单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals suppressive transcriptional programs regulated by MIS/AMH in neonatal ovaries
2021-05-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2100920118
PMID:33980714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了MIS/AMH在新生小鼠卵巢中抑制卵泡发育的转录调控机制 | 首次揭示了MIS处理后卵巢细胞类型的特异性转录特征，以及其在抑制卵泡发育中的具体作用 | NA | 探究MIS抑制卵泡发育的机制 | 新生小鼠卵巢中的卵泡发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠卵巢 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing for breast cancer: present and future
2021-May-14, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00485-1
PMID:33990550
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术为深入理解乳腺癌的生物学行为提供了新的策略 | NA | 深入分析乳腺癌的发生发展机制，识别新的治疗靶点并开发新的治疗途径 | 乳腺癌细胞的异质性、转移、耐药性和预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
A stem cell population at the anorectal junction maintains homeostasis and participates in tissue regeneration
2021-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23034-x
PMID:33980830
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研究论文 | 本文通过体内谱系追踪、单细胞转录组学、计算建模和三维类器官培养系统研究了肛门直肠交界处的过渡区细胞，发现了一群具有多能性的Krt17+基底细胞，这些细胞在正常稳态下维持鳞状上皮，并在组织损伤后参与腺上皮的修复 | 首次揭示了肛门直肠交界处过渡区细胞在组织再生中的作用 | NA | 研究过渡区细胞在正常和损伤状态下的组织再生作用 | 肛门直肠交界处的过渡区细胞 | NA | NA | 体内谱系追踪、单细胞转录组学、计算建模、三维类器官培养系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
What are the applications of single-cell RNA sequencing in cancer research: a systematic review
2021-May-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01955-1
PMID:33975628
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中的应用，详细介绍了其准备过程、测序平台以及数据分析的主要步骤和方法 | scRNA-seq技术因其前所未有的高分辨率而被广泛应用于癌症研究，有助于更好地理解癌症细胞生物学和发病机制 | NA | 探讨scRNA-seq在癌症研究中的应用，特别是其在实体肿瘤研究中的发现和成就 | 单细胞RNA测序技术及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-09 |
Resident memory T cells in tumor-distant tissues fortify against metastasis formation
2021-05-11, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109118
PMID:33979626
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研究论文 | 研究使用小鼠乳腺癌模型，探讨了肿瘤远处组织中驻留记忆T细胞（Ts）的形成及其在防止转移形成中的作用 | 首次揭示了肿瘤、对侧乳腺黏膜和前转移肺中Ts的发育过程，并通过单细胞RNA测序分析了Ts的两种表型状态 | NA | 探讨肿瘤远处组织中驻留记忆T细胞的形成及其在防止转移形成中的作用 | 驻留记忆T细胞（Ts）及其在肿瘤远处组织中的发育和功能 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠乳腺癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Pan-cancer analysis reveals tumor-associated macrophage communication in the tumor microenvironment
2021-May-10, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-021-00226-1
PMID:33971970
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据，探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤微环境（TME）中的分子特征及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次揭示了TAM亚群间的异质性及其在肿瘤进展中的作用，特别是CD86+ TAMs的关键角色，并发现了六个枢纽基因（包括FLI1）在TAM与肿瘤细胞相互作用中的异常表达 | NA | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其与其他微环境成分的通信模式 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能和相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同肿瘤类型的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling of buffelgrass (Cenchrus ciliaris) eggs unveils apomictic parthenogenesis signatures
2021-05-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89170-y
PMID:33972603
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研究论文 | 本文通过激光捕获显微切割技术对刺毛草（Cenchrus ciliaris）的性成熟和孤雌生殖卵细胞进行RNA测序，揭示了孤雌生殖卵细胞的转录组特征 | 首次创建了刺毛草卵细胞的从头转录组，并识别了孤雌生殖卵细胞与性成熟卵细胞之间的转录差异 | NA | 旨在揭示孤雌生殖机制，为作物育种中双单倍体生产提供帮助 | 刺毛草的性成熟和孤雌生殖卵细胞 | NA | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 性成熟和孤雌生殖卵细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-09 |
CCR2-dependent monocyte-derived cells restrict SARS-CoV-2 infection
2021-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.05.03.442538
PMID:33972938
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研究论文 | 本文研究了CCR2依赖的单核细胞衍生的细胞在限制SARS-CoV-2感染中的作用 | 首次详细描述了CCR2依赖的单核细胞在SARS-CoV-2感染中的保护作用，并使用scRNA-seq分析和体内抗体标记技术进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类免疫反应存在差异 | 探讨SARS-CoV-2感染中先天免疫机制的保护作用 | SARS-CoV-2感染中的CCR2依赖的单核细胞 | NA | 呼吸系统疾病 | scRNA-seq, 体内抗体标记 | NA | 细胞 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Hotspot identifies informative gene modules across modalities of single-cell genomics
2021-05-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.04.005
PMID:33951459
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研究论文 | 本文提出了一种名为“Hotspot”的方法，用于在单细胞基因组学的多模态数据中识别信息性基因模块 | Hotspot方法能够直接在给定的细胞间相似性度量上操作，并可与任何识别细胞间转录变异主要轴的方法（线性或非线性）集成 | NA | 旨在解决单细胞RNA-seq数据分析中识别信息性基因变异及其模块化组织的问题 | 单细胞RNA-seq数据中的基因变异及其模块化组织 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-09 |
scSNV: accurate dscRNA-seq SNV co-expression analysis using duplicate tag collapsing
2021-05-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02364-5
PMID:33962667
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研究论文 | 本文介绍了scSNV，一种用于dscRNA-seq实验中通过分子重复标签折叠来准确识别单核苷酸变异及其共表达的新方法 | scSNV通过折叠分子重复标签，提高了变异识别的准确性，并能同时检测遗传变异和A>G RNA编辑 | NA | 开发一种新的流程，以最大化dscRNA-seq实验中变异调用的准确性，并利用分子重复来优化变异共表达的检测 | dscRNA-seq实验中的单核苷酸变异及其共表达 | 生物信息学 | NA | dscRNA-seq | NA | RNA序列 | 二十二个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals urothelial cell heterogeneity and regenerative cues following cyclophosphamide-induced bladder injury
2021-05-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03740-6
PMID:33953164
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研究论文 | 本研究使用基于液滴的单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠膀胱黏膜层在正常和受伤条件下的细胞类型，揭示了尿路上皮细胞的异质性及其在环磷酰胺诱导的膀胱损伤后的再生机制 | 首次详细描述了在环磷酰胺诱导的膀胱损伤中，不同膀胱细胞亚群如何协同作用以驱动修复和再生过程 | NA | 深入理解环磷酰胺诱导的膀胱损伤期间的细胞动态，并识别对受伤膀胱再生有重要贡献的微环境因子 | 小鼠膀胱黏膜层的细胞在正常和受伤条件下的类型和功能 | 数字病理学 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-09 |
Deep generative model embedding of single-cell RNA-Seq profiles on hyperspheres and hyperbolic spaces
2021-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22851-4
PMID:33953202
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPhere的可扩展深度生成模型，用于将单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据嵌入到低维的超球面或双曲空间中，以准确表示scRNA-seq数据 | scPhere模型解决了多层次的复杂批次因素，促进了大型数据集的交互式可视化，解决了细胞拥挤问题，并揭示了时间轨迹 | NA | 开发一种新的方法来处理和解释单细胞RNA测序数据中的维度降低问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 文本 | 九个大型数据集，来自人类患者或动物发育的复杂组织 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
Distinct identities of leaf phloem cells revealed by single cell transcriptomics
2021-05-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaa060
PMID:33955487
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术揭示了叶片韧皮部细胞的不同身份 | 首次通过单细胞转录组学技术详细分析了叶片韧皮部细胞的代谢途径和功能 | NA | 探究叶片韧皮部细胞的特性和功能 | 叶片韧皮部细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 至少19种细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
Evidence for phloem loading via the abaxial bundle sheath cells in maize leaves
2021-05-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaa055
PMID:33955497
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了C4玉米叶片中束鞘细胞的分化，特别是背侧束鞘细胞在韧皮部装载中的作用 | 发现了玉米中一种新的韧皮部装载机制，其中背侧束鞘细胞为主要途径，用于质外体蔗糖向韧皮部的转移 | NA | 研究C4玉米叶片中束鞘细胞的分化及其在韧皮部装载中的作用 | C4玉米的束鞘细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
Single-keratinocyte transcriptomic analyses identify different clonal types and proliferative potential mediated by FOXM1 in human epidermal stem cells
2021-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22779-9
PMID:33947848
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了人类表皮干细胞中由FOXM1介导的不同克隆类型和增殖潜力 | 发现FOXM1作为YAP依赖的关键调节因子在表皮干细胞中的作用 | NA | 提高表皮培养中干细胞测量的标准 | 人类表皮干细胞及其克隆类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-09 |
Cell-level metadata are indispensable for documenting single-cell sequencing datasets
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001077
PMID:33945522
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中细胞级元数据的重要性及其在现有研究中的缺失情况 | 强调了细胞级元数据在单细胞测序数据中的不可或缺性，并呼吁提高相关标准和文档记录 | 指出大多数研究未能提供足够的细胞级元数据，导致数据复现、探索和验证的困难 | 探讨单细胞RNA测序数据中细胞级元数据的必要性及其对研究的影响 | 单细胞RNA测序数据及其细胞级元数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01323-8
PMID:33958794
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研究论文 | 研究了乳腺癌患者在接受抗PD1治疗前后肿瘤内细胞的变化，通过单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组分析，揭示了免疫治疗反应的异质性 | 首次详细描述了抗PD1治疗前后乳腺癌肿瘤内T细胞的克隆扩增及其相关免疫表型和基因集的变化 | 研究仅限于激素受体阳性或三阴性乳腺癌患者，且样本量相对较小 | 探讨为何只有部分乳腺癌肿瘤对抗PD1免疫检查点阻断治疗有反应 | 乳腺癌患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组分析 | NA | 单细胞数据 | 29名接受抗PD1治疗的患者和11名在接受新辅助化疗后接受抗PD1治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
Transcriptional analysis of cystic fibrosis airways at single-cell resolution reveals altered epithelial cell states and composition
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01332-7
PMID:33958799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，比较了囊性纤维化患者和健康捐赠者的近端气道，揭示了疾病相关的细胞状态和组成的改变 | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了囊性纤维化气道的转录组变化，并发现了疾病依赖性的细胞差异 | NA | 揭示囊性纤维化气道疾病的细胞状态和组成变化，为开发新的靶向疗法提供分子图谱 | 囊性纤维化患者的近端气道与健康肺捐赠者的近端气道 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 囊性纤维化患者样本19例，健康肺捐赠者样本19例 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
Predicting anti-PD-1 responders in malignant melanoma from the frequency of S100A9+ monocytes in the blood
2021-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002171
PMID:33963011
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，研究了恶性黑色素瘤患者中S100A9+单核细胞频率与抗PD-1治疗反应的关系 | 首次揭示了S100A9+单核细胞在预测抗PD-1治疗反应中的潜在作用 | 研究样本量较小，需要进一步在大规模患者群体中验证 | 寻找预测抗PD-1治疗反应的生物标志物 | 恶性黑色素瘤患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 细胞 | 单细胞RNA测序分析涉及8例患者，流式细胞术分析涉及20例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-09 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本文利用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告基因等位基因，研究了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用 | 首次揭示了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的关键作用，并提出在缺乏性别分化的情况下，发育中的睾丸内的信号驱动生殖细胞转化 | NA | 探讨NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用及其机制 | 睾丸生殖细胞肿瘤的发生机制 | NA | 睾丸肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |