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当前共找到 194 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
GranatumX: A Community-engaging, Modularized, and Flexible Webtool for Single-cell Data Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.005
PMID:34973417
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研究论文 | 介绍了一种名为GranatumX的下一代软件环境，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | GranatumX允许生物学家在基于Web的图形环境中访问最新的scRNA-seq生物信息学方法，并为软件开发者提供了一个快速推广其工具的平台 | NA | 开发一个社区参与、模块化和灵活的Web工具，用于单细胞数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Progression and Heterogeneity in Multiple Nodules of Lung Adenocarcinoma
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100082
PMID:34927899
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了五名多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织，深入探讨了肺腺癌亚型的异质性和演化机制 | 本研究首次在单细胞水平上对肺腺癌的异质性和演化进行了全面的基因表达分析，揭示了免疫微环境在肺腺癌发展过程中的变化 | NA | 探索肺腺癌亚型异质性和演化的相关因素 | 多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名多结节型肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Methodologies: From Transcriptome to Multi-Dimensional Measurement
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100111
PMID:34927917
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术及其在多维度测量中的应用 | 介绍了单细胞转录组测序技术在多维度（基因组、表观基因组、转录组、空间和时间维度）的综合分析方法 | 目前仅在转录组水平或一维测量上存在局限性 | 深入理解细胞多样性、疾病过程和多细胞生物的组织结构 | 单细胞及其在生物系统中的分子特征和发展轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomes Reveal Characteristics of MicroRNAs in Gene Expression Noise Reduction
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.05.002
PMID:34606979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了微小RNA（miRNA）在减少小鼠细胞mRNA水平基因表达噪声中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，证明了miRNA在减少基因表达噪声中的作用，并构建了后转录调控的物理模型，通过合成基因电路观察，展示了miRNA目标加速降解与转录激活对抵抗外部波动的贡献 | NA | 探究miRNA在减少基因表达噪声中的作用及其机制 | 小鼠细胞中的miRNA及其目标基因 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | 物理模型 | RNA表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
A Single-cell Transcriptome Atlas of Cashmere Goat Hair Follicle Morphogenesis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.003
PMID:34534715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了绒山羊胎儿背部皮肤在不同发育阶段的细胞异质性和细胞命运决定 | 首次通过无监督聚类分析识别了16个细胞集群，并揭示了真皮和表皮细胞系发育路径的详细分子景观 | NA | 探究绒山羊毛发 follicle 发育过程中的转录组特征 | 绒山羊的次级毛发 follicle (SHFs) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,705个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals distinct cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma
2021-Jun, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2767
PMID:34277817
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了头颈鳞状细胞癌中不同类型的癌症相关成纤维细胞 | 首次详细描述了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其与临床预后的关联 | 研究仅限于TCGA数据库中的临床数据，可能需要更多临床样本验证结果 | 阐明头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在疾病进展中的潜在作用 | 头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚群 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Seurat包 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA的临床数据和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Single-cell Long Non-coding RNA Landscape of T Cells in Human Cancer Immunity
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.02.006
PMID:34284134
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研究论文 | 本研究通过分析超过20,000个T细胞的单细胞RNA测序数据，首次提供了人类T细胞中长非编码RNA（lncRNA）的全面目录及其功能谱 | 开发了自定义的从头转录组装配流程，获得了一个包含9433个基因的新lncRNA目录，增加了当前人类lncRNA目录的16%，并几乎翻倍了T细胞中表达的lncRNA数量 | NA | 深入理解癌症免疫疗法中新生物标志物或治疗靶点的开发 | 人类癌症免疫中的T细胞及其lncRNA | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | MetaCell算法 | RNA序列数据 | 超过20,000个T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Mapping Human Pluripotent Stem Cell-derived Erythroid Differentiation by Single-cell Transcriptome Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.03.009
PMID:34284135
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研究论文 | 本研究利用iPSC细胞系BC1建立红细胞再生系统，并通过10X Genomics单细胞转录组平台分析了第14天的细胞谱系和分化轨迹 | 首次在单细胞水平上完整描绘了iPSC来源的红细胞分化路径，并识别了不同阶段的红细胞类型及其特异性转录因子调控网络 | NA | 优化iPSC来源的红细胞分化系统，并模拟体内造血发育和分化 | iPSC来源的红细胞分化系统及其在红细胞再生中的应用 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用iPSC细胞系BC1进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-08 |
scLink: Inferring Sparse Gene Co-expression Networks from Single-cell Expression Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.006
PMID:34252628
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研究论文 | 提出了一种名为scLink的方法，用于从单细胞基因表达数据中推断稀疏的基因共表达网络 | scLink方法利用统计网络建模来理解基因间的共表达关系，并构建稀疏的基因共表达网络 | NA | 研究基因表达的调控和协调机制，以理解健康和疾病中生物过程的复杂性 | 单细胞基因表达数据中的基因共表达网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-08 |
Determination of the dynamic cellular transcriptional profiles during kidney development from birth to maturity in rats by single-cell RNA sequencing
2021-Jun-24, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00542-9
PMID:34226524
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从出生到成年大鼠肾脏发育过程中的细胞转录组动态变化 | 首次提供了从出生到成年大鼠肾脏发育中期和晚期的全面基因表达图谱 | NA | 深入理解肾脏发育中期和晚期的分子基础和调控事件 | 大鼠肾脏发育过程中的细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54,704个大鼠肾脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02320-w
PMID:34193958
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化用于酵母的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq，并使用该平台研究了霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的影响 | 开发了针对酵母细胞优化的yeastDrop-Seq平台，解决了Drop-Seq技术在不同细胞大小和形态特征生物体应用中的挑战 | NA | 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞转录组的影响 | 酵母细胞的转录组 | 生物技术 | NA | Drop-Seq | NA | 转录组数据 | 多个同源酵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-08 |
The amniotic fluid cell-free transcriptome in spontaneous preterm labor
2021-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-92439-x
PMID:34188072
|
研究论文 | 研究分析了自发早产情况下羊水中的游离RNA转录组，并探讨其在预测自发早产中的价值 | 首次量化了羊水中游离RNA中的已知胎盘单细胞RNA-Seq特征，并应用随机森林模型预测羊水穿刺后的分娩时间 | NA | 探讨羊水中游离RNA在预测自发早产中的应用 | 自发早产情况下羊水中的游离RNA | NA | 早产 | RNA-Seq | 随机森林模型 | RNA | 共分析了38份羊水样本，其中10份来自24小时内分娩的妇女，28份来自24小时后分娩的妇女 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-08 |
NF-Y Subunits Overexpression in HNSCC
2021-Jun-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13123019
PMID:34208636
|
研究论文 | 研究报道了NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的过度表达情况 | 首次分析了TCGA和细胞系中的RNA-seq数据，并利用单细胞RNA-seq数据进行了肿瘤亚型的划分和生存曲线的推导 | NA | 探讨NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤生物学行为的影响 | NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了TCGA数据库和头颈部鳞状细胞癌的细胞系数据 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-08 |
A Literature-Derived Knowledge Graph Augments the Interpretation of Single Cell RNA-seq Datasets
2021-06-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060898
PMID:34200671
|
研究论文 | 本文通过自然语言处理框架量化基因与细胞类型之间的关系，并开发了一种增强型注释算法来提高单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 首次展示了如何系统地应用文献衍生的知识图谱来加速和增强单细胞RNA测序数据的注释和解释 | NA | 开发一种新的方法来增强单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 人类蛋白质编码基因与细胞类型之间的关系，以及单细胞RNA测序数据集的细胞身份预测 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 2600万篇生物医学文献，133个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptomic Heterogeneity and Post-Traumatic Osteoarthritis-Associated Early Molecular Changes in Mouse Articular Chondrocytes
2021-06-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061462
PMID:34200880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了健康和受伤小鼠膝关节软骨细胞的转录组异质性及其在创伤后骨关节炎早期分子变化 | 首次对关节软骨细胞进行单细胞分辨率的分子水平全面分析，并识别出九种具有不同分子特征的软骨细胞亚型 | 由于从密集的软骨细胞外基质中分离软骨细胞的技术难度，可能存在一定的技术限制 | 阐明不同软骨细胞亚型的分子和功能特征，以及这些亚型与其他关节细胞类型之间的相互作用，从而加深对关节生物学和骨关节炎病理学的理解 | 小鼠关节软骨细胞及其在创伤后的分子变化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和受伤的小鼠膝关节软骨细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Diversity of Rainbow Trout Blood B Cells Revealed by Single Cell RNA Sequencing
2021-Jun-09, Biology
DOI:10.3390/biology10060511
PMID:34207643
|
研究论文 | 本研究利用10× Genomics单细胞RNA测序技术，首次在硬骨鱼中分析了外周血中单个B细胞的转录模式 | 首次在硬骨鱼中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞的转录模式 | 研究主要集中在硬骨鱼中的彩虹鳟，尚未广泛应用于其他非模式生物 | 理解硬骨鱼B细胞的生物学特性并发现潜在的标记物 | 彩虹鳟的外周血B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十至数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-08 |
Exploring Viral Diversity in a Gypsum Karst Lake Ecosystem Using Targeted Single-Cell Genomics
2021-06-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060886
PMID:34201311
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研究论文 | 本研究利用靶向细胞分选结合单细胞测序技术，探索了石膏岩溶湖生态系统中感染绿色硫细菌的病毒的基因内容和基因组潜力 | 本研究发现大多数病毒基因和蛋白质序列与公共数据库中的噬菌体序列相似度很低或无相似性，揭示了先前未描述的绿色硫细菌病毒的巨大多样性 | NA | 研究石膏岩溶湖生态系统中绿色硫细菌病毒的多样性和分布 | 绿色硫细菌及其感染的病毒 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 62个单扩增基因组中鉴定出82个病毒连接体 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptional Heterogeneity of Lymphatic Endothelial Cells in Normal and Inflamed Murine Lymph Nodes
2021-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061371
PMID:34199492
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常和炎症状态下小鼠淋巴结中淋巴内皮细胞的转录变化 | 发现了淋巴内皮细胞在不同淋巴结窦中对皮肤炎症的个体响应，表明它们在病理条件下发挥不同功能 | NA | 深入分析淋巴结淋巴内皮细胞在正常状态和皮肤炎症中的转录景观 | 小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及正常和炎症状态下的小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq landscape midbrain cell responses to red spotted grouper nervous necrosis virus infection
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009665
PMID:34185811
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和感染红点石斑神经坏死病毒（RGNNV）的石斑鱼中脑细胞的转录组响应 | 首次揭示了RGNNV主要攻击石斑鱼的中脑，并识别了35种转录上不同的细胞亚型，包括28种神经元和7种非神经元细胞类型 | NA | 探讨神经坏死病毒（NNV）感染对鱼类中脑细胞的影响及其免疫响应 | 红点石斑鱼（Epinephelus coioides）的中脑细胞 | 数字病理学 | 鱼类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和感染RGNNV的石斑鱼中脑细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Breadth of Osteoblast Heterogeneity
2021-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10496
PMID:34189385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了成骨细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了成骨细胞的异质性，并识别出可能作为成骨细胞成熟阶段新标记的基因 | 研究仅限于新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他物种或不同发育阶段的成骨细胞 | 探索成骨细胞的异质性及其生物学意义 | 新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 272个Venus单细胞 | NA | NA | NA | NA |