单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Evidence for phloem loading via the abaxial bundle sheath cells in maize leaves
2021-05-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaa055
PMID:33955497
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了C4玉米叶片中束鞘细胞的分化，特别是背侧束鞘细胞在韧皮部装载中的作用 | 发现了玉米中一种新的韧皮部装载机制，其中背侧束鞘细胞为主要途径，用于质外体蔗糖向韧皮部的转移 | NA | 研究C4玉米叶片中束鞘细胞的分化及其在韧皮部装载中的作用 | C4玉米的束鞘细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Single-keratinocyte transcriptomic analyses identify different clonal types and proliferative potential mediated by FOXM1 in human epidermal stem cells
2021-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22779-9
PMID:33947848
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了人类表皮干细胞中由FOXM1介导的不同克隆类型和增殖潜力 | 发现FOXM1作为YAP依赖的关键调节因子在表皮干细胞中的作用 | NA | 提高表皮培养中干细胞测量的标准 | 人类表皮干细胞及其克隆类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Cell-level metadata are indispensable for documenting single-cell sequencing datasets
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001077
PMID:33945522
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中细胞级元数据的重要性及其在现有研究中的缺失情况 | 强调了细胞级元数据在单细胞测序数据中的不可或缺性，并呼吁提高相关标准和文档记录 | 指出大多数研究未能提供足够的细胞级元数据，导致数据复现、探索和验证的困难 | 探讨单细胞RNA测序数据中细胞级元数据的必要性及其对研究的影响 | 单细胞RNA测序数据及其细胞级元数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集 | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01323-8
PMID:33958794
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研究论文 | 研究了乳腺癌患者在接受抗PD1治疗前后肿瘤内细胞的变化，通过单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组分析，揭示了免疫治疗反应的异质性 | 首次详细描述了抗PD1治疗前后乳腺癌肿瘤内T细胞的克隆扩增及其相关免疫表型和基因集的变化 | 研究仅限于激素受体阳性或三阴性乳腺癌患者，且样本量相对较小 | 探讨为何只有部分乳腺癌肿瘤对抗PD1免疫检查点阻断治疗有反应 | 乳腺癌患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组分析 | NA | 单细胞数据 | 29名接受抗PD1治疗的患者和11名在接受新辅助化疗后接受抗PD1治疗的患者 |
| 125 | 2024-08-09 |
Transcriptional analysis of cystic fibrosis airways at single-cell resolution reveals altered epithelial cell states and composition
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01332-7
PMID:33958799
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，比较了囊性纤维化患者和健康捐赠者的近端气道，揭示了疾病相关的细胞状态和组成的改变 | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了囊性纤维化气道的转录组变化，并发现了疾病依赖性的细胞差异 | NA | 揭示囊性纤维化气道疾病的细胞状态和组成变化，为开发新的靶向疗法提供分子图谱 | 囊性纤维化患者的近端气道与健康肺捐赠者的近端气道 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 囊性纤维化患者样本19例，健康肺捐赠者样本19例 |
| 126 | 2024-08-09 |
Predicting anti-PD-1 responders in malignant melanoma from the frequency of S100A9+ monocytes in the blood
2021-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002171
PMID:33963011
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，研究了恶性黑色素瘤患者中S100A9+单核细胞频率与抗PD-1治疗反应的关系 | 首次揭示了S100A9+单核细胞在预测抗PD-1治疗反应中的潜在作用 | 研究样本量较小，需要进一步在大规模患者群体中验证 | 寻找预测抗PD-1治疗反应的生物标志物 | 恶性黑色素瘤患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 细胞 | 单细胞RNA测序分析涉及8例患者，流式细胞术分析涉及20例患者 |
| 127 | 2024-08-09 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本文利用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告基因等位基因，研究了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用 | 首次揭示了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的关键作用，并提出在缺乏性别分化的情况下，发育中的睾丸内的信号驱动生殖细胞转化 | NA | 探讨NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用及其机制 | 睾丸生殖细胞肿瘤的发生机制 | NA | 睾丸肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型进行研究 |
| 128 | 2024-08-09 |
Hierarchicell: an R-package for estimating power for tests of differential expression with single-cell data
2021-May-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07635-w
PMID:33932993
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研究论文 | Hierarchicell是一个R包，用于估计单细胞数据中差异表达测试的统计功效 | Hierarchicell是首个明确模拟并考虑单细胞RNA-seq数据中层级相关结构（即样本内相关性）的单细胞功率计算器 | NA | 开发一个工具，用于准确估计单细胞RNA-seq数据中差异表达测试的统计功效 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 用户指定的独立实验单位数量（如个体）和实验单位内的细胞数量 |
| 129 | 2024-08-09 |
Aging-dependent regulatory cells emerge in subcutaneous fat to inhibit adipogenesis
2021-05-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.026
PMID:33878347
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research paper | 本研究通过比较年轻和老年小鼠皮下脂肪组织中的总基质血管细胞的scRNA-seq数据，发现了一种与年龄相关的调节细胞（ARC），这种细胞仅在老年小鼠和人类的皮下脂肪组织中出现，并能分泌高水平的促炎趋化因子，抑制邻近脂肪前体的增殖和分化。 | 首次鉴定出一种与年龄相关的调节细胞（ARC），并揭示了其在老年小鼠和人类皮下脂肪组织中的出现及其抑制脂肪前体分化的机制。 | NA | 探究与年龄相关的皮下脂肪组织损失的分子机制。 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织中的基质血管细胞。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织样本 |
| 130 | 2024-08-09 |
Adaptive cell invasion maintains lateral line organ homeostasis in response to environmental changes
2021-05-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.027
PMID:33878346
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研究论文 | 本文通过细胞系标记、活体时间流逝成像和单细胞RNA测序技术，发现zebrafish侧线器官中的高度可移动皮肤衍生细胞能够入侵成熟的机械感觉器官并分化为Neuromast相关（Nm）离子细胞，以响应环境变化，维持器官稳态 | 发现了Nm离子细胞，挑战了侧线器官完全由胚胎衍生而来的观点，并提出Nm离子细胞可能是通过调节离子微环境来调控感觉毛细胞功能的潜在调节因子 | NA | 研究环境变化下侧线器官稳态的维持机制 | zebrafish侧线器官中的感觉毛细胞和Nm离子细胞 | NA | NA | 细胞系标记、活体时间流逝成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
A subpopulation of embryonic microglia respond to maternal stress and influence nearby neural progenitors
2021-05-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.018
PMID:33887203
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研究论文 | 研究探讨了胚胎期下丘脑中的小胶质细胞对母体应激的反应及其对邻近神经干细胞的影响 | 发现胚胎期下丘脑中的小胶质细胞能响应母体应激，并通过分泌CCL3和CCL4影响神经干细胞的增殖和分化 | 研究主要集中在雄性胚胎，对雌性的影响未详细探讨 | 探究胚胎期下丘脑小胶质细胞对母体应激的响应及其对神经发育的影响 | 胚胎期下丘脑的小胶质细胞和神经干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及雄性胚胎的小胶质细胞和神经干细胞 |
| 132 | 2024-08-09 |
Establishing and maintaining fertility: the importance of cell cycle arrest
2021-05-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348151.120
PMID:33888561
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综述 | 本文综述了Cip/Kip家族的周期素依赖性激酶抑制剂（CKIs）在小鼠性腺发育中的作用，特别强调了单细胞RNA测序研究显示的周期素依赖性激酶抑制剂的异质性 | 强调了单细胞RNA测序研究显示的周期素依赖性激酶抑制剂的异质性，并突出了细胞周期抑制剂在控制和维持雌性生育能力中的新角色 | NA | 探讨细胞周期抑制剂在性腺发育和维持生育能力中的重要性 | 小鼠性腺发育中的Cip/Kip家族周期素依赖性激酶抑制剂 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
Gremlin 1+ fibroblastic niche maintains dendritic cell homeostasis in lymphoid tissues
2021-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00920-6
PMID:33903764
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，鉴定了在人和小鼠淋巴结中表达Gremlin1的成纤维网状细胞亚群，并发现这些细胞在维持淋巴组织中树突状细胞稳态中起关键作用 | 首次揭示了Gremlin1成纤维细胞在淋巴结中形成的新微环境，该微环境对淋巴组织中树突状细胞的稳态维持至关重要 | NA | 探究成纤维网状细胞在淋巴组织中的功能及其对树突状细胞稳态的影响 | 人和小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人和小鼠的淋巴结样本 |
| 134 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of human white adipose tissue identifies new cell states in health and obesity
2021-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00922-4
PMID:33907320
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和流式细胞术，揭示了健康和肥胖人体白色脂肪组织中基质血管部分的大规模综合细胞普查，并报告了脂肪组织定居的先天淋巴细胞、树突状细胞和单核细胞衍生巨噬细胞的新亚群和发展轨迹。 | 本文首次揭示了肥胖人体白色脂肪组织中免疫调节机制向炎症网络的转变，并提供了健康人体白色脂肪组织的详细和无偏见的细胞景观。 | NA | 研究健康和肥胖人体白色脂肪组织中的细胞状态和相互作用。 | 人体白色脂肪组织中的细胞亚群和发展轨迹。 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 健康和肥胖的人体白色脂肪组织样本 |
| 135 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing links multiregional immune landscapes and tissue-resident T cells in ccRCC to tumor topology and therapy efficacy
2021-05-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.03.007
PMID:33861994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和T细胞受体测序，分析了167,283个细胞，来自多个肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血，以绘制透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的免疫景观，并探讨了免疫异质性对临床结果的影响 | 首次通过单细胞测序技术，结合T细胞受体测序，全面描绘了ccRCC的免疫景观，并揭示了组织驻留T细胞和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与免疫检查点阻断（ICB）治疗反应的关联 | 研究样本仅来自六名患者，可能不足以代表所有ccRCC患者的免疫特征 | 探讨透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的免疫异质性及其对治疗效果的影响 | ccRCC患者的肿瘤区域、淋巴结、正常肾脏和外周血中的细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA）和T细胞受体（TCR）测序 | NA | 细胞 | 167,283个细胞，来自六名患者 |
| 136 | 2024-08-09 |
Early stem cell aging in the mature brain
2021-05-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.018
PMID:33848469
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研究论文 | 本文研究了成年海马体中神经干细胞（NSC）行为受多种因素干扰的情况，并探讨了NSC老化机制及潜在干预措施。 | 首次揭示了短期NSC（ST-NSC）和长期NSC（LT-NSC）的不同老化模式，并识别了酪氨酸蛋白激酶Abl1作为NSC老化因子。 | NA | 旨在识别影响神经干细胞行为的早期机制，以促进生命后期组织功能的维持。 | 成年海马体中的神经干细胞（NSC）及其老化机制。 | NA | NA | 克隆追踪、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
Irx3 and Irx5 in Ins2-Cre+ cells regulate hypothalamic postnatal neurogenesis and leptin response
2021-05, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00382-y
PMID:33859429
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研究论文 | 研究探讨了Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用，以及它们如何影响下丘脑的产后神经发生和瘦素反应 | 发现了早期产后下丘脑中表达Irx3和Irx5的高水平放射状胶质样神经干细胞群，并证明了Irx3和Irx5的减少剂量促进产后下丘脑的神经发生 | NA | 探究Irx3和Irx5基因如何通过改变食物摄入量来影响肥胖 | Irx3和Irx5基因在Ins2-Cre+细胞中的作用 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Irx3和Irx5基因突变的双重杂合子小鼠 |
| 138 | 2024-08-09 |
Applications of single-cell and bulk RNA sequencing in onco-immunology
2021-05, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2021.03.005
PMID:33866228
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综述 | 本文综述了单细胞和常规（bulk）RNA测序在肿瘤免疫学中的应用，介绍了数据预处理、统计分析方法以及相关的计算挑战 | 提供了基因表达分析的实例，如差异表达分析、降维、聚类和富集分析，并展示了如何使用去卷积算法从bulk或单细胞RNA-seq中识别和量化多种免疫亚群 | 讨论了单细胞和bulk RNA-seq在临床应用中的优缺点 | 探讨RNA测序技术在肿瘤免疫学中的应用潜力，特别是在免疫治疗反应中的分子机制识别 | 单细胞和bulk RNA-seq技术在肿瘤免疫学中的应用 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq） | 机器学习和深度学习模型 | RNA-seq数据 | 使用公开数据集进行示例分析 |
| 139 | 2024-08-09 |
A CD44/Brg1 nuclear complex confers mesenchymal progenitor cells with enhanced fibrogenicity in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-05-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.144652
PMID:33822772
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研究论文 | 研究探讨了CD44/Brg1核复合体在特发性肺纤维化中增强间充质前体细胞纤维化能力的作用 | 首次揭示了CD44与Brg1和Zeb1形成核蛋白复合体，通过上调Sox2基因表达促进特发性肺纤维化中间充质前体细胞的自我更新和纤维化能力 | NA | 探究CD44在特发性肺纤维化中间充质前体细胞中的作用及其分子机制 | 特发性肺纤维化中的间充质前体细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及特发性肺纤维化患者的肺部间充质前体细胞 |
| 140 | 2024-08-09 |
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
2021-05, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01231-3
PMID:33785863
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研究论文 | 研究了免疫介导性再生障碍性贫血（AA）患者淋巴细胞中的体细胞突变情况 | 首次详细描述了非白血病T细胞中的体细胞突变及其在AA发病机制中的作用 | 样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨体细胞突变在免疫介导性再生障碍性贫血发病机制中的作用 | AA患者的CD4+和CD8+ T细胞 | NA | 再生障碍性贫血 | 定制的2533基因面板测序、T细胞受体beta测序、单细胞测序 | NA | 基因序列 | 24名AA患者和20名健康对照 |