单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-09 |
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
2021-05, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01231-3
PMID:33785863
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研究论文 | 研究了免疫介导性再生障碍性贫血（AA）患者淋巴细胞中的体细胞突变情况 | 首次详细描述了非白血病T细胞中的体细胞突变及其在AA发病机制中的作用 | 样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨体细胞突变在免疫介导性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | AA患者的CD4+和CD8+ T细胞 | NA | 再生障碍性贫血 | 定制的2533基因面板测序、T细胞受体beta测序、单细胞测序 | NA | 基因序列 | 24名AA患者和20名健康对照 |
| 142 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics trajectory and molecular convergence of clinically relevant mutations in Brugada syndrome
2021-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00061.2021
PMID:33797273
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚及其与心脏发育细胞类型的关联 | 首次通过单细胞转录组学分析，揭示了Brugada综合征中临床相关突变在离子运输域的富集，并识别了与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 | NA | 评估Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚，并识别与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 | Brugada综合征中的临床相关突变及其在心脏发育中的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 733个突变，涉及16个与Brugada综合征相关的钠、钙、钾通道及调控和结构基因 |
| 143 | 2024-08-09 |
Notch Signaling between Cerebellar Granule Cell Progenitors
2021 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0468-20.2021
PMID:33762301
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研究论文 | 本文研究了小脑颗粒细胞前体细胞中的Notch信号传导机制 | 首次报道Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞中的比例分化作用 | NA | 探讨Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞分化中的作用 | 小脑颗粒细胞前体细胞及其分化过程 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本 |
| 144 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 infection of the oral cavity and saliva
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01296-8
PMID:33767405
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析人类小唾液腺和牙龈样本，揭示了口腔在COVID-19中的感染情况及其作为病毒传播途径的潜力 | 首次详细描述了口腔中SARS-CoV-2感染的细胞机制，并证实唾液可作为病毒传播的途径 | NA | 探讨口腔在COVID-19中的感染情况及其作为病毒传播途径的可能性 | 人类小唾液腺和牙龈的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 9个样本，包含13,824个细胞 |
| 145 | 2024-08-09 |
Genetic control of retinal ganglion cell genesis
2021-May, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03814-w
PMID:33782712
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综述 | 本文综述了视网膜神经节细胞（RGCs）的生成及其调控网络的最新研究进展 | 利用单细胞转录组学技术，提供了对RGC类型和发展轨迹的前所未有的新见解 | 需要进一步研究以全面理解RGC生成的不同方面 | 总结当前对RGC生成调控因子和途径功能的理解，并讨论未来研究中可利用的新兴技术 | 视网膜神经节细胞的生成及其调控网络 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 约40种不同类型的RGCs |
| 146 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Breast Cancer in BRCA1 Mutation Carriers
2021-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-2123
PMID:33727227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源，特别是雌激素受体阳性乳腺癌的起源 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | BRCA1突变携带者的乳腺癌组织及其邻近或预防性正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 82,122个细胞，来自4名BRCA1突变携带者和3名非携带者 |
| 147 | 2024-08-09 |
Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis
2021-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03416-3
PMID:33731940
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的体外培养系统，用于从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的鼠胚胎发育 | 该系统能够精确模拟体内发育过程，并适用于引入各种胚胎扰动和微操作 | NA | 研究胚胎发育过程，特别是后植入期的形态发生和人工胚胎发生 | 鼠胚胎从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的发育过程 | NA | NA | 三维旋转瓶培养技术，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-09 |
Angiodiversity and organotypic functions of sinusoidal endothelial cells
2021-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09780-y
PMID:33745018
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综述 | 本文综述了血管多样性及器官特异性功能在肝窦内皮细胞（LSEC）中的表现 | 近年来，通过细胞分离和批量转录组学或单细胞RNA测序技术，识别了LSEC的分子程序和亚群，并发现了LSEC衍生的血管内分泌信号在肝脏稳态和疾病发病机制中的重要作用 | NA | 总结近年来对肝脏血管多样性的理解及其功能后果 | 肝窦内皮细胞（LSEC）及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 电子显微镜、细胞分离技术、批量转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 149 | 2024-08-09 |
Single-cell mRNA profiling reveals changes in solute carrier expression and suggests a metabolic switch during zebrafish pronephros development
2021-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00610.2020
PMID:33749326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了斑马鱼前肾在发育过程中溶质载体表达的变化，揭示了代谢转换的机制 | 首次揭示了斑马鱼胚胎肾脏在发育过程中葡萄糖转运能力的变化，以及后期对单羧酸和氨基酸转运能力的增强 | NA | 探究斑马鱼前肾在发育过程中如何响应过滤底物和内在能量需求的变化 | 斑马鱼前肾的溶质载体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼前肾的细胞 |
| 150 | 2024-08-09 |
A single-cell survey of the human glomerulonephritis
2021-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16407
PMID:33754492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人类肾小球肾炎的细胞基因表达谱 | 首次定义了肾小球肾炎的足细胞标记物，并在细胞水平上发现了IgA、膜性肾病和狼疮性肾炎的特异性标记物 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性 | 揭示肾小球肾炎的细胞基因表达谱，以更好地理解其病理过程 | 人类肾移植供体样本、肾小球肾炎样本、恶性高血压样本和慢性间质性肾炎样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共分析了8个样本，包括2个肾移植供体样本、4个肾小球肾炎样本、1个恶性高血压样本和1个慢性间质性肾炎样本 |
| 151 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Treatment Effects in Prostate Cancer
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2021-035
PMID:33712490
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞转录组的影响 | 首次通过单细胞转录组学分析了恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞的转录组差异 | NA | 研究恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞转录组的影响 | 前列腺癌和小细胞癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 152 | 2024-08-09 |
DNA glycosylase Neil3 regulates vascular smooth muscle cell biology during atherosclerosis development
2021-05, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文研究了DNA糖基化酶NEIL3在动脉粥样硬化发展中对血管平滑肌细胞（VSMC）表型的调节作用 | 首次揭示了NEIL3通过非经典机制影响VSMC表型，特别是通过激活Akt信号通路促进动脉粥样硬化的形成 | NA | 探讨NEIL3在动脉粥样硬化发展中的作用及其对VSMC表型的影响 | NEIL3缺陷的Apoe-/-小鼠和NEIL3缺失的人类主动脉VSMC | NA | 心血管疾病 | qPCR, 免疫组织化学, 酶学检测, 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学, BrdU增殖实验, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NEIL3缺陷的Apoe-/-小鼠和NEIL3缺失的人类主动脉VSMC |
| 153 | 2024-08-09 |
Computational modeling of malignant ascites reveals CCL5-SDC4 interaction in the immune microenvironment of ovarian cancer
2021-05, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23289
PMID:33721368
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了卵巢癌患者的腹水细胞，揭示了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌免疫微环境中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和NicheNet分析预测了卵巢癌中免疫细胞与癌细胞之间的通信，并发现了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌细胞生存中的潜在作用 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的腹水细胞进行分析 | 探究卵巢癌患者腹水中细胞类型及其相互作用，寻找潜在的预后标志物 | 卵巢癌患者的腹水细胞及其在免疫微环境中的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NicheNet | 细胞 | 五个卵巢癌患者的腹水细胞 |
| 154 | 2024-08-09 |
PieParty: visualizing cells from scRNA-seq data as pie charts
2021-05, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000986
PMID:33674364
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PieParty的新方法，用于将scRNA-seq数据可视化为饼图，每个饼图代表一个细胞，每个切片对应单个基因的表达 | PieParty允许同时可视化多个基因和基因网络的表达，生成信息密集、空间高效且高度直观的图表 | NA | 开发一种新的方法来可视化scRNA-seq数据，以提高信息表达的直观性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 155 | 2024-08-09 |
Pathogenesis Study Based on High-Throughput Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Novel Transcriptional Landscape and Heterogeneity of Retinal Cells in Type 2 Diabetic Mice
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0839
PMID:33674409
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研究论文 | 本研究通过高吞吐量的单细胞测序分析，揭示了2型糖尿病小鼠视网膜细胞的新转录景观和异质性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了2型糖尿病小鼠视网膜细胞的特定表达模式和细胞间通信变化，并探讨了视黄醛结合蛋白1（RLBP1）作为治疗糖尿病视网膜病变的潜在靶点 | NA | 旨在阐明介导糖尿病视网膜病变发病机制的因素 | 2型糖尿病小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括leptin受体缺陷型和对照小鼠的视网膜样本 |
| 156 | 2024-08-09 |
Single Molecule-Based fliFISH Validates Radial and Heterogeneous Gene Expression Patterns in Pancreatic Islet β-Cells
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0802
PMID:33685924
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研究论文 | 本研究使用基于波动定位成像的荧光原位杂交技术（fliFISH）在单细胞水平上量化小鼠胰腺胰岛切片中的转录本，验证了胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 首次使用fliFISH技术在空间背景下评估胰岛中转录本的异质性，准确量化了从单拷贝到每细胞超过100拷贝的广泛表达水平 | NA | 验证胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 小鼠胰腺胰岛中的Insulin 2等基因的表达模式 | 数字病理学 | NA | 波动定位成像的荧光原位杂交（fliFISH） | NA | 图像 | 小鼠胰腺胰岛切片中的单细胞 |
| 157 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the sustained immune cell dysfunction in the pathogenesis of sepsis secondary to bacterial pneumonia
2021-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.01.026
PMID:33691144
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康对照组和细菌性肺炎继发脓毒症患者的外周血单个核细胞，探讨了免疫细胞在疾病过程中的数量和功能变化 | 首次详细描述了细菌性肺炎继发脓毒症患者免疫细胞在急性、稳定和恢复期的动态变化，并比较了不同病原体引起的脓毒症中免疫反应的差异 | 研究样本量较小，仅包括两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示细菌性肺炎继发脓毒症中免疫细胞功能障碍的具体变化 | 健康对照组和细菌性肺炎继发脓毒症患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括健康对照组和两名脓毒症患者 |
| 158 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: An overview for the ophthalmologist
2021-May-19, Seminars in ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.1080/08820538.2021.1889615
PMID:33635751
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review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）技术在眼科领域的应用及其对疾病分子机制理解的重要性 | scRNAseq技术相较于传统的混合RNA分析，能够识别组织中细胞的组成和异质性，为新发现提供了新的机会 | NA | 探讨scRNAseq技术在眼科疾病研究中的应用及其对疾病病理生理机制理解的影响 | 眼科疾病相关的病理组织 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | RNA | 数千个细胞 |
| 159 | 2024-08-09 |
Targeted Therapy Given after Anti-PD-1 Leads to Prolonged Responses in Mouse Melanoma Models through Sustained Antitumor Immunity
2021-05, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0905
PMID:33653716
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研究论文 | 研究探讨了免疫疗法（anti-PD-1）后给予靶向疗法（ceritinib-trametinib或dabrafenib-trametinib）在鼠黑色素瘤模型中通过持续抗肿瘤免疫延长反应的效果 | 首次研究了免疫疗法后靶向疗法的顺序对鼠黑色素瘤模型的抗肿瘤反应的影响，并发现这种顺序能调节免疫环境，增加T细胞、单核细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞的浸润，减少肿瘤相关巨噬细胞、髓源性抑制细胞和调节性T细胞的数量 | 研究仅限于鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究免疫疗法与靶向疗法组合在鼠黑色素瘤模型中的效果及机制 | 鼠黑色素瘤模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），反向相位蛋白分析（RPPA） | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白分析数据 | 使用了携带突变（SW1）或突变（SM1）的鼠黑色素瘤模型 |
| 160 | 2024-08-09 |
Novel risk factors for craniofacial microsomia and assessment of their utility in clinic diagnosis
2021-05-31, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab055
PMID:33615373
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研究论文 | 本文研究了颅面微小畸形（CFM）的新风险因素及其在临床诊断中的应用 | 本文首次在大规模CFM队列中识别了15个显著关联的基因组位点，并构建了一个基于多基因风险评分（PRS）的CFM风险预测模型，同时确定了父亲吸烟作为关键的环境风险因素 | NA | 研究CFM的遗传风险因素和环境威胁及其相互作用，以改善CFM的诊断和产前筛查 | CFM的遗传和环境风险因素 | 遗传学 | 颅面微小畸形 | 多组学数据分析，单细胞RNA测序 | 多基因风险评分（PRS）模型 | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 6074个CFM样本 |