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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-29 |
Sequential regulation of hemogenic fate and hematopoietic stem and progenitor cell formation from arterial endothelium by Ezh1/2
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.014
PMID:34143974
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研究论文 | 该研究揭示了Ezh1/2通过顺序调控动脉内皮细胞中的血液生成命运和造血干祖细胞形成的机制 | 首次阐明Ezh1在脊椎动物造血干祖细胞产生中的表观遗传调控作用及其与Ezh2的非冗余顺序功能 | 主要在斑马鱼胚胎中进行研究,未在哺乳动物模型中验证,且单细胞RNA测序分析的样本量有限 | 探究Ezh1/2在动脉内皮细胞向血液生成命运转变和造血干祖细胞形成中的调控机制 | 斑马鱼胚胎和诱导多能干细胞来源的体外分化体系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎中ezh1不同基因型的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-29 |
Single-cell RNA-Seq reveals a highly coordinated transcriptional program in mouse germ cells during primordial follicle formation
2021-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13424
PMID:34174788
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示小鼠原始卵泡形成过程中生殖细胞的协调转录程序 | 首次通过单细胞RNA测序构建了新生小鼠卵巢生殖细胞发育轨迹,并利用SCENIC算法识别出可能调控卵泡形成的关键转录因子 | 未明确说明 | 阐明原始卵泡形成过程中卵母细胞的发育轨迹和调控机制 | 新生小鼠卵巢中的单个生殖细胞 | 机器学习 | 原发性卵巢功能不全 | RNA-seq | Monocle, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 新生(P0.5)小鼠卵巢中的单个生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-05-29 |
Genome stabilization by RAD51-stimulatory compound 1 enhances efficiency of somatic cell nuclear transfer-mediated reprogramming and full-term development of cloned mouse embryos
2021-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13059
PMID:34021643
|
研究论文 | 发现通过RAD51激活剂RS-1稳定基因组可提高体细胞核移植重编程效率及克隆小鼠胚胎全程发育能力 | 首次揭示RAD51活性在体细胞核移植胚胎中低于IVF,并通过RS-1激活RAD51增强DNA损伤修复,克服发育阻滞,提高克隆胚胎生产效率 | 未提及具体局限性,可能涉及RS-1的长期安全性或机制中组蛋白去甲基化酶独立通路的细节未完全阐明 | 研究修复遗传不稳定性或DNA双链断裂在体细胞核移植重编程中的作用,以提高胚胎发育效率 | 体外受精胚胎和体细胞核移植来源的小鼠胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 包括体细胞核移植胚胎和IVF胚胎,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-03-06 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为spQSP-IO的混合计算模型平台,用于模拟肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制剂免疫疗法的效果 | 开发了结合定量系统药理学模型和基于代理的空间模型的新平台,以整合空间数据并增强预测能力 | 未明确提及具体数据限制或模型验证的局限性 | 研究肿瘤微环境和癌症-免疫细胞相互作用在肿瘤发展中的作用,并评估抗PD-1治疗的效果 | 非小细胞肺癌的虚拟患者模型 | 机器学习 | 肺癌 | 定量系统药理学模型、基于代理的模型、空间转录组学 | 混合计算模型 | 空间数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-06 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型,揭示了胆汁盐代谢和Fxr信号通路在非哺乳类脊椎动物中的保守性及微生物修饰作用 | 首次在斑马鱼中系统解析了胆汁盐合成、转运及微生物修饰的全过程,并利用单细胞RNA测序构建了肠道上皮细胞图谱,明确了Fxr在回肠及其他细胞类型中的转录调控功能 | 研究主要基于斑马鱼模型,结果向哺乳动物的直接推演可能存在物种差异,且微生物修饰的具体机制仍需进一步探索 | 探究非哺乳类脊椎动物中胆汁盐代谢和Fxr信号通路的保守性与调控机制 | 斑马鱼的肝脏、肠道及肠道微生物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-02 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ClonMapper的功能化谱系追踪系统,该系统整合了DNA条形码、单细胞RNA测序和克隆分离技术,用于全面表征异质群体中的数千个克隆 | 开发了ClonMapper系统,首次将DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离相结合,实现了对特定克隆的活细胞操作和基因组、表观组、转录组测量的整合 | NA | 研究肿瘤进化与治疗过程中的克隆动态 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及原代人类慢性淋巴细胞白血病样本 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | DNA条形码,单细胞RNA测序,克隆分离 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-24 |
Review of multi-omics data resources and integrative analysis for human brain disorders
2021-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elab024
PMID:33969380
|
综述 | 本文综述了人类脑部疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 及时更新了快速发展的多组学数据资源,并涵盖了单细胞组学和空间转录组学等新兴技术 | NA | 总结人类脑部健康与疾病的多组学数据资源及整合分析方法 | 人类大脑,包括健康对照和神经精神疾病患者 | 生物信息学 | 神经精神疾病 | 多组学数据整合分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
New insights for precision treatment of glioblastoma from analysis of single-cell lncRNA expression
2021-Jul, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03584-9
PMID:33693962
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞lncRNA表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型,并提出新的精准治疗策略 | 首次将lncRNA作为分型标志物结合单细胞表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型,揭示了传统组织分型的局限性 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本量有限 | 基于单细胞lncRNA表达谱改进胶质母细胞瘤分子分型并开发精准治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者单细胞测序数据和TCGA数据库组织数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | t-SNE,Seurat无监督聚类 | 单细胞测序数据,基因表达数据 | GSE84465数据库单细胞数据,TCGA数据库组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
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研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因筛选技术研究体细胞核移植重编程抗性基因在小鼠雄性生殖细胞发育中的关键作用 | 首次利用CRISPR技术系统筛选SRRG基因并揭示Cox7b2、Gm773和Tuba3a/3b在精子发生过程中的关键功能 | 研究仅针对五个未表征的SRRG基因,可能遗漏其他重要基因;结果主要基于小鼠模型 | 鉴定影响小鼠雄性生殖细胞发育的关键基因 | C57BL/6N小鼠的雄性生殖细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 多个基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胎盘来源的内皮细胞具有造血潜能并能产生巨噬细胞 | 首次揭示胎盘内皮细胞具有造血潜能并能产生称为霍夫鲍尔细胞样细胞的胎盘巨噬细胞,并鉴定出两种亚型 | 研究仅限于小鼠模型,人类胎盘造血潜能尚需验证 | 探索胚胎其他部位是否能够产生巨噬细胞 | 小鼠胎儿胎盘造血系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Inhibition of lung tumorigenesis by a small molecule CA170 targeting the immune checkpoint protein VISTA
2021-07-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02381-x
PMID:34302042
|
研究论文 | 本研究通过小分子CA170靶向免疫检查点蛋白VISTA抑制肺癌发生 | 首次使用三肽小分子VISTA拮抗剂CA170联合KRAS疫苗实现肺癌发生的几乎完全抑制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探索靶向VISTA的小分子拮抗剂在肺癌免疫治疗中的疗效 | 致癌物诱导的小鼠肺癌模型 | 癌症免疫治疗 | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠肺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Human oral mucosa cell atlas reveals a stromal-neutrophil axis regulating tissue immunity
2021-07-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.013
PMID:34129837
|
研究论文 | 构建人类口腔黏膜单细胞转录组图谱,揭示基质细胞-中性粒细胞轴在组织免疫调控中的作用 | 首次系统揭示口腔黏膜基质细胞通过促进抗菌防御和中性粒细胞招募调控组织免疫平衡的新机制 | NA | 解析口腔黏膜组织特异性病理生理机制 | 健康个体和牙周炎患者的口腔黏膜组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Role of Tim4 in the regulation of ABCA1+ adipose tissue macrophages and post-prandial cholesterol levels
2021-07-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24684-7
PMID:34290249
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研究论文 | 本研究探讨Tim4在脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运中的作用 | 首次发现Tim4通过调节溶酶体功能调控餐后高密度脂蛋白胆固醇释放的新机制 | 研究主要依赖小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 阐明脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运的分子机制 | 脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇代谢 | 免疫代谢 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,骨髓嵌合体模型,细胞清除实验 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
2021-07-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02414-y
PMID:34225769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠和人类红细胞成熟过程中基因表达动力学的协调性阶跃变化 | 发现红细胞成熟过程中存在基因表达动力学的协调性阶跃变化,突破了当前RNA速度分析框架的假设限制 | 当前RNA速度分析工具无法处理表达动力学随时间变化的情况 | 研究红细胞成熟过程中的基因表达动力学特征 | 小鼠胚胎和人类胎儿肝细胞 | 单细胞基因组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA速度分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎时间序列数据集和Gata1缺失嵌合体胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Genome-wide CRISPRi/a screens in human neurons link lysosomal failure to ferroptosis
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00862-0
PMID:34031600
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研究论文 | 通过人类神经元中的全基因组CRISPRi/a筛选,揭示了溶酶体功能障碍与铁死亡之间的关联机制 | 首次在人类神经元中开展全基因组CRISPR干扰和激活筛选,建立了跨细胞类型系统比较基因功能的CRISPRbrain数据平台 | 研究主要聚焦神经元对慢性氧化应激的反应,其他细胞类型的验证相对有限 | 系统理解细胞类型特异性基因功能,特别是神经元在氧化应激下的响应机制 | 人类神经元细胞 | 功能基因组学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰, CRISPR激活, 单细胞转录组学 | CRISPRi/a筛选系统 | 基因表达数据, 功能基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
The co-chaperone Fkbp5 shapes the acute stress response in the paraventricular nucleus of the hypothalamus of male mice
2021-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01044-x
PMID:33649453
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研究论文 | 本研究揭示了Fkbp5在下丘脑室旁核中通过细胞类型特异性方式调节HPA轴活性和急性应激反应的关键作用 | 首次阐明Fkbp5在PVN中通过细胞类型特异性机制调节HPA轴活性,特别是在Crh神经元中的特异性表达和作用 | 研究仅针对雄性小鼠,未涉及雌性动物;Crh特异性Fkbp5过表达仅部分重现PVN特异性表型 | 阐明Fkbp5在下丘脑室旁核中调节HPA轴活性和急性应激反应的具体机制 | 雄性小鼠的下丘脑室旁核神经元,特别是Sim1神经元和Crh神经元 | 神经科学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,基因过表达 | NA | 基因表达数据,神经元活动数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Functionally distinct POMC-expressing neuron subpopulations in hypothalamus revealed by intersectional targeting
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00854-0
PMID:34002087
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研究论文 | 本研究通过交叉遗传学方法揭示了表达POMC的下丘脑神经元中功能不同的亚群 | 开发了新型小鼠模型,首次实现了对表达瘦素受体和胰高血糖素样肽-1受体的不同POMC神经元亚群进行标记、翻译组分析和功能表征 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究下丘脑中POMC表达神经元异质性的分子基础和功能后果 | 小鼠下丘脑弓状核中的POMC表达神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 电生理记录、单细胞测序、交叉Cre/Dre依赖性重组 | 遗传工程小鼠模型 | 电生理数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
A single cell atlas of human cornea that defines its development, limbal progenitor cells and their interactions with the immune cells
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.03.010
PMID:33865984
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序构建了人类角膜从胚胎发育到成年的全面细胞图谱 | 首次在单细胞水平上定义了角膜发育过程、识别了新的角膜缘祖细胞表面标志物GPHA2,并揭示了免疫细胞与角膜缘祖细胞的相互作用 | 样本数量相对有限(4例成人和17例胚胎/胎儿角膜),且主要基于10x Genomics平台的技术分析 | 构建人类角膜发育和成年的单细胞图谱,研究角膜缘祖细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 人类角膜和相邻结膜组织,包括成人、胚胎和胎儿样本 | 单细胞组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光分析, RNA干扰 | Seurat图聚类, UMAP嵌入, 伪时序分析 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 免疫荧光图像 | 21,343个成人角膜细胞和89,897个胚胎/胎儿角膜细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 19 | 2025-10-06 |
Human Dermal Fibroblast Subpopulations Are Conserved across Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.11.028
PMID:33385399
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研究论文 | 通过重新分析13,823个人类成人真皮成纤维细胞的单细胞RNA测序数据,确定了三个主要类型和十个亚型的成纤维细胞分类体系 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集,揭示了人类真皮成纤维细胞的保守亚群分类,提出了包含3个主要类型和10个亚型的统一分类框架 | 研究仅基于已发表的测序数据,未进行新的实验验证;分析局限于成人健康皮肤样本 | 解决单细胞RNA测序研究中成纤维细胞亚群分类不一致的问题,建立统一的分类标准 | 人类成人真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,823个人类成人真皮成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
A review of computational strategies for denoising and imputation of single-cell transcriptomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa222
PMID:33003202
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综述 | 对单细胞转录组数据去噪和插补的计算方法进行全面分析比较 | 首次对19种单细胞转录组数据去噪和插补方法进行系统性定量评估,涵盖多种实验场景和性能指标 | 未提供定量基准测试标准,仅对现有方法进行比较分析 | 评估单细胞转录组数据去噪和插补计算方法的性能 | 19种单细胞转录组数据去噪和插补计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |