单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 194 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用，对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴，并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应，并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-09-30 |
Integration of Transformative Platforms for the Discovery of Causative Genes in Cardiovascular Diseases
2021-06, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-021-07175-1
PMID:33856594
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综述 | 本文综述了利用基因组关联研究（GWAS）和其他多学科技术平台整合，以发现心血管疾病致病基因的最新进展 | 本文强调了通过多学科团队整合遗传发现与多种技术平台，展示了这种方法的变革潜力 | NA | 探讨心血管疾病致病基因的发现及其机制 | 心血管疾病及其相关基因和变异 | 基因组学 | 心血管疾病 | 基因组关联研究（GWAS）、RNA测序、代谢组学、表观基因组学 | NA | 基因数据、RNA数据、代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-09-28 |
Discovering Cellular Mitochondrial Heteroplasmy Heterogeneity with Single Cell RNA and ATAC Sequencing
2021-Jun-05, Biology
DOI:10.3390/biology10060503
PMID:34198745
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术研究细胞线粒体异质性的方法 | 本文首次系统性地综述了单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性方面的应用 | 当前方法在研究线粒体异质性方面存在局限性，未来需要进一步解决 | 探讨单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性中的应用 | 细胞线粒体异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-09-06 |
OVOL1 Regulates Psoriasis-Like Skin Inflammation and Epidermal Hyperplasia
2021-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.10.025
PMID:33333123
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研究论文 | 研究揭示了OVOL1在调节银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的保护作用 | 首次发现OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的保护作用，并通过RNA测序揭示了Ovol1缺失对表皮分化和炎症反应的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类银屑病患者中验证 | 探讨OVOL1在银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的分子机制 | OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的作用及其对表皮分化和免疫细胞的影响 | NA | 银屑病 | RNA测序 | NA | RNA | Ovol1缺失小鼠的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-25 |
Polar Gini Curve: A Technique to Discover Gene Expression Spatial Patterns from Single-cell RNA-seq Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.006
PMID:34958962
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研究论文 | 本文介绍了一种名为极性基尼曲线的方法，用于通过分析单细胞RNA测序数据来表征簇标记 | 极性基尼曲线结合基因表达和二维坐标信息，用于检测单细胞RNA测序数据中任何簇细胞的均匀性模式 | NA | 开发一种方法来表征单细胞RNA测序数据中的簇标记和空间基因表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的簇细胞和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 极性基尼曲线 | 基因表达数据 | 涉及多个模拟案例研究和实际的新生小鼠心脏细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.09.008
PMID:34775075
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎27天龄的胸腰椎和肋骨原基细胞的转录组图谱 | 首次在全生物体层面分析了胸腰椎和肋骨原基相关基因的表达动态，并揭示了骨形成和血管生成在胸腰椎和肋骨发育中的耦合过程 | NA | 探究脊椎动物胸腰椎和肋骨原基发育中的胚胎骨形成和血管生成 | 猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个27天龄的猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法，能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析，揭示每种细胞类型的独特变化，并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势，但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制，以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-12 |
Boosting scRNA-seq data clustering by cluster-aware feature weighting
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04033-7
PMID:34078287
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研究论文 | 本文提出了一种名为CaFew的新方法，通过集群感知特征加权来选择基因，以提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类的性能 | CaFew方法通过优化聚类目标函数，获得特征权重矩阵，用于特征选择，从而提高聚类效果 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8个真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-12 |
Neural G0: a quiescent-like state found in neuroepithelial-derived cells and glioma
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209522
PMID:34101353
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，并构建了一个细胞周期分类器，识别出神经上皮来源细胞类型中的传统细胞周期阶段和一个类似静止状态（Neural G0），该状态在哺乳动物神经发生和胶质瘤中存在。 | 本研究首次识别出神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0），并发现该状态与较不具侵袭性的肿瘤和患者生存期延长相关。 | NA | 研究神经上皮来源细胞和胶质瘤中的细胞周期状态，特别是类似静止状态（Neural G0）。 | 人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，以及神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0）。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-12 |
EyeDiseases: an integrated resource for dedicating to genetic variants, gene expression and epigenetic factors of human eye diseases
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab050
PMID:34085038
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研究论文 | 开发了一个名为EyeDiseases的数据库，用于整合和解释人类眼病的多组学数据 | 首次开发了一个专门用于整合和解释人类眼病多组学数据的数据库 | NA | 加速发现和验证与各种眼病相关的候选位点和基因，以促进分子诊断和治疗 | 人类眼病的遗传变异、基因表达和表观遗传因子 | 数字病理学 | 眼病 | 多组学技术 | NA | 基因组数据 | 包含1344个与疾病相关的基因、1774个转录文件和105个表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.004
PMID:34571259
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胰腺β细胞中的性别差异转录组和2型糖尿病基因 | 首次揭示了小鼠β细胞中的性别差异转录组，并识别出与性别相关的2型糖尿病基因 | 研究局限于小鼠模型，结果可能无法直接应用于人类 | 探究性别在2型糖尿病发病机制中的作用 | 小鼠胰腺β细胞和与高脂饮食诱导的2型糖尿病相关的基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
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研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征，并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
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研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征，可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
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研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变，揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞，并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者，可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-05 |
Cis P-tau underlies vascular contribution to cognitive impairment and dementia and can be effectively targeted by immunotherapy in mice
2021-06-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz7615
PMID:34078745
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研究论文 | 该研究探讨了Cis P-tau在血管性认知障碍和痴呆中的作用及其免疫治疗潜力 | 本研究首次明确了Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的关键作用，并提出了针对它的免疫治疗策略 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在临床人群中验证 | 研究Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的作用及其治疗潜力 | 小鼠模型和血管性认知障碍及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 血管性认知障碍，阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，免疫治疗 | 小鼠模型 | 文本，RNA测序数据 | 小鼠模型及患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
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研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本，可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者（16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者） | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mouse islets exposed to proinflammatory cytokines
2021-06, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000949
PMID:33883217
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠胰岛在炎性细胞因子影响下的单细胞RNA测序结果 | 首次揭示了不同类型的胰岛内分泌细胞对炎性细胞因子的响应及其基因表达变化的异质性 | 主要只研究了IL-1β和IFN-γ的影响，未考虑其他可能的细胞因子 | 理解炎性细胞因子如何影响胰岛细胞的基因表达 | 小鼠胰岛的内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰岛样本，具体样本数未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Cutting Edge: Distinct B Cell Repertoires Characterize Patients with Mild and Severe COVID-19
2021-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100135
PMID:34049971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了轻度和重度COVID-19患者B细胞受体的特征，发现轻度患者在症状出现约30天后，其B细胞库中富含克隆多样性和体细胞高突变的记忆B细胞 | 首次揭示了轻度COVID-19患者与重度患者在B细胞反应上的差异，表明轻度患者的B细胞反应较少受到干扰 | 研究仅分析了B细胞的单细胞RNA测序数据，未涉及其他免疫细胞类型 | 探讨COVID-19患者B细胞反应的差异及其对免疫保护的影响 | 轻度和重度COVID-19患者的B细胞库 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Separating measurement and expression models clarifies confusion in single-cell RNA sequencing analysis
2021-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00873-4
PMID:34031584
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据中零值比例高导致的术语混淆问题，并提出了区分真实基因表达水平和测量误差的方法 | 提出了基于泊松测量模型的简单方法，并强调了区分真实表达水平和测量误差的重要性 | NA | 旨在澄清单细胞RNA测序分析中的术语混淆问题 | 单细胞RNA测序数据中的零值和测量误差 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松测量模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |