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当前共找到 194 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis as a Promising Tool to Study Pluripotent Stem Cell Reprogramming
2021-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115988
PMID:34206025
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在多能干细胞重编程研究中的应用 | 介绍了近年来积极使用的单细胞分析技术，并预测了未来的研究方向 | NA | 理解疾病和细胞活动在单细胞层面的机制 | 多能干细胞及其重编程过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-08 |
Dopamine Neuron Diversity: Recent Advances and Current Challenges in Human Stem Cell Models and Single Cell Sequencing
2021-06-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061366
PMID:34206038
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综述 | 本文综述了多巴胺神经元多样性的最新进展和当前挑战，特别是在人干细胞模型和单细胞测序技术中的应用 | 利用人多能干细胞和先进的计算单细胞转录组学技术，有望解码人多巴胺神经元的成熟和多样化机制 | 目前尚未有系统性的分子分类方法在全基因组水平上对多巴胺神经元进行分类 | 探讨如何利用干细胞模型和单细胞RNA测序技术深入理解人多巴胺神经元的生物学特性 | 人中脑多巴胺神经元的多样性和功能 | 干细胞研究 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-08 |
Early role for a Na+,K+-ATPase (ATP1A3) in brain development
2021-06-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023333118
PMID:34161264
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研究论文 | 本文探讨了Na,K-ATPase α3亚基在儿童多微脑回症中的作用及其在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 首次揭示了Na,K-ATPase泵复合体可能形成非冗余的细胞类型特异性α-β异构体组合，如兴奋性神经元中的α3-β1和抑制性神经元中的α3-β2 | NA | 研究Na,K-ATPase α3亚基在人脑皮质发育中的作用及其与疾病的关系 | Na,K-ATPase α3亚基在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 神经科学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | mRNA | 约125,000个单个细胞和52,000个核 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-08 |
Dissociation of microdissected mouse brain tissue for artifact free single-cell RNA sequencing
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100590
PMID:34159323
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research paper | 本文介绍了一种酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应，并降低技术变异 | 提出了一种新的酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应 | NA | 开发一种新的方法来分离小鼠脑细胞，以获得高质量的单细胞RNA测序结果 | 小鼠脑细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 3周至24个月大的小鼠脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-08 |
Spike-in normalization for single-cell RNA-seq reveals dynamic global transcriptional activity mediating anticancer drug response
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab054
PMID:34159316
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，通过将内源基因表达与插入分子标准化，揭示了抗癌药物处理后癌细胞转录活性的动态变化 | 首次通过插入分子标准化方法，揭示了药物处理后单细胞转录活性的动态变化及其对药物反应的影响 | NA | 探究抗癌药物处理后癌细胞单细胞转录异质性的机制 | 癌细胞在不同药物处理后的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 转录组数据 | 多种癌细胞系及患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
The endogenous cellular protease inhibitor SPINT2 controls SARS-CoV-2 viral infection and is associated to disease severity
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009687
PMID:34181691
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研究论文 | 研究探讨了内源性细胞蛋白酶抑制剂SPINT2在SARS-CoV-2病毒感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | 发现了SPINT2与TMPRSS2之间的共调控关系，并验证了SPINT2在抑制SARS-CoV-2表达中的作用 | NA | 识别决定疾病易感性和严重程度的毒力因子 | SPINT2在SARS-CoV-2感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 使用Calu-3细胞系进行验证，评估了来自合并症疾病的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-08 |
Individual B cells transcribe multiple rearranged immunoglobulin light chains in teleost fish
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102615
PMID:34142062
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研究论文 | 研究了硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的多个重排转录现象 | 首次展示了硬骨鱼类B细胞中单个细胞内多个重排VJC基因的转录，揭示了硬骨鱼类中同型排斥的宽松性 | NA | 探讨硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的重排和转录机制 | 硬骨鱼类B细胞及其免疫球蛋白轻链 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 单个虹鳟鱼B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-08 |
Cell landscape atlas for patients with chronic thromboembolic pulmonary hypertension after pulmonary endarterectomy constructed using single-cell RNA sequencing
2021-06-21, Aging
DOI:10.18632/aging.203168
PMID:34153003
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研究论文 | 本研究旨在构建慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观图谱，并全面表征其细胞组成 | 首次提供了CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织在单细胞分辨率下的细胞景观图谱 | 未提及具体限制 | 构建并表征CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观 | CTEPH患者肺动脉内膜切除术后的肺组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5个肺动脉内膜切除术后的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Collection and preprocessing of fine needle aspirate patient samples for single cell profiling and data analysis
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100581
PMID:34151301
|
研究论文 | 本文描述了采集和预处理用于单细胞分析的皮肤细针穿刺（FNA）样本的方法 | 采用FNA采集方法，具有微创性，更易被患者接受，并能进行频繁的纵向采样，从而获得高质量的单细胞测序数据 | NA | 介绍一种采集和预处理皮肤FNA样本的方法，以进行单细胞RNA测序和数据分析 | 皮肤FNA样本的采集和预处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-08 |
Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24014-x
PMID:34140477
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于模型的方法Perler，用于整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据与原位杂交（ISH）参考数据，以预测空间基因表达 | Perler方法通过生成线性映射和高斯混合模型，提高了空间转录组预测的准确性和生物学可解释性 | NA | 开发一种新的计算方法，用于准确且可解释地从scRNA-seq数据中解码多细胞系统的空间转录组 | 果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层的空间基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH） | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 涉及多种生物样本，包括果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-08 |
Implicating Gene and Cell Networks Responsible for Differential COVID-19 Host Responses via an Interactive Single Cell Web Portal
2021-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.06.07.447287
PMID:34127975
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据，开发了一个交互式单细胞网络门户，用于探索和比较细胞特征，以获得新的见解和假设 | 本文创新性地整合了多种数据集，并开发了一个交互式网络门户，使用户能够探索和比较细胞特征，从而提出新的生物学假设 | NA | 开发一个交互式单细胞网络门户，以便用户能够探索和比较细胞特征，从而获得新的见解和假设 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 数据集 | 多种样本类型，包括血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals penaeid shrimp hemocyte subpopulations and cell differentiation process
2021-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66954
PMID:34132195
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了虾类血细胞的六种类型及其转录组特征，并预测了它们的分化途径和细胞生长因子。 | 首次通过单细胞RNA测序技术对虾类血细胞进行了详细的分类和分化途径预测，提供了对虾类免疫系统的统一分类。 | NA | 揭示虾类血细胞的亚群分类和细胞分化过程，以增进对虾类免疫系统的理解。 | 虾类血细胞的分类、成熟和分化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-08 |
Utilizing single-cell RNA sequencing for analyzing the characteristics of PBMC in patients with Kawasaki disease
2021-06-14, BMC pediatrics
IF:2.0Q2
DOI:10.1186/s12887-021-02754-5
PMID:34126969
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析川崎病患者的PBMC细胞特征，并探讨其潜在的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术在单细胞水平上揭示川崎病患者的免疫细胞紊乱 | 样本量较小，仅包括一名健康儿童和一名川崎病患者 | 分析川崎病患者外周血单个核细胞的特征，并探索其潜在的分子机制 | 川崎病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两名样本，包括一名健康儿童和一名川崎病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-08 |
Hypomorphic and hypermorphic mouse models of Fsip2 indicate its dosage-dependent roles in sperm tail and acrosome formation
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199216
PMID:34125190
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研究论文 | 本研究通过构建FSIP2基因的低表达和高表达小鼠模型，探讨了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用 | 首次揭示了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用，并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析验证了其功能 | NA | 探讨FSIP2基因在精子形态和功能中的作用 | FSIP2基因及其在精子形成中的作用 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | RNA，蛋白质 | 包括低表达和高表达FSIP2的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-08 |
SDImpute: A statistical block imputation method based on cell-level and gene-level information for dropouts in single-cell RNA-seq data
2021-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009118
PMID:34138847
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研究论文 | 本文提出了一种名为SDImpute的统计方法，用于对单细胞RNA测序数据中的缺失值进行区块填补 | SDImpute方法能够基于基因表达水平和相似细胞及基因的表达变异自动识别缺失事件，并通过利用相似细胞中未受缺失影响的基因表达进行区块填补 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中大量缺失值对下游分析的阻碍问题 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | 基因表达数据 | 包括模拟数据集和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-08 |
IL-6 contributes to metastatic switch via the differentiation of monocytic-dendritic progenitors into prometastatic immune cells
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002856
PMID:34140316
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞通过IL-6介导的造血干细胞和祖细胞（HSPCs）向促转移性单核-树突状祖细胞（MDPs）的分化，从而促进肿瘤转移的机制。 | 首次揭示了肿瘤源性IL-6在劫持HSPC分化程序中的新作用，使其向促转移性MDPs分化，进而功能性地分化为免疫抑制性单核细胞，支持转移开关。 | NA | 研究肿瘤细胞如何通过IL-6影响HSPCs的分化，从而促进肿瘤转移。 | 使用具有低或高转移潜能的肿瘤细胞克隆模型，研究HSPCs的分化命运及其在肿瘤转移中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用来自低和高转移潜能肿瘤的小鼠骨髓HSPCs，以及来自乳腺癌和肺癌患者的外周单核细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Next Generation Sequencing-Based Identification of T-Cell Receptors for Immunotherapy Against Hepatocellular Carcinoma
2021-Jun, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1697
PMID:34141993
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研究论文 | 本文介绍了一种基于下一代测序（NGS）的HBV特异性T细胞受体（TCR）识别方法，无需TCR单一化过程，通过两种配对策略有效识别多克隆T细胞中的TCR | 本文提出的NGS方法避免了传统T细胞克隆扩增和单细胞测序的繁琐步骤和成本，提高了TCR识别的效率和速度 | 该方法的有效性依赖于多克隆T细胞的纯化，且需要进一步的功能评估以验证其临床应用潜力 | 开发一种快速有效的HBV特异性TCR识别方法，用于HBV相关肝细胞癌的TCR-T细胞免疫治疗 | HBV特异性T细胞受体（TCR） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NGS | NA | 序列数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Novel non-terminal tumor sampling procedure using fine needle aspiration supports immuno-oncology biomarker discovery in preclinical mouse models
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002894
PMID:34145033
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研究论文 | 本文介绍了一种基于细针穿刺的新型非终末期肿瘤采样方法，用于在小鼠模型中进行肿瘤微环境（TME）的活检，并支持免疫肿瘤学生物标志物的发现。 | 开发了一种非终末期的肿瘤采样方法，通过细针穿刺技术，允许在小鼠模型中重复采样，并能够将肿瘤微环境生物标志物与治疗反应结果直接关联。 | NA | 旨在识别能够预测或丰富治疗反应的生物标志物，并改进肿瘤微环境的药效学分析。 | 小鼠模型中的肿瘤微环境（TME）和肿瘤浸润性免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 细针穿刺 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of renal cell cancers reveal insights into tumor microenvironment, cell of origin, and therapy response
2021-06-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2103240118
PMID:34099557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肾细胞癌，揭示了肿瘤微环境、细胞起源及治疗反应的相关信息 | 首次通过单细胞RNA测序构建了良性和恶性肾细胞图谱，并预测了多种肾细胞癌亚型的潜在细胞起源 | NA | 阐明不同肾细胞癌亚型的细胞起源及其在肿瘤微环境和治疗反应中的作用 | 肾细胞癌及其亚型 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | RNA | 超过10种肾细胞癌亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell sequencing in cancer research: progress and perspectives
2021-06-09, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01105-2
PMID:34108022
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用进展和前景 | 单细胞测序技术能够解析单个细胞层面的细胞和分子景观，与提供平均数据的批量测序不同 | NA | 总结单细胞测序技术及其在癌症研究中的最新进展 | 恶性细胞、免疫细胞的景观、肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及肿瘤生物行为的潜在机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |