单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 194 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Clinical and molecular characteristics of COVID-19 patients with persistent SARS-CoV-2 infection
2021-06-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23621-y
PMID:34108465
|
研究论文 | 本文比较了长期病毒脱落（LDs）和短期病毒脱落（SDs）的COVID-19患者的临床和分子特征，并发现LDs患者的某些细胞因子和趋化因子水平较低，单细胞RNA测序显示LDs中的自然杀伤细胞和CD14单核细胞减少，而调节性T细胞增加。 | 首次详细描述了COVID-19患者中持续SARS-CoV-2感染的临床和分子特征，并发现了与病毒持续感染相关的免疫抑制和低RP表达。 | NA | 研究COVID-19患者中持续SARS-CoV-2感染的临床和分子特征 | COVID-19患者中长期和短期病毒脱落的临床和分子特征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 103名独立患者 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
CSF1R inhibition rescues tau pathology and neurodegeneration in an A/T/N model with combined AD pathologies, while preserving plaque associated microglia
2021-06-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-021-01204-8
PMID:34103079
|
研究论文 | 本文报道了一种新的tau种子模型，其中淀粉样病变促进了双侧tau传播并导致脑萎缩，从而再现了强ATN病理 | 首次展示了CSF1R抑制剂在保留斑块相关小胶质细胞的同时，显著减轻tau病理和神经元萎缩的作用 | NA | 研究小胶质细胞在阿尔茨海默病中ATN病理组合存在下的作用及其对病理的影响 | 小胶质细胞在ATN病理组合中的激活状态及其对tau病理和神经元萎缩的影响 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Resolving the graft ischemia-reperfusion injury during liver transplantation at the single cell resolution
2021-06-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03878-3
PMID:34103479
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了肝移植过程中缺血再灌注损伤（IRI）的细胞机制 | 首次提供了肝移植过程中肝内细胞群的动态转录组图谱 | NA | 揭示肝移植过程中缺血再灌注损伤的细胞机制 | 肝移植过程中的肝组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 14,313个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of human nail unit defines RSPO4 onychofibroblasts and SPINK6 nail epithelium
2021-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02223-w
PMID:34099859
|
研究论文 | 本研究利用多指症标本进行人类指甲单元的单细胞RNA测序，揭示了指甲特异性间充质和上皮细胞群，分别由RSPO4和SPINK6特征化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类指甲单元中的特定细胞类型及其基因表达特征 | 研究样本来自多指症患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索人类指甲组织的转录组特征及其在疾病中的作用 | 人类指甲单元的间充质和上皮细胞 | 数字病理学 | 先天性无甲症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,541个细胞来自4个额外手指 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-08 |
Cellular Tropism of SARS-CoV-2 across Human Tissues and Age-related Expression of ACE2 and TMPRSS2 in Immune-inflammatory Stromal Cells
2021-Jun, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2021.0429
PMID:34094637
|
研究论文 | 本研究分析了SARS-CoV-2在不同人体组织中的细胞嗜性，并探讨了ACE2和TMPRSS2在免疫炎症间质细胞中的年龄相关表达变化 | 开发了一种新的分析框架，用于绘制SARS-CoV-2的细胞嗜性，并强调了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在系统解决病毒发病机制中的作用 | NA | 探讨SARS-CoV-2的细胞嗜性及其在不同细胞类型中的年龄相关表达变化，为临床治疗和病理研究提供指导 | SARS-CoV-2的细胞嗜性、ACE2和TMPRSS2的表达 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 不同人体组织和不同细胞类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
[Regulation of RNA Binding Protein Mbnl1 on Development of Mouse Embryonic Hematopoietic Stem Cells]
2021-Jun, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
研究论文 | 分析小鼠胚胎造血干细胞发育过程中单细胞RNA结合蛋白（RBPs）的动态分子表达特征，并研究Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 | 通过生物信息学分析和CRISPR/Cas9技术构建Mbnl1敲除小鼠模型，研究Mbnl1在造血干细胞发育中的作用 | NA | 阐明Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 | 小鼠胚胎造血干细胞（HSCs）及其发育过程中的单细胞RNA结合蛋白Mbnl1 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9技术 | NA | 单细胞转录组数据 | E11.5时期的Mbnl1+/+和Mbnl1-/-两种基因型胚胎的主动脉-性腺-中肾（AGM）和卵黄囊（YS）组织 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Tracing the origin of hair follicle stem cells
2021-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03638-5
PMID:34108685
|
研究论文 | 本文通过结合无标记的长期三维活体成像和单细胞转录组学，追踪了小鼠毛囊上皮细胞在发育过程中的动态谱系进展和转录组变化 | 本文首次描述了'望远镜模型'，这是一种用于外胚层器官发育的通用模型，其中胚胎中的二维同心区域扩展形成三维纵向排列的圆柱形隔室 | NA | 揭示毛囊干细胞的起源及其在发育过程中的诱导机制 | 小鼠毛囊上皮细胞的发育过程 | NA | NA | 三维活体成像、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 涉及小鼠毛囊上皮细胞的整个发育过程 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
The effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07744-6
PMID:34090348
|
研究论文 | 本文研究了甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 首次深入分析了甲醇固定对样本RNA完整性的影响，并阐明了在不同单细胞RNA测序实验设计中使用固定的潜在后果 | NA | 探讨甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 甲醇固定的细胞与活细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
PIKE-R2P: Protein-protein interaction network-based knowledge embedding with graph neural network for single-cell RNA to protein prediction
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04022-w
PMID:34078261
|
研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质-蛋白质相互作用网络和图神经网络的知识嵌入方法PIKE-R2P，用于单细胞RNA到蛋白质的预测 | PIKE-R2P方法结合了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）和先验知识嵌入到图神经网络中，显著提高了预测性能 | NA | 开发一种新的机器学习模型，用于从单细胞RNA测序数据预测蛋白质丰度 | 单细胞RNA到蛋白质的预测 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
The immune modulatory effects of umbilical cord-derived mesenchymal stromal cells in severe COVID-19 pneumonia
2021-06-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02376-9
PMID:34078447
|
研究论文 | 研究脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节作用 | 首次提供了脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19背景下可能相关的免疫学数据 | 研究仅基于单个患者的数据，可能缺乏广泛的代表性 | 探讨脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节效果 | 严重COVID-19肺炎患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA和功能性检测 | NA | 血液和支气管肺泡灌洗液样本 | 单个患者 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Mammary cell gene expression atlas links epithelial cell remodeling events to breast carcinogenesis
2021-06-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02201-2
PMID:34079055
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了50K小鼠和24K人类乳腺上皮细胞图谱，涵盖了大部分生命阶段，以表征乳腺上皮细胞在发育、妊娠和绝经期间的复杂重塑过程 | 首次整合了小鼠和人类乳腺上皮细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了乳腺上皮细胞重塑与乳腺癌发展之间的关系 | NA | 研究乳腺上皮细胞在不同生命阶段的重塑过程及其与乳腺癌发展的关联 | 小鼠和人类的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 50K小鼠乳腺上皮细胞和24K人类乳腺上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Targeting of the CD80/86 proinflammatory axis as a therapeutic strategy to prevent severe COVID-19
2021-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90797-0
PMID:34075090
|
研究论文 | 本文探讨了通过阻断CD80/86促炎轴作为治疗策略来预防严重COVID-19的可能性 | 提出了使用abatacept药物阻断CD80/86共刺激信号作为治疗严重COVID-19的新策略 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体 | 验证阻断CD80/86促炎轴作为治疗严重COVID-19的有效性 | COVID-19患者的免疫反应和治疗效果 | 免疫学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共涉及86名患者，包括38名风湿病患者和48名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-08 |
coupleCoC+: An information-theoretic co-clustering-based transfer learning framework for the integrative analysis of single-cell genomic data
2021-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009064
PMID:34077420
|
研究论文 | 本文提出了一种基于信息论的共聚类转移学习框架coupleCoC+，用于单细胞基因组数据的整合分析 | coupleCoC+利用源数据中的信息辅助目标数据的分析，通过链接特征实现有效知识转移，并匹配源数据和目标数据中的相似细胞类型 | NA | 提高多模态单细胞基因组数据的整体聚类性能 | 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和单细胞甲基化数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, sc-methylation | 共聚类框架 | 基因组数据 | 包括小鼠皮质scATAC-seq和scRNA-seq数据、小鼠和人类scRNA-seq数据、小鼠皮质sc-methylation和scRNA-seq数据，以及来自两个批次的人类血液树突细胞scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Direct and indirect immune effects of CMP-001, a virus-like particle containing a TLR9 agonist
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002484
PMID:34083419
|
研究论文 | 本文探讨了含有TLR9激动剂的病毒样颗粒CMP-001对树突状细胞和单核细胞的免疫刺激作用及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 研究揭示了CMP-001通过抗Qβ抗体反应激活树突状细胞和单核细胞，进而增强肿瘤T细胞反应的复杂机制 | NA | 探索CMP-001对树突状细胞和单核细胞的初始效应如何激活其他细胞，从而促进肿瘤T细胞反应的发展 | CMP-001对不同外周血单个核细胞（PBMC）群体的摄取及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种外周血单个核细胞（PBMC）群体 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies molecular targets associated with poor in vitro maturation performance of oocytes collected from ovarian stimulation
2021-06-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab100
PMID:34052851
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了从卵巢刺激中收集的卵母细胞体外成熟（rIVM）性能不佳的分子靶点，并探讨了如何通过恢复GATA-1/CREB1/WNT信号轴来提高其可用性。 | 首次揭示了GATA-1/CREB1/WNT信号轴在rIVM卵母细胞中的抑制状态，并发现通过添加没食子酸可以提高卵母细胞的成熟率。 | 在高质量和低质量rIVM卵母细胞的比较中，样本数量有限；无法预测卵母细胞纺锤体的存在，仅能通过极体排出作为指标。 | 探讨与rIVM卵母细胞性能不佳相关的转录组特征，并寻找恢复其性能的方法。 | 从卵巢刺激中收集的人类卵母细胞和从年轻小鼠中收集的未成熟卵母细胞。 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 人类卵母细胞：10个来自7名捐赠者（体内卵母细胞），10个来自10名捐赠者（rIVM卵母细胞）；小鼠卵母细胞：84个（含没食子酸），85个（不含没食子酸） | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
A spatial vascular transcriptomic, proteomic, and phosphoproteomic atlas unveils an angiocrine Tie-Wnt signaling axis in the liver
2021-06-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.05.001
PMID:34038707
|
研究论文 | 本文通过结合空间细胞分选与转录组学和定量蛋白质组学/磷蛋白质组学，建立了肝脏内皮细胞的空间解析蛋白质组图谱，深入揭示了区域化的血管信号机制 | 本文首次揭示了肝脏中血管Wnt活性的Tie受体信号作为选择性和特定调节器的机制，以及其在肝脏再生中调控肝细胞功能的血管内分泌信号作用 | NA | 深入理解肝脏内皮细胞信号的空间组织 | 肝脏内皮细胞的蛋白质组和磷蛋白质组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq），定量蛋白质组学，磷蛋白质组学 | NA | 转录组，蛋白质组，磷蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in cancer: Applications, advances, and emerging challenges
2021-Jun-25, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.04.001
PMID:34027052
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肿瘤研究领域的应用、进展及新兴挑战 | scRNA-seq作为一种有效的方法，能够在单细胞分辨率下解析人类肿瘤组织，为解释肿瘤生物学提供了新的视角 | NA | 进一步阐明癌症机制，开发更好的检测和治疗策略 | 肿瘤循环细胞、肿瘤干细胞、肿瘤耐药性、肿瘤微环境等 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones
2021-06-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.04.026
PMID:34010629
|
研究论文 | 本文开发了CloneSeq平台，结合3D水凝胶球内的克隆扩增和基于液滴的RNA测序，用于揭示细胞异质性。 | CloneSeq提高了检测细胞变异的敏感性，并能揭示特定亚群，如癌症干细胞样细胞和胚胎干细胞的早期分化决策。 | NA | 克服单细胞测序的敏感性限制，揭示生物系统中的细胞异质性。 | 肺癌细胞和胚胎干细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及。 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
Use of scREAD to explore and analyze single-cell and single-nucleus RNA-seq data for Alzheimer's disease
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100513
PMID:34013209
|
研究论文 | 本文介绍了使用scREAD数据库对阿尔茨海默病的单细胞和单核RNA测序数据进行探索和分析的方法 | 开发了scREAD数据库，提供了对现有AD scRNA-seq和snRNA-seq数据的全面分析 | NA | 探索和分析阿尔茨海默病的单细胞和单核RNA测序数据 | 阿尔茨海默病的单细胞和单核基因表达谱 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-09 |
Spatial multi-omics sequencing for fixed tissue via DBiT-seq
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100532
PMID:34027489
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过DBiT-seq平台对固定冷冻组织样本进行空间多组学测序的方法 | 该技术采用基于微流体的方法，将组合DNA寡核苷酸条形码直接引入固定在玻璃载玻片上的组织切片中的细胞 | 该技术不能直接解析单个细胞，但可以实现空间转录组学和目标蛋白质组面板空间分析的近单细胞分辨率 | 构建固定冷冻组织样本的多组学图谱 | 固定冷冻组织样本 | 组学技术 | NA | DBiT-seq | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |