单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
The neutrotime transcriptional signature defines a single continuum of neutrophils across biological compartments
2021-05-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22973-9
PMID:34001893
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常和炎症状态下小鼠组织中中性粒细胞的转录特征，揭示了中性粒细胞发育的单一连续谱。 | 本文首次提出了中性粒细胞发育的单一连续谱概念，称为中性时间（neutrotime），并验证了其在人和小鼠中的普遍性。 | NA | 探讨中性粒细胞在不同生物隔室中的功能多样性是否需要离散的中性粒细胞亚群。 | 正常和炎症状态下小鼠组织中的中性粒细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Quantifying the effect of experimental perturbations at single-cell resolution
2021-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00803-5
PMID:33558698
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研究论文 | 本文通过连续测量转录组空间中扰动效应，量化了单细胞水平上实验扰动的影响 | 开发了一种使用图信号处理估计每个细胞在各实验条件下相对似然性的方法，并提出了顶点频率聚类来提取受扰动影响的细胞群 | NA | 量化单细胞水平上实验扰动的影响 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图信号处理 | 转录组数据 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Immune dysregulation and autoreactivity correlate with disease severity in SARS-CoV-2-associated multisystem inflammatory syndrome in children
2021-05-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.04.003
PMID:33891889
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序、流式细胞术、抗原受体谱分析和无偏倚血清蛋白质组学方法，分析了儿童多系统炎症综合征（MIS-C）、成人COVID-19和健康儿童及成人的免疫特征，发现MIS-C患者的疾病严重程度与免疫失调和自身反应性相关。 | 研究定义了MIS-C患者的警报素、细胞毒性、TCR谱和浆细胞样前体细胞的特征，这些特征可能用于临床诊断和早期预测疾病严重程度。 | NA | 探讨儿童多系统炎症综合征（MIS-C）的免疫特征及其与疾病严重程度的关系。 | MIS-C患者、成人COVID-19患者和健康儿童及成人。 | 免疫学 | 儿童多系统炎症综合征 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、抗原受体谱分析、血清蛋白质组学 | NA | RNA、细胞、蛋白质 | MIS-C患者、成人COVID-19患者和健康儿童及成人的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Control of neurogenic competence in mammalian hypothalamic tanycytes
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg3777
PMID:34049878
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研究论文 | 本研究展示了特定破坏NFI转录因子家族可以显著刺激视丘下部tanycyte的增殖和神经发生 | 首次揭示了NFI因子在tanycyte中抑制Sonic hedgehog和Wnt信号通路的作用，以及这些通路的调控对tanycyte衍生神经发生的影响 | NA | 探索控制哺乳动物视丘下部tanycyte神经发生能力的分子机制 | 视丘下部tanycyte及其衍生神经元的身份和分子调控机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109173
PMID:33991510
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研究论文 | 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体（BCR）库的动态变化及交叉反应性反应的出现 | 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征，并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100288
PMID:33969321
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析，探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 | 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化，以及与自体免疫相关的抗体反应 | NA | 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 | COVID-19患者的脑脊液和血液 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Suppressive neutrophils require PIM1 for metabolic fitness and survival during chronic viral infection
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109160
PMID:34038722
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染中髓样细胞的作用，发现抑制性中性粒细胞在慢性感染中富集，并高度表达PIM1基因，该基因编码的激酶促进线粒体适应性和细胞存活。 | 首次揭示了抑制性中性粒细胞在慢性病毒感染中的作用及其依赖PIM1的代谢适应性和生存机制。 | NA | 探讨髓样细胞在慢性病毒感染中的作用及机制。 | 抑制性中性粒细胞和髓样来源的抑制细胞（M-MDSCs）。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Sarcomere function activates a p53-dependent DNA damage response that promotes polyploidization and limits in vivo cell engraftment
2021-05-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109088
PMID:33951429
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研究论文 | 研究通过构建人心脏肌细胞模型，利用荧光标记的细胞周期蛋白B1和心脏肌钙蛋白T追踪复制和多倍化过程，揭示了肌节功能通过激活p53依赖的DNA损伤反应促进多倍化和限制体内细胞植入的机制。 | 首次揭示肌节功能通过p53依赖的DNA损伤反应促进心脏肌细胞多倍化，并发现通过抑制肌节功能或清除活性氧可以抑制细胞周期停滞和多倍化，从而增强心脏肌细胞在受损心脏中的植入。 | 研究主要在体外模型中进行，需要进一步的体内实验验证其发现的有效性和安全性。 | 探讨心脏肌细胞复制和多倍化的机制，以及如何通过干预这些机制来改善心脏肌细胞的替换策略。 | 人心脏肌细胞的复制和多倍化过程。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | 图像 | 使用荧光标记的细胞周期蛋白B1和心脏肌钙蛋白T追踪复制和多倍化过程，具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
The relationship between the gut microbiome and host gene expression: a review
2021-May, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02237-0
PMID:33221945
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综述 | 本文综述了肠道微生物组与宿主基因表达之间关系的最新研究 | 介绍了新兴技术如单细胞RNA测序和类器官生成在深化这一关系理解中的潜力 | NA | 探讨肠道微生物组如何影响宿主基因表达及其对宿主生理过程的重要性 | 肠道微生物组与宿主基因表达的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Differential RA responsiveness among subsets of mouse late progenitor spermatogonia
2021-05-05, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-21-0031
PMID:33835049
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研究论文 | 本文研究了小鼠晚期生殖干细胞在不同子集对视黄酸（RA）的反应差异 | 首次功能性地测试了表达视黄酸受体γ（RARG）的生殖干细胞对RA的反应，并发现RARG单独不足以在小鼠睾丸中启动生殖干细胞对RA的反应 | NA | 探究小鼠晚期生殖干细胞在不同子集对视黄酸的反应差异 | 小鼠晚期生殖干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals transcriptional landscape and intratumor heterogenicity in gallbladder cancer liver metastasis microenvironment
2021-May, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2227
PMID:34164523
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胆囊癌肝转移微环境的转录组特征和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了胆囊癌肝转移微环境中多种细胞类型的特征和相互作用 | 研究结果初步，需要进一步验证和深入研究 | 探索胆囊癌肝转移的分子机制 | 胆囊癌肝转移组织中的细胞类型及其特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7,788个细胞，包括T细胞、B细胞、恶性细胞、成纤维细胞、内皮细胞、巨噬细胞、树突状细胞和肥大细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-08 |
A high-resolution cell atlas of the domestic pig lung and an online platform for exploring lung single-cell data
2021-05-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.03.012
PMID:34144929
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了3个月龄猪肺的细胞异质性，生成了包含16种主要细胞类型的单细胞图谱，并构建了一个在线平台ScdbLung用于探索猪肺单细胞数据 | 首次生成了猪肺的高分辨率单细胞图谱，并构建了一个综合的在线平台，用于指导猪肺研究和临床应用 | NA | 研究猪肺细胞异质性，比较猪肺与人类肺部在细胞交流和呼吸病毒受体表达模式上的相似性与差异性 | 3个月龄猪肺的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 13,580个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-08 |
FACS Enrichment of Total Interstitial Cells and Fibroblasts from Adult Mouse Ventricles
2021-May-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4028
PMID:34150935
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研究论文 | 本文描述了一种基于荧光激活细胞分选（FACS）的方法，用于从成年小鼠心室中分离出两种心脏细胞组分：总间质细胞群（TIP；非心肌细胞）和富集的（-GFP）心脏成纤维细胞。 | 本文提供了一种新的FACS方法，用于分离和富集成年小鼠心室中的总间质细胞和心脏成纤维细胞。 | NA | 研究心脏间质细胞的异质性和在健康及心肌梗死心脏中的动态变化。 | 成年小鼠心室中的总间质细胞和心脏成纤维细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 成年小鼠心室细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-08 |
Multimodal analysis for human ex vivo studies shows extensive molecular changes from delays in blood processing
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102404
PMID:34113805
|
研究论文 | 本文研究了血液处理延迟对人类外周血单个核细胞（PBMC）数量、状态及血浆蛋白质组的影响 | 发现血液处理延迟6小时即可导致单细胞转录组和血浆蛋白质组发生显著变化 | 研究仅限于血液处理延迟的影响，未涉及其他可能影响因素 | 探讨血液处理延迟对多组学平台在临床和转化研究中应用的影响 | 人类外周血单个核细胞（PBMC）及其血浆蛋白质组 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 单细胞转录组、血浆蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-08 |
Stromal Heterogeneity in the Human Proliferative Endometrium-A Single-Cell RNA Sequencing Study
2021-May-22, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11060448
PMID:34067358
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨人类增殖期子宫内膜中的基质细胞异质性 | 通过单细胞RNA测序技术发现了多种基质细胞群体，这些群体可能具有控制炎症和细胞外基质组成的能力 | NA | 旨在理解健康再生过程中的细胞相互作用，并为良性妇科疾病的治疗开发新疗法 | 人类增殖期子宫内膜的基质细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自健康生育期女性的增殖期子宫内膜活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Dysregulation of Pulmonary Responses in Severe COVID-19
2021-05-21, Viruses
DOI:10.3390/v13060957
PMID:34064104
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研究论文 | 本研究重新分析了已发表的单细胞RNA测序数据，探讨了严重COVID-19患者与轻症患者在支气管肺泡灌洗液中细胞类型的差异及其对肺部病理的影响。 | 发现了严重COVID-19患者中TH17型细胞减少、IFNA1表达细胞减少且TLR7和TLR8表达降低，以及IgA表达B细胞和超活化上皮细胞（或巨噬细胞）增加等现象，并提出IFN-I和PAI-1作为预测严重COVID-19的潜在生物标志物。 | NA | 探讨严重COVID-19患者的肺部反应失调机制，并寻找潜在的生物标志物。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞类型及其表达特征。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Regulation and Role of Transcription Factors in Osteogenesis
2021-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115445
PMID:34064134
|
综述 | 本文综述了转录因子在成骨过程中的调控作用及其机制 | 介绍了通过谱系追踪、细胞分选和单细胞转录组研究在骨骼干细胞和基因调控方面的新发现 | NA | 探讨转录因子在成骨过程中的调控作用 | 成骨细胞的分化及其调控机制 | NA | NA | 谱系追踪、细胞分选、单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Characterization of Alternative Splicing (AS) Events during Chicken (Gallus gallus) Male Germ-Line Stem Cell Differentiation with Single-Cell RNA-seq
2021-May-20, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani11051469
PMID:34065391
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了鸡雄性生殖干细胞分化过程中的可变剪接事件 | 首次在全基因组范围内提供了鸡雄性生殖干细胞可变剪接事件的综合图谱 | NA | 深入理解生殖细胞分化过程，为家禽繁殖、干细胞生物学及人类药物研发开辟新途径 | 鸡的胚胎干细胞、性腺原始生殖细胞和精原干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共检测了来自15,338个基因的38,494个可变剪接事件，以及来自14,783个基因的48,955个事件和来自15,089个基因的49,900个事件 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-08 |
Fabrication of Microfluidic Devices for Emulsion Formation by Microstereolithography
2021-May-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26092817
PMID:34068649
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综述 | 本文综述了使用微立体光刻技术制造用于乳液形成的微流控设备的基本原理和最新创新 | 微立体光刻技术简化了设备制造过程，提供了真正的三维几何形状，成本效益高，并支持多材料加工 | NA | 支持研究人员建立自己的微立体光刻系统以制造定制的微流控设备 | 微立体光刻技术及其在微流控设备制造中的应用 | 微流控技术 | NA | 微立体光刻（PµSL） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-08 |
The Cellular Composition of Bovine Coccygeal Intervertebral Discs: A Comprehensive Single-Cell RNAseq Analysis
2021-May-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094917
PMID:34066404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（RNAseq）分析了牛尾椎间盘的细胞组成，揭示了核软骨（NP）和纤维环（AF）中的细胞群及其发育变化。 | 本文首次整合scRNAseq和RNAseq数据，稳定了聚类结果，并鉴定了NP和AF结构/组织特异性基因，揭示了年轻牛椎间盘中NP和AF的细胞表型复杂性。 | NA | 支持退化椎间盘再生治疗的研究 | 牛尾椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），批量RNA测序（RNAseq） | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |