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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2024-08-09
Hierarchicell: an R-package for estimating power for tests of differential expression with single-cell data
2021-May-01, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 Hierarchicell是一个R包,用于估计单细胞数据中差异表达测试的统计功效 Hierarchicell是首个明确模拟并考虑单细胞RNA-seq数据中层级相关结构(即样本内相关性)的单细胞功率计算器 NA 开发一个工具,用于准确估计单细胞RNA-seq数据中差异表达测试的统计功效 单细胞RNA-seq数据中的差异表达测试 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 用户指定的独立实验单位数量(如个体)和实验单位内的细胞数量 NA NA NA NA
142 2024-08-09
Aging-dependent regulatory cells emerge in subcutaneous fat to inhibit adipogenesis
2021-05-17, Developmental cell IF:10.7Q1
research paper 本研究通过比较年轻和老年小鼠皮下脂肪组织中的总基质血管细胞的scRNA-seq数据,发现了一种与年龄相关的调节细胞(ARC),这种细胞仅在老年小鼠和人类的皮下脂肪组织中出现,并能分泌高水平的促炎趋化因子,抑制邻近脂肪前体的增殖和分化。 首次鉴定出一种与年龄相关的调节细胞(ARC),并揭示了其在老年小鼠和人类皮下脂肪组织中的出现及其抑制脂肪前体分化的机制。 NA 探究与年龄相关的皮下脂肪组织损失的分子机制。 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织中的基质血管细胞。 NA NA scRNA-seq NA 细胞数据 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织样本 NA NA NA NA
143 2024-08-09
Adaptive cell invasion maintains lateral line organ homeostasis in response to environmental changes
2021-05-03, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文通过细胞系标记、活体时间流逝成像和单细胞RNA测序技术,发现zebrafish侧线器官中的高度可移动皮肤衍生细胞能够入侵成熟的机械感觉器官并分化为Neuromast相关(Nm)离子细胞,以响应环境变化,维持器官稳态 发现了Nm离子细胞,挑战了侧线器官完全由胚胎衍生而来的观点,并提出Nm离子细胞可能是通过调节离子微环境来调控感觉毛细胞功能的潜在调节因子 NA 研究环境变化下侧线器官稳态的维持机制 zebrafish侧线器官中的感觉毛细胞和Nm离子细胞 NA NA 细胞系标记、活体时间流逝成像、单细胞RNA测序 NA 细胞 NA NA NA NA NA
144 2024-08-09
A subpopulation of embryonic microglia respond to maternal stress and influence nearby neural progenitors
2021-05-03, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 研究探讨了胚胎期下丘脑中的小胶质细胞对母体应激的反应及其对邻近神经干细胞的影响 发现胚胎期下丘脑中的小胶质细胞能响应母体应激,并通过分泌CCL3和CCL4影响神经干细胞的增殖和分化 研究主要集中在雄性胚胎,对雌性的影响未详细探讨 探究胚胎期下丘脑小胶质细胞对母体应激的响应及其对神经发育的影响 胚胎期下丘脑的小胶质细胞和神经干细胞 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 涉及雄性胚胎的小胶质细胞和神经干细胞 NA NA NA NA
145 2024-08-09
Gremlin 1+ fibroblastic niche maintains dendritic cell homeostasis in lymphoid tissues
2021-05, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,鉴定了在人和小鼠淋巴结中表达Gremlin1的成纤维网状细胞亚群,并发现这些细胞在维持淋巴组织中树突状细胞稳态中起关键作用 首次揭示了Gremlin1成纤维细胞在淋巴结中形成的新微环境,该微环境对淋巴组织中树突状细胞的稳态维持至关重要 NA 探究成纤维网状细胞在淋巴组织中的功能及其对树突状细胞稳态的影响 人和小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞及树突状细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 人和小鼠的淋巴结样本 NA NA NA NA
146 2024-08-09
Single-cell sequencing of human white adipose tissue identifies new cell states in health and obesity
2021-05, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学和流式细胞术,揭示了健康和肥胖人体白色脂肪组织中基质血管部分的大规模综合细胞普查,并报告了脂肪组织定居的先天淋巴细胞、树突状细胞和单核细胞衍生巨噬细胞的新亚群和发展轨迹。 本文首次揭示了肥胖人体白色脂肪组织中免疫调节机制向炎症网络的转变,并提供了健康人体白色脂肪组织的详细和无偏见的细胞景观。 NA 研究健康和肥胖人体白色脂肪组织中的细胞状态和相互作用。 人体白色脂肪组织中的细胞亚群和发展轨迹。 数字病理学 肥胖 单细胞转录组学 NA 细胞 健康和肥胖的人体白色脂肪组织样本 NA NA NA NA
147 2024-08-09
Single-cell sequencing links multiregional immune landscapes and tissue-resident T cells in ccRCC to tumor topology and therapy efficacy
2021-05-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA和T细胞受体测序,分析了167,283个细胞,来自多个肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血,以绘制透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的免疫景观,并探讨了免疫异质性对临床结果的影响 首次通过单细胞测序技术,结合T细胞受体测序,全面描绘了ccRCC的免疫景观,并揭示了组织驻留T细胞和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)与免疫检查点阻断(ICB)治疗反应的关联 研究样本仅来自六名患者,可能不足以代表所有ccRCC患者的免疫特征 探讨透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的免疫异质性及其对治疗效果的影响 ccRCC患者的肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血中的细胞 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA)和T细胞受体(TCR)测序 NA 细胞 167,283个细胞,来自六名患者 NA NA NA NA
148 2024-08-09
Early stem cell aging in the mature brain
2021-05-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文研究了成年海马体中神经干细胞(NSC)行为受多种因素干扰的情况,并探讨了NSC老化机制及潜在干预措施。 首次揭示了短期NSC(ST-NSC)和长期NSC(LT-NSC)的不同老化模式,并识别了酪氨酸蛋白激酶Abl1作为NSC老化因子。 NA 旨在识别影响神经干细胞行为的早期机制,以促进生命后期组织功能的维持。 成年海马体中的神经干细胞(NSC)及其老化机制。 NA NA 克隆追踪、单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
149 2024-08-09
Irx3 and Irx5 in Ins2-Cre+ cells regulate hypothalamic postnatal neurogenesis and leptin response
2021-05, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 研究探讨了Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用,以及它们如何影响下丘脑的产后神经发生和瘦素反应 发现了早期产后下丘脑中表达Irx3和Irx5的高水平放射状胶质样神经干细胞群,并证明了Irx3和Irx5的减少剂量促进产后下丘脑的神经发生 NA 探究Irx3和Irx5基因如何通过改变食物摄入量来影响肥胖 Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用 NA 肥胖 单细胞RNA测序 NA RNA Irx3和Irx5基因突变的双重杂合子小鼠 NA NA NA NA
150 2024-08-09
Applications of single-cell and bulk RNA sequencing in onco-immunology
2021-05, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
综述 本文综述了单细胞和常规(bulk)RNA测序在肿瘤免疫学中的应用,介绍了数据预处理、统计分析方法以及相关的计算挑战 提供了基因表达分析的实例,如差异表达分析、降维、聚类和富集分析,并展示了如何使用去卷积算法从bulk或单细胞RNA-seq中识别和量化多种免疫亚群 讨论了单细胞和bulk RNA-seq在临床应用中的优缺点 探讨RNA测序技术在肿瘤免疫学中的应用潜力,特别是在免疫治疗反应中的分子机制识别 单细胞和bulk RNA-seq技术在肿瘤免疫学中的应用 NA NA RNA测序(RNA-seq) 机器学习和深度学习模型 RNA-seq数据 使用公开数据集进行示例分析 NA NA NA NA
151 2024-08-09
A CD44/Brg1 nuclear complex confers mesenchymal progenitor cells with enhanced fibrogenicity in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-05-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究探讨了CD44/Brg1核复合体在特发性肺纤维化中增强间充质前体细胞纤维化能力的作用 首次揭示了CD44与Brg1和Zeb1形成核蛋白复合体,通过上调Sox2基因表达促进特发性肺纤维化中间充质前体细胞的自我更新和纤维化能力 NA 探究CD44在特发性肺纤维化中间充质前体细胞中的作用及其分子机制 特发性肺纤维化中的间充质前体细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及特发性肺纤维化患者的肺部间充质前体细胞 NA NA NA NA
152 2024-08-09
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
2021-05, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 研究了免疫介导性再生障碍性贫血(AA)患者淋巴细胞中的体细胞突变情况 首次详细描述了非白血病T细胞中的体细胞突变及其在AA发病机制中的作用 样本量相对较小,需要进一步的大规模研究来验证结果 探讨体细胞突变在免疫介导性再生障碍性贫血发病机制中的作用 AA患者的CD4+和CD8+ T细胞 NA 再生障碍性贫血 定制的2533基因面板测序、T细胞受体beta测序、单细胞测序 NA 基因序列 24名AA患者和20名健康对照 NA NA NA NA
153 2024-08-09
Single-cell transcriptomics trajectory and molecular convergence of clinically relevant mutations in Brugada syndrome
2021-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚及其与心脏发育细胞类型的关联 首次通过单细胞转录组学分析,揭示了Brugada综合征中临床相关突变在离子运输域的富集,并识别了与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 NA 评估Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚,并识别与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 Brugada综合征中的临床相关突变及其在心脏发育中的影响 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 733个突变,涉及16个与Brugada综合征相关的钠、钙、钾通道及调控和结构基因 NA NA NA NA
154 2024-08-09
Notch Signaling between Cerebellar Granule Cell Progenitors
2021 May-Jun, eNeuro IF:2.7Q3
研究论文 本文研究了小脑颗粒细胞前体细胞中的Notch信号传导机制 首次报道Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞中的比例分化作用 NA 探讨Notch信号在小脑颗粒细胞前体细胞分化中的作用 小脑颗粒细胞前体细胞及其分化过程 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠样本 NA NA NA NA
155 2024-08-09
Genetic control of retinal ganglion cell genesis
2021-May, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
综述 本文综述了视网膜神经节细胞(RGCs)的生成及其调控网络的最新研究进展 利用单细胞转录组学技术,提供了对RGC类型和发展轨迹的前所未有的新见解 需要进一步研究以全面理解RGC生成的不同方面 总结当前对RGC生成调控因子和途径功能的理解,并讨论未来研究中可利用的新兴技术 视网膜神经节细胞的生成及其调控网络 NA NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 约40种不同类型的RGCs NA NA NA NA
156 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Breast Cancer in BRCA1 Mutation Carriers
2021-05-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源,特别是雌激素受体阳性乳腺癌的起源 研究样本量相对较小,可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 探究BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 BRCA1突变携带者的乳腺癌组织及其邻近或预防性正常乳腺组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 82,122个细胞,来自4名BRCA1突变携带者和3名非携带者 NA NA NA NA
157 2024-08-09
Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis
2021-05, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文介绍了一种高效的体外培养系统,用于从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的鼠胚胎发育 该系统能够精确模拟体内发育过程,并适用于引入各种胚胎扰动和微操作 NA 研究胚胎发育过程,特别是后植入期的形态发生和人工胚胎发生 鼠胚胎从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的发育过程 NA NA 三维旋转瓶培养技术,单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
158 2024-08-09
Angiodiversity and organotypic functions of sinusoidal endothelial cells
2021-05, Angiogenesis IF:9.2Q1
综述 本文综述了血管多样性及器官特异性功能在肝窦内皮细胞(LSEC)中的表现 近年来,通过细胞分离和批量转录组学或单细胞RNA测序技术,识别了LSEC的分子程序和亚群,并发现了LSEC衍生的血管内分泌信号在肝脏稳态和疾病发病机制中的重要作用 NA 总结近年来对肝脏血管多样性的理解及其功能后果 肝窦内皮细胞(LSEC)及其在肝脏中的功能 NA NA 电子显微镜、细胞分离技术、批量转录组学、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
159 2024-08-09
Single-cell mRNA profiling reveals changes in solute carrier expression and suggests a metabolic switch during zebrafish pronephros development
2021-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了斑马鱼前肾在发育过程中溶质载体表达的变化,揭示了代谢转换的机制 首次揭示了斑马鱼胚胎肾脏在发育过程中葡萄糖转运能力的变化,以及后期对单羧酸和氨基酸转运能力的增强 NA 探究斑马鱼前肾在发育过程中如何响应过滤底物和内在能量需求的变化 斑马鱼前肾的溶质载体表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 斑马鱼前肾的细胞 NA NA NA NA
160 2024-08-09
A single-cell survey of the human glomerulonephritis
2021-05, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了人类肾小球肾炎的细胞基因表达谱 首次定义了肾小球肾炎的足细胞标记物,并在细胞水平上发现了IgA、膜性肾病和狼疮性肾炎的特异性标记物 研究样本数量有限,可能影响结果的普遍性 揭示肾小球肾炎的细胞基因表达谱,以更好地理解其病理过程 人类肾移植供体样本、肾小球肾炎样本、恶性高血压样本和慢性间质性肾炎样本 数字病理学 肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 共分析了8个样本,包括2个肾移植供体样本、4个肾小球肾炎样本、1个恶性高血压样本和1个慢性间质性肾炎样本 NA NA NA NA
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