单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 193 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Single-cell data clustering based on sparse optimization and low-rank matrix factorization
2021-06-17, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkab098
PMID:33787873
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研究论文 | 本文提出了一种基于稀疏优化和低秩矩阵分解的单细胞RNA测序数据聚类新算法scSO | scSO算法能够准确预测细胞聚类数量，并正确分类大多数细胞 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏优化和低秩矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个基准数据集 |
| 162 | 2024-08-09 |
Female Immunity Protects from Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2021-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4261
PMID:33795258
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研究论文 | 研究探讨了性别差异对皮肤鳞状细胞癌（cSCC）的影响，发现女性免疫系统在cSCC中提供了更强的保护作用 | 首次展示了女性免疫系统在cSCC中的保护作用，以及性别对癌症免疫相关表达途径和T细胞浸润的影响 | 研究主要集中在免疫功能正常和免疫抑制的患者以及小鼠模型上，可能需要更多样化的样本和模型来验证结果 | 探讨性别差异在皮肤鳞状细胞癌中的影响及其分子机制 | 免疫功能正常和免疫抑制的皮肤鳞状细胞癌患者，以及FVB/N小鼠和人类角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 738名免疫功能正常的cSCC患者，160名免疫抑制的cSCC患者，63名晚期cSCC患者，20名晚期cSCC患者，以及FVB/N小鼠和人类角质形成细胞 |
| 163 | 2024-08-09 |
Inhibition of macrophage histone demethylase JMJD3 protects against abdominal aortic aneurysms
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201839
PMID:33779682
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研究论文 | 本研究探讨了抑制巨噬细胞组蛋白去甲基酶JMJD3对腹主动脉瘤的保护作用 | 首次揭示了JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用，并提出了针对JMJD3的细胞特异性药物治疗可能是一种有效的干预方法 | NA | 研究JMJD3在腹主动脉瘤形成中的作用及潜在的治疗策略 | 腹主动脉瘤中的巨噬细胞和JMJD3酶 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用人类腹主动脉瘤组织进行研究 |
| 164 | 2024-08-09 |
Combining segmental bulk- and single-cell RNA-sequencing to define the chondrocyte gene expression signature in the murine knee joint
2021-06, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.03.007
PMID:33762205
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研究论文 | 本研究通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，定义了小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 提出了一种新的实用方法，通过结合批量RNA测序和单细胞RNA测序来解决从小鼠膝关节中提取软骨细胞转录组的技术难题 | NA | 精确描绘软骨细胞的转录组，并研究未来小鼠OA模型中软骨细胞的疾病表型 | 小鼠膝关节软骨细胞的基因表达特征 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 批量RNA测序分析了不同段，单细胞RNA测序分析了包含主要软骨细胞的131个细胞簇 |
| 165 | 2024-08-09 |
Regenerative cross talk between cardiac cells and macrophages
2021-06-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00056.2021
PMID:33769920
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研究论文 | 本文通过分析多个RNA测序数据集，研究了心肌细胞和巨噬细胞之间的再生交叉对话，以及这种对话如何随着年龄变化影响心脏的再生能力 | 首次详细探讨了巨噬细胞在心脏再生中的作用及其随年龄变化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 揭示心脏再生过程中心肌细胞与巨噬细胞之间的交叉对话及其分子机制 | 心肌细胞和巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠心脏样本 |
| 166 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of radiosensitivity in head and neck squamous cell carcinoma
2021-06, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2021.03.017
PMID:33775714
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据、大量组织测序数据和反卷积数据，全面分析了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 发现了HNSCC细胞的放射敏感性聚类与分子分型高度一致，并开发了一种放射抗性评分，识别了可能从联合放疗和免疫检查点阻断中受益的HNSCC群体 | NA | 全面探讨HNSCC的放射抗性，并提出新的治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的放射敏感性 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序, RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, 大量组织测序数据 | 1388个原发性癌细胞, 499个原发性HNSCC样本 |
| 167 | 2024-08-09 |
Advances and Opportunities in Single-Cell Transcriptomics for Plant Research
2021-06-17, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
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综述 | 本文综述了近年来植物单细胞转录组学的主要进展，并提供了一个从样本准备到数据分析的全面指南 | 介绍了单细胞转录组学在植物生物学领域的最新技术和应用 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响和加速植物特定研究 | 植物生物学中的单细胞转录组学技术 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Mouse multipotent progenitor 5 cells are located at the interphase between hematopoietic stem and progenitor cells
2021-06-10, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007876
PMID:33754628
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研究论文 | 本研究通过表型定义和功能特征化MPP5细胞，并使用RNA测序分析来全面分析LSK细胞室，重点关注新定义的MPP5亚群的功能和分子特性 | 首次定义和功能特征化MPP5细胞，并展示了其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的动态和多功能性 | NA | 研究造血干细胞和多能祖细胞的特性和功能 | MPP5细胞及其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | LSK细胞 |
| 169 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Paracrine Functions of the Epicardial-Derived Cells in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2021-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌功能 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌作用，特别是TGFβ1和成纤维细胞生长因子的表达 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 | 探讨心外膜在心律失常性心肌病发病机制中的作用 | 心外膜来源细胞及其在心律失常性心肌病中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约18,000个增强绿色荧光蛋白标记的心外膜来源细胞 |
| 170 | 2024-08-09 |
TCF7 is not essential for glucose homeostasis in mice
2021-06, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101213
PMID:33741532
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF7在小鼠肝细胞和胰岛β细胞中的表达对葡萄糖稳态的相对代谢重要性 | 发现TCF7表达并非小鼠葡萄糖稳态的关键决定因素，且胰岛中TCF7的表达主要来自与胰岛相关的免疫细胞而非β细胞 | NA | 研究TCF7在肝细胞和胰岛β细胞中的表达对小鼠葡萄糖稳态的影响 | 小鼠的肝细胞和胰岛β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用不同饮食的小鼠进行实验，包括常规饮食和高脂饮食的小鼠 |
| 171 | 2024-08-09 |
Resolving organoid brain region identities by mapping single-cell genomic data to reference atlases
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.015
PMID:33711282
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研究论文 | 本文开发了一套计算工具（VoxHunt），通过与空间和单细胞转录组参考数据集的比较，评估脑类器官的模式、发育状态和细胞身份 | 开发了VoxHunt工具，用于评估脑类器官的工程协议和注释在遗传和环境扰动实验中在类器官中出现的细胞命运 | NA | 研究脑类器官的细胞组成、分化轨迹和遗传扰动 | 脑类器官的细胞身份和发育状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞和批量基因组数据 | 多个类器官协议模型的不同脑结构 |
| 172 | 2024-08-09 |
Activity of Combined Androgen Receptor Antagonism and Cell Cycle Inhibition in Androgen Receptor Positive Triple Negative Breast Cancer
2021-06, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-20-0807
PMID:33722849
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研究论文 | 研究联合使用雄激素受体拮抗剂和细胞周期抑制剂在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌中的活性 | 首次探讨了CDK4/6抑制剂abemaciclib与靶向雄激素生物合成及雄激素受体活性的药物seviteronel联合使用在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌模型中的协同效应 | 研究仅限于细胞系和小鼠异种移植模型，尚未进行人体临床试验 | 探索CDK4/6抑制剂abemaciclib与seviteronel联合使用在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌中的治疗效果 | 雄激素受体阳性三阴性乳腺癌细胞系、细胞系异种移植模型及患者来源的异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了多个雄激素受体阳性三阴性乳腺癌细胞系及患者来源的异种移植模型 |
| 173 | 2024-08-09 |
Multiplex indexing approach for the detection of DNase I hypersensitive sites in single cells
2021-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab102
PMID:33693880
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研究论文 | 本文介绍了一种新的索引策略，用于解析基于批量细胞分析的单细胞DNase超敏感性 profiles，称为索引单细胞DNase测序（iscDNase-seq） | iscDNase-seq技术利用终端DNA转移酶（TdT）和T4 DNA连接酶的活动，为DNase消化的染色质末端添加独特的细胞条形码，通过三层索引策略，可以在单次实验中对超过15,000个单细胞进行全基因组DHSs的分析 | NA | 开发和验证一种新的单细胞染色质可及性分析技术 | 单细胞的染色质可及性和基因表达变异 | 数字病理学 | NA | iscDNase-seq | NA | 测序数据 | 超过15,000个单细胞 |
| 174 | 2024-08-09 |
γδ T Cells in Merkel Cell Carcinomas Have a Proinflammatory Profile Prognostic of Patient Survival
2021-06, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0817
PMID:33674358
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研究论文 | 研究分析了58个Merkel细胞癌（MCC）病变中的T细胞浸润情况，发现γδ T细胞具有促炎特征，与患者生存预后相关 | 首次揭示了γδ T细胞在Merkel细胞癌中的促炎特征及其作为预后生物标志物的潜力 | NA | 研究Merkel细胞癌中T细胞浸润的特征及其对患者生存的影响 | Merkel细胞癌中的T细胞浸润 | 免疫学 | 皮肤癌 | 多重免疫组化/免疫荧光（m-IHC/IF）、流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 58个Merkel细胞癌病变，来自39名患者 |
| 175 | 2024-08-09 |
Anatomy, Endocrine Regulation, and Embryonic Development of the Rete Testis
2021-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab046
PMID:33661305
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综述 | 本文综述了哺乳动物睾丸网（rete testis）的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育，重点探讨了其分子调控机制的最新发现 | 利用现代分子方法如全局RNA测序揭示了睾丸网细胞前体的转录特征，指出其与Sertoli细胞至少有部分共同起源 | 睾丸网发育的胚胎起源和分子调控机制仍了解不足，缺乏独特的分子标记 | 旨在填补对睾丸网发育分子调控机制的知识空白，并确定未来研究方向 | 睾丸网的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育 | NA | NA | 全局RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 176 | 2024-08-09 |
Large-scale phylogenomic analysis provides new insights into the phylogeny of the class Oligohymenophorea (Protista, Ciliophora) with establishment of a new subclass Urocentria nov. subcl
2021-06, Molecular phylogenetics and evolution
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.ympev.2021.107112
PMID:33609708
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研究论文 | 本研究通过大规模的系统基因组学分析，对Oligohymenophorea类（原生生物，纤毛虫）的系统发育进行了深入研究，并建立了一个新的亚纲Urocentria nov. subcl。 | 本研究首次通过单细胞测序技术对六种非培养的寡毛纤毛虫的基因组和/或转录组进行了测序，并基于85个分类单元的扩展采样进行了系统基因组学分析，揭示了Urocentrids形成了一个独立的分支，支持了新亚纲Urocentria的建立。 | NA | 旨在深入理解Oligohymenophorea类纤毛虫的系统发育关系，特别是亚纲Peniculia中的长期存在问题的分类单元Urocentrum和Paranassula。 | 六种非培养的寡毛纤毛虫的基因组和/或转录组 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和转录组数据 | 85个分类单元，包括157个核基因编码36,953个氨基酸 |
| 177 | 2024-08-09 |
A TNFR2-hnRNPK Axis Promotes Primary Liver Cancer Development via Activation of YAP Signaling in Hepatic Progenitor Cells
2021-06-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-3175
PMID:33619115
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研究论文 | 本研究揭示了TNF受体II（TNFR2）-hnRNPK-YAP信号轴在肝前体细胞（HPC）中对原发性肝癌（PLC）发展的关键作用 | 首次阐明了TNFR2-hnRNPK-YAP信号轴在肝前体细胞中介导的原发性肝癌发展中的机制 | NA | 探讨炎症介导的原发性肝癌发展的潜在机制 | 肝前体细胞（HPC）中的TNF受体II（TNFR2）-hnRNPK-YAP信号轴 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 178 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing technologies in pancreatic cancer
2021-Jun, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-021-04095-4
PMID:33599893
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在胰腺癌研究中的应用 | 单细胞测序技术能够研究肿瘤中每个单独的细胞，检测单细胞的基因组、转录组和多组学特征，揭示细胞间的进化关系和肿瘤细胞的异质性 | NA | 探讨单细胞测序技术在胰腺癌研究中的应用及其对诊断和治疗的影响 | 胰腺癌及其相关细胞类型，如癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和多组学数据 | NA |
| 179 | 2024-08-09 |
Multigene phylogenetics of euglenids based on single-cell transcriptomics of diverse phagotrophs
2021-06, Molecular phylogenetics and evolution
IF:3.6Q2
DOI:10.1016/j.ympev.2021.107088
PMID:33545276
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，对多种食细胞性鞭毛虫进行了多基因系统发育分析 | 首次包括食细胞性和共生性鞭毛虫的多基因系统发育分析，揭示了鞭毛虫的单系性及其内部分支的独立性 | 某些关系的支持较弱，导致某些姐妹群的关系仍未解决 | 探究鞭毛虫的系统发育关系及其进化历史 | 多种食细胞性鞭毛虫及其共生性鞭毛虫 | NA | NA | 单细胞转录组学 | 多基因系统发育分析 | 转录组数据 | 28个分类群 |
| 180 | 2024-08-09 |
Single-cell TCR repertoire analysis reveals highly polyclonal composition of human intraepithelial CD8+ αβ T lymphocytes in untreated celiac disease
2021-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202048974
PMID:33559929
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研究论文 | 通过单细胞测序比较了乳糜泻患者和健康个体的CD8 αβ上皮内淋巴细胞的αβ T细胞受体库 | 发现未治疗的乳糜泻患者的T细胞受体库比治疗患者和健康个体的更具有多克隆性和多样性 | NA | 研究乳糜泻患者与健康个体间CD8 αβ上皮内淋巴细胞的T细胞受体库差异 | 乳糜泻患者和健康个体的CD8 αβ上皮内淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |