单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-08 |
Regulation and Role of Transcription Factors in Osteogenesis
2021-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115445
PMID:34064134
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综述 | 本文综述了转录因子在成骨过程中的调控作用及其机制 | 介绍了通过谱系追踪、细胞分选和单细胞转录组研究在骨骼干细胞和基因调控方面的新发现 | NA | 探讨转录因子在成骨过程中的调控作用 | 成骨细胞的分化及其调控机制 | NA | NA | 谱系追踪、细胞分选、单细胞转录组 | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-08 |
Characterization of Alternative Splicing (AS) Events during Chicken (Gallus gallus) Male Germ-Line Stem Cell Differentiation with Single-Cell RNA-seq
2021-May-20, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani11051469
PMID:34065391
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了鸡雄性生殖干细胞分化过程中的可变剪接事件 | 首次在全基因组范围内提供了鸡雄性生殖干细胞可变剪接事件的综合图谱 | NA | 深入理解生殖细胞分化过程，为家禽繁殖、干细胞生物学及人类药物研发开辟新途径 | 鸡的胚胎干细胞、性腺原始生殖细胞和精原干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共检测了来自15,338个基因的38,494个可变剪接事件，以及来自14,783个基因的48,955个事件和来自15,089个基因的49,900个事件 |
| 63 | 2024-08-08 |
Fabrication of Microfluidic Devices for Emulsion Formation by Microstereolithography
2021-May-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26092817
PMID:34068649
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综述 | 本文综述了使用微立体光刻技术制造用于乳液形成的微流控设备的基本原理和最新创新 | 微立体光刻技术简化了设备制造过程，提供了真正的三维几何形状，成本效益高，并支持多材料加工 | NA | 支持研究人员建立自己的微立体光刻系统以制造定制的微流控设备 | 微立体光刻技术及其在微流控设备制造中的应用 | 微流控技术 | NA | 微立体光刻（PµSL） | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-08 |
The Cellular Composition of Bovine Coccygeal Intervertebral Discs: A Comprehensive Single-Cell RNAseq Analysis
2021-May-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094917
PMID:34066404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（RNAseq）分析了牛尾椎间盘的细胞组成，揭示了核软骨（NP）和纤维环（AF）中的细胞群及其发育变化。 | 本文首次整合scRNAseq和RNAseq数据，稳定了聚类结果，并鉴定了NP和AF结构/组织特异性基因，揭示了年轻牛椎间盘中NP和AF的细胞表型复杂性。 | NA | 支持退化椎间盘再生治疗的研究 | 牛尾椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），批量RNA测序（RNAseq） | NA | RNA序列 | NA |
| 65 | 2024-08-08 |
The Transcriptome of SH-SY5Y at Single-Cell Resolution: A CITE-Seq Data Analysis Workflow
2021-May-06, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps4020028
PMID:34066513
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研究论文 | 本文介绍了一种CITE-seq数据分析流程，用于分析SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | CITE-seq技术结合了抗体标记和细胞分选的免疫表型能力与单细胞RNA测序的分辨率，通过添加12-bp核苷酸条形码到抗体上，可以在同一运行中对多个条形码样本进行测序，从而降低scRNA-seq的成本 | NA | 展示理想的CITE-seq数据分析流程，并探索细胞异质性 | SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | CITE-seq | NA | 转录组数据 | 2879个单细胞 |
| 66 | 2024-08-09 |
Multiomics characteristics of neurogenesis-related gene are dysregulated in tumor immune microenvironment
2021-May-31, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-021-00202-y
PMID:34059678
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研究论文 | 本研究利用大规模临床队列和单细胞RNA测序技术，探讨了热/冷肿瘤微环境的分子特征 | 提供了通过单细胞RNA测序技术解析肿瘤微环境为热/冷肿瘤微环境的新方法 | NA | 深入了解热/冷肿瘤微环境的分子特征 | 肿瘤微环境中的分子差异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大规模临床队列 |
| 67 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of cultured human endometrial CD140b+CD146+ perivascular cells highlights the importance of in vivo microenvironment
2021-05-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02354-1
PMID:34051872
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了培养的人类子宫内膜CD140b+CD146+周细胞，揭示了体内微环境在维持细胞身份中的重要性。 | 首次提供了培养的人类CD140b+CD146+周细胞的单细胞图谱，并识别出培养特有的相对均一的细胞群体。 | NA | 探讨子宫内膜间质/干细胞的细胞异质性及其与原代细胞的关系。 | 培养的人类子宫内膜CD140b+CD146+周细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自月经期和分泌期子宫内膜的培养细胞 |
| 68 | 2024-08-09 |
Developmental bifurcation of human T follicular regulatory cells
2021-05-28, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abd8411
PMID:34049865
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，分析了从人血液、髂淋巴结和扁桃体中分离的T滤泡辅助细胞和调节细胞的成熟过程 | 研究发现T细胞的成熟过程呈现分叉轨迹，一条路径通向血液中的T细胞，另一条通向最成熟的GC T细胞 | 由于缺乏体外模拟体内生物学的实验方法以及难以获取健康人淋巴组织，研究受到一定限制 | 研究人类T滤泡辅助细胞和调节细胞的发育过程 | 人类T滤泡辅助细胞和调节细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从人血液、髂淋巴结和扁桃体中分离的T细胞和T细胞样本 |
| 69 | 2024-08-09 |
Comparative Analysis of Public Data Sets to Identify Stemness Markers That Differentiate Liver Cancer Stem Cells
2021-May-27, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI210290
PMID:34042693
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研究论文 | 本研究通过分析大量单细胞RNA测序数据，旨在识别区分肝癌干细胞的干细胞标志物 | 利用共享大数据推动转化医学，生成新的假设 | NA | 识别肝癌干细胞中的重要干细胞标志物，解释其对治疗的抵抗性 | 肝癌干细胞及其干细胞标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10865个单细胞RNA测序样本，涉及42684个编码和非编码基因 |
| 70 | 2024-08-09 |
Contrastive self-supervised clustering of scRNA-seq data
2021-May-27, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04210-8
PMID:34044773
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研究论文 | 本文提出了一种新的无监督学习方法contrastive-sc，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的细胞聚类 | 该方法采用自监督对比学习框架，最初用于图像处理，现在被改编用于scRNA-seq数据，并在模拟和真实世界数据集上与现有技术进行了广泛比较 | NA | 研究目的是提出一种新的scRNA-seq数据聚类方法 | scRNA-seq数据的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 自监督对比学习 | 人工神经网络 | scRNA-seq数据 | 模拟和真实世界数据集 |
| 71 | 2024-08-09 |
Actuation enhances patterning in human neural tube organoids
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22952-0
PMID:34045434
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研究论文 | 本文开发了能够驱动类器官的设备，并展示了主动机械力如何增强源自单个人类多能干细胞（hPSC）的神经管类器官的形态发生和模式化 | 首次实现了通过主动机械力动态协调的机械操作来增强类器官的模式化，而不仅仅是依赖于对机械力做出反应的细胞外基质 | NA | 研究主动机械力如何影响类器官的生长和模式化，以及这种影响的分子机制 | 源自单个人类多能干细胞的神经管类器官 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组学和免疫组织化学 | NA | 细胞 | 单个人类多能干细胞（hPSC） |
| 72 | 2024-08-09 |
Comparison of the major cell populations among osteoarthritis, Kashin-Beck disease and healthy chondrocytes by single-cell RNA-seq analysis
2021-05-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03832-3
PMID:34045450
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，比较了骨关节炎、大骨节病和健康软骨细胞中的主要细胞群体 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了大骨节病和骨关节炎中软骨细胞群体的异质性，并发现了新的细胞标志物 | NA | 旨在识别大骨节病、骨关节炎患者和健康对照组中软骨细胞的主要细胞群体及其转录程序，以区分这三组中的软骨细胞 | 大骨节病、骨关节炎患者和健康对照组的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
A top-down measure of gene-to-gene coordination for analyzing cell-to-cell variability
2021-05-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90353-w
PMID:34040065
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研究论文 | 本文应用一种新开发的计算方法来测量全局基因协调水平（GCL），以系统地研究基因调控数值模型中的细胞间变异性 | 本文提出的方法能够评估和比较具有相同细胞间变异性的群体中引入的生物变异性和技术变异性之间的比率，并且对小样本大小或数据组成性引起的虚假相关性具有鲁棒性 | NA | 区分细胞间变异性中的生物变异性和技术变异性，并研究其对基因调控的影响 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术测量的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
A potential role for somatostatin signaling in regulating retinal neurogenesis
2021-05-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90554-3
PMID:34040115
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研究论文 | 研究探讨了生长抑素信号在调节视网膜神经发生中的潜在作用 | 首次在体内证实了生长抑素受体2（Sstr2）信号对视网膜神经发生的负向调节作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析，体内实验数据较少 | 探究生长抑素信号在视网膜神经发生中的作用及其机制 | 视网膜神经发生过程中的神经肽及其受体 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类胚胎视网膜组织 |
| 75 | 2024-08-08 |
scDesign2: a transparent simulator that generates high-fidelity single-cell gene expression count data with gene correlations captured
2021-05-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02367-2
PMID:34034771
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDesign2的透明模拟器，能够生成高保真的单细胞基因表达计数数据，并捕捉基因间的相关性 | scDesign2是首个能够同时保留基因、捕捉基因相关性并生成任意数量具有不同测序深度的细胞的模拟器 | NA | 解决单细胞转录组学中基准测试实验协议和计算方法的挑战 | 单细胞基因表达计数数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 任意数量 |
| 76 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma identifies a novel fibroblast subtype associated with poor prognosis but better immunotherapy response
2021-May-25, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00271-4
PMID:34035226
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了胰腺导管腺癌（PDAC）中的肿瘤间异质性，发现了一种新型癌症相关成纤维细胞（meCAFs）亚型，该亚型与不良预后相关，但显示出更好的免疫治疗反应 | 首次在PDAC中发现了一种新型癌症相关成纤维细胞亚型meCAFs，并揭示了其在PDAC进展和免疫治疗反应中的关键作用 | NA | 探索胰腺导管腺癌的肿瘤间异质性，并评估新型癌症相关成纤维细胞亚型在治疗选择中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌中的癌症相关成纤维细胞、导管癌细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个PDAC患者样本 |
| 77 | 2024-08-08 |
A 3D system to model human pancreas development and its reference single-cell transcriptome atlas identify signaling pathways required for progenitor expansion
2021-05-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23295-6
PMID:34035279
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研究论文 | 本文报道了建立一个7至10周胎儿胰腺的单细胞转录组图谱，并开发了InterCom R包用于识别受体-配体对及其下游效应，同时建立了一个从胎儿组织或人多能干细胞开始的3D人胰腺培养系统，用于长期维持胰腺前体细胞。 | 本文创新性地建立了3D人胰腺培养系统和InterCom R包，用于研究细胞间相互作用和胰腺前体细胞的扩展。 | NA | 研究人胰腺发育过程中的细胞间相互作用和信号通路。 | 人胰腺发育过程中的细胞和信号通路。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7至10周胎儿胰腺样本 |
| 78 | 2024-08-08 |
Characterizing the tumor microenvironment of metastatic ovarian cancer by single-cell transcriptomics
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109165
PMID:34038734
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了转移性卵巢癌肿瘤微环境的细胞组成和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了转移性卵巢癌肿瘤微环境中9种主要细胞类型的转录特征，并揭示了不同免疫细胞亚群在肿瘤微环境中的分布和功能 | 研究样本仅来自6名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解肿瘤微环境的细胞组成及其在癌症免疫治疗中的作用 | 转移性卵巢癌患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 9,885个细胞，来自6名患者 |
| 79 | 2024-08-09 |
Dissecting the microenvironment around biosynthetic scaffolds in murine skin wound healing
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf0787
PMID:34039601
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研究论文 | 研究了三种不同表面形貌（随机、对齐和格子状）的静电纺丝膜对小鼠和大鼠皮肤伤口愈合及免疫调节特性的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示了微环境中不同的细胞异质性，并发现对齐的支架能促进适应性免疫反应 | NA | 探讨生物材料结构特性对细胞行为和免疫反应的影响 | 静电纺丝膜在皮肤伤口愈合中的作用及其对免疫细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和大鼠的皮肤伤口样本 |
| 80 | 2024-08-09 |
Shared transcriptional profiles of atypical B cells suggest common drivers of expansion and function in malaria, HIV, and autoimmunity
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg8384
PMID:34039612
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研究论文 | 本文通过无偏倚的单细胞RNA测序技术，揭示了在疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞（ABCs）的转录谱相似性，并探讨了其功能和扩张的共同驱动因素。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞的相似转录谱，并发现干扰素-γ在这些疾病中驱动ABCs的扩张。 | NA | 探究非典型B细胞在慢性传染病和自身免疫疾病中的扩张和功能。 | 非典型B细胞（ABCs）及其在疟疾、HIV和自身免疫疾病中的转录谱和功能。 | 免疫学 | 疟疾, HIV, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |