单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 194 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Retinoic acid signaling is critical during the totipotency window in early mammalian development
2021-06, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/s41594-021-00590-w
PMID:34045724
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研究论文 | 本研究通过小分子筛选发现视黄酸信号通路是调控哺乳动物早期发育全能性的关键机制 | 首次发现视黄酸信号通路在胚胎全能性细胞调控中的核心作用，并利用单细胞RNA-seq揭示细胞重编程的转录动态 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型，尚未在人类系统中验证 | 探索调控哺乳动物早期发育全能性阶段的关键信号通路 | 小鼠胚胎干细胞和2细胞样细胞(2CLCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小分子筛选 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Deficiency of histone lysine methyltransferase SETDB2 in hematopoietic cells promotes vascular inflammation and accelerates atherosclerosis
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147984
PMID:34003795
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETDB2在造血细胞中通过调控巨噬细胞活化抑制血管炎症和动脉粥样硬化进展的新机制 | 首次发现SETDB2在动脉粥样硬化病变中表达上调，并证明其在造血细胞中缺失会促进血管炎症和加速动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究SETDB2在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变、造血细胞、巨噬细胞 | 表观遗传学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、基因敲除 | Ldlr基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147703
PMID:34003797
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞测序技术，揭示了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞相互作用的时空分布特征 | 首次优化了空间转录组学与单核测序数据的协调分析，将30种主要细胞类型定位到人类肾切除标本中，并在两种小鼠AKI模型中发现了免疫细胞浸润的空间特异性机制 | 研究仅基于人类肾切除标本和两种小鼠AKI模型，需要进一步验证其在其他肾脏疾病中的普适性 | 探索急性肾损伤中细胞类型空间分布特征及免疫细胞浸润机制 | 人类肾切除标本、小鼠缺血/再灌注损伤模型、盲肠结扎穿刺模型 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞测序, CODEX免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 人类肾切除标本1例，两种小鼠AKI模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases
2021-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03794-2020
PMID:33602861
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Pooled CRISPR-activation screening coupled with single-cell RNA-seq in mouse embryonic stem cells
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100426
PMID:33899013
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研究论文 | 介绍在小鼠胚胎干细胞中使用10x Genomics单细胞RNA测序进行汇集CRISPR激活筛选的实验方案 | 将汇集CRISPR激活筛选与单细胞RNA测序相结合，能够在细胞水平无偏倚地并行评估基因功能 | NA | 开发一种评估基因功能和调控的实验方法 | 小鼠胚胎干细胞 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 26 | 2025-10-06 |
Advances and Opportunities in Single-Cell Transcriptomics for Plant Research
2021-06-17, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
|
综述 | 本文综述了植物单细胞转录组学的主要进展，并提供了从样本制备到数据分析的实用指南 | 全面总结了植物单细胞转录组学的最新技术进展，并展望了未来发展方向 | 作为综述文章，不包含原始研究数据和实验验证 | 促进植物单细胞转录组学技术的发展和推广应用 | 植物生物系统 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Analysis of single-cell RNA sequencing data based on autoencoders
2021-Jun-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04150-3
PMID:34103004
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研究论文 | 开发了一个基于自编码器的单细胞RNA测序数据分析工具scAEspy | 整合了四种先进自编码器并开发了两种新型自编码器，提供多种损失函数选择，可与批次效应去除工具结合使用 | 工具仍需用户定义两个参数，且目前主要针对单细胞RNA测序数据 | 改进单细胞RNA测序数据的下游分析，特别是数据降维和数据集整合 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器(Autoencoders) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Ovarian tumors orchestrate distinct cellular compositions
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.014
PMID:34107269
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析卵巢癌微环境中不同细胞群的组成及相互作用 | 首次在单细胞水平系统描绘卵巢癌微环境中肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞间的相互作用网络 | NA | 探究肿瘤T细胞浸润的决定因素及卵巢癌微环境的细胞组成特征 | 卵巢癌微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 单细胞组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Multi-tissue single-cell analysis deconstructs the complex programs of mouse natural killer and type 1 innate lymphoid cells in tissues and circulation
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.024
PMID:33945787
|
研究论文 | 通过多组织单细胞分析解构小鼠自然杀伤细胞和1型先天淋巴样细胞在组织和循环系统中的复杂程序 | 首次通过多组织单细胞RNA测序系统比较不同组织中NK细胞和ILC1细胞的基因表达程序，并发现肿瘤环境中循环NK细胞程序的重塑 | 研究仅限于小鼠模型，人类样本验证不足 | 解析小鼠不同组织中自然杀伤细胞和1型先天淋巴样细胞的异质性和功能特征 | 小鼠NK1.1NKp46细胞（包括NK细胞和ILC1细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自血液、脾脏、多种组织和实体肿瘤的小鼠NK1.1NKp46细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
A unique macrophage subpopulation signals directly to progenitor cells to promote regenerative neurogenesis in the zebrafish spinal cord
2021-06-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.04.031
PMID:34033756
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性操作，揭示了斑马鱼脊髓损伤后特定巨噬细胞亚群直接信号传导至祖细胞促进再生性神经发生的新机制 | 首次发现促再生巨噬细胞通过TNFa-Tnfrsf1a信号轴直接激活祖细胞的AP-1活性，而非通过发育信号通路，这一机制在哺乳动物中不存在 | 研究仅基于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中验证其适用性 | 探究免疫细胞在脊髓再生性神经发生中的直接信号传导机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型中的巨噬细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，细胞类型特异性操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Pro-cachectic factors link experimental and human chronic kidney disease to skeletal muscle wasting programs
2021-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135821
PMID:34060483
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性肾脏病中肾脏与骨骼肌之间的信号交流机制，发现促恶病质因子在肌肉萎缩中的作用 | 首次通过单细胞测序技术识别了肾脏特定细胞群中activin A的表达，并验证了其在慢性肾脏病诱导肌肉萎缩中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究慢性肾脏病与骨骼肌萎缩之间的分子机制 | 慢性肾脏病患者和实验小鼠模型 | 分子生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种实验性CKD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Secreted inhibitors drive the loss of regeneration competence in Xenopus limbs
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199158
PMID:34105722
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和体外再生肢体培养，揭示了非洲爪蟾肢体再生能力丧失的分子机制 | 发现再生能力缺失的蝌蚪中分泌抑制因子（如Noggin）富集是抑制顶端外胚层嵴细胞形成的关键因素 | 研究主要基于非洲爪蟾模型，在高等脊椎动物中的应用效果仍需验证 | 探究非洲爪蟾肢体再生能力丧失的分子机制和细胞调控因子 | 非洲爪蟾蝌蚪的肢体再生过程 | 发育生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞转录组测序, 体外器官培养 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Ultra-high-throughput single-cell RNA sequencing and perturbation screening with combinatorial fluidic indexing
2021-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01153-z
PMID:34059827
|
研究论文 | 开发了一种名为scifi-RNA-seq的超高通量单细胞RNA测序技术，通过组合流体索引实现百万级细胞的成本效益测序 | 结合细胞内组合预索引与微流控技术，可解析过载液滴中的单个转录组，实现数千样本的多重检测 | NA | 开发高通量单细胞测序技术以支持细胞图谱项目和扰动筛选 | 人类和小鼠细胞系、原代人类T细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，微流控技术 | scifi-RNA-seq | 组合流体索引单细胞RNA测序技术，结合细胞内预索引和微流控液滴系统 |
| 34 | 2025-10-06 |
Targeted single-cell RNA sequencing of transcription factors enhances the identification of cell types and trajectories
2021-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.273961.120
PMID:34011578
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研究论文 | 开发了一种靶向转录因子的单细胞RNA测序方法，可增强细胞类型和发育轨迹的识别能力 | 提出了靶向约1000个转录因子的scCapture-seq方法，显著提高了低表达基因的检测灵敏度 | 仅针对转录因子进行靶向测序，可能忽略其他重要基因的表达信息 | 改进单细胞RNA测序技术，提高对细胞类型和发育轨迹的分辨能力 | iPSC来源的神经元培养物 | 单细胞测序技术 | NA | 靶向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scCapture-seq（靶向转录因子单细胞测序） |
| 35 | 2025-10-06 |
Clonally expanded EOMES+ Tr1-like cells in primary and metastatic tumors are associated with disease progression
2021-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00930-4
PMID:34017124
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学发现EOMES+ Tr1样细胞在肿瘤中的克隆扩增与疾病进展相关 | 首次鉴定出EOMES+ Tr1样细胞亚群在原发性及转移性肿瘤中克隆扩增，并与疾病进展和免疫治疗反应相关 | 研究仅限于结直肠癌和非小细胞肺癌，未涉及其他肿瘤类型 | 探索肿瘤浸润T细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的作用 | 原发性及转移性结直肠癌和非小细胞肺癌的CD4 T细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌, 非小细胞肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Evolutionary genetic algorithm identifies IL2RB as a potential predictive biomarker for immune-checkpoint therapy in colorectal cancer
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab016
PMID:33928242
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研究论文 | 本研究通过进化遗传算法ACE从TCGA数据中识别出IL2RB作为结直肠癌免疫检查点治疗的潜在预测生物标志物 | 开发了新型进化算法ACE挖掘TCGA数据中的临床关联，首次发现IL2RB与免疫检查点基因在结直肠癌中的广泛联系 | 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据验证，需要进一步前瞻性临床研究确认其临床效用 | 识别结直肠癌免疫检查点治疗的预测生物标志物 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，基因表达分析 | 进化遗传算法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | TCGA结肠腺癌数据集和115例MSI-H结肠癌组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Female Immunity Protects from Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2021-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4261
PMID:33795258
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研究论文 | 本研究通过临床数据和动物实验证明女性免疫系统对皮肤鳞状细胞癌具有更强的保护作用 | 首次揭示女性免疫系统在cSCC中具有性别偏向性保护作用，独立于突变负荷 | 样本量有限，免疫抑制患者组样本较小 | 探究性别差异在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类cSCC患者、FVB/N小鼠、人类角质形成细胞 | 癌症免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 全外显子测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 原发性cSCC患者938例（免疫正常738例，免疫抑制160例），晚期cSCC患者83例（免疫正常63例，免疫抑制20例），FVB/N小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14633
PMID:33078414
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研究论文 | 本研究通过单细胞分子分析绘制了嗜碱性粒细胞和肥大细胞发育的高分辨率图谱 | 首次在单细胞水平揭示了嗜碱性粒细胞和肥大细胞的分化轨迹，发现了一个先前未表征的腹膜嗜碱性粒细胞-肥大细胞双能祖细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 绘制嗜碱性粒细胞和肥大细胞的发育分化路径 | 小鼠骨髓和腹膜细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 多色流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞命运测定 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 小鼠骨髓和腹膜细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高覆盖度单细胞RNA测序分析 |
| 39 | 2025-10-06 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制，发现IL-1和IL-10信号通路是关键调节因子 | 首次在遗传性和获得性IL-10抵抗背景下系统解析单核细胞IL-23表达调控网络，并区分稳态与疾病相关的IL-23产生特征 | 研究主要聚焦单核细胞，其他免疫细胞类型的贡献可能未完全阐明 | 阐明炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制及其在疾病分型和治疗反应预测中的作用 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核吞噬细胞及外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因网络相关性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 患者活检样本 | 健康个体和IBD患者的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0745-1
PMID:32398717
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，揭示了神经元活动可增加成年中枢神经系统中转位蛋白(TSPO)的表达水平 | 首次证明神经元活动可直接调控TSPO表达，挑战了TSPO仅作为神经炎症生物标志物的传统认知 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证；未探讨TSPO功能改变的具体分子机制 | 探究神经元活动是否影响成年中枢神经系统中TSPO的表达水平 | 成年C57BL6/N小鼠的海马体和大脑皮层区域 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 基因表达数据, 蛋白质成像数据 | 12周龄C57BL6/N小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |