单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 193 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-08 |
Diversity of Rainbow Trout Blood B Cells Revealed by Single Cell RNA Sequencing
2021-Jun-09, Biology
DOI:10.3390/biology10060511
PMID:34207643
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研究论文 | 本研究利用10× Genomics单细胞RNA测序技术，首次在硬骨鱼中分析了外周血中单个B细胞的转录模式 | 首次在硬骨鱼中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞的转录模式 | 研究主要集中在硬骨鱼中的彩虹鳟，尚未广泛应用于其他非模式生物 | 理解硬骨鱼B细胞的生物学特性并发现潜在的标记物 | 彩虹鳟的外周血B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十至数千个单个细胞 |
| 82 | 2024-08-08 |
Exploring Viral Diversity in a Gypsum Karst Lake Ecosystem Using Targeted Single-Cell Genomics
2021-06-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060886
PMID:34201311
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研究论文 | 本研究利用靶向细胞分选结合单细胞测序技术，探索了石膏岩溶湖生态系统中感染绿色硫细菌的病毒的基因内容和基因组潜力 | 本研究发现大多数病毒基因和蛋白质序列与公共数据库中的噬菌体序列相似度很低或无相似性，揭示了先前未描述的绿色硫细菌病毒的巨大多样性 | NA | 研究石膏岩溶湖生态系统中绿色硫细菌病毒的多样性和分布 | 绿色硫细菌及其感染的病毒 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 62个单扩增基因组中鉴定出82个病毒连接体 |
| 83 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptional Heterogeneity of Lymphatic Endothelial Cells in Normal and Inflamed Murine Lymph Nodes
2021-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061371
PMID:34199492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常和炎症状态下小鼠淋巴结中淋巴内皮细胞的转录变化 | 发现了淋巴内皮细胞在不同淋巴结窦中对皮肤炎症的个体响应，表明它们在病理条件下发挥不同功能 | NA | 深入分析淋巴结淋巴内皮细胞在正常状态和皮肤炎症中的转录景观 | 小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及正常和炎症状态下的小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 |
| 84 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq landscape midbrain cell responses to red spotted grouper nervous necrosis virus infection
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009665
PMID:34185811
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和感染红点石斑神经坏死病毒（RGNNV）的石斑鱼中脑细胞的转录组响应 | 首次揭示了RGNNV主要攻击石斑鱼的中脑，并识别了35种转录上不同的细胞亚型，包括28种神经元和7种非神经元细胞类型 | NA | 探讨神经坏死病毒（NNV）感染对鱼类中脑细胞的影响及其免疫响应 | 红点石斑鱼（Epinephelus coioides）的中脑细胞 | 数字病理学 | 鱼类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和感染RGNNV的石斑鱼中脑细胞 |
| 85 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Breadth of Osteoblast Heterogeneity
2021-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10496
PMID:34189385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了成骨细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了成骨细胞的异质性，并识别出可能作为成骨细胞成熟阶段新标记的基因 | 研究仅限于新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他物种或不同发育阶段的成骨细胞 | 探索成骨细胞的异质性及其生物学意义 | 新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 272个Venus单细胞 |
| 86 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis as a Promising Tool to Study Pluripotent Stem Cell Reprogramming
2021-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115988
PMID:34206025
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在多能干细胞重编程研究中的应用 | 介绍了近年来积极使用的单细胞分析技术，并预测了未来的研究方向 | NA | 理解疾病和细胞活动在单细胞层面的机制 | 多能干细胞及其重编程过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 87 | 2024-08-08 |
Dopamine Neuron Diversity: Recent Advances and Current Challenges in Human Stem Cell Models and Single Cell Sequencing
2021-06-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061366
PMID:34206038
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综述 | 本文综述了多巴胺神经元多样性的最新进展和当前挑战，特别是在人干细胞模型和单细胞测序技术中的应用 | 利用人多能干细胞和先进的计算单细胞转录组学技术，有望解码人多巴胺神经元的成熟和多样化机制 | 目前尚未有系统性的分子分类方法在全基因组水平上对多巴胺神经元进行分类 | 探讨如何利用干细胞模型和单细胞RNA测序技术深入理解人多巴胺神经元的生物学特性 | 人中脑多巴胺神经元的多样性和功能 | 干细胞研究 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 88 | 2024-08-08 |
Early role for a Na+,K+-ATPase (ATP1A3) in brain development
2021-06-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023333118
PMID:34161264
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研究论文 | 本文探讨了Na,K-ATPase α3亚基在儿童多微脑回症中的作用及其在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 首次揭示了Na,K-ATPase泵复合体可能形成非冗余的细胞类型特异性α-β异构体组合，如兴奋性神经元中的α3-β1和抑制性神经元中的α3-β2 | NA | 研究Na,K-ATPase α3亚基在人脑皮质发育中的作用及其与疾病的关系 | Na,K-ATPase α3亚基在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 神经科学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | mRNA | 约125,000个单个细胞和52,000个核 |
| 89 | 2024-08-08 |
Dissociation of microdissected mouse brain tissue for artifact free single-cell RNA sequencing
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100590
PMID:34159323
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research paper | 本文介绍了一种酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应，并降低技术变异 | 提出了一种新的酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应 | NA | 开发一种新的方法来分离小鼠脑细胞，以获得高质量的单细胞RNA测序结果 | 小鼠脑细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 3周至24个月大的小鼠脑组织 |
| 90 | 2024-08-08 |
Obtaining purified human intestinal epithelia for single-cell analysis and organoid culture
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100597
PMID:34169291
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研究论文 | 本文描述了制备和分离高存活率的人类胎儿和儿童肠道组织以获得上皮单细胞悬液的协议 | 该协议能够生成用于单细胞RNA测序数据的上皮富集单细胞悬液，并从胎儿和儿童肠道创建人类肠道类器官 | NA | 制备和分离人类胎儿和儿童肠道组织以进行单细胞分析和类器官培养 | 人类胎儿和儿童的肠道组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA |
| 91 | 2024-08-08 |
Spike-in normalization for single-cell RNA-seq reveals dynamic global transcriptional activity mediating anticancer drug response
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab054
PMID:34159316
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，通过将内源基因表达与插入分子标准化，揭示了抗癌药物处理后癌细胞转录活性的动态变化 | 首次通过插入分子标准化方法，揭示了药物处理后单细胞转录活性的动态变化及其对药物反应的影响 | NA | 探究抗癌药物处理后癌细胞单细胞转录异质性的机制 | 癌细胞在不同药物处理后的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 转录组数据 | 多种癌细胞系及患者样本 |
| 92 | 2024-08-08 |
The endogenous cellular protease inhibitor SPINT2 controls SARS-CoV-2 viral infection and is associated to disease severity
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009687
PMID:34181691
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研究论文 | 研究探讨了内源性细胞蛋白酶抑制剂SPINT2在SARS-CoV-2病毒感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | 发现了SPINT2与TMPRSS2之间的共调控关系，并验证了SPINT2在抑制SARS-CoV-2表达中的作用 | NA | 识别决定疾病易感性和严重程度的毒力因子 | SPINT2在SARS-CoV-2感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 使用Calu-3细胞系进行验证，评估了来自合并症疾病的数据集 |
| 93 | 2024-08-08 |
Individual B cells transcribe multiple rearranged immunoglobulin light chains in teleost fish
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102615
PMID:34142062
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研究论文 | 研究了硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的多个重排转录现象 | 首次展示了硬骨鱼类B细胞中单个细胞内多个重排VJC基因的转录，揭示了硬骨鱼类中同型排斥的宽松性 | NA | 探讨硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的重排和转录机制 | 硬骨鱼类B细胞及其免疫球蛋白轻链 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 单个虹鳟鱼B细胞 |
| 94 | 2024-08-08 |
Cell landscape atlas for patients with chronic thromboembolic pulmonary hypertension after pulmonary endarterectomy constructed using single-cell RNA sequencing
2021-06-21, Aging
DOI:10.18632/aging.203168
PMID:34153003
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研究论文 | 本研究旨在构建慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观图谱，并全面表征其细胞组成 | 首次提供了CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织在单细胞分辨率下的细胞景观图谱 | 未提及具体限制 | 构建并表征CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观 | CTEPH患者肺动脉内膜切除术后的肺组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5个肺动脉内膜切除术后的肺组织样本 |
| 95 | 2024-08-08 |
Collection and preprocessing of fine needle aspirate patient samples for single cell profiling and data analysis
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100581
PMID:34151301
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研究论文 | 本文描述了采集和预处理用于单细胞分析的皮肤细针穿刺（FNA）样本的方法 | 采用FNA采集方法，具有微创性，更易被患者接受，并能进行频繁的纵向采样，从而获得高质量的单细胞测序数据 | NA | 介绍一种采集和预处理皮肤FNA样本的方法，以进行单细胞RNA测序和数据分析 | 皮肤FNA样本的采集和预处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 96 | 2024-08-08 |
Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24014-x
PMID:34140477
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研究论文 | 本文介绍了一种基于模型的方法Perler，用于整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据与原位杂交（ISH）参考数据，以预测空间基因表达 | Perler方法通过生成线性映射和高斯混合模型，提高了空间转录组预测的准确性和生物学可解释性 | NA | 开发一种新的计算方法，用于准确且可解释地从scRNA-seq数据中解码多细胞系统的空间转录组 | 果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层的空间基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH） | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 涉及多种生物样本，包括果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层 |
| 97 | 2024-08-08 |
Implicating Gene and Cell Networks Responsible for Differential COVID-19 Host Responses via an Interactive Single Cell Web Portal
2021-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.06.07.447287
PMID:34127975
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据，开发了一个交互式单细胞网络门户，用于探索和比较细胞特征，以获得新的见解和假设 | 本文创新性地整合了多种数据集，并开发了一个交互式网络门户，使用户能够探索和比较细胞特征，从而提出新的生物学假设 | NA | 开发一个交互式单细胞网络门户，以便用户能够探索和比较细胞特征，从而获得新的见解和假设 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 数据集 | 多种样本类型，包括血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 |
| 98 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals penaeid shrimp hemocyte subpopulations and cell differentiation process
2021-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66954
PMID:34132195
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了虾类血细胞的六种类型及其转录组特征，并预测了它们的分化途径和细胞生长因子。 | 首次通过单细胞RNA测序技术对虾类血细胞进行了详细的分类和分化途径预测，提供了对虾类免疫系统的统一分类。 | NA | 揭示虾类血细胞的亚群分类和细胞分化过程，以增进对虾类免疫系统的理解。 | 虾类血细胞的分类、成熟和分化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 99 | 2024-08-08 |
Utilizing single-cell RNA sequencing for analyzing the characteristics of PBMC in patients with Kawasaki disease
2021-06-14, BMC pediatrics
IF:2.0Q2
DOI:10.1186/s12887-021-02754-5
PMID:34126969
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析川崎病患者的PBMC细胞特征，并探讨其潜在的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术在单细胞水平上揭示川崎病患者的免疫细胞紊乱 | 样本量较小，仅包括一名健康儿童和一名川崎病患者 | 分析川崎病患者外周血单个核细胞的特征，并探索其潜在的分子机制 | 川崎病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两名样本，包括一名健康儿童和一名川崎病患者 |
| 100 | 2024-08-08 |
Hypomorphic and hypermorphic mouse models of Fsip2 indicate its dosage-dependent roles in sperm tail and acrosome formation
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199216
PMID:34125190
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研究论文 | 本研究通过构建FSIP2基因的低表达和高表达小鼠模型，探讨了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用 | 首次揭示了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用，并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析验证了其功能 | NA | 探讨FSIP2基因在精子形态和功能中的作用 | FSIP2基因及其在精子形成中的作用 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | RNA，蛋白质 | 包括低表达和高表达FSIP2的小鼠模型 |