单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 182 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in pancreatic cancer
2021-07, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-021-00471-z
PMID:34040169
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Differentiation and activation of fibroblastic reticular cells
2021-07, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.12981
PMID:34046914
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review | 本文综述了高分辨率转录组分析在纤维网状细胞（FRC）分化和激活过程中的最新发现，特别是在感染和炎症背景下的应用 | 利用单细胞转录组学和专门的小鼠模型，提高了对FRC亚群特征和功能的分辨率 | 生成的数据维度较高，需要仔细分析和验证 | 深化对FRC分化和激活过程的理解，并探讨单细胞转录组数据分析的概念、策略及其在基质细胞生物学中的广泛影响 | 纤维网状细胞（FRC）及其在次级淋巴器官中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Low bias multiple displacement amplification with confinement effect based on agarose gel
2021-Jul, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-021-03415-3
PMID:34050387
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research paper | 本文提出了一种基于低熔点琼脂糖凝胶的改进多重置换扩增（MDA）方法，名为gelMDA，用于提高单细胞基因组扩增的效率和减少扩增偏差。 | gelMDA方法通过使用低熔点琼脂糖凝胶，显著提高了扩增的灵敏度和产物产量，同时降低了变异系数（CV）和提高了重现性。 | NA | 研究旨在改进单细胞全基因组扩增技术，提高扩增效率并减少扩增偏差。 | 单细胞基因组和转录组的扩增与测序。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 直径为30μm的组织切片区域 |
| 124 | 2024-08-09 |
Human photoreceptor cells from different macular subregions have distinct transcriptional profiles
2021-07-28, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab140
PMID:34014299
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序比较了人眼中央视网膜同心区域的基因表达，揭示了不同视网膜区域的独特分子特征 | 首次详细描述了视网膜转录组的空间特征，并发现了特定区域特有的基因表达模式和差异剪接基因 | NA | 探究人眼中央视网膜不同区域的基因表达差异 | 人眼中央视网膜的锥状光感受器细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 125 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlas of Endothelial Cells of the Human Lung
2021-07-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文提供了一个全面的人类肺部内皮细胞参考图谱，通过重新分析6个数据集的单细胞RNA测序数据，揭示了肺部内皮细胞的多样性和组成。 | 发现了先前未被识别的肺部内皮细胞亚群，并通过跨物种分析确认了这些细胞类型在人类和老鼠中的存在。 | NA | 提供一个详细的肺部内皮细胞图谱，以促进对肺部内皮细胞多样性和组成的更好理解。 | 人类和小鼠的肺部内皮细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过15,000个血管内皮细胞来自73个个体 |
| 126 | 2024-08-09 |
Single-cell co-expression analysis reveals that transcriptional modules are shared across cell types in the brain
2021-07-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.04.010
PMID:34015329
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了大脑中跨细胞类型的转录模块共享现象 | 利用大脑细胞普查网络的单细胞RNA测序数据，首次展示了跨细胞类型的共享转录调控信号 | NA | 探究基因-基因关系如何塑造细胞身份 | 大脑中的细胞类型及其转录调控模块 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 500,000个细胞/核，涵盖7个BICCN数据集 |
| 127 | 2024-08-09 |
Treg cell-derived osteopontin promotes microglia-mediated white matter repair after ischemic stroke
2021-07-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.04.022
PMID:34015256
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞（Treg细胞）在缺血性中风后对长期组织修复的有益作用及其机制 | 发现Treg细胞通过分泌骨桥蛋白促进小胶质细胞介导的白质修复 | NA | 揭示Treg细胞作为中风恢复的神经修复目标 | Treg细胞在中风后的作用及其对白质修复的影响 | NA | 中风 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠实验中风模型 |
| 128 | 2024-08-09 |
Functionally distinct POMC-expressing neuron subpopulations in hypothalamus revealed by intersectional targeting
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00854-0
PMID:34002087
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研究论文 | 本文通过交叉定位技术揭示了下丘脑中表达POMC的神经元亚群具有不同的功能特性 | 开发了新的鼠模型，通过交叉Cre/Dre依赖的重组技术成功标记、翻译组学分析和功能表征了表达瘦素受体和胰高血糖素样肽1受体的不同POMC神经元 | 尚未解决POMC神经元异质性的确切分子基础和功能后果 | 揭示下丘脑中POMC表达神经元的功能异质性和分子基础 | 下丘脑弓状核中表达POMC的神经元 | NA | NA | 交叉Cre/Dre依赖的重组技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19
2021-07-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI148517
PMID:34003804
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段在上呼吸道中的细胞嗜性，特别是鼻纤毛细胞 | 本文首次展示了SARS-CoV-2在多纤毛上皮细胞中的蛋白质水平相对较高，并且其定位局限于细胞的顶侧 | NA | 探讨SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性，并提出预防病毒传播的策略 | SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性及病毒复制情况 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-Seq | NA | 蛋白质水平数据 | 患者样本 |
| 130 | 2024-08-09 |
Genome stabilization by RAD51-stimulatory compound 1 enhances efficiency of somatic cell nuclear transfer-mediated reprogramming and full-term development of cloned mouse embryos
2021-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13059
PMID:34021643
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研究论文 | 本文研究了RAD51刺激化合物1通过增强体细胞核转移介导的重编程效率和克隆小鼠胚胎的完整发育，从而稳定基因组的作用。 | 通过补充RS-1激活剂，增加RAD51表达和DSB焦点，从而提高SCNT重编程效率，并观察到大量基因的重新激活，可能与克服发育障碍有关。 | NA | 研究基因组不稳定性和DNA损伤在体细胞重编程过程中的作用，以及如何通过修复这些损伤来提高重编程效率。 | 体细胞核转移（SCNT）介导的重编程过程中的基因组稳定性和DNA损伤修复。 | NA | NA | 体细胞核转移（SCNT），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
Transcriptome landscape of double negative T cells by single-cell RNA sequencing
2021-07, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2021.102653
PMID:34022742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自C57BL/6小鼠脾脏的28,835个单个免疫细胞，揭示了五种转录上不同的幼稚DNT细胞簇，这些细胞簇表达独特的基因集并主要执行辅助T细胞、细胞毒性和先天免疫功能 | 本研究首次详细描述了幼稚和激活状态下的DNT细胞的异质性，解决了关于DNT细胞的争议，并提供了潜在的转录特征 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 揭示DNT细胞的分子和功能特征，以及它们在免疫系统中的作用 | DNT细胞的转录组特征及其在免疫系统中的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,835个单个免疫细胞 |
| 132 | 2024-08-09 |
Active Flow Control and Dynamic Analysis in Droplet Microfluidics
2021-07-27, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
|
综述 | 本文综述了液滴微流控领域中最近开发的流体控制技术以及与分析方法的独特集成，重点关注自动化和与模拟/数字域的连接 | 本文强调了液滴微流控技术在自动化和与分析方法集成方面的新进展 | 目前大多数分析读出是光学性质的，且样本准备和液滴形成及操作主要依赖被动手段 | 探讨液滴微流控技术的发展潜力及其在分析科学中的应用 | 液滴微流控技术及其在分析方法中的集成 | 微流控 | NA | 液滴微流控 | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
Parallel functional reduction in the mitochondria of apicomplexan parasites
2021-07-12, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2021.04.028
PMID:33974849
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，对寄生虫门中的早期分化线格拉雷纳的线粒体代谢谱进行了表征，发现其线粒体能量代谢显著减少，并多次平行发生功能性减少。 | 本研究揭示了格拉雷纳寄生虫线粒体的严重功能性减少，并展示了从完全需氧的器官到功能极度减少的'线粒体'的广泛功能范围，扩展了含有线粒体相关器官的生物多样性。 | NA | 探究寄生虫门中早期分化线格拉雷纳的线粒体代谢谱及其功能性减少的机制。 | 格拉雷纳寄生虫的线粒体代谢谱及其功能性减少。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
SchistoCyte Atlas: A Single-Cell Transcriptome Resource for Adult Schistosomes
2021-07, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2021.04.010
PMID:33975779
|
research paper | 本文介绍了SchistoCyte Atlas，一个用于探索成年曼氏血吸虫单细胞分辨率基因表达的网络平台。 | SchistoCyte Atlas为非专业人士提供了全球可访问的资源，加速了对这些破坏性寄生虫生物学的理解。 | NA | 旨在探索成年血吸虫的单细胞分辨率基因表达。 | 成年曼氏血吸虫的单细胞基因表达。 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
Single-cell Profiles and Prognostic Impact of Tumor-Infiltrating Lymphocytes Coexpressing CD39, CD103, and PD-1 in Ovarian Cancer
2021-07-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4394
PMID:33963000
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研究论文 | 本研究评估了在卵巢癌中表达CD39、CD103和PD-1的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的表型、克隆性和预后意义 | 首次详细描述了同时表达CD39、CD103和PD-1的TIL亚群，并揭示了其在卵巢癌中的预后价值和潜在的免疫治疗靶点 | NA | 探讨肿瘤浸润淋巴细胞中特定标记物的表达及其在卵巢癌中的预后影响 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSC）中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高维流式细胞术、单细胞测序、多重免疫荧光 | NA | 细胞 | 初级和匹配的化疗前/后HGSC样本 |
| 136 | 2024-08-09 |
Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010
PMID:33964410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术描绘了人类角膜缘组织的细胞图谱，并揭示了其在角膜稳态和免疫血管生成特权中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了人类角膜缘组织的细胞类型和状态，揭示了角膜缘干细胞/祖细胞在细胞间通讯中的核心作用及其与微环境细胞的双向调控关系 | NA | 描绘人类角膜缘组织的细胞图谱，揭示其在角膜稳态和免疫血管生成特权中的作用 | 人类角膜缘组织的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 细胞 | 从六个人类角膜缘组织中收集了47,627个细胞 |
| 137 | 2024-08-09 |
Cellular components of the hematopoietic niche and their regulation of hematopoietic stem cell function
2021-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000656
PMID:33966008
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSC）功能的调控机制，特别是骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | 利用转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学和活体动物成像等新技术，揭示了HSC在骨内的位置及维持微环境所需的信号分子 | NA | 探讨造血干细胞的发育和功能如何被造血微环境中的多种细胞成分调控 | 骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | NA | NA | 转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学、活体动物成像 | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics: Molecular Maps of the Mammalian Brain
2021-07-08, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
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综述 | 本文综述了空间转录组学在神经解剖学中的应用及其对大脑分子图谱构建的影响 | 空间转录组学开启了神经解剖学的新时代，通过无监督和无偏见地探索组织结构的分子特征，推动新一代大脑图谱的产生 | NA | 探讨空间转录组学如何通过基因表达谱对大脑区域进行分子分类，从而超越主观的神经解剖学定义 | 哺乳动物大脑的分子图谱 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
Expression map of entry receptors and infectivity factors for pan-coronaviruses in preimplantation and implantation stage human embryos
2021-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-021-02192-3
PMID:33913101
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研究论文 | 本文分析了公开的单细胞RNA测序数据，研究了人类胚胎在植入前和植入阶段对多种冠状病毒的易感性 | 首次分析了人类胚胎中多种冠状病毒的进入受体和感染因子的表达图谱 | NA | 预测发育中的人类胚胎是否对多种冠状病毒易感 | 人类胚胎在植入前和植入阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同发育阶段的人类胚胎细胞 |
| 140 | 2024-08-09 |
ChrNet: A re-trainable chromosome-based 1D convolutional neural network for predicting immune cell types
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.037
PMID:33932523
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研究论文 | 本文介绍了一种基于染色体的可重训练一维卷积神经网络（ChrNet），用于预测免疫细胞类型 | ChrNet利用基因在染色体上的位置信息，提高了细胞类型分类的性能 | NA | 提高肿瘤微环境中免疫细胞类型的识别准确性，以改善癌症的临床预后和治疗管理 | 免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 一维卷积神经网络（1D-CNN） | CNN | 基因数据 | NA |