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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.09.008
PMID:34775075
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了猪胚胎27天龄的胸腰椎和肋骨原基细胞的转录组图谱 | 首次在全生物体层面分析了胸腰椎和肋骨原基相关基因的表达动态,并揭示了骨形成和血管生成在胸腰椎和肋骨发育中的耦合过程 | NA | 探究脊椎动物胸腰椎和肋骨原基发育中的胚胎骨形成和血管生成 | 猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个27天龄的猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法,能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析,揭示每种细胞类型的独特变化,并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势,但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制,以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-12 |
Boosting scRNA-seq data clustering by cluster-aware feature weighting
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04033-7
PMID:34078287
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研究论文 | 本文提出了一种名为CaFew的新方法,通过集群感知特征加权来选择基因,以提高单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据聚类的性能 | CaFew方法通过优化聚类目标函数,获得特征权重矩阵,用于特征选择,从而提高聚类效果 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8个真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-12 |
Neural G0: a quiescent-like state found in neuroepithelial-derived cells and glioma
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209522
PMID:34101353
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类神经干细胞(hNSCs)的细胞周期状态,并构建了一个细胞周期分类器,识别出神经上皮来源细胞类型中的传统细胞周期阶段和一个类似静止状态(Neural G0),该状态在哺乳动物神经发生和胶质瘤中存在。 | 本研究首次识别出神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态(Neural G0),并发现该状态与较不具侵袭性的肿瘤和患者生存期延长相关。 | NA | 研究神经上皮来源细胞和胶质瘤中的细胞周期状态,特别是类似静止状态(Neural G0)。 | 人类神经干细胞(hNSCs)的细胞周期状态,以及神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态(Neural G0)。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-12 |
EyeDiseases: an integrated resource for dedicating to genetic variants, gene expression and epigenetic factors of human eye diseases
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab050
PMID:34085038
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研究论文 | 开发了一个名为EyeDiseases的数据库,用于整合和解释人类眼病的多组学数据 | 首次开发了一个专门用于整合和解释人类眼病多组学数据的数据库 | NA | 加速发现和验证与各种眼病相关的候选位点和基因,以促进分子诊断和治疗 | 人类眼病的遗传变异、基因表达和表观遗传因子 | 数字病理学 | 眼病 | 多组学技术 | NA | 基因组数据 | 包含1344个与疾病相关的基因、1774个转录文件和105个表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.004
PMID:34571259
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胰腺β细胞中的性别差异转录组和2型糖尿病基因 | 首次揭示了小鼠β细胞中的性别差异转录组,并识别出与性别相关的2型糖尿病基因 | 研究局限于小鼠模型,结果可能无法直接应用于人类 | 探究性别在2型糖尿病发病机制中的作用 | 小鼠胰腺β细胞和与高脂饮食诱导的2型糖尿病相关的基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
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研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征,并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
|
研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征,可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-05 |
Profiling B cell immunodominance after SARS-CoV-2 infection reveals antibody evolution to non-neutralizing viral targets
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.001
PMID:34022127
|
研究论文 | 这篇文章解析了SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变,揭示了抗体对非中和病毒靶点的进化 | 首次通过单细胞测序分析COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性B细胞,并揭示了抗体对非中和内源性抗原的适应性 | 研究样本仅限于38名COVID-19患者,可能限制了结果的普适性 | 了解SARS-CoV-2感染后记忆B细胞的演变及其对二次暴露时抗体的重要性 | 研究对象为38名COVID-19患者的记忆B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 38名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-05 |
Cis P-tau underlies vascular contribution to cognitive impairment and dementia and can be effectively targeted by immunotherapy in mice
2021-06-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz7615
PMID:34078745
|
研究论文 | 该研究探讨了Cis P-tau在血管性认知障碍和痴呆中的作用及其免疫治疗潜力 | 本研究首次明确了Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的关键作用,并提出了针对它的免疫治疗策略 | 本研究主要基于小鼠模型,尚需在临床人群中验证 | 研究Cis P-tau在血管性认知障碍和阿尔茨海默病中的作用及其治疗潜力 | 小鼠模型和血管性认知障碍及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 血管性认知障碍,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,免疫治疗 | 小鼠模型 | 文本,RNA测序数据 | 小鼠模型及患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-05 |
The derepression of transposable elements in lung cells is associated with the inflammatory response and gene activation in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-Jun-09, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-021-00241-3
PMID:34108012
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研究论文 | 本文探讨了转座元件在特发性肺纤维化中的去抑制与炎症反应和基因激活的关联 | 研究首次展示了转座元件在特发性肺纤维化患者肺细胞中的失调与基因表达和炎症反应的关联 | 研究中仅使用了24名样本,可能无法全面代表特发性肺纤维化患者的多样性 | 确定转座元件是否与特发性肺纤维化相关 | 健康供体与特发性肺纤维化患者的肺细胞转录组 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 24名受试者(16名健康供体和8名特发性肺纤维化患者) | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mouse islets exposed to proinflammatory cytokines
2021-06, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000949
PMID:33883217
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠胰岛在炎性细胞因子影响下的单细胞RNA测序结果 | 首次揭示了不同类型的胰岛内分泌细胞对炎性细胞因子的响应及其基因表达变化的异质性 | 主要只研究了IL-1β和IFN-γ的影响,未考虑其他可能的细胞因子 | 理解炎性细胞因子如何影响胰岛细胞的基因表达 | 小鼠胰岛的内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰岛样本,具体样本数未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Cutting Edge: Distinct B Cell Repertoires Characterize Patients with Mild and Severe COVID-19
2021-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100135
PMID:34049971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了轻度和重度COVID-19患者B细胞受体的特征,发现轻度患者在症状出现约30天后,其B细胞库中富含克隆多样性和体细胞高突变的记忆B细胞 | 首次揭示了轻度COVID-19患者与重度患者在B细胞反应上的差异,表明轻度患者的B细胞反应较少受到干扰 | 研究仅分析了B细胞的单细胞RNA测序数据,未涉及其他免疫细胞类型 | 探讨COVID-19患者B细胞反应的差异及其对免疫保护的影响 | 轻度和重度COVID-19患者的B细胞库 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Separating measurement and expression models clarifies confusion in single-cell RNA sequencing analysis
2021-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00873-4
PMID:34031584
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据中零值比例高导致的术语混淆问题,并提出了区分真实基因表达水平和测量误差的方法 | 提出了基于泊松测量模型的简单方法,并强调了区分真实表达水平和测量误差的重要性 | NA | 旨在澄清单细胞RNA测序分析中的术语混淆问题 | 单细胞RNA测序数据中的零值和测量误差 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松测量模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies
2021-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02407-x
PMID:34167583
|
研究论文 | 本文探讨了优化单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)映射工作流程的方法 | 提出了针对单细胞RNA测序数据的不同归一化和聚合策略、协变量调整技术以及多重检验校正方法的最佳实践指南 | NA | 优化单细胞eQTL研究,以提高eQTL发现的效率 | 单细胞RNA测序数据及其在eQTL映射中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用真实和模拟数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Single-cell immunophenotyping of the skin lesion erythema migrans identifies IgM memory B cells
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148035
PMID:34061047
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序与B细胞受体(BCR)测序技术,对莱姆病早期皮肤病变红斑游走(EM)中的B细胞及其BCR库进行了免疫表型分析 | 首次揭示了莱姆病早期皮肤感染部位B细胞的表型,表明这些细胞具有局部抗原呈递和抗体产生的能力 | NA | 探讨B细胞在莱姆病早期皮肤免疫反应中的作用 | 红斑游走(EM)皮肤病变中的B细胞及其BCR库 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序,B细胞受体(BCR)测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Interleukin-6 is an activator of pituitary stem cells upon local damage, a competence quenched in the aging gland
2021-06-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2100052118
PMID:34161279
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,探讨了垂体干细胞在局部损伤后的急性激活过程,并对比了衰老垂体的反应 | 首次揭示了白细胞介素-6(IL-6)在年轻垂体中损伤后激活干细胞的作用,并发现衰老垂体中这种能力被抑制 | 研究主要集中在实验小鼠模型上,未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探究垂体干细胞在损伤后的激活机制及其在衰老过程中的变化 | 垂体干细胞在损伤和衰老过程中的反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及年轻和中年小鼠的垂体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines heterogeneity of epicardial cells and fibroblasts within the infarcted murine heart
2021-06-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.65921
PMID:34152268
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、RNA原位杂交和Wilms肿瘤蛋白1阳性细胞的谱系追踪,分析了心肌梗死小鼠心脏中心外膜基质细胞与激活的心肌成纤维细胞/基质细胞的细胞组成、位置和层次结构。 | 本研究首次识别了11种转录上不同的EpiSC群体,并发现其中两组表达心脏特异性标志物和肌节蛋白,提示具有心肌生成潜力。 | NA | 研究心外膜基质细胞在心肌梗死后的细胞异质性和其在心脏修复中的作用。 | 心外膜基质细胞和心肌成纤维细胞在心肌梗死小鼠心脏中的特性。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 心肌梗死小鼠心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2-mediated dysregulation of metabolism and autophagy uncovers host-targeting antivirals
2021-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24007-w
PMID:34155207
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2如何通过调节细胞代谢和自噬过程来影响宿主,并探讨了通过诱导自噬来抑制病毒传播的可能性 | 首次展示了SARS-CoV-2通过调节细胞代谢和自噬来影响宿主,并验证了通过外源性给药诱导自噬可以有效抑制病毒传播 | 研究主要集中在体外实验和动物模型,需要进一步的人体临床试验来验证其治疗效果 | 探讨SARS-CoV-2如何影响宿主细胞的代谢和自噬,并寻找可能的抗病毒治疗策略 | SARS-CoV-2感染的细胞、COVID-19患者的肺样本以及肺和黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单核和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包括COVID-19患者的肺样本和肺及黏膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing shows the immunosuppressive landscape and tumor heterogeneity of HBV-associated hepatocellular carcinoma
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24010-1
PMID:34140495
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析了HBV相关肝细胞癌患者的免疫景观和肿瘤异质性 | 发现了肿瘤相关巨噬细胞抑制肿瘤T细胞浸润以及TIGIT-NECTIN2相互作用调控免疫抑制环境 | NA | 揭示HBV相关肝细胞癌中的免疫抑制景观和细胞间相互作用 | HBV相关肝细胞癌患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一批HBV相关肝细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |