单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Adaptive Natural Killer Cells Facilitate Effector Functions of Daratumumab in Multiple Myeloma
2021-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3418
PMID:33602683
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研究论文 | 研究了不同自然杀伤（NK）细胞亚群在多发性骨髓瘤中的不同作用，并识别支持达雷妥尤单抗通过抗体依赖性细胞毒性（ADCC）发挥强大抗骨髓瘤活性的NK细胞亚群 | 发现适应性NK细胞在多发性骨髓瘤中是ADCC的重要介质，并支持通过选择性利用适应性NK细胞来更好地预测和改善达雷妥尤单抗的治疗效果 | NA | 研究不同NK细胞亚群在多发性骨髓瘤中的作用，并识别支持达雷妥尤单抗抗骨髓瘤活性的NK细胞亚群 | 多发性骨髓瘤患者的NK细胞及其在达雷妥尤单抗治疗中的作用 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | NA | 细胞 | 157名新诊断的多发性骨髓瘤（NDMM）患者 |
| 162 | 2024-08-09 |
scRNA-seq of ovarian follicle granulosa cells from different fertility goats reveals distinct expression patterns
2021-May, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.13920
PMID:33624340
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了不同繁殖能力的济宁灰山羊卵巢卵泡颗粒细胞在不同发育阶段的基因表达模式 | 首次发现高繁殖力和低繁殖力山羊群体中卵巢卵泡颗粒细胞的基因表达模式 | NA | 揭示山羊卵巢卵泡颗粒细胞在不同发育阶段的基因表达差异及其与繁殖能力的关系 | 济宁灰山羊卵巢卵泡颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两个群体的济宁灰山羊卵巢卵泡颗粒细胞，包括高繁殖力（HL）和低繁殖力（LL） |
| 163 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals species-specific time spans of cell cycle transitions in early oogenesis
2021-05-12, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab048
PMID:33575778
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，比较了小鼠、猴子和人类雌性生殖细胞在卵子发生过程中的细胞周期转换时间跨度的物种特异性差异 | 首次揭示了不同物种间卵子发生过程中细胞周期转换时间跨度的差异，并提出了这种差异可能与雌性生殖细胞发育异时性有关 | NA | 探索不同物种间卵子发生过程中细胞周期转换时间跨度的差异 | 小鼠、猴子和人类的雌性生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和猴子的雌性生殖细胞样本，以及人类雌性生殖细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 164 | 2024-08-09 |
Coordinated changes in cellular behavior ensure the lifelong maintenance of the hippocampal stem cell population
2021-05-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.01.003
PMID:33581058
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研究论文 | 本文研究了海马体神经干细胞数量的维持机制，特别是在成年小鼠中干细胞行为的协调变化 | 本文揭示了成年小鼠海马体神经干细胞数量稳定的原因，即干细胞行为的协调变化，并通过单细胞转录组学、建模和标记保留分析等方法验证了这一发现 | NA | 探讨海马体神经干细胞数量终身维持的机制 | 海马体神经干细胞的行为变化及其对神经发生的影响 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 165 | 2024-08-09 |
Tracing production instability in a clonally derived CHO cell line using single-cell transcriptomics
2021-05, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.27715
PMID:33586781
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了一个克隆衍生CHO细胞系的生产不稳定性，导致单克隆抗体（mAb）产量显著下降 | 通过scRNA-seq数据识别与mAb转基因变异相关的亚群，并重建细胞系演化轨迹，发现与重链和轻链基因表达减少相关 | NA | 研究CHO细胞系中单克隆抗体生产不稳定性的机制 | 克隆衍生CHO细胞系的生产不稳定性 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 166 | 2024-08-09 |
Potential applications of deep learning in single-cell RNA sequencing analysis for cell therapy and regenerative medicine
2021-05, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3336
PMID:33587792
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综述 | 本文探讨了深度学习方法与单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据结合在细胞治疗和再生医学中的应用 | 通过结合深度学习与scRNA-seq技术，能够发现细胞的隐藏结构，更准确地预测其效果，并有效利用具有分化潜能的亚群进行干细胞治疗 | scRNA-seq技术对生物和技术噪声敏感，后续数据分析在去噪、降维、填补缺失值等方面计算难度大 | 探讨深度学习方法如何与scRNA-seq数据结合，以深入解释数据，改进干细胞的后续分析，识别潜在亚群，并推动细胞治疗和再生医学措施的实施 | 干细胞及其在细胞治疗和再生医学中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习 | 数据集 | NA |
| 167 | 2024-08-09 |
Transcriptional characterization of human megakaryocyte polyploidization and lineage commitment
2021-05, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15271
PMID:33587817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对人类骨髓中的巨核细胞（MKs）及其从造血干细胞（HSCs）的分化过程进行了转录组水平的特征分析 | 首次使用单细胞测序技术对人类骨髓中不同多倍体水平的巨核细胞转录组进行特征分析，并揭示了巨核细胞分化过程中的转录变化 | NA | 研究巨核细胞的转录特征及其从造血干细胞的分化过程 | 人类骨髓中的巨核细胞及其从造血干细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Intratumoral Plasmid IL12 Expands CD8+ T Cells and Induces a CXCR3 Gene Signature in Triple-negative Breast Tumors that Sensitizes Patients to Anti-PD-1 Therapy
2021-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3944
PMID:33593880
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研究论文 | 研究通过在三阴性乳腺癌肿瘤中使用IL12质粒进行免疫激活，评估其对CD8+ T细胞扩增和CXCR3基因特征的影响，以及对PD-1疗法的敏感性 | 首次展示了IL12质粒治疗后CXCR3基因特征的增强，以及这种特征与CD8+ T细胞浸润和PD-1/PD-L1表达的关联 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床试验数据，需要更多临床验证 | 探索增强三阴性乳腺癌免疫原性和T细胞浸润的方法，以提高PD-1疗法的疗效 | 三阴性乳腺癌患者和肿瘤模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠模型和少量三阴性乳腺癌患者 |
| 169 | 2024-08-09 |
SPOTlight: seeded NMF regression to deconvolute spatial transcriptomics spots with single-cell transcriptomes
2021-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab043
PMID:33544846
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研究论文 | 开发了一种名为SPOTlight的计算工具，用于整合空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，以推断复杂组织中细胞类型和状态的位置 | SPOTlight采用种子非负矩阵分解（NMF）回归方法，利用细胞类型标记基因和非负最小二乘（NNLS）来解卷积ST捕获位置（spots），即使在浅序列或小规模的scRNA-seq参考数据集上也能保持高预测准确性 | NA | 旨在通过整合ST和scRNA-seq数据，推断组织中细胞类型和状态的空间分布 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 非负矩阵分解（NMF）回归 | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 涉及小鼠大脑和人类胰腺癌的多个样本 |
| 170 | 2024-08-09 |
RUNX-1 haploinsufficiency causes a marked deficiency of megakaryocyte-biased hematopoietic progenitor cells
2021-05-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006389
PMID:33569577
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研究论文 | 研究了RUNX-1单倍体不足对造血祖细胞和随后的巨核细胞生成的影响 | 通过单细胞RNA测序和免疫印迹分析，揭示了RUNX-1单倍体不足导致的巨核细胞偏向的造血祖细胞亚群的减少和基因表达变化 | NA | 探讨RUNX-1单倍体不足对造血祖细胞和巨核细胞生成的影响，并寻找可能的治疗干预措施 | 从患者和野生型细胞系中衍生的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的造血祖细胞（iHPCs）和巨核细胞（iMks） | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括患者衍生的和野生型细胞系衍生的iHPCs和iMks |
| 171 | 2024-08-09 |
Space: the final frontier - achieving single-cell, spatially resolved transcriptomics in plants
2021-05-21, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20200274
PMID:33522561
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research paper | 本文综述了空间转录组学方法的发展，并强调了在实现植物组织单细胞分辨率3D空间转录组学方面的最新进展和当前挑战 | 本文提出了在植物中实现单细胞分辨率的空间转录组学的新方法和技术 | 当前方法通常需要细胞分选、转基因植物、原生质体化或其他耗时或破坏性的过程，且大多数技术在实施过程中会失去大部分或全部空间分辨率 | 实现植物组织中单细胞分辨率的3D空间转录组学 | 植物组织的空间转录组学 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 172 | 2024-08-09 |
PPARs in liver physiology
2021-05-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2021.166097
PMID:33524529
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综述 | 本文综述了过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）在肝脏生理中的最新研究进展，特别关注了PPAR调控中先前被忽视的方面 | 利用单细胞RNA测序等技术揭示了PPAR表达、活性和下游信号调控的复杂性 | NA | 探讨PPARs在肝脏生理中的作用及其调控机制 | 过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 173 | 2024-08-09 |
Development of an optimal protocol for molecular profiling of tumor cells in pleural effusions at single-cell level
2021-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14821
PMID:33484069
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研究论文 | 本文旨在开发一种优化的实验室测试协议，用于对胸腔积液中的游离肿瘤细胞（FTCs）进行单细胞测序 | 开发了一种精确的单细胞突变检测器（ASMD），用于识别FTCs中的体细胞突变，并改进了全基因组扩增（WGA）协议以减少相关错误 | NA | 开发一种优化的单细胞测序协议，用于分析胸腔积液中的游离肿瘤细胞 | 胸腔积液中的游离肿瘤细胞（FTCs） | 数字病理学 | NA | 全基因组扩增（WGA），基因组测序 | NA | 基因组数据 | 案例1：19个细胞，案例2：20个细胞 |
| 174 | 2024-08-09 |
Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes
2021-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00795-2
PMID:33462507
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研究论文 | 本文开发了一种名为CopyKAT的集成贝叶斯分割方法，用于从单细胞RNA测序数据中估计基因组拷贝数剖面，并应用于多种人类肿瘤中区分癌细胞与正常细胞类型 | CopyKAT方法能够准确区分肿瘤微环境中的正常细胞类型和恶性细胞，并解析肿瘤内的克隆亚结构 | NA | 解决单细胞转录组分析中区分肿瘤微环境中的正常细胞类型和恶性细胞以及解析肿瘤内克隆亚结构的挑战 | 21种肿瘤中的46,501个单细胞，包括三阴性乳腺癌、胰腺导管腺癌、间变性甲状腺癌、浸润性导管癌和胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯分割模型 | 转录组数据 | 46,501个单细胞 |
| 175 | 2024-08-09 |
Supervised Adversarial Alignment of Single-Cell RNA-seq Data
2021-05, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2020.0439
PMID:33470876
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研究论文 | 本文开发了一种领域对抗神经网络模型，用于学习单细胞RNA测序数据的降维表示，以克服批次效应 | 提出了一种监督对抗神经网络模型，该模型同时优化细胞类型分配的准确性和无法区分批次（领域），从而有效克服批次效应 | NA | 克服单细胞RNA测序数据分析中的批次效应 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 领域对抗神经网络 | 基因表达数据 | 多个不同数据集 |
| 176 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling of satellite glial cells in stellate ganglia reveals developmental and functional axial dynamics
2021-05, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23965
PMID:33432730
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了小鼠星状神经节的卫星胶质细胞（SGCs）的转录组多样性及其在神经发育和功能中的作用 | 首次揭示了成年小鼠星状神经节中卫星胶质细胞的转录组异质性及其在神经发育和功能中的动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 探讨卫星胶质细胞在星状神经节中的转录组多样性及其对神经功能的影响 | 小鼠星状神经节的卫星胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8只小鼠的星状神经节，共11,595个细胞 |
| 177 | 2024-08-09 |
Exploring the Genetic Association of the ABAT Gene with Alzheimer's Disease
2021-May, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-020-02271-z
PMID:33404980
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研究论文 | 本研究通过遗传和表达水平上的综合分析，探讨了ABAT基因与阿尔茨海默病之间的潜在遗传关联 | 首次在阿尔茨海默病中识别出ABAT基因3'-UTR区域的遗传变异，并发现这些变异与ABAT mRNA表达降低相关 | NA | 研究ABAT基因与阿尔茨海默病的遗传关联 | ABAT基因及其在阿尔茨海默病中的作用 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联研究(GWAS) | NA | 遗传变异数据、mRNA表达数据 | 使用目前最大的阿尔茨海默病全基因组关联研究(GWAS)的元分析数据 |
| 178 | 2024-08-09 |
Molecular determinants and heterogeneity underlying host response to EV-A71 infection at single-cell resolution
2021-05, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2021.1872976
PMID:33406999
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了EV-A71感染后的分化肠上皮细胞（C2BBe1）的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了EV-A71感染引起的细胞间变异和转录组差异，并发现了与病毒RNA表达密切相关的ANXA2蛋白以及lncRNA CYTOR在促进EV-A71复制中的功能 | 研究仅限于细胞培养模型，未涉及体内环境 | 探讨EV-A71感染后宿主反应的分子决定因素和异质性 | EV-A71感染的分化肠上皮细胞（C2BBe1） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染EV-A71的分化肠上皮细胞（C2BBe1） |
| 179 | 2024-08-09 |
Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian
2021-05-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa333
PMID:33355655
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术对acoel扁虫Isodiametra pulchra进行细胞类型分析 | 发现了acoel扁虫中十种主要的细胞类型，并描述了大量特定类群的标记基因，表明存在特定类群的共同分子机制 | NA | 探索双边对称动物细胞类型的进化及其身体结构的起源 | acoel扁虫Isodiametra pulchra的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 180 | 2024-08-09 |
CRISPR Screening of CAR T Cells and Cancer Stem Cells Reveals Critical Dependencies for Cell-Based Therapies
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1243
PMID:33328215
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，研究了CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）中影响CAR介导的肿瘤杀伤的关键分子决定因素 | 通过相互CRISPR筛选，识别了CAR T细胞和肿瘤细胞中调控CAR T细胞细胞毒性的基因，为增强CAR T细胞的抗肿瘤疗效提供了分子靶向策略 | NA | 探索增强CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤疗效的方法 | CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC） | 免疫疗法 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR筛选 | NA | 基因组数据 | 患者来源的GSCs和编辑的CAR T细胞 |