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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Evolutionary genetic algorithm identifies IL2RB as a potential predictive biomarker for immune-checkpoint therapy in colorectal cancer
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab016
PMID:33928242
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研究论文 | 本研究通过进化遗传算法ACE从TCGA数据中识别出IL2RB作为结直肠癌免疫检查点治疗的潜在预测生物标志物 | 开发了新型进化算法ACE挖掘TCGA数据中的临床关联,首次发现IL2RB与免疫检查点基因在结直肠癌中的广泛联系 | 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据验证,需要进一步前瞻性临床研究确认其临床效用 | 识别结直肠癌免疫检查点治疗的预测生物标志物 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,基因表达分析 | 进化遗传算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像 | TCGA结肠腺癌数据集和115例MSI-H结肠癌组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Female Immunity Protects from Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2021-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4261
PMID:33795258
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研究论文 | 本研究通过临床数据和动物实验证明女性免疫系统对皮肤鳞状细胞癌具有更强的保护作用 | 首次揭示女性免疫系统在cSCC中具有性别偏向性保护作用,独立于突变负荷 | 样本量有限,免疫抑制患者组样本较小 | 探究性别差异在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类cSCC患者、FVB/N小鼠、人类角质形成细胞 | 癌症免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 全外显子测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 原发性cSCC患者938例(免疫正常738例,免疫抑制160例),晚期cSCC患者83例(免疫正常63例,免疫抑制20例),FVB/N小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14633
PMID:33078414
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研究论文 | 本研究通过单细胞分子分析绘制了嗜碱性粒细胞和肥大细胞发育的高分辨率图谱 | 首次在单细胞水平揭示了嗜碱性粒细胞和肥大细胞的分化轨迹,发现了一个先前未表征的腹膜嗜碱性粒细胞-肥大细胞双能祖细胞群 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 绘制嗜碱性粒细胞和肥大细胞的发育分化路径 | 小鼠骨髓和腹膜细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 多色流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞命运测定 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 小鼠骨髓和腹膜细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高覆盖度单细胞RNA测序分析 |
| 24 | 2025-10-06 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制,发现IL-1和IL-10信号通路是关键调节因子 | 首次在遗传性和获得性IL-10抵抗背景下系统解析单核细胞IL-23表达调控网络,并区分稳态与疾病相关的IL-23产生特征 | 研究主要聚焦单核细胞,其他免疫细胞类型的贡献可能未完全阐明 | 阐明炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制及其在疾病分型和治疗反应预测中的作用 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核吞噬细胞及外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因网络相关性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 患者活检样本 | 健康个体和IBD患者的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0745-1
PMID:32398717
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,揭示了神经元活动可增加成年中枢神经系统中转位蛋白(TSPO)的表达水平 | 首次证明神经元活动可直接调控TSPO表达,挑战了TSPO仅作为神经炎症生物标志物的传统认知 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;未探讨TSPO功能改变的具体分子机制 | 探究神经元活动是否影响成年中枢神经系统中TSPO的表达水平 | 成年C57BL6/N小鼠的海马体和大脑皮层区域 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 基因表达数据, 蛋白质成像数据 | 12周龄C57BL6/N小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用,对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-07 |
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100450
PMID:33982010
|
研究论文 | 介绍使用开源工具构建单细胞RNA测序数据处理流程,用于降维分析 | 提出模块化开源软件构建的完整数据分析流程,强调流程灵活性优于商业平台 | 未提及具体性能指标或与其他方法的对比验证 | 开发灵活的单细胞RNA测序数据处理流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
|
研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴,并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应,并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-09-30 |
Integration of Transformative Platforms for the Discovery of Causative Genes in Cardiovascular Diseases
2021-06, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-021-07175-1
PMID:33856594
|
综述 | 本文综述了利用基因组关联研究(GWAS)和其他多学科技术平台整合,以发现心血管疾病致病基因的最新进展 | 本文强调了通过多学科团队整合遗传发现与多种技术平台,展示了这种方法的变革潜力 | NA | 探讨心血管疾病致病基因的发现及其机制 | 心血管疾病及其相关基因和变异 | 基因组学 | 心血管疾病 | 基因组关联研究(GWAS)、RNA测序、代谢组学、表观基因组学 | NA | 基因数据、RNA数据、代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-09-28 |
Discovering Cellular Mitochondrial Heteroplasmy Heterogeneity with Single Cell RNA and ATAC Sequencing
2021-Jun-05, Biology
DOI:10.3390/biology10060503
PMID:34198745
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术研究细胞线粒体异质性的方法 | 本文首次系统性地综述了单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性方面的应用 | 当前方法在研究线粒体异质性方面存在局限性,未来需要进一步解决 | 探讨单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性中的应用 | 细胞线粒体异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-09-06 |
OVOL1 Regulates Psoriasis-Like Skin Inflammation and Epidermal Hyperplasia
2021-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.10.025
PMID:33333123
|
研究论文 | 研究揭示了OVOL1在调节银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的保护作用 | 首次发现OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的保护作用,并通过RNA测序揭示了Ovol1缺失对表皮分化和炎症反应的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类银屑病患者中验证 | 探讨OVOL1在银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的分子机制 | OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的作用及其对表皮分化和免疫细胞的影响 | NA | 银屑病 | RNA测序 | NA | RNA | Ovol1缺失小鼠的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-25 |
Polar Gini Curve: A Technique to Discover Gene Expression Spatial Patterns from Single-cell RNA-seq Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.006
PMID:34958962
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为极性基尼曲线的方法,用于通过分析单细胞RNA测序数据来表征簇标记 | 极性基尼曲线结合基因表达和二维坐标信息,用于检测单细胞RNA测序数据中任何簇细胞的均匀性模式 | NA | 开发一种方法来表征单细胞RNA测序数据中的簇标记和空间基因表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的簇细胞和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 极性基尼曲线 | 基因表达数据 | 涉及多个模拟案例研究和实际的新生小鼠心脏细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.09.008
PMID:34775075
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了猪胚胎27天龄的胸腰椎和肋骨原基细胞的转录组图谱 | 首次在全生物体层面分析了胸腰椎和肋骨原基相关基因的表达动态,并揭示了骨形成和血管生成在胸腰椎和肋骨发育中的耦合过程 | NA | 探究脊椎动物胸腰椎和肋骨原基发育中的胚胎骨形成和血管生成 | 猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个27天龄的猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法,能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析,揭示每种细胞类型的独特变化,并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势,但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制,以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-12 |
Boosting scRNA-seq data clustering by cluster-aware feature weighting
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04033-7
PMID:34078287
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研究论文 | 本文提出了一种名为CaFew的新方法,通过集群感知特征加权来选择基因,以提高单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据聚类的性能 | CaFew方法通过优化聚类目标函数,获得特征权重矩阵,用于特征选择,从而提高聚类效果 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8个真实scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-12 |
Neural G0: a quiescent-like state found in neuroepithelial-derived cells and glioma
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209522
PMID:34101353
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类神经干细胞(hNSCs)的细胞周期状态,并构建了一个细胞周期分类器,识别出神经上皮来源细胞类型中的传统细胞周期阶段和一个类似静止状态(Neural G0),该状态在哺乳动物神经发生和胶质瘤中存在。 | 本研究首次识别出神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态(Neural G0),并发现该状态与较不具侵袭性的肿瘤和患者生存期延长相关。 | NA | 研究神经上皮来源细胞和胶质瘤中的细胞周期状态,特别是类似静止状态(Neural G0)。 | 人类神经干细胞(hNSCs)的细胞周期状态,以及神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态(Neural G0)。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-12 |
EyeDiseases: an integrated resource for dedicating to genetic variants, gene expression and epigenetic factors of human eye diseases
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab050
PMID:34085038
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研究论文 | 开发了一个名为EyeDiseases的数据库,用于整合和解释人类眼病的多组学数据 | 首次开发了一个专门用于整合和解释人类眼病多组学数据的数据库 | NA | 加速发现和验证与各种眼病相关的候选位点和基因,以促进分子诊断和治疗 | 人类眼病的遗传变异、基因表达和表观遗传因子 | 数字病理学 | 眼病 | 多组学技术 | NA | 基因组数据 | 包含1344个与疾病相关的基因、1774个转录文件和105个表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.004
PMID:34571259
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胰腺β细胞中的性别差异转录组和2型糖尿病基因 | 首次揭示了小鼠β细胞中的性别差异转录组,并识别出与性别相关的2型糖尿病基因 | 研究局限于小鼠模型,结果可能无法直接应用于人类 | 探究性别在2型糖尿病发病机制中的作用 | 小鼠胰腺β细胞和与高脂饮食诱导的2型糖尿病相关的基因 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-05 |
Phospholipids of APOE lipoproteins activate microglia in an isoform-specific manner in preclinical models of Alzheimer's disease
2021-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23762-0
PMID:34099706
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研究论文 | 本研究探讨了APOE脂蛋白的磷脂如何以同种型特异性影响阿尔茨海默病中微胶质细胞的反应。 | 发现人类APOEε3和APOEε4在阿尔茨海默病大脑中存在特异性的磷脂特征,并揭示了APOE3脂蛋白与APOE4在微胶质细胞响应Aβ方面的显著差异 | 尚需进一步研究以明确APOE和TREM2在真实生物体中的复杂相互作用 | 阐明APOE同种型在阿尔茨海默病微胶质细胞反应中的作用 | 使用预临床阿尔茨海默病鼠模型研究APOE3和APOE4对微胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用APOE3和APOE4小鼠的脂蛋白和微胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-05 |
Mucosal-associated invariant T cell responses differ by sex in COVID-19
2021-06-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.008
PMID:33870241
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研究论文 | 该研究探讨了COVID-19中粘膜相关不变T细胞反应在性别上的差异 | 揭示了女性特有的保护性MAIT细胞特征,可能解释了女性在COVID-19中的低感染率 | 尚未完全了解导致免疫反应性别差异的机制 | 研究性别对COVID-19免疫反应的影响 | 医院和非医院COVID-19感染者的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 36色流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 包括住院和未住院的COVID-19感染者、未感染的密切接触者和健康对照个体的样本 | NA | NA | NA | NA |