单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 21 | 2025-10-06 |
Cell-type specific analysis of physiological action of estrogen in mouse oviducts
2021-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002747R
PMID:33818810
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析雌激素在小鼠输卵管中对不同细胞类型的特异性调控作用 | 首次在单细胞水平揭示雌激素对输卵管不同细胞类型的特异性调控，并鉴定出IGF1作为关键靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类输卵管研究数据有限 | 探究雌激素在输卵管环境调控中的细胞特异性作用机制 | 小鼠输卵管细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,原位杂交,细胞类型特异性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 卵巢切除激素替代小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human embryos identifies multiple sympathoblast lineages with potential implications for neuroblastoma origin
2021-05, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00818-x
PMID:33833454
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析人类胚胎发育过程，识别出多种交感神经母细胞谱系及其与神经母细胞瘤起源的潜在关联 | 首次发现肾上腺内交感神经母细胞直接来源于神经相关施万细胞前体，而非迁移神经嵴，这一过程在人类发育中持续数周 | 研究仅涵盖受孕后6-14周的人类胚胎发育阶段，样本时间窗口有限 | 探究人类胚胎发育过程中细胞状态进展与儿科疾病起源的关系 | 人类胚胎神经嵴和中胚层来源的谱系，包括肾上腺、肾脏、内皮和造血组织 | 单细胞生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎发育第6-14周的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Ventricular, atrial, and outflow tract heart progenitors arise from spatially and molecularly distinct regions of the primitive streak
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001200
PMID:33999917
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠胚胎中心脏祖细胞在原始条纹中的空间和分子预模式 | 发现心脏祖细胞在原始条纹中已按心室、心房和流出道预先分区，比既往认知更早 | 研究局限于小鼠胚胎模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究哺乳动物心脏发育过程中祖细胞的起源和分化机制 | 小鼠胚胎的心脏祖细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 小鼠胚胎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01329-2
PMID:33879890
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示COVID-19免疫反应特征 | 首次在COVID-19中整合单细胞转录组、表面蛋白质组和抗原受体分析，发现非经典单核细胞扩增和造血干细胞向巨核细胞分化的倾向 | 横断面研究设计，无法追踪个体随时间变化的免疫反应 | 解析COVID-19发病机制中的协调免疫反应 | 130名不同严重程度COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, 表面蛋白质组分析, T/B细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 78万个外周血单个核细胞，来自130名患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Establishing and maintaining fertility: the importance of cell cycle arrest
2021-05-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348151.120
PMID:33888561
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综述 | 本文综述了Cip/Kip家族细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂在小鼠性腺发育中的作用，特别关注其对生育能力建立和维持的重要性 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂的异质性，发现了细胞周期抑制剂在控制和维持雌性生育能力中的新作用 | NA | 探讨细胞周期停滞在建立和维持生育能力中的重要性 | 小鼠性腺发育过程中的生殖细胞和体细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 infection of the oral cavity and saliva
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01296-8
PMID:33767405
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了口腔是SARS-CoV-2感染的重要部位，并证实唾液具有传播病毒的潜在风险 | 首次系统绘制人类口腔小唾液腺和牙龈的单细胞图谱，发现SARS-CoV-2病毒进入因子在口腔上皮细胞中广泛表达，并证实唾液细胞可携带活病毒 | 样本量相对有限（9个样本），主要聚焦于口腔局部感染机制，未深入探讨全身性影响 | 探究SARS-CoV-2在口腔 cavity的感染机制和传播途径 | 人类口腔小唾液腺和牙龈组织，以及感染者唾液样本 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质表达数据 | 9个组织样本（13,824个细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
DNA glycosylase Neil3 regulates vascular smooth muscle cell biology during atherosclerosis development
2021-05, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究探讨DNA糖基化酶Neil3通过调控血管平滑肌细胞表型影响动脉粥样硬化发展的机制 | 首次揭示Neil3通过非经典DNA修复功能调控VSMC表型转化，并证实Akt信号通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明Neil3在动脉粥样硬化发展中对血管平滑肌细胞生物学行为的调控机制 | Apoe-/-动脉粥样硬化易感小鼠和人类原代主动脉血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学, BrdU增殖实验, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | Neil3缺陷的Apoe-/-小鼠模型和NEIL3敲除的人原代主动脉VSMCs | NA | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Transcriptional characterization of human megakaryocyte polyploidization and lineage commitment
2021-05, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15271
PMID:33587817
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研究论文 | 首次使用单细胞RNA测序技术表征人类骨髓巨核细胞在不同倍体化水平下的转录组特征及其从造血干细胞的分化过程 | 首次对原代人类骨髓巨核细胞进行单细胞转录组研究，发现两个具有巨核细胞分化倾向的造血干细胞亚群，并揭示了应激性血小板生成中的特异性基因表达特征 | 研究样本量相对有限，且主要关注骨髓巨核细胞，未涉及其他组织来源的巨核细胞 | 研究人类骨髓巨核细胞的谱系承诺、成熟步骤和血小板生成过程 | 人类骨髓巨核细胞和造血干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓样本，包括近期心肌梗死患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data
2021-05-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa919
PMID:33151294
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研究论文 | 介绍了一个用于从单细胞RNA-seq数据中高分辨率识别细胞群体的R工具包ILoReg | 提出了一种新的概率特征提取方法，通过迭代聚类投影(ICP)算法结合逻辑回归和聚类相似性比较，能够识别转录组差异细微的细胞亚群 | NA | 开发一种改进的单细胞RNA-seq数据分析方法，提高细胞群体识别的分辨率 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归, 聚类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa236
PMID:33232439
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研究论文 | 通过回肠转录组分析揭示儿童克罗恩病初治患者的IL17和NOD信号通路表达特征，并识别驱动差异表达基因的上皮细胞 | 首次在儿童克罗恩病初治患者中发现31个基因特征，识别表达抗菌基因转录本的特殊上皮细胞亚群驱动IL17和NOD信号通路上调 | 样本量有限（共70例），部分相关性分析p值未达到显著水平（如复发时间相关性p=0.07） | 确定儿童克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型 | 儿童克罗恩病患者和对照组的回肠组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序, 单细胞测序, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 27例初治克罗恩病, 26例确诊克罗恩病, 17例对照 | NA | 单细胞RNA测序, 靶向自身免疫RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and microenvironmental control of skin cancer
2021-05, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13177
PMID:32976658
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综述 | 探讨皮肤组织中细胞异质性及微环境对携带致癌突变细胞的调控机制 | 整合体内功能研究与单细胞转录组分析，揭示表皮干细胞及其微环境在癌症预防与促进中的双重作用 | NA | 阐明微环境如何调控携带突变细胞的恶性进展机制 | 皮肤组织中的表皮干细胞、成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 单细胞生物学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-07 |
A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa190
PMID:34020546
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综述 | 本文系统回顾了15种利用单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的计算方法 | 首次对单细胞RNA测序数据下的调控网络推断方法进行全面比较分析，包括模拟评估方法的性能、对dropout的敏感性和时间复杂性 | 仅涵盖15种方法，可能未包含该领域所有最新进展；基于模拟数据的评估可能与真实生物系统存在差异 | 帮助生命科学家选择适合其数据和分析目的的方法，并为计算科学家开发新方法提供参考 | 基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia
2021-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00574-8
PMID:33239726
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病诱导的应激特征 | 首次在人类骨髓中发现NK0细胞作为NK1样和NK2样细胞的前体，并揭示AML对NK细胞异质性的深远影响 | 样本来源仅限于人类骨髓和脾脏，未涉及其他组织或更大规模验证 | 探究骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病对其功能的影响 | 人类骨髓和脾脏中的自然杀伤细胞，包括健康个体和急性髓系白血病患者 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓和脾脏NK细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-07 |
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-217470
PMID:33277241
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和骨髓巨噬细胞的TRIM8过表达是IFN-γ超反应性的分子机制 | 首次发现TRIM8在SJIA单核细胞中上调并通过体外实验证实其增强巨噬细胞IFN-γ反应性 | 骨髓巨噬细胞样本量较小（仅1例患者），需要更大规模验证 | 探究系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和巨噬细胞的极化表型及IFN反应分子特征 | 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞和骨髓巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | NA | 转录组数据 | 26例SJIA患者外周血单核细胞，1例SJIA合并MAS患者骨髓巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-07 |
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.038
PMID:34019793
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研究论文 | 通过单细胞蛋白活性分析鉴定与肾癌复发相关的肿瘤巨噬细胞亚群 | 首次应用VIPER算法量化单细胞蛋白活性，发现传统基因表达分析无法检测的TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞亚群与肾癌复发相关 | 研究基于治疗初期的肾癌切除样本，未涉及治疗后的肿瘤微环境变化 | 构建透明细胞肾癌肿瘤微环境图谱并鉴定预后相关细胞亚群 | 透明细胞肾癌患者的肿瘤和癌旁组织中的造血和非造血细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨定量多光谱免疫荧光 | VIPER算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 影像数据 | 治疗初期肾癌切除样本的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
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研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后，母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活，即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小，且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 reveals multi-process defects in antiviral immunity
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00681-2
PMID:33972731
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了重症COVID-19患者血液抗原呈递细胞的免疫缺陷 | 揭示了重症COVID-19患者抗原呈递细胞中抗病毒免疫防御的多重缺陷机制 | 研究样本量较小，仅包括15名患者和4名健康对照 | 探讨重症COVID-19患者抗原呈递细胞的免疫缺陷机制 | 重症COVID-19患者的血液抗原呈递细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名重症COVID-19患者和4名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-10-10 |
A single-cell atlas of Plasmodium falciparum transmission through the mosquito
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23434-z
PMID:34045457
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的发育轨迹和转录特征，并识别了人类和啮齿动物寄生虫之间的保守和非保守基因使用 | NA | 揭示恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况，为寻找抗疟药物和疫苗靶点提供依据 | 恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | NA | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-09-30 |
Longitudinal proteomic analysis of severe COVID-19 reveals survival-associated signatures, tissue-specific cell death, and cell-cell interactions
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100287
PMID:33969320
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研究论文 | 本文通过纵向蛋白质组分析严重COVID-19患者，揭示了与生存相关的蛋白质特征、组织特异性细胞死亡和细胞间相互作用 | 本文首次通过大规模蛋白质组数据和单细胞RNA测序数据的联合分析，揭示了严重COVID-19患者的免疫和非免疫蛋白质特征，并提出了细胞间相互作用驱动组织损伤的模型 | 本文的样本量相对较小，且仅限于COVID-19患者和症状性对照组，可能限制了结果的普适性 | 揭示严重COVID-19疾病的潜在机制 | COVID-19患者的血浆蛋白质组和细胞间相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 306名COVID-19患者和78名症状性对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-09-25 |
The Dynamic Counterbalance of RAC1-YAP/OB-Cadherin Coordinates Tissue Spreading with Stem Cell Fate Patterning
2021-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004000
PMID:34026448
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研究论文 | 研究了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的作用 | 揭示了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的关键作用，并通过单细胞测序和体内伤口愈合实验验证了这一机制 | NA | 探讨分子信号如何在多细胞组织的扩散动态和细胞命运承诺中起作用 | 胚胎发育和再生医学中的组织扩散 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞迁移轨迹分析 | NA | NA | NA | NA | NA |