单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 194 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Multi-tissue single-cell analysis deconstructs the complex programs of mouse natural killer and type 1 innate lymphoid cells in tissues and circulation
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.024
PMID:33945787
|
研究论文 | 通过多组织单细胞分析解构小鼠自然杀伤细胞和1型先天淋巴样细胞在组织和循环系统中的复杂程序 | 首次通过多组织单细胞RNA测序系统比较不同组织中NK细胞和ILC1细胞的基因表达程序，并发现肿瘤环境中循环NK细胞程序的重塑 | 研究仅限于小鼠模型，人类样本验证不足 | 解析小鼠不同组织中自然杀伤细胞和1型先天淋巴样细胞的异质性和功能特征 | 小鼠NK1.1NKp46细胞（包括NK细胞和ILC1细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自血液、脾脏、多种组织和实体肿瘤的小鼠NK1.1NKp46细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
A unique macrophage subpopulation signals directly to progenitor cells to promote regenerative neurogenesis in the zebrafish spinal cord
2021-06-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.04.031
PMID:34033756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性操作，揭示了斑马鱼脊髓损伤后特定巨噬细胞亚群直接信号传导至祖细胞促进再生性神经发生的新机制 | 首次发现促再生巨噬细胞通过TNFa-Tnfrsf1a信号轴直接激活祖细胞的AP-1活性，而非通过发育信号通路，这一机制在哺乳动物中不存在 | 研究仅基于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中验证其适用性 | 探究免疫细胞在脊髓再生性神经发生中的直接信号传导机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型中的巨噬细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，细胞类型特异性操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过自我组织生成的人类胚胎模型（类囊胚），能够模拟人类囊胚的谱系分离过程 | 首次通过短暂诱导滋养外胚层，在3天内形成具有三个组织层的囊胚样结构，实现了高保真度的人类胚胎谱系分离 | NA | 建立可扩展的人类胚胎研究实验模型 | 人类幼稚多能细胞和由此生成的类囊胚结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Pro-cachectic factors link experimental and human chronic kidney disease to skeletal muscle wasting programs
2021-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135821
PMID:34060483
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研究论文 | 本研究揭示了慢性肾脏病中肾脏与骨骼肌之间的信号交流机制，发现促恶病质因子在肌肉萎缩中的作用 | 首次通过单细胞测序技术识别了肾脏特定细胞群中activin A的表达，并验证了其在慢性肾脏病诱导肌肉萎缩中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究慢性肾脏病与骨骼肌萎缩之间的分子机制 | 慢性肾脏病患者和实验小鼠模型 | 分子生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多种实验性CKD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Secreted inhibitors drive the loss of regeneration competence in Xenopus limbs
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199158
PMID:34105722
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和体外再生肢体培养，揭示了非洲爪蟾肢体再生能力丧失的分子机制 | 发现再生能力缺失的蝌蚪中分泌抑制因子（如Noggin）富集是抑制顶端外胚层嵴细胞形成的关键因素 | 研究主要基于非洲爪蟾模型，在高等脊椎动物中的应用效果仍需验证 | 探究非洲爪蟾肢体再生能力丧失的分子机制和细胞调控因子 | 非洲爪蟾蝌蚪的肢体再生过程 | 发育生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞转录组测序, 体外器官培养 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Ultra-high-throughput single-cell RNA sequencing and perturbation screening with combinatorial fluidic indexing
2021-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01153-z
PMID:34059827
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研究论文 | 开发了一种名为scifi-RNA-seq的超高通量单细胞RNA测序技术，通过组合流体索引实现百万级细胞的成本效益测序 | 结合细胞内组合预索引与微流控技术，可解析过载液滴中的单个转录组，实现数千样本的多重检测 | NA | 开发高通量单细胞测序技术以支持细胞图谱项目和扰动筛选 | 人类和小鼠细胞系、原代人类T细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，微流控技术 | scifi-RNA-seq | 组合流体索引单细胞RNA测序技术，结合细胞内预索引和微流控液滴系统 |
| 27 | 2025-10-06 |
Targeted single-cell RNA sequencing of transcription factors enhances the identification of cell types and trajectories
2021-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.273961.120
PMID:34011578
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研究论文 | 开发了一种靶向转录因子的单细胞RNA测序方法，可增强细胞类型和发育轨迹的识别能力 | 提出了靶向约1000个转录因子的scCapture-seq方法，显著提高了低表达基因的检测灵敏度 | 仅针对转录因子进行靶向测序，可能忽略其他重要基因的表达信息 | 改进单细胞RNA测序技术，提高对细胞类型和发育轨迹的分辨能力 | iPSC来源的神经元培养物 | 单细胞测序技术 | NA | 靶向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scCapture-seq（靶向转录因子单细胞测序） |
| 28 | 2025-10-06 |
Clonally expanded EOMES+ Tr1-like cells in primary and metastatic tumors are associated with disease progression
2021-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00930-4
PMID:34017124
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学发现EOMES+ Tr1样细胞在肿瘤中的克隆扩增与疾病进展相关 | 首次鉴定出EOMES+ Tr1样细胞亚群在原发性及转移性肿瘤中克隆扩增，并与疾病进展和免疫治疗反应相关 | 研究仅限于结直肠癌和非小细胞肺癌，未涉及其他肿瘤类型 | 探索肿瘤浸润T细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的作用 | 原发性及转移性结直肠癌和非小细胞肺癌的CD4 T细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌, 非小细胞肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Evolutionary genetic algorithm identifies IL2RB as a potential predictive biomarker for immune-checkpoint therapy in colorectal cancer
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab016
PMID:33928242
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研究论文 | 本研究通过进化遗传算法ACE从TCGA数据中识别出IL2RB作为结直肠癌免疫检查点治疗的潜在预测生物标志物 | 开发了新型进化算法ACE挖掘TCGA数据中的临床关联，首次发现IL2RB与免疫检查点基因在结直肠癌中的广泛联系 | 研究主要基于生物信息学分析和回顾性数据验证，需要进一步前瞻性临床研究确认其临床效用 | 识别结直肠癌免疫检查点治疗的预测生物标志物 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，基因表达分析 | 进化遗传算法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | TCGA结肠腺癌数据集和115例MSI-H结肠癌组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Female Immunity Protects from Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2021-06-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4261
PMID:33795258
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研究论文 | 本研究通过临床数据和动物实验证明女性免疫系统对皮肤鳞状细胞癌具有更强的保护作用 | 首次揭示女性免疫系统在cSCC中具有性别偏向性保护作用，独立于突变负荷 | 样本量有限，免疫抑制患者组样本较小 | 探究性别差异在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类cSCC患者、FVB/N小鼠、人类角质形成细胞 | 癌症免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 全外显子测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 原发性cSCC患者938例（免疫正常738例，免疫抑制160例），晚期cSCC患者83例（免疫正常63例，免疫抑制20例），FVB/N小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Single-cell molecular profiling provides a high-resolution map of basophil and mast cell development
2021-06, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14633
PMID:33078414
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研究论文 | 本研究通过单细胞分子分析绘制了嗜碱性粒细胞和肥大细胞发育的高分辨率图谱 | 首次在单细胞水平揭示了嗜碱性粒细胞和肥大细胞的分化轨迹，发现了一个先前未表征的腹膜嗜碱性粒细胞-肥大细胞双能祖细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 绘制嗜碱性粒细胞和肥大细胞的发育分化路径 | 小鼠骨髓和腹膜细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 多色流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞命运测定 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 小鼠骨髓和腹膜细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高覆盖度单细胞RNA测序分析 |
| 32 | 2025-10-06 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制，发现IL-1和IL-10信号通路是关键调节因子 | 首次在遗传性和获得性IL-10抵抗背景下系统解析单核细胞IL-23表达调控网络，并区分稳态与疾病相关的IL-23产生特征 | 研究主要聚焦单核细胞，其他免疫细胞类型的贡献可能未完全阐明 | 阐明炎症性肠病中单核细胞IL-23表达的调控机制及其在疾病分型和治疗反应预测中的作用 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核吞噬细胞及外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因网络相关性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 患者活检样本 | 健康个体和IBD患者的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Neuronal activity increases translocator protein (TSPO) levels
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0745-1
PMID:32398717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，揭示了神经元活动可增加成年中枢神经系统中转位蛋白(TSPO)的表达水平 | 首次证明神经元活动可直接调控TSPO表达，挑战了TSPO仅作为神经炎症生物标志物的传统认知 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证；未探讨TSPO功能改变的具体分子机制 | 探究神经元活动是否影响成年中枢神经系统中TSPO的表达水平 | 成年C57BL6/N小鼠的海马体和大脑皮层区域 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 共聚焦激光扫描显微镜 | NA | 基因表达数据, 蛋白质成像数据 | 12周龄C57BL6/N小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间充质样状态转变的机制 | 首次系统阐明巨噬细胞通过OSM-STAT3信号通路驱动胶质母细胞瘤细胞向间充质亚型转变的细胞间相互作用机制 | 研究主要关注巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用，对其他免疫细胞类型的影响可能未完全阐明 | 解析胶质母细胞瘤中间充质亚型的形成机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 人类胶质母细胞瘤肿瘤样本和模型系统中的癌细胞与免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 体外和体内功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-07 |
Processing single-cell RNA-seq data for dimension reduction-based analyses using open-source tools
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100450
PMID:33982010
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研究论文 | 介绍使用开源工具构建单细胞RNA测序数据处理流程，用于降维分析 | 提出模块化开源软件构建的完整数据分析流程，强调流程灵活性优于商业平台 | 未提及具体性能指标或与其他方法的对比验证 | 开发灵活的单细胞RNA测序数据处理流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2024-12-11 |
SARS-CoV-2 exacerbates proinflammatory responses in myeloid cells through C-type lectin receptors and Tweety family member 2
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.05.006
PMID:34048708
|
研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2通过C型凝集素受体和Tweety家族成员2在髓系细胞中加剧促炎反应的机制 | 首次识别出SARS-CoV-2刺突蛋白的多个C型凝集素受体和TTYH2作为糖依赖性结合伙伴，并发现这些受体在髓系细胞中的表达与COVID-19严重程度相关 | 研究主要集中在髓系细胞的受体上，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探讨SARS-CoV-2如何通过特定受体在髓系细胞中引发促炎反应，并寻找潜在的治疗靶点 | SARS-CoV-2刺突蛋白与髓系细胞受体的相互作用及其引发的炎症反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的肺部细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-09-30 |
Integration of Transformative Platforms for the Discovery of Causative Genes in Cardiovascular Diseases
2021-06, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-021-07175-1
PMID:33856594
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综述 | 本文综述了利用基因组关联研究（GWAS）和其他多学科技术平台整合，以发现心血管疾病致病基因的最新进展 | 本文强调了通过多学科团队整合遗传发现与多种技术平台，展示了这种方法的变革潜力 | NA | 探讨心血管疾病致病基因的发现及其机制 | 心血管疾病及其相关基因和变异 | 基因组学 | 心血管疾病 | 基因组关联研究（GWAS）、RNA测序、代谢组学、表观基因组学 | NA | 基因数据、RNA数据、代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-09-28 |
Discovering Cellular Mitochondrial Heteroplasmy Heterogeneity with Single Cell RNA and ATAC Sequencing
2021-Jun-05, Biology
DOI:10.3390/biology10060503
PMID:34198745
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术研究细胞线粒体异质性的方法 | 本文首次系统性地综述了单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性方面的应用 | 当前方法在研究线粒体异质性方面存在局限性，未来需要进一步解决 | 探讨单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性中的应用 | 细胞线粒体异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-09-06 |
OVOL1 Regulates Psoriasis-Like Skin Inflammation and Epidermal Hyperplasia
2021-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.10.025
PMID:33333123
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研究论文 | 研究揭示了OVOL1在调节银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的保护作用 | 首次发现OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的保护作用，并通过RNA测序揭示了Ovol1缺失对表皮分化和炎症反应的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类银屑病患者中验证 | 探讨OVOL1在银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的分子机制 | OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的作用及其对表皮分化和免疫细胞的影响 | NA | 银屑病 | RNA测序 | NA | RNA | Ovol1缺失小鼠的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-25 |
Polar Gini Curve: A Technique to Discover Gene Expression Spatial Patterns from Single-cell RNA-seq Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.006
PMID:34958962
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研究论文 | 本文介绍了一种名为极性基尼曲线的方法，用于通过分析单细胞RNA测序数据来表征簇标记 | 极性基尼曲线结合基因表达和二维坐标信息，用于检测单细胞RNA测序数据中任何簇细胞的均匀性模式 | NA | 开发一种方法来表征单细胞RNA测序数据中的簇标记和空间基因表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的簇细胞和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 极性基尼曲线 | 基因表达数据 | 涉及多个模拟案例研究和实际的新生小鼠心脏细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |