单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 200 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-12 |
Maternal respiratory SARS-CoV-2 infection in pregnancy is associated with a robust inflammatory response at the maternal-fetal interface
2021-05-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.04.016
PMID:33969332
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研究论文 | 研究了孕妇在妊娠晚期感染SARS-CoV-2后，母胎界面发生的炎症反应 | 首次揭示了妊娠晚期SARS-CoV-2感染在母胎界面引起的免疫激活，即使在没有检测到局部病毒入侵的情况下 | 研究样本量较小，且仅限于妊娠晚期的孕妇 | 探讨孕妇感染SARS-CoV-2后母胎界面的病理生理机制及其对胎儿的潜在影响 | 妊娠晚期感染SARS-CoV-2的孕妇及其胎盘组织 | NA | COVID-19 | 免疫组织化学、单细胞转录组学 | NA | 组织、细胞 | 15例妊娠晚期孕妇的胎盘组织 |
| 2 | 2024-12-06 |
Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presenting cells in severe COVID-19 reveals multi-process defects in antiviral immunity
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00681-2
PMID:33972731
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了重症COVID-19患者血液抗原呈递细胞的免疫缺陷 | 揭示了重症COVID-19患者抗原呈递细胞中抗病毒免疫防御的多重缺陷机制 | 研究样本量较小，仅包括15名患者和4名健康对照 | 探讨重症COVID-19患者抗原呈递细胞的免疫缺陷机制 | 重症COVID-19患者的血液抗原呈递细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15名重症COVID-19患者和4名健康对照 |
| 3 | 2024-10-10 |
A single-cell atlas of Plasmodium falciparum transmission through the mosquito
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23434-z
PMID:34045457
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的发育轨迹和转录特征，并识别了人类和啮齿动物寄生虫之间的保守和非保守基因使用 | NA | 揭示恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况，为寻找抗疟药物和疫苗靶点提供依据 | 恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | NA | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4 | 2024-09-30 |
Longitudinal proteomic analysis of severe COVID-19 reveals survival-associated signatures, tissue-specific cell death, and cell-cell interactions
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100287
PMID:33969320
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研究论文 | 本文通过纵向蛋白质组分析严重COVID-19患者，揭示了与生存相关的蛋白质特征、组织特异性细胞死亡和细胞间相互作用 | 本文首次通过大规模蛋白质组数据和单细胞RNA测序数据的联合分析，揭示了严重COVID-19患者的免疫和非免疫蛋白质特征，并提出了细胞间相互作用驱动组织损伤的模型 | 本文的样本量相对较小，且仅限于COVID-19患者和症状性对照组，可能限制了结果的普适性 | 揭示严重COVID-19疾病的潜在机制 | COVID-19患者的血浆蛋白质组和细胞间相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 306名COVID-19患者和78名症状性对照组 |
| 5 | 2024-09-25 |
The Dynamic Counterbalance of RAC1-YAP/OB-Cadherin Coordinates Tissue Spreading with Stem Cell Fate Patterning
2021-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004000
PMID:34026448
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研究论文 | 研究了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的作用 | 揭示了RAC1-YAP与OB-cadherin之间的动态平衡在协调组织扩散与干细胞命运模式中的关键作用，并通过单细胞测序和体内伤口愈合实验验证了这一机制 | NA | 探讨分子信号如何在多细胞组织的扩散动态和细胞命运承诺中起作用 | 胚胎发育和再生医学中的组织扩散 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞迁移轨迹分析 | NA |
| 6 | 2024-09-08 |
Cell-type specific analysis of physiological action of estrogen in mouse oviducts
2021-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002747R
PMID:33818810
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研究论文 | 研究评估了雌激素对小鼠输卵管中不同细胞类型的生理作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析雌激素对小鼠输卵管中不同细胞类型的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证在人类中的适用性 | 探讨雌激素在体内对输卵管环境的具体调控机制 | 小鼠输卵管中的不同细胞类型 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用卵巢切除-激素替代小鼠模型进行研究 |
| 7 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing of batch Chlamydomonas cultures reveals heterogeneity in their diurnal cycle phase
2021-05-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab025
PMID:33585940
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Chlamydomonas reinhardtii在不同环境和基因型下的细胞异质性，特别是在昼夜周期中的表现。 | 首次使用scRNA-seq技术揭示了Chlamydomonas细胞在铁或氮缺乏条件下的异质性，并展示了昼夜节律对细胞响应的影响。 | 研究仅限于实验室培养的Chlamydomonas reinhardtii，未涉及自然环境中的藻类群体。 | 探讨Chlamydomonas reinhardtii在不同环境条件下的转录组异质性。 | Chlamydomonas reinhardtii的单细胞转录组。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及两种基因型的Chlamydomonas细胞，在三种不同环境条件下进行测序。 |
| 8 | 2024-08-12 |
Ventricular, atrial, and outflow tract heart progenitors arise from spatially and molecularly distinct regions of the primitive streak
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001200
PMID:33999917
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序结合遗传谱系追踪和活体成像技术，揭示了在小鼠胚胎原条阶段，第一和第二心场（FHF和SHF）被细分为不同的前体细胞池，这些前体细胞在原条中具有不同的起源和分子特征 | 本研究首次在更早的胚胎发育阶段发现了FHF和SHF的细分前体细胞池，并揭示了这些细胞在原条中的不同起源和分子特征 | NA | 探讨心脏前体细胞在原条中的起源和分子特征 | 小鼠胚胎原条中的心脏前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 分子数据 | 小鼠胚胎原条中的多个前体细胞亚群 |
| 9 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptomics reveals the effect of PD-L1/TGF-β blockade on the tumor microenvironment
2021-05-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01034-z
PMID:34030676
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了PD-L1和/或TGF-β阻断对肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了PD-L1和/或TGF-β阻断在肿瘤微环境中的转录程序，并发现CCL5作为潜在的生物标志物 | 临床上PD-L1和TGF-β联合阻断的疗效尚未得到证实，且TGF-β抑制剂常引起毒性反应 | 探索增强T细胞浸润和PD-L1/PD-L1疗法疗效的策略 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约30,000个单细胞 |
| 10 | 2024-08-11 |
Applications of Single-Cell Sequencing in Dermatology
2021-May-20, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.931862
PMID:34011922
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在皮肤病学领域的应用进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上评估基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学信息，揭示疾病的病理机制和药物抵抗性，并能识别新的细胞类型和分化轨迹 | NA | 总结单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | 单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学数据 | NA |
| 11 | 2024-08-11 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了MCF10A细胞在TGF-β1刺激下经历上皮间质转化（EMT）的过程 | 揭示了EMT过程中信号通路的顺序和平行激活，以及过渡细胞状态的存在，并确定了驱动EMT的关键调控信号节点和微小RNA及转录因子的表达 | NA | 探究上皮间质转化（EMT）过程中的信号交叉对话和基因调控网络 | MCF10A细胞在TGF-β1刺激下的EMT过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MCF10A细胞 |
| 12 | 2024-08-11 |
Concurrent X chromosome inactivation and upregulation during non-human primate preimplantation development revealed by single-cell RNA-sequencing
2021-05-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89175-7
PMID:33953270
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了非人类灵长类动物（绒猴）胚胎植入前发育阶段的X染色体失活和上调现象 | 首次在绒猴胚胎中观察到XIST的上调以及X染色体单等位基因表达的增加，表明X染色体失活的存在 | 研究仅限于绒猴胚胎，未涉及其他非人类灵长类动物或人类胚胎 | 阐明非人类灵长类动物X染色体剂量补偿机制 | 绒猴胚胎植入前发育阶段的X染色体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个绒猴胚胎 |
| 13 | 2024-08-11 |
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01329-2
PMID:33879890
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析，探讨了COVID-19患者免疫反应的特征 | 首次对COVID-19患者进行了大规模的单细胞转录组、表面蛋白组及T和B淋巴细胞抗原受体分析，揭示了免疫细胞在疾病中的具体变化 | 研究仅基于横断面队列，未涉及纵向数据分析 | 探究COVID-19患者免疫系统的响应机制及其对疾病发展的影响 | COVID-19患者的免疫细胞及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组、表面蛋白组分析 | NA | 细胞数据 | 130名不同严重程度的COVID-19患者，共780,000个外周血单个核细胞 |
| 14 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
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研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 |
| 15 | 2024-08-05 |
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101459
PMID:33789950
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研究论文 | 本研究表明猕猴是人类侧支肾发生的有效模型。 | 首次确认猕猴作为真实侧支肾发生的模型，促进了对人类晚期妊娠肾发生的分子研究。 | 该研究未能详细探讨不同妊娠阶段的细胞变化。 | 研究大三分支肾发生的分子机制。 | 129-131天妊娠期的猕猴胎儿肾脏。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 4个猕猴胎儿肾脏样本 |
| 16 | 2024-08-05 |
A biomechanical switch regulates the transition towards homeostasis in oesophageal epithelium
2021-05, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00679-w
PMID:33972733
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研究论文 | 这篇文章探讨了机械应力如何调节食管上皮向稳态过渡的机制 | 揭示了机械应力对KLF4细胞群体的影响，从而平衡细胞增殖并标志着稳态的过渡 | 目前尚未完全了解调控细胞决策的所有过程 | 研究食管上皮细胞在后出生阶段如何响应机械应力以达到稳态 | 小鼠食管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.038
PMID:34019793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和VIPER算法分析了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境（TME），识别出与复发相关的肿瘤特异性巨噬细胞亚群。 | 本研究首次通过单细胞蛋白质活性分析，揭示了通过基因表达分析无法检测到的临床相关细胞亚群，特别是发现了一种肿瘤特异性巨噬细胞亚群，其特征为TREM2/APOE/C1Q的上调。 | NA | 构建全面的ccRCC肿瘤微环境图谱，并识别与复发相关的肿瘤特异性巨噬细胞亚群。 | ccRCC肿瘤及其邻近组织的造血和非造血亚群。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自未经治疗的ccRCC切除术的肿瘤和肿瘤邻近组织样本 |
| 18 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of human embryos identifies multiple sympathoblast lineages with potential implications for neuroblastoma origin
2021-05, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00818-x
PMID:33833454
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了人类胚胎发育过程中神经嵴和间充质来源的细胞系向肾上腺、肾脏、内皮和造血组织分化的过程 | 研究发现肾上腺内交感神经母细胞直接来源于神经相关的施万细胞前体，与局部嗜铬细胞相似，而大多数肾上腺外交感神经母细胞则来源于迁移的神经嵴 | NA | 揭示人类胚胎发育过程中细胞状态的进展，以了解儿科疾病的起源 | 人类胚胎发育中神经嵴和间充质来源的细胞系 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及人类胚胎发育的第6至第14周 |
| 19 | 2024-08-07 |
Generative modeling of single-cell time series with PRESCIENT enables prediction of cell trajectories with interventions
2021-05-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23518-w
PMID:34050150
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PRESCIENT的生成模型框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中学习潜在的分化景观，并预测细胞轨迹在干预下的变化 | PRESCIENT模型能够模拟细胞在物理时间内的随机演化，并预测干预措施对细胞分化轨迹的影响 | NA | 开发一种新的计算方法，用于预测单细胞RNA测序数据中的细胞命运及其在干预下的变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成模型 | 时间序列数据 | 实验性谱系追踪数据集 |
| 20 | 2024-08-07 |
A stony coral cell atlas illuminates the molecular and cellular basis of coral symbiosis, calcification, and immunity
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.005
PMID:33945788
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，定义了Stylophora pistillata生命周期中的超过40种细胞类型，揭示了珊瑚共生、钙化及免疫的分子和细胞基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了石珊瑚的细胞类型和分子通路，揭示了珊瑚共生、钙化和免疫的分子机制 | NA | 揭示石珊瑚生物学的分子和细胞基础 | 石珊瑚的细胞类型和分子通路 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过40种细胞类型 |