单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 182 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Discrete limbal epithelial stem cell populations mediate corneal homeostasis and wound healing
2021-07-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.003
PMID:33984282
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高级定量谱系追踪技术，深入分析了小鼠角膜缘上皮细胞，揭示了两种位于不同亚区的角膜缘上皮干细胞（LSCs）群体的存在及其在角膜稳态和伤口愈合中的作用 | 本文首次揭示了角膜缘上皮干细胞存在两种不同的群体，分别位于外缘和内缘，各自在伤口愈合和角膜上皮稳态维持中发挥作用 | NA | 研究角膜缘上皮干细胞在角膜稳态和伤口愈合中的作用机制 | 小鼠角膜缘上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量谱系追踪 | NA | RNA | 小鼠角膜缘上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma
2021-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103459
PMID:34192657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了食管非恶性组织和食管鳞状细胞癌的转录组网络，揭示了肿瘤微环境中的细胞异质性和相互作用。 | 研究首次识别了食管鳞状细胞癌的四个恶性特征，并构建了细胞间通信图谱，为食管鳞状细胞癌的治疗提供了新的潜在标记和靶点。 | 研究仅使用了五个肿瘤样本和五个非恶性样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 探究食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境及其异质性，为临床管理提供新的治疗靶点。 | 食管非恶性组织和食管鳞状细胞癌的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 128,688个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Single-cell spatial transcriptomic analysis reveals common and divergent features of developing postnatal granule cerebellar cells and medulloblastoma
2021-07-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01071-8
PMID:34210306
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学分析，揭示了发育中的小脑颗粒细胞与髓母细胞瘤之间的共同特征和差异 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细分析了小脑颗粒细胞的发育状态及其与髓母细胞瘤的关系 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究小脑颗粒细胞发育过程中的转录调控及其与髓母细胞瘤的关系 | 小脑颗粒细胞和髓母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24,919个小鼠小脑细胞和18,372个Patched+/-突变小鼠细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Mammalian tracheal development and reconstruction: insights from in vivo and in vitro studies
2021-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.198192
PMID:34228796
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综述 | 本文综述了哺乳动物气管发育及从多能干细胞生成气管组织的最新进展 | 采用单细胞测序技术和定量分析方法，从细胞到组织层面解析了气管形态发生的细胞基础 | NA | 探讨气管发育异常的原因及开发从干细胞重建三维气管的技术 | 哺乳动物的气管发育和重建 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞和组织数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
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研究论文 | 研究了斑马鱼肠道中胆盐的微生物代谢及其对法尼醇X受体（Fxr）信号传导的影响 | 首次展示了斑马鱼中肝脏胆盐合成和回肠运输途径的关键成分的保守性，并揭示了胆盐微生物修饰对Fxr活性的增强作用 | NA | 探讨非哺乳脊椎动物中胆盐代谢和Fxr信号传导的机制 | 斑马鱼肠道中的胆盐合成、分泌、吸收及其对Fxr信号的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing analyses suggest developmental paths of cancer-associated fibroblasts with gene expression dynamics
2021-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.487
PMID:34323427
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
A safe and effective mucosal RSV vaccine in mice consisting of RSV phosphoprotein and flagellin variant
2021-07-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109401
PMID:34289371
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研究论文 | 本文构建了一种重组蛋白P-KFD1，由RSV磷蛋白和E. coli K12株衍生的鞭毛蛋白变体KFD1组成，通过鼻内免疫在小鼠中抑制RSV复制并保护其免受肺部疾病的影响。 | 首次报道了使用P-KFD1重组蛋白作为鼻内疫苗，有效抑制RSV复制并保护小鼠免受肺部疾病的影响，且无疫苗增强疾病（VED）。 | 研究仅在 mice 模型中进行，尚未在人类中验证其安全性和有效性。 | 开发一种安全有效的黏膜RSV疫苗。 | RSV病毒和小鼠模型。 | 疫苗学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Regional specialization and fate specification of bone stromal cells in skeletal development
2021-07-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109352
PMID:34260921
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研究论文 | 本文通过小鼠遗传学、体外细胞分化实验和转录组分析，研究了骨髓间充质干细胞（BMSCs）在骨骼发育中的区域特异性和命运指定 | 首次揭示了来自骨干（dpMSCs）和骨骺（mpMSCs）的BMSCs之间的根本差异，并阐明了BMSC命运受PDGFRβ信号和转录因子Jun-B调控的机制 | NA | 深入理解BMSC在骨骼发育中的发展、谱系关系和分化 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其在骨骼发育中的作用 | NA | NA | 小鼠遗传学、体外细胞分化实验、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Single-nucleus RNA-seq2 reveals functional crosstalk between liver zonation and ploidy
2021-07-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24543-5
PMID:34253736
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研究论文 | 本文开发了一种针对冷冻组织核转录组全面分析的单核RNA-seq2方法，用于揭示肝细胞不同倍性水平下的转录组特征及其与代谢潜能和空间分布的关系 | 开发了适用于冷冻组织核转录组分析的单核RNA-seq2方法，揭示了肝细胞倍性与代谢潜能及空间分布之间的相互作用 | NA | 探索细胞异质性，特别是肝细胞中倍性状态与代谢潜能及空间分布的关系 | 肝细胞的转录组特征及其与倍性状态的关系 | 数字病理学 | NA | 单核RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model
2021-07-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-93330-5
PMID:34230565
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研究论文 | 本研究通过使用共生模型对小鼠网膜进行单细胞RNA测序，揭示了网膜激活和扩张的细胞基础 | 发现了一种新的细胞群，该细胞群在激活的网膜中同时表达巨噬细胞和成纤维细胞标记，表明其可能源自循环巨噬细胞衍生的成纤维细胞样细胞 | 文章未明确提及研究的具体局限性 | 探究网膜在激活过程中的细胞类型变化及其来源 | 小鼠网膜细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Coupled analysis of transcriptome and BCR mutations reveals role of OXPHOS in affinity maturation
2021-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00936-y
PMID:34031613
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和主题建模分析了氧化磷酸化(OXPHOS)模块在生发中心(GC)B细胞中的表达，并结合免疫球蛋白重链(Igh)可变基因区域的体细胞超突变分析，揭示了OXPHOS在亲和力成熟中的作用。 | 首次揭示了氧化磷酸化(OXPHOS)在生发中心B细胞亲和力成熟中的作用，并通过实验验证了OXPHOS活性对B细胞克隆扩增和正选择的促进作用。 | NA | 阐明氧化磷酸化在生发中心B细胞亲和力成熟过程中的作用机制。 | 生发中心B细胞及其在亲和力成熟过程中的基因表达和突变。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，主题建模 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of human oocyte ageing
2021-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16594
PMID:34037315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类卵母细胞老化过程中的关键基因和生物信号通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人类卵母细胞老化过程中的差异表达基因及其富集的生物过程 | 研究样本量较小，且仅包括老年和年轻患者，可能影响结果的普遍性 | 探究人类卵母细胞老化过程中的关键基因和相关生物信号通路 | 人类卵母细胞 | 基因组学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 9个RNA-seq数据集，包括6名老年患者和3名年轻患者 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Modeling gene regulatory networks using neural network architectures
2021-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00099-8
PMID:38217125
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeepSEM的深度生成模型，用于联合推断基因调控网络（GRN）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的生物学意义表示 | 开发了一种神经网络版本的结构方程模型（SEM），明确模拟基因间的调控关系 | NA | 研究目的是开发一种新方法来分析单细胞RNA测序数据并推断基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Extrathymic Aire-expressing cells support maternal-fetal tolerance
2021-07-16, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf1968
PMID:34272228
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研究论文 | 研究探讨了AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用，发现母体中AIRE表达细胞的缺失会导致小鼠早期妊娠中的宫内生长受限 | 报道了一种维持母体-胎儿免疫稳态的新机制，并证明外胸腺AIRE表达细胞（eTACs）保护胚胎免受免疫介导的宫内生长受限 | NA | 研究AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用 | AIRE表达细胞在母体-胎儿耐受中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠妊娠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-08 |
Single Cell Technologies: Beyond Microfluidics
2021-07-29, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0001822021
PMID:35368355
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research paper | 本文探讨了不依赖微流控技术的单细胞RNA测序（scRNA-seq）新方法 | 介绍了不依赖微流控技术的新型scRNA-seq方法，这些方法成本低、高度可定制，适用于具备分子生物学知识的实验室 | 目前广泛采用的10× Genomics解决方案存在高成本、中等通量和固定试剂盒组件导致的不可定制性 | 研究不依赖微流控技术的单细胞RNA测序新方法 | 单细胞RNA测序技术 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Approaches for Tracing T Cell Development
2021-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100408
PMID:34644259
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在追踪T细胞发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率，以分析细胞身份及其基因表达程序 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何提供对T细胞发育的深入见解 | T细胞发育过程中的细胞身份和基因表达程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-08 |
Development of metastasis-associated seven gene signature for predicting lung adenocarcinoma prognosis using single-cell RNA sequencing data
2021-07-01, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021298
PMID:34517518
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，开发了一种与转移相关的七个基因特征，用于预测肺腺癌患者的预后 | 首次基于单细胞RNA测序数据开发了与转移相关的七个基因特征，用于预测肺腺癌患者的总体生存率，并揭示了其潜在的分子机制 | NA | 开发一种新的基因特征，用于预测肺腺癌患者的预后 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox比例风险回归模型和LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 训练组236例，测试组232例，整个TCGA-LUAD队列468例 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-08 |
Regulation of CTLA-4 and PD-L1 Expression in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis Patients after Treatment with Fingolimod, IFNβ-1α, Glatiramer Acetate, and Dimethyl Fumarate Drugs
2021-Jul-27, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11080721
PMID:34442365
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研究论文 | 研究评估了多发性硬化症患者在接受不同药物治疗后，外周血单个核细胞中CTLA-4和PD-L1基因表达的变化 | 使用单细胞RNA测序数据评估多发性硬化症患者不同细胞类型中CTLA-4和PD-L1的基因表达 | NA | 研究CTLA-4和PD-L1表达在多发性硬化症治疗中的变化及其对疾病发展的影响 | 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-08 |
[Clinical importance of screening differential gene set of monocytes based on single-cell sequencing and digital polymerase chain reaction technology for early diagnosis of sepsis]
2021-Jul, Zhonghua wei zhong bing ji jiu yi xue
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研究论文 | 本研究旨在验证脓毒症中特定分化的单核细胞亚群，并通过单细胞测序和数字聚合酶链反应技术筛选和构建用于早期诊断脓毒症的单核细胞差异基因集 | 通过单细胞测序和数字PCR技术筛选出具有可靠诊断价值的单核细胞差异基因集，为早期诊断脓毒症提供新思路 | NA | 验证脓毒症中单核细胞的特定分化亚群，并筛选构建用于早期诊断的差异基因集 | 脓毒症患者的单核细胞及其差异基因集 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序技术，数字聚合酶链反应（PCR）技术 | NA | 基因表达数据 | 从2020年6月至2021年3月，广东省人民医院收治的脓毒症患者中提取外周血单个核细胞（PBMC） | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-08 |
Keratin Profiling by Single-Cell RNA-Sequencing Identifies Human Prostate Stem Cell Lineage Hierarchy and Cancer Stem-Like Cells
2021-Jul-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22158109
PMID:34360875
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了前列腺球中的上皮细胞谱系层次结构，并通过角蛋白分析识别了人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术对前列腺干细胞及其后代祖细胞进行角蛋白分析，揭示了干细胞和癌症相关通路的富集 | NA | 阐明人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞的角蛋白特征，以促进前列腺癌症干细胞样细胞的鉴定和治疗靶向 | 人类前列腺干细胞及其后代祖细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个前列腺干细胞和祖细胞集群 | NA | NA | NA | NA |