单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 182 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-08 |
Characterizing dedifferentiation of thyroid cancer by integrated analysis
2021-Jul, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf3657
PMID:34321197
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对甲状腺癌的异质性和分化过程进行了深入分析 | 首次在单细胞分辨率下描绘了甲状腺癌的分化过程及其抑制性免疫微环境，并揭示了CREB3L1在甲状腺癌分化相关通路中的潜在驱动作用 | NA | 深入理解甲状腺癌的去分化过程及其对患者预后的影响 | 甲状腺癌的异质性、分化过程及其分子机制 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 46,205个细胞 |
| 62 | 2024-08-08 |
A single-cell type transcriptomics map of human tissues
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh2169
PMID:34321199
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学分析和空间抗体为基础的蛋白质组学，创建了人类组织的高分辨率单细胞类型图谱 | 本文创新性地推出了一个开放访问图谱，允许研究人员探索192个单细胞类型簇中人类蛋白质编码基因的表达 | NA | 旨在绘制人类体内细胞、组织和器官的基因表达图谱 | 人类组织的单细胞类型转录组 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 192个单细胞类型簇 |
| 63 | 2024-08-08 |
Direct identification of neoantigen-specific TCRs from tumor specimens by high-throughput single-cell sequencing
2021-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002595
PMID:34321276
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞测序技术，直接从肿瘤样本中识别新抗原特异性T细胞受体（TCR） | 开发了一种新的流程，利用高通量单细胞测序技术从肿瘤样本中分离新抗原特异性TCR序列 | NA | 研究T细胞介导的免疫治疗反应，并开发基于T细胞的肿瘤特异性突变治疗方法 | 新抗原特异性T细胞受体（TCR） | 数字病理学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | 高通量单细胞测序 | NA | TCR序列 | 从三个黑色素瘤和三个结直肠癌肿瘤样本中分离出28个新抗原特异性TCR |
| 64 | 2024-08-08 |
Combining single-cell sequencing to identify key immune genes and construct the prognostic evaluation model for colon cancer patients
2021-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.465
PMID:34323426
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-08 |
Single-cell alternative polyadenylation analysis delineates GABAergic neuron types
2021-07-23, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01076-3
PMID:34301239
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAPAS的新型计算框架，用于利用3'-tag-based scRNA-seq数据在单细胞水平上识别新的多聚腺苷酸位点并量化APA | 首次在单细胞水平上系统研究APA，并开发了SAPAS框架 | NA | 研究APA在单细胞水平上的作用及其对细胞异质性的影响 | GABA能中间神经元的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA-seq数据 | GABA能中间神经元的单细胞RNA测序数据 |
| 66 | 2024-08-08 |
Plaque-associated human microglia accumulate lipid droplets in a chimeric model of Alzheimer's disease
2021-07-23, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00473-0
PMID:34301296
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研究论文 | 研究报告了在阿尔茨海默病（AD）的嵌合模型中，人类斑块相关的小胶质细胞积累脂滴的情况，并探讨了TREM2 R47H突变对此的影响。 | 首次揭示了在AD患者中，人类斑块相关的小胶质细胞（DAMs）中脂滴的积累情况，并探讨了TREM2 R47H突变对此的影响。 | 研究仅在嵌合阿尔茨海默病小鼠模型中进行，尚未在人类患者中直接验证。 | 探讨TREM2 R47H突变对人类小胶质细胞功能的影响，特别是在脂滴积累和斑块反应性方面。 | 人类野生型和同源TREM2-R47H诱导多能干细胞（iPSC）衍生的小胶质细胞前体。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序和组织学分析 | 嵌合模型 | 单细胞RNA测序数据和组织学图像 | 从嵌合AD小鼠中分离的人类野生型TREM2和同源TREM2-R47H DAM异种移植小胶质细胞（xMGs） |
| 67 | 2024-08-08 |
EGR1 dysregulation defines an inflammatory and leukemic program in cell trajectory of human-aged hematopoietic stem cells (HSC)
2021-07-22, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02498-0
PMID:34294125
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析650个单细胞转录组，揭示了人类衰老造血干细胞（HSC）中EGR1上调及其与炎症和白血病相关转录程序的关系。 | 首次揭示了EGR1在衰老HSC中的上调及其与炎症和白血病相关转录程序的关系。 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及实验验证。 | 揭示衰老过程中造血干细胞分子机制的精确机制。 | 人类衰老的造血干细胞（HSC）。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 650个单细胞 |
| 68 | 2024-08-08 |
CD8+ tissue-resident memory T cells promote liver fibrosis resolution by inducing apoptosis of hepatic stellate cells
2021-07-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24734-0
PMID:34294714
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研究论文 | 本文通过小鼠饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎（NASH）及其后续的纤维化缓解模型，展示了CD8组织驻留记忆T（CD8 Trm）细胞在缓解肝纤维化中的直接作用 | 首次揭示了CD8 Trm细胞在肝纤维化缓解中的作用，并通过单细胞转录组分析和流式细胞术验证了其在NASH缓解肝脏中的富集 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究CD8 Trm细胞在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）及其肝纤维化缓解中的作用机制 | CD8 Trm细胞在肝纤维化缓解中的作用及其分子机制 | NA | 肝病 | 单细胞转录组分析，流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠模型及NASH患者肝脏样本 |
| 69 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome and TCR profiling reveal activated and expanded T cell populations in Parkinson's disease
2021-Jul-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00280-3
PMID:34282123
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和TCR测序，综合分析了帕金森病（PD）患者血液和脑脊液中T细胞的组成、功能和谱系关系 | 发现了PD患者中从中心记忆到终末效应T细胞的连续进展的CD8 T细胞大群体，以及显著扩增的细胞毒性CD4 T细胞（CD4 CTLs） | NA | 揭示帕金森病中T细胞免疫的重要性 | 帕金森病患者的T细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组测序，TCR测序 | NA | 转录组数据，TCR数据 | 血液和脑脊液样本 |
| 70 | 2024-08-08 |
Correction to: The effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing data
2021-Jul-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07806-9
PMID:34281520
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profile of human pulmonary artery endothelial cells in health and pulmonary arterial hypertension
2021-07-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94163-y
PMID:34282213
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了来自肺移植患者和健康捐赠者的肺动脉内皮细胞的转录组特征 | 首次探索了健康和肺动脉高压（PAH）患者的肺动脉内皮细胞的病理多样性，并揭示了新的生物学途径 | 研究样本量较小，仅包括三名PAH患者和三名健康捐赠者 | 揭示肺动脉高压患者肺动脉内皮细胞的细胞异质性及其与健康状态的差异 | 人肺动脉内皮细胞在健康和肺动脉高压状态下的转录组特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 36,368个PAH内皮细胞和36,086个健康细胞 |
| 72 | 2024-08-08 |
A statistical framework for differential pseudotime analysis with multiple single-cell RNA-seq samples
2021-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.07.10.451910
PMID:34282418
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Lamian的统计框架，用于多样本单细胞RNA测序数据的差异伪时间分析 | Lamian框架能够考虑样本间的变异性，从而减少样本特定的假发现，提高结果的可推广性 | NA | 开发一种新的计算框架，用于比较不同实验条件下多样本的伪时间模式 | 单细胞RNA测序数据中的伪时间轨迹及其在不同生物条件下的变化 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个样本，包括不同疾病严重程度的COVID-19患者 |
| 73 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Unique Entity and Signature Markers of Transit-Amplifying Cells in Human Corneal Limbus
2021-07-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.9.36
PMID:34297801
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，鉴定了人角膜缘基底上皮细胞中的一种独特的过渡放大细胞（TAC）群体及其标志性基因 | 首次鉴定了一种独特的TAC实体，并揭示了一组细胞周期依赖性基因作为TAC的标志性标记 | NA | 旨在表征角膜缘基底上皮细胞中候选TAC群体的基因表达谱 | 人角膜缘基底上皮细胞中的过渡放大细胞（TAC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16,360个角膜缘基底细胞 |
| 74 | 2024-08-08 |
Innate-like self-reactive B cells infiltrate human renal allografts during transplant rejection
2021-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24615-6
PMID:34272370
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人肾移植中B细胞在移植排斥中的作用 | 首次揭示了人肾移植中B细胞具有类似先天细胞的转录状态，并能产生针对特定组织或炎症相关抗原的自反应抗体 | NA | 探讨人肾移植中B细胞在移植排斥中的作用机制 | 人肾移植中的B细胞及其在移植排斥中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
YTHDF2 alleviates cardiac hypertrophy via regulating Myh7 mRNA decoy
2021-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00649-7
PMID:34266473
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研究论文 | 本研究探讨了m6A阅读蛋白YTHDF2在心脏肥大中的潜在作用及其机制 | 首次揭示了YTHDF2通过m6A依赖的方式调节Myh7 mRNA来抑制心脏肥大的新机制 | NA | 研究YTHDF2在心脏肥大中的作用及其分子机制 | YTHDF2蛋白在心脏肥大中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 免疫沉淀, 质谱分析, 基因本体论分析, KEGG通路分析 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用横跨主动脉缩窄手术构建的心脏肥大小鼠模型, 以及通过异丙肾上腺素或苯肾上腺素刺激分离的心肌细胞 |
| 76 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of freshly isolated bovine milk cells and cultured primary mammary epithelial cells
2021-07-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-00972-1
PMID:34267220
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了新鲜分离的牛乳细胞和培养的初级乳腺上皮细胞的基因表达谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了牛乳细胞和初级乳腺上皮细胞的基因表达多样性 | 研究仅限于单次样本分析，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探究牛乳中单核细胞组成及其基因表达谱的多样性 | 新鲜分离的牛乳细胞和培养的初级乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | NA | Drop-seq技术 | NA | RNA数据 | 7,119个牛乳细胞和10,549个初级乳腺上皮细胞 |
| 77 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal dynamics of inner ear sensory and non-sensory cells revealed by single-cell transcriptomics
2021-07-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109358
PMID:34260939
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析揭示了内耳感觉和非感觉细胞的时空动态变化 | 首次通过计算分析单细胞转录组数据，分类并解析了14种个体感觉和非感觉亚型细胞，并揭示了过渡上皮细胞在新生小鼠椭圆囊扩张过程中的动态增殖和分化过程 | NA | 揭示非感觉上皮细胞如何参与新生小鼠感觉上皮生长的顺序和协调过程 | 内耳感觉和非感觉细胞的类型多样性和细胞添加机制 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
scPNMF: sparse gene encoding of single cells to facilitate gene selection for targeted gene profiling
2021-07-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab273
PMID:34252925
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研究论文 | 本文开发了一种名为scPNMF的单细胞投影非负矩阵分解方法，用于从scRNA-seq数据中无监督地选择信息基因 | scPNMF方法通过改进初始化和增加基选择步骤，能够更好地区分细胞类型，并支持新目标基因分析数据与参考数据在低维空间中的对齐 | NA | 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中选择信息基因，以促进目标基因分析 | 单细胞RNA测序数据中的信息基因选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(PNMF) | 基因表达数据 | 多种scRNA-seq数据集 |
| 79 | 2024-08-08 |
CALLR: a semi-supervised cell-type annotation method for single-cell RNA sequencing data
2021-07-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab286
PMID:34252936
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研究论文 | 本文提出了一种名为CALLR的半监督细胞类型注释方法，用于单细胞RNA测序数据 | CALLR方法结合了基于图拉普拉斯矩阵的无监督学习和使用稀疏逻辑回归的监督学习，通过交替更新细胞聚类和注释标签，实现了高注释准确性 | NA | 提出一种新的半监督学习方法，用于提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏逻辑回归 | RNA测序数据 | 10个真实数据集 |
| 80 | 2024-08-08 |
stPlus: a reference-based method for the accurate enhancement of spatial transcriptomics
2021-07-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab298
PMID:34252941
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研究论文 | 本文提出了一种基于参考的方法stPlus，利用单细胞RNA测序数据增强空间转录组学 | stPlus通过精心设计的自编码器和加权k近邻方法，提高了基因表达预测的准确性和细胞群识别能力 | NA | 旨在提高空间转录组学中基因表达预测的准确性和细胞群识别能力 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 适用于不同基因检测灵敏度水平、样本大小和空间测量基因数量的数据集 |