单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-08-09	Single-cell transcriptomic analyses of dairy cattle ruminal epithelial cells during weaning 2021-07, Genomics IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.039 PMID:33933592	研究论文	本研究使用10× Genomics Chromium Controller获取了断奶前后两个荷斯坦小牛瘤胃上皮组织的单细胞RNA测序数据，并分析了细胞类型及其标记基因	首次在牛中实施单细胞转录组分析，揭示了瘤胃上皮细胞类型及其在断奶期间的发展	NA	研究断奶期间瘤胃上皮细胞的类型及其发展	荷斯坦小牛瘤胃上皮细胞	数字病理学	NA	scRNA-seq	NA	转录组数据	5064个断奶前细胞和1372个断奶后细胞
142	2024-08-09	Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis 2021-07, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220002 PMID:33858850	研究论文	本研究旨在探讨tenascin-C（TNC）在附着点新骨形成中的作用及其分子机制	首次揭示了TNC通过抑制细胞外基质（ECM）的粘附力并激活Hippo信号通路，促进附着点新骨形成	NA	识别tenascin-C在附着点新骨形成中的作用及其分子机制	来自强直性脊柱炎患者的韧带组织样本及动物模型	NA	强直性脊柱炎	免疫组织化学染色、单细胞RNA测序、原子力显微镜	NA	组织样本、RNA序列	来自强直性脊柱炎患者的韧带组织样本及DBA/1模型动物
143	2024-08-09	Novel antigens of CAR T cell therapy: New roads; old destination 2021-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2021.101079 PMID:33862524	综述	本文综述了针对新型肿瘤抗原的CAR-T细胞疗法的最新进展及其在临床上的抗肿瘤成就	利用生物信息学和细胞生物学的新技术，如单细胞RNA测序，发现新的肿瘤抗原，为CAR-T疗法在实体瘤治疗中提供新的靶点	CAR-T疗法在实体瘤治疗中仍面临肿瘤抗原不明确、免疫抑制性肿瘤微环境和CAR-T细胞浸润不良等挑战	探讨和总结针对新型肿瘤抗原的CAR-T疗法的开发及其临床应用	CAR-T细胞疗法及其在治疗复发/难治性B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤和套细胞淋巴瘤中的应用	免疫治疗	血液肿瘤	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
144	2024-08-09	A single cell atlas of human cornea that defines its development, limbal progenitor cells and their interactions with the immune cells 2021-07, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2021.03.010 PMID:33865984	研究论文	本文通过单细胞分析技术，构建了人类角膜从胚胎到成年的全面单细胞图谱，并揭示了角膜发育、边缘祖细胞及其与免疫细胞的相互作用。	首次通过单细胞RNA测序和ATAC测序技术，详细描绘了人类角膜及其相邻结膜细胞类型的发育过程，并发现了一种新的边缘祖细胞表面标记物GPHA2。	NA	旨在通过单细胞分析技术，深入理解角膜发育过程及其与免疫细胞的相互作用，为眼表疾病的诊断和治疗提供新的见解。	人类角膜及其相邻结膜的细胞类型，特别是边缘祖细胞和免疫细胞。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和ATAC测序	UMAP和Seurat图谱聚类	细胞	21,343个细胞来自四个成年人类角膜和相邻结膜，89,897个细胞来自胚胎和胎儿角膜
145	2024-08-09	Activation of Sympathetic Signaling in Macrophages Blocks Systemic Inflammation and Protects against Renal Ischemia-Reperfusion Injury 2021-Jul, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2020121723 PMID:33875568	研究论文	本研究探讨了交感神经系统信号在巨噬细胞中的激活对LPS诱导的脓毒症和肾脏缺血再灌注损伤的影响	发现β2-肾上腺素能受体信号在巨噬细胞中的激活通过诱导Tim3表达，引起抗炎表型改变，从而保护肾脏免受缺血再灌注损伤	NA	研究交感神经系统信号在巨噬细胞中的作用及其对炎症性疾病的影响	巨噬细胞中的交感神经系统信号、LPS诱导的脓毒症、肾脏缺血再灌注损伤	NA	肾脏疾病	RNA测序	NA	RNA	使用小鼠巨噬细胞系进行实验
146	2024-08-09	In silico analysis of the potential mechanism of a preventive Chinese medicine formula on coronavirus disease 2019 2021-Jul-15, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jep.2021.114098 PMID:33831468	研究论文	本研究通过网络药理学、单细胞RNA表达谱分析、分子对接和回顾性研究，探索了预防性中药方剂XG-1对COVID-19的潜在预防机制	本研究结合多种分析方法，包括网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接和回顾性研究，以全面探索XG-1的预防机制	NA	探索XG-1对COVID-19的潜在预防机制	XG-1中药方剂对COVID-19的预防效果及其机制	中医药	COVID-19	网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、回顾性研究	NA	基因表达数据、化学成分数据	47名密切接触者
147	2024-08-09	Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine 2021-07, The European respiratory journal DOI:10.1183/13993003.04314-2020 PMID:33833036	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
148	2024-08-09	Transcriptome Regulation by Oncogenic ALK Pathway in Mammalian Cortical Development Revealed by Single-Cell RNA Sequencing 2021-07-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhab058 PMID:33791755	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了致癌ALK通路在哺乳动物大脑皮质发育中的转录组调控作用	首次揭示了ALK在哺乳动物大脑发育中的作用，并识别了由ALK调控的不同发育阶段的不同表达基因（DEGs）	NA	探讨致癌ALK通路在神经发育中的关键作用及其对细胞类型特异性转录组的调控	ALK在哺乳动物大脑发育中的作用及其对神经细胞的影响	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	使用人脑类器官进行scRNA-seq分析
149	2024-08-09	Human Primary Airway Basal Cells Display a Continuum of Molecular Phases from Health to Disease in Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2021-07, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2020-0464OC PMID:33789072	研究论文	本研究优化了基于流式细胞术的细胞分选协议，用于分离人类气道基底细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了从健康到慢性阻塞性肺病（COPD）不同阶段的基底细胞分子特征。	首次通过单细胞RNA测序揭示了健康与COPD患者气道基底细胞的分子连续性，并识别了可能指示COPD的上调基因。	研究主要集中在COPD晚期阶段，可能需要进一步研究其他疾病阶段以获得更全面的理解。	揭示气道基底细胞在COPD和其他肺部疾病中的作用，并发现新的治疗靶点。	人类气道基底细胞及其在健康和COPD中的分子特征。	数字病理学	慢性阻塞性肺病	流式细胞术，单细胞RNA测序	NA	RNA	来自健康捐赠者和COPD IV期患者的气道基底细胞
150	2024-08-09	Modelling hereditary diffuse gastric cancer initiation using transgenic mouse-derived gastric organoids and single-cell sequencing 2021-07, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.5675 PMID:33797756	研究论文	本研究利用转基因小鼠衍生的胃类器官和单细胞测序技术，模拟遗传性弥漫性胃癌（HDGC）的初始阶段。	首次通过单细胞RNA测序探索了HDGC小鼠类器官模型中的转录组景观，揭示了CDH1缺失在早期肿瘤发生中的影响。	NA	研究CDH1基因缺失如何启动遗传性弥漫性胃癌的机制。	遗传性弥漫性胃癌（HDGC）的初始阶段。	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
151	2024-08-09	Single-cell transcriptomics dissects hematopoietic cell destruction and T-cell engagement in aplastic anemia 2021-07-08, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2020008966 PMID:33763704	研究论文	本文通过单细胞转录组分析，揭示了再生障碍性贫血中造血干细胞和祖细胞（HSPCs）与T细胞之间的分子相互作用	首次在单细胞水平上解析了再生障碍性贫血中HSPCs和T细胞的转录组变化，并识别了细胞类型特异性的配体-受体相互作用	研究主要受限于技术手段和骨髓衰竭背景下HSPCs的稀少性	探究再生障碍性贫血中HSPCs与T细胞的复杂关系及其分子机制	再生障碍性贫血患者的残留HSPCs和T细胞	数字病理学	再生障碍性贫血	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
152	2024-08-09	Single-cell sequencing technology in tumor research 2021-Jul, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry DOI:10.1016/j.cca.2021.03.013 PMID:33766554	综述	本文综述了单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其在肿瘤诊断和临床治疗中的重要性	单细胞测序技术解决了传统批量组织测序无法揭示稀有细胞独特基因表达的问题	NA	探讨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤诊断和治疗的贡献	肿瘤细胞的异质性及其在分子层面的复杂变化	数字病理学	肿瘤	单细胞测序（SCS）	NA	基因组、转录组和表观基因组数据	NA
153	2024-08-09	Robust integration of multiple single-cell RNA sequencing datasets using a single reference space 2021-07, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-021-00859-x PMID:33767393	research paper	本文介绍了一种使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架的算法，用于整合多个单细胞RNA测序数据集	提出了Reference Principal Component Integration (RPCI)方法，该方法通过使用参考数据集的基因特征向量来建立全局框架，以实现多个单细胞RNA测序数据集的整合	NA	开发一种新的算法，用于更准确地整合多个单细胞RNA测序数据集	单细胞RNA测序数据集的整合方法	digital pathology	NA	scRNA-seq	NA	基因表达数据	使用了模拟数据集和真实数据集进行验证
154	2024-08-09	Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing 2021-07-01, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2021.02.024 PMID:33730555	研究论文	本文描述了使用3D器官培养条件和单细胞测序技术探索人类泪腺的研究	建立了长期3D器官培养条件，并使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑揭示了泪腺细胞分化的主要调控因子	NA	研究泪腺的（病）生理学	人类和鼠类的泪腺	NA	NA	单细胞测序	CRISPR-Cas9	器官	NA
155	2024-08-09	Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal the metabolic heterogeneity in human breast cancers 2021-07-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2021.03.003 PMID:33677091	研究论文	本研究通过综合分析多个包含基因组学、转录组学、代谢组学和单细胞转录组数据集，揭示了乳腺癌能量相关代谢特征的异质性	本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了乳腺癌细胞的代谢状态及其与肿瘤微环境的相互作用，为基于患者或细胞类型特异性癌症代谢的治疗策略提供了新见解	NA	揭示乳腺癌能量代谢的异质性及其对预后和治疗的影响	乳腺癌的能量相关代谢特征	数字病理学	乳腺癌	转录组学	NA	转录组数据	三个独立的大样本队列
156	2024-08-09	New insights for precision treatment of glioblastoma from analysis of single-cell lncRNA expression 2021-Jul, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-021-03584-9 PMID:33693962	研究论文	本研究利用长链非编码RNA（lncRNA）作为标记物，结合单细胞表达谱对胶质母细胞瘤（GBM）进行重新分类，并基于分类结果分析传统疗法的不足，提出新的精准治疗见解。	本研究首次使用lncRNA作为分子标记物，结合单细胞表达数据对GBM进行重新分类，揭示了单细胞水平上的肿瘤内异质性，并提出了新的精准治疗策略。	研究主要基于已有的单细胞测序数据进行分析，未来需要更多的实验验证和临床数据支持。	旨在通过单细胞lncRNA表达分析，提高胶质母细胞瘤的精准治疗效果。	胶质母细胞瘤（GBM）及其分子特征和治疗策略。	数字病理学	脑肿瘤	单细胞测序	NA	单细胞表达数据	使用来自GSE84465的GBM单细胞测序数据
157	2024-08-09	Single-cell sequencing in translational cancer research and challenges to meet clinical diagnostic needs 2021-07, Genes, chromosomes & cancer DOI:10.1002/gcc.22944 PMID:33611828	综述	本文概述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用，并探讨了其满足临床诊断需求的潜力及面临的挑战	单细胞测序技术使得能够在转录、遗传、表观遗传和蛋白质水平上研究单个细胞，提供了比整体样本测序更深入的癌症发展基础过程的分辨率	讨论了单细胞测序技术在临床诊断应用中面临的主要挑战	探讨单细胞测序技术在癌症研究中的应用及其满足临床诊断需求的潜力	单细胞测序技术在癌症研究中的应用	数字病理学	癌症	单细胞测序	NA	基因组数据	NA
158	2024-08-09	Sinoatrial node pacemaker cells share dominant biological properties with glutamatergic neurons 2021-07, Protein & cell IF:13.6Q1 DOI:10.1007/s13238-020-00820-9 PMID:33548033	研究论文	本研究揭示了窦房结起搏细胞（SANPCs）具有谷氨酸能神经元的特性	首次发现SANPCs与谷氨酸能神经元在生物学特性上具有显著相似性，并揭示了谷氨酸能神经递质系统在心脏节律调控中的潜在作用	NA	探讨SANPCs的细胞本质及其与谷氨酸能神经元的关系	SANPCs与谷氨酸能神经元的生物学特性	NA	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	NA
159	2024-08-09	Elucidating the cellular dynamics of the brain with single-cell RNA sequencing 2021-07, RNA biology IF:3.6Q2 DOI:10.1080/15476286.2020.1870362 PMID:33499699	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在过去十年的发展及其在神经科学领域的应用	介绍了多组学适应和空间转录组学工作流程的最新进展，这些技术能够从单个细胞中收集更全面的信息	NA	探讨scRNA-seq技术的发展及其在神经科学中的应用，特别是在健康和疾病状态下对神经系统基本细胞动态和分子机制的理解	单细胞RNA测序技术及其在神经科学中的应用	数字病理学	神经系统疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
160	2024-08-09	Compression of quantification uncertainty for scRNA-seq counts 2021-Jul-19, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btab001 PMID:33471073	研究论文	本文研究了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中基因表达量化估计的不确定性压缩方法	提出了一种新的方法，通过存储推断重复集的均值和方差来捕获基因水平的量化不确定性，同时显著减少了磁盘存储和内存使用	NA	旨在改进scRNA-seq数据处理中的量化不确定性表示，减少计算资源需求	scRNA-seq数据中的基因表达量化不确定性	生物信息学	NA	scRNA-seq	NA	基因表达数据	NA