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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-07 |
A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa190
PMID:34020546
|
综述 | 本文系统回顾了15种利用单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的计算方法 | 首次对单细胞RNA测序数据下的调控网络推断方法进行全面比较分析，包括模拟评估方法的性能、对dropout的敏感性和时间复杂性 | 仅涵盖15种方法，可能未包含该领域所有最新进展；基于模拟数据的评估可能与真实生物系统存在差异 | 帮助生命科学家选择适合其数据和分析目的的方法，并为计算科学家开发新方法提供参考 | 基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia
2021-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00574-8
PMID:33239726
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病诱导的应激特征 | 首次在人类骨髓中发现NK0细胞作为NK1样和NK2样细胞的前体，并揭示AML对NK细胞异质性的深远影响 | 样本来源仅限于人类骨髓和脾脏，未涉及其他组织或更大规模验证 | 探究骨髓中自然杀伤细胞的分化轨迹及急性髓系白血病对其功能的影响 | 人类骨髓和脾脏中的自然杀伤细胞，包括健康个体和急性髓系白血病患者 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类骨髓和脾脏NK细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-07 |
Monocyte and bone marrow macrophage transcriptional phenotypes in systemic juvenile idiopathic arthritis reveal TRIM8 as a mediator of IFN-γ hyper-responsiveness and risk for macrophage activation syndrome
2021-05, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-217470
PMID:33277241
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和骨髓巨噬细胞的TRIM8过表达是IFN-γ超反应性的分子机制 | 首次发现TRIM8在SJIA单核细胞中上调并通过体外实验证实其增强巨噬细胞IFN-γ反应性 | 骨髓巨噬细胞样本量较小（仅1例患者），需要更大规模验证 | 探究系统性幼年特发性关节炎中单核细胞和巨噬细胞的极化表型及IFN反应分子特征 | 系统性幼年特发性关节炎患者的外周血单核细胞和骨髓巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | NA | 转录组数据 | 26例SJIA患者外周血单核细胞，1例SJIA合并MAS患者骨髓巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-021-00269-2
PMID:34001262
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法 | 首次在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序，而非传统的单核RNA测序 | 763个细胞中仅有171个达到质量控制标准，样本利用率较低 | 探索在单一肌肉类型中应用全细胞流式分选方法进行单细胞RNA测序的可行性 | 小鼠快肌趾短屈肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式分选, RNA原位杂交(RISH) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 763个小鼠趾短屈肌肌纤维(171个通过质量控制) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-07 |
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.038
PMID:34019793
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研究论文 | 通过单细胞蛋白活性分析鉴定与肾癌复发相关的肿瘤巨噬细胞亚群 | 首次应用VIPER算法量化单细胞蛋白活性，发现传统基因表达分析无法检测的TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞亚群与肾癌复发相关 | 研究基于治疗初期的肾癌切除样本，未涉及治疗后的肿瘤微环境变化 | 构建透明细胞肾癌肿瘤微环境图谱并鉴定预后相关细胞亚群 | 透明细胞肾癌患者的肿瘤和癌旁组织中的造血和非造血细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 空间分辨定量多光谱免疫荧光 | VIPER算法 | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 影像数据 | 治疗初期肾癌切除样本的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
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研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后，母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活，即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小，且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 reveals multi-process defects in antiviral immunity
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00681-2
PMID:33972731
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了重症COVID-19患者血液抗原呈递细胞的免疫缺陷 | 揭示了重症COVID-19患者抗原呈递细胞中抗病毒免疫防御的多重缺陷机制 | 研究样本量较小，仅包括15名患者和4名健康对照 | 探讨重症COVID-19患者抗原呈递细胞的免疫缺陷机制 | 重症COVID-19患者的血液抗原呈递细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名重症COVID-19患者和4名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-10-10 |
A single-cell atlas of Plasmodium falciparum transmission through the mosquito
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23434-z
PMID:34045457
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的发育轨迹和转录特征，并识别了人类和啮齿动物寄生虫之间的保守和非保守基因使用 | NA | 揭示恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况，为寻找抗疟药物和疫苗靶点提供依据 | 恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | NA | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-09-30 |
Longitudinal proteomic analysis of severe COVID-19 reveals survival-associated signatures, tissue-specific cell death, and cell-cell interactions
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100287
PMID:33969320
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研究论文 | 本文通过纵向蛋白质组分析严重COVID-19患者，揭示了与生存相关的蛋白质特征、组织特异性细胞死亡和细胞间相互作用 | 本文首次通过大规模蛋白质组数据和单细胞RNA测序数据的联合分析，揭示了严重COVID-19患者的免疫和非免疫蛋白质特征，并提出了细胞间相互作用驱动组织损伤的模型 | 本文的样本量相对较小，且仅限于COVID-19患者和症状性对照组，可能限制了结果的普适性 | 揭示严重COVID-19疾病的潜在机制 | COVID-19患者的血浆蛋白质组和细胞间相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 306名COVID-19患者和78名症状性对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-09-25 |
The Dynamic Counterbalance of RAC1-YAP/OB-Cadherin Coordinates Tissue Spreading with Stem Cell Fate Patterning
2021-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004000
PMID:34026448
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研究论文 | 研究了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的作用 | 揭示了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的关键作用，并通过单细胞测序和体内伤口愈合实验验证了这一机制 | NA | 探讨分子信号如何在多细胞组织的扩散动态和细胞命运承诺中起作用 | 胚胎发育和再生医学中的组织扩散 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞迁移轨迹分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing of batch Chlamydomonas cultures reveals heterogeneity in their diurnal cycle phase
2021-05-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab025
PMID:33585940
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Chlamydomonas reinhardtii在不同环境和基因型下的细胞异质性，特别是在昼夜周期中的表现。 | 首次使用scRNA-seq技术揭示了Chlamydomonas细胞在铁或氮缺乏条件下的异质性，并展示了昼夜节律对细胞响应的影响。 | 研究仅限于实验室培养的Chlamydomonas reinhardtii，未涉及自然环境中的藻类群体。 | 探讨Chlamydomonas reinhardtii在不同环境条件下的转录组异质性。 | Chlamydomonas reinhardtii的单细胞转录组。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及两种基因型的Chlamydomonas细胞，在三种不同环境条件下进行测序。 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptomics reveals the effect of PD-L1/TGF-β blockade on the tumor microenvironment
2021-05-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01034-z
PMID:34030676
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了PD-L1和/或TGF-β阻断对肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了PD-L1和/或TGF-β阻断在肿瘤微环境中的转录程序，并发现CCL5作为潜在的生物标志物 | 临床上PD-L1和TGF-β联合阻断的疗效尚未得到证实，且TGF-β抑制剂常引起毒性反应 | 探索增强T细胞浸润和PD-L1/PD-L1疗法疗效的策略 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约30,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-11 |
Applications of Single-Cell Sequencing in Dermatology
2021-May-20, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.931862
PMID:34011922
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在皮肤病学领域的应用进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上评估基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学信息，揭示疾病的病理机制和药物抵抗性，并能识别新的细胞类型和分化轨迹 | NA | 总结单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | 单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-11 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了MCF10A细胞在TGF-β1刺激下经历上皮间质转化（EMT）的过程 | 揭示了EMT过程中信号通路的顺序和平行激活，以及过渡细胞状态的存在，并确定了驱动EMT的关键调控信号节点和微小RNA及转录因子的表达 | NA | 探究上皮间质转化（EMT）过程中的信号交叉对话和基因调控网络 | MCF10A细胞在TGF-β1刺激下的EMT过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MCF10A细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-11 |
Concurrent X chromosome inactivation and upregulation during non-human primate preimplantation development revealed by single-cell RNA-sequencing
2021-05-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89175-7
PMID:33953270
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了非人类灵长类动物（绒猴）胚胎植入前发育阶段的X染色体失活和上调现象 | 首次在绒猴胚胎中观察到XIST的上调以及X染色体单等位基因表达的增加，表明X染色体失活的存在 | 研究仅限于绒猴胚胎，未涉及其他非人类灵长类动物或人类胚胎 | 阐明非人类灵长类动物X染色体剂量补偿机制 | 绒猴胚胎植入前发育阶段的X染色体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个绒猴胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
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研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-05 |
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101459
PMID:33789950
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研究论文 | 本研究表明猕猴是人类侧支肾发生的有效模型。 | 首次确认猕猴作为真实侧支肾发生的模型，促进了对人类晚期妊娠肾发生的分子研究。 | 该研究未能详细探讨不同妊娠阶段的细胞变化。 | 研究大三分支肾发生的分子机制。 | 129-131天妊娠期的猕猴胎儿肾脏。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 4个猕猴胎儿肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Generative modeling of single-cell time series with PRESCIENT enables prediction of cell trajectories with interventions
2021-05-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23518-w
PMID:34050150
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PRESCIENT的生成模型框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中学习潜在的分化景观，并预测细胞轨迹在干预下的变化 | PRESCIENT模型能够模拟细胞在物理时间内的随机演化，并预测干预措施对细胞分化轨迹的影响 | NA | 开发一种新的计算方法，用于预测单细胞RNA测序数据中的细胞命运及其在干预下的变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成模型 | 时间序列数据 | 实验性谱系追踪数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Treatment scheduling effects on the evolution of drug resistance in heterogeneous cancer cell populations
2021-May-26, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-021-00270-4
PMID:34040000
|
研究论文 | 本研究探讨了靶向治疗组合的排程对三阴性乳腺癌（TNBC）药物抗性的影响 | 本研究首次评估了克唑替尼（ALK/MET抑制剂）和纳维妥昔布（ABT-263；Bcl-2/Bcl-xL抑制剂）组合在696种两周期顺序和同时治疗方案中的抗性模式，并使用DNA集成条形码和单细胞RNA测序追踪克隆动态和抗性机制 | 本研究主要在体外进行，需要进一步的体内和临床研究以验证结果 | 研究靶向治疗组合的排程对三阴性乳腺癌药物抗性的影响 | 三阴性乳腺癌细胞 | NA | 乳腺癌 | DNA集成条形码和单细胞RNA测序 | NA | NA | 696种治疗方案，26天周期，MDA-MB-231 TNBC细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Co-development of central and peripheral neurons with trunk mesendoderm in human elongating multi-lineage organized gastruloids
2021-05-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23294-7
PMID:34021144
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研究论文 | 本研究利用多谱系组织化的延长型胚胎样体（EMLO）模型，探讨了中枢和周围神经系统的共同发育及其与躯干中胚层的关联 | 首次在EMLO胚胎样体模型中实现了中枢和周围神经系统的共同发育与躯干中胚层的研究 | NA | 探索早期人类神经发育及神经病理学的基本见解 | 中枢和周围神经系统的共同发育及其与躯干中胚层的关系 | 发育生物学 | NA | 免疫荧光技术，单细胞RNA测序 | EMLO胚胎样体模型 | 细胞 | 四十天的EMLO样品，包括第16天的单细胞RNA-Seq数据 | NA | NA | NA | NA |