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当前共找到 182 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
New insights for precision treatment of glioblastoma from analysis of single-cell lncRNA expression
2021-Jul, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03584-9
PMID:33693962
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞lncRNA表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型，并提出新的精准治疗策略 | 首次将lncRNA作为分型标志物结合单细胞表达谱对胶质母细胞瘤进行重新分型，揭示了传统组织分型的局限性 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本量有限 | 基于单细胞lncRNA表达谱改进胶质母细胞瘤分子分型并开发精准治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者单细胞测序数据和TCGA数据库组织数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | t-SNE，Seurat无监督聚类 | 单细胞测序数据，基因表达数据 | GSE84465数据库单细胞数据，TCGA数据库组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
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研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因筛选技术研究体细胞核移植重编程抗性基因在小鼠雄性生殖细胞发育中的关键作用 | 首次利用CRISPR技术系统筛选SRRG基因并揭示Cox7b2、Gm773和Tuba3a/3b在精子发生过程中的关键功能 | 研究仅针对五个未表征的SRRG基因，可能遗漏其他重要基因；结果主要基于小鼠模型 | 鉴定影响小鼠雄性生殖细胞发育的关键基因 | C57BL/6N小鼠的雄性生殖细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 多个基因敲除小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胎盘来源的内皮细胞具有造血潜能并能产生巨噬细胞 | 首次揭示胎盘内皮细胞具有造血潜能并能产生称为霍夫鲍尔细胞样细胞的胎盘巨噬细胞，并鉴定出两种亚型 | 研究仅限于小鼠模型，人类胎盘造血潜能尚需验证 | 探索胚胎其他部位是否能够产生巨噬细胞 | 小鼠胎儿胎盘造血系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Inhibition of lung tumorigenesis by a small molecule CA170 targeting the immune checkpoint protein VISTA
2021-07-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02381-x
PMID:34302042
|
研究论文 | 本研究通过小分子CA170靶向免疫检查点蛋白VISTA抑制肺癌发生 | 首次使用三肽小分子VISTA拮抗剂CA170联合KRAS疫苗实现肺癌发生的几乎完全抑制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体验证 | 探索靶向VISTA的小分子拮抗剂在肺癌免疫治疗中的疗效 | 致癌物诱导的小鼠肺癌模型 | 癌症免疫治疗 | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠肺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Human oral mucosa cell atlas reveals a stromal-neutrophil axis regulating tissue immunity
2021-07-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.013
PMID:34129837
|
研究论文 | 构建人类口腔黏膜单细胞转录组图谱，揭示基质细胞-中性粒细胞轴在组织免疫调控中的作用 | 首次系统揭示口腔黏膜基质细胞通过促进抗菌防御和中性粒细胞招募调控组织免疫平衡的新机制 | NA | 解析口腔黏膜组织特异性病理生理机制 | 健康个体和牙周炎患者的口腔黏膜组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Role of Tim4 in the regulation of ABCA1+ adipose tissue macrophages and post-prandial cholesterol levels
2021-07-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24684-7
PMID:34290249
|
研究论文 | 本研究探讨Tim4在脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运中的作用 | 首次发现Tim4通过调节溶酶体功能调控餐后高密度脂蛋白胆固醇释放的新机制 | 研究主要依赖小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 阐明脂肪组织巨噬细胞调控餐后胆固醇转运的分子机制 | 脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇代谢 | 免疫代谢 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，骨髓嵌合体模型，细胞清除实验 | NA | 基因表达数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
2021-07-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02414-y
PMID:34225769
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠和人类红细胞成熟过程中基因表达动力学的协调性阶跃变化 | 发现红细胞成熟过程中存在基因表达动力学的协调性阶跃变化，突破了当前RNA速度分析框架的假设限制 | 当前RNA速度分析工具无法处理表达动力学随时间变化的情况 | 研究红细胞成熟过程中的基因表达动力学特征 | 小鼠胚胎和人类胎儿肝细胞 | 单细胞基因组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA速度分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎时间序列数据集和Gata1缺失嵌合体胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Genome-wide CRISPRi/a screens in human neurons link lysosomal failure to ferroptosis
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00862-0
PMID:34031600
|
研究论文 | 通过人类神经元中的全基因组CRISPRi/a筛选，揭示了溶酶体功能障碍与铁死亡之间的关联机制 | 首次在人类神经元中开展全基因组CRISPR干扰和激活筛选，建立了跨细胞类型系统比较基因功能的CRISPRbrain数据平台 | 研究主要聚焦神经元对慢性氧化应激的反应，其他细胞类型的验证相对有限 | 系统理解细胞类型特异性基因功能，特别是神经元在氧化应激下的响应机制 | 人类神经元细胞 | 功能基因组学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰, CRISPR激活, 单细胞转录组学 | CRISPRi/a筛选系统 | 基因表达数据, 功能基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
The co-chaperone Fkbp5 shapes the acute stress response in the paraventricular nucleus of the hypothalamus of male mice
2021-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01044-x
PMID:33649453
|
研究论文 | 本研究揭示了Fkbp5在下丘脑室旁核中通过细胞类型特异性方式调节HPA轴活性和急性应激反应的关键作用 | 首次阐明Fkbp5在PVN中通过细胞类型特异性机制调节HPA轴活性，特别是在Crh神经元中的特异性表达和作用 | 研究仅针对雄性小鼠，未涉及雌性动物；Crh特异性Fkbp5过表达仅部分重现PVN特异性表型 | 阐明Fkbp5在下丘脑室旁核中调节HPA轴活性和急性应激反应的具体机制 | 雄性小鼠的下丘脑室旁核神经元，特别是Sim1神经元和Crh神经元 | 神经科学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，基因过表达 | NA | 基因表达数据，神经元活动数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Functionally distinct POMC-expressing neuron subpopulations in hypothalamus revealed by intersectional targeting
2021-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00854-0
PMID:34002087
|
研究论文 | 本研究通过交叉遗传学方法揭示了表达POMC的下丘脑神经元中功能不同的亚群 | 开发了新型小鼠模型，首次实现了对表达瘦素受体和胰高血糖素样肽-1受体的不同POMC神经元亚群进行标记、翻译组分析和功能表征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究下丘脑中POMC表达神经元异质性的分子基础和功能后果 | 小鼠下丘脑弓状核中的POMC表达神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 电生理记录、单细胞测序、交叉Cre/Dre依赖性重组 | 遗传工程小鼠模型 | 电生理数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
A single cell atlas of human cornea that defines its development, limbal progenitor cells and their interactions with the immune cells
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.03.010
PMID:33865984
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序构建了人类角膜从胚胎发育到成年的全面细胞图谱 | 首次在单细胞水平上定义了角膜发育过程、识别了新的角膜缘祖细胞表面标志物GPHA2，并揭示了免疫细胞与角膜缘祖细胞的相互作用 | 样本数量相对有限（4例成人和17例胚胎/胎儿角膜），且主要基于10x Genomics平台的技术分析 | 构建人类角膜发育和成年的单细胞图谱，研究角膜缘祖细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 人类角膜和相邻结膜组织，包括成人、胚胎和胎儿样本 | 单细胞组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光分析, RNA干扰 | Seurat图聚类, UMAP嵌入, 伪时序分析 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 免疫荧光图像 | 21,343个成人角膜细胞和89,897个胚胎/胎儿角膜细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 12 | 2025-10-06 |
Human Dermal Fibroblast Subpopulations Are Conserved across Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.11.028
PMID:33385399
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研究论文 | 通过重新分析13,823个人类成人真皮成纤维细胞的单细胞RNA测序数据，确定了三个主要类型和十个亚型的成纤维细胞分类体系 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集，揭示了人类真皮成纤维细胞的保守亚群分类，提出了包含3个主要类型和10个亚型的统一分类框架 | 研究仅基于已发表的测序数据，未进行新的实验验证；分析局限于成人健康皮肤样本 | 解决单细胞RNA测序研究中成纤维细胞亚群分类不一致的问题，建立统一的分类标准 | 人类成人真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,823个人类成人真皮成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
A review of computational strategies for denoising and imputation of single-cell transcriptomic data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa222
PMID:33003202
|
综述 | 对单细胞转录组数据去噪和插补的计算方法进行全面分析比较 | 首次对19种单细胞转录组数据去噪和插补方法进行系统性定量评估，涵盖多种实验场景和性能指标 | 未提供定量基准测试标准，仅对现有方法进行比较分析 | 评估单细胞转录组数据去噪和插补计算方法的性能 | 19种单细胞转录组数据去噪和插补计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-07 |
Rapid microfluidic isolation of virally infected primary bronchial epithelial cells for single-cell RNA sequencing
2021-07-16, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0020
PMID:34269076
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研究论文 | 介绍了一种使用微流控设备快速分离病毒感染的原代支气管上皮细胞用于单细胞RNA测序的优化方法 | 开发了可在生物安全柜内操作、使用常规实验室设备即可快速分离病毒感染细胞的微流控方法 | NA | 建立病毒感染支气管上皮细胞的高效分离方法以促进单细胞RNA测序研究 | 病毒感染的原代支气管上皮细胞和细胞系 | 单细胞测序技术 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-07 |
Tenascin-C-mediated suppression of extracellular matrix adhesion force promotes entheseal new bone formation through activation of Hippo signalling in ankylosing spondylitis
2021-07, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220002
PMID:33858850
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研究论文 | 本研究揭示了肌腱蛋白C通过抑制细胞外基质粘附力激活Hippo信号通路，从而促进强直性脊柱炎附着点新骨形成的分子机制 | 首次发现FSP1+成纤维细胞来源的TNC通过调控ECM机械特性激活Hippo/YAP信号通路促进软骨内成骨 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床样本数量有限 | 探究TNC在强直性脊柱炎附着点新骨形成中的作用及分子机制 | 强直性脊柱炎患者韧带组织、胶原抗体诱导关节炎模型、DBA/1小鼠模型 | 病理机制研究 | 强直性脊柱炎 | 免疫组化染色、原子力显微镜、RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 组织样本、基因表达数据、机械特性数据 | 患者手术获取的韧带组织样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2024-10-13 |
Influenza virus infection increases ACE2 expression and shedding in human small airway epithelial cells
2021-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03988-2020
PMID:33419885
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研究论文 | 研究流感病毒感染如何增加人类小气道上皮细胞中ACE2的表达和脱落，从而增加COVID-19的风险 | 首次揭示了流感病毒感染会增加ACE2的表达和脱落，从而增加SARS-CoV-2感染的风险 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨流感病毒感染如何增加COVID-19的风险 | 人类小气道上皮细胞和相关分子 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自非疾病供体肺的初级小气道上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-12 |
Modular, efficient and constant-memory single-cell RNA-seq preprocessing
2021-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00870-2
PMID:33795888
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研究论文 | 描述了一种平衡效率和准确性的单细胞RNA测序数据预处理工作流程 | 工作流程基于kallisto和bustools程序，具有接近最优的速度和恒定的内存需求，适用于任意大规模数据集 | NA | 开发一种高效的单细胞RNA测序数据预处理方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-10-06 |
Assessing the replicability of spatial gene expression using atlas data from the adult mouse brain
2021-07, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001341
PMID:34280183
|
研究论文 | 本文评估了成年小鼠大脑中空间基因表达数据的重复性，特别是通过比较Allen脑图谱和空间转录组学数据集 | 首次使用可行的空间技术对Allen脑图谱的全脑、全转录组空间表达数据进行基准测试，并与第二个独立数据集进行比较 | 模型在不同数据集之间的双向分类性能无法重现，表明跨平台分类不够稳健 | 评估成年小鼠大脑中空间基因表达数据的重复性 | 成年小鼠大脑的空间基因表达数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LASSO回归、线性回归和基于相关性的特征选择 | 基因表达数据 | 成年小鼠大脑的全脑、全转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-10-01 |
Single-cell classification using graph convolutional networks
2021-Jul-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04278-2
PMID:34238220
|
研究论文 | 本文提出了一种名为sigGCN的多模态端到端深度学习模型，用于细胞分类，结合了图卷积网络（GCN）和神经网络来利用基因相互作用网络 | 本文的创新点在于将基因相互作用网络与基因表达数据结合，通过图卷积网络方法提取有效特征，从而提高细胞分类的性能 | NA | 研究目的是通过结合基因相互作用网络和基因表达数据，提高细胞分类的准确性 | 研究对象是单细胞RNA测序（scRNAseq）数据中的细胞分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-09-25 |
Epithelial cell plasticity drives endoderm formation during gastrulation
2021-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00694-x
PMID:34168324
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研究论文 | 本文研究了在原肠胚形成过程中，上皮细胞可塑性驱动内胚层形成的过程 | 本文首次揭示了内胚层的形成独立于经典的EMT过程，而是通过上皮细胞可塑性机制实现的，并发现Foxa2作为上皮门控因子抑制EMT | NA | 揭示原肠胚形成过程中内胚层形成的分子机制 | 胚胎干细胞和鼠胚胎 | NA | NA | 高分辨率单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |