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.22944
PMID:33611828
|
综述 | 本文概述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用,并探讨了其满足临床诊断需求的潜力及面临的挑战 | 单细胞测序技术使得能够在转录、遗传、表观遗传和蛋白质水平上研究单个细胞,提供了比整体样本测序更深入的癌症发展基础过程的分辨率 | 讨论了单细胞测序技术在临床诊断应用中面临的主要挑战 | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的应用及其满足临床诊断需求的潜力 | 单细胞测序技术在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-09 |
Sinoatrial node pacemaker cells share dominant biological properties with glutamatergic neurons
2021-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00820-9
PMID:33548033
|
研究论文 | 本研究揭示了窦房结起搏细胞(SANPCs)具有谷氨酸能神经元的特性 | 首次发现SANPCs与谷氨酸能神经元在生物学特性上具有显著相似性,并揭示了谷氨酸能神经递质系统在心脏节律调控中的潜在作用 | NA | 探讨SANPCs的细胞本质及其与谷氨酸能神经元的关系 | SANPCs与谷氨酸能神经元的生物学特性 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-09 |
Elucidating the cellular dynamics of the brain with single-cell RNA sequencing
2021-07, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2020.1870362
PMID:33499699
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在过去十年的发展及其在神经科学领域的应用 | 介绍了多组学适应和空间转录组学工作流程的最新进展,这些技术能够从单个细胞中收集更全面的信息 | NA | 探讨scRNA-seq技术的发展及其在神经科学中的应用,特别是在健康和疾病状态下对神经系统基本细胞动态和分子机制的理解 | 单细胞RNA测序技术及其在神经科学中的应用 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |