单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 161 - 171 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Angiogenesis after acute myocardial infarction
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa287
PMID:33063086
|
研究论文 | 本文探讨了急性心肌梗死后血管生成机制及其潜在治疗策略 | 利用细胞系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了心肌梗死区域新生毛细血管结构的形成机制，并发现具有干细胞特性的组织驻留内皮细胞在心肌梗死后血管生成中的作用 | 目前对心肌梗死后细胞间通讯的复杂性理解尚处于初级阶段，且临床转化需要谨慎选择适合的患者 | 研究急性心肌梗死后血管生成的机制，并探索其治疗潜力 | 急性心肌梗死后的血管生成过程及参与的细胞类型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 细胞系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种细胞类型，包括内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 |
| 162 | 2024-08-09 |
A new bioinformatics tool to recover missing gene expression in single-cell RNA sequencing data
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa053
PMID:32997747
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-09 |
Imputing single-cell RNA-seq data by considering cell heterogeneity and prior expression of dropouts
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa052
PMID:33002136
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞亚群的有界低秩（PBLR）方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值（dropout） | PBLR方法考虑了细胞异质性和dropout率与预期表达水平之间的关系，能够有效恢复dropout事件，并提高低维表示和基因间关系的恢复 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的计算挑战，特别是由于技术噪声导致的dropout问题 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有界低秩（PBLR）方法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 164 | 2024-08-09 |
The HDAC Inhibitor Domatinostat Promotes Cell-Cycle Arrest, Induces Apoptosis, and Increases Immunogenicity of Merkel Cell Carcinoma Cells
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.08.023
PMID:33002502
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研究论文 | 研究了HDAC抑制剂Domatinostat在Merkel细胞癌中的作用，包括细胞周期阻滞、诱导凋亡和增强免疫原性 | Domatinostat不仅能直接抑制肿瘤生长，还能恢复MCC细胞表面的HLA I类分子表达，增强其被细胞毒性T细胞识别和清除的能力 | NA | 探讨Domatinostat在Merkel细胞癌中的疗效和作用机制 | Merkel细胞癌 | NA | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 165 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of SARS-CoV-2 entry receptors in human organoids
2021-04, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30054
PMID:32944935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了人源类器官中SARS-CoV-2进入受体ACE2和TMPRSS2的表达情况 | 首次在单细胞水平上分析了人源类器官中多种RNA受体在SARS-CoV-2发病机制中的作用 | 研究主要集中在ACE2和TMPRSS2的表达分析，未涉及其他可能的病毒进入途径 | 探索SARS-CoV-2在人源类器官中的发病机制及药物开发 | 人源类器官中的ACE2和TMPRSS2表达及其他RNA受体 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种人源类器官样本 |
| 166 | 2024-08-09 |
FOXI1 expression in chromophobe renal cell carcinoma and renal oncocytoma: a study of The Cancer Genome Atlas transcriptome-based outlier mining and immunohistochemistry
2021-Apr, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-020-02900-x
PMID:32812119
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研究论文 | 本研究利用The Cancer Genome Atlas（TCGA）的转录组数据，结合基因表达综合数据库和单细胞RNA测序数据，分析了FOXI1在正常肾组织和不同肾肿瘤中的mRNA表达，并通过免疫组化验证了FOXI1在肾间介细胞（ICs）、透明细胞癌（chRCC）和肾嗜酸细胞瘤（RO）中的表达水平。 | 首次详细研究了FOXI1在肾肿瘤中的表达模式，并发现其在ICs、chRCCs和ROs中的显著上调表达，表明FOXI1可能是IC相关肿瘤的潜在生物标志物。 | 研究主要基于TCGA数据库和有限的组织样本，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨FOXI1在肾肿瘤中的表达及其作为诊断标志物的潜力。 | FOXI1在正常肾组织和不同肾肿瘤中的mRNA表达及免疫组化染色。 | 数字病理学 | 肾癌 | 转录组分析、免疫组化 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 367例不同类型的肾肿瘤组织 |
| 167 | 2024-08-09 |
Inferring cancer progression from Single-Cell Sequencing while allowing mutation losses
2021-04-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa722
PMID:32805010
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research paper | 本文介绍了一种基于模拟退火的新方法Simulated Annealing Single-Cell inference (SASC)，用于从单细胞测序数据中推断癌症进展，并引入了一种允许有限突变损失的Dollo-k模型 | 提出了一种新的基于模拟退火的SASC方法，并引入了允许有限突变损失的Dollo-k模型 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断癌症进展，并允许突变损失 | 单细胞测序数据中的癌症进展推断 | digital pathology | NA | 单细胞测序(SCS) | 模拟退火 | 单细胞测序数据 | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Discovering a sparse set of pairwise discriminating features in high-dimensional data
2021-04-19, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa690
PMID:32730566
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研究论文 | 本文提出了一种无监督方法，用于在高维数据中识别定义低维子空间的关键特征，以进行有效的聚类分析 | 本文创新地提出了一种基于特征选择的无监督方法，用于在低维空间中揭示数据点的线性可分性 | NA | 旨在从高维生物数据中提取有意义的特征，以促进对生物过程的深入理解 | 单细胞RNA测序数据中的关键转录因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据点 | 409个总转录因子中的27个关键转录因子 |
| 169 | 2024-08-09 |
netAE: semi-supervised dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing to facilitate cell labeling
2021-04-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa669
PMID:32726427
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研究论文 | 本文提出了一种半监督的单细胞RNA测序数据降维方法netAE，以促进细胞标记 | netAE方法在少量标记样本的情况下，仍能实现高分类准确度，并保持原始空间的相似性结构 | NA | 旨在通过半监督方法改进细胞标记流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络增强自编码器（netAE） | RNA测序数据 | 三个公共数据集 |
| 170 | 2024-08-09 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-06, ArXiv
PMID:32699813
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研究论文 | 本研究通过高通量测序技术分析了COVID-19患者在感染期间多个时间点的B细胞受体（BCR）库，以了解不同疾病严重程度下的B细胞反应特征 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞受体库的整体景观，并发现了与SARS-CoV-1和SARS-CoV-2交叉反应的B细胞受体 | 研究样本量较小，仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者中B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
| 171 | 2024-08-09 |
Glial cell diversity and methamphetamine-induced neuroinflammation in human cerebral organoids
2021-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0676-x
PMID:32051547
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研究论文 | 本研究使用人脑类器官和单细胞RNA测序技术，探讨了甲基苯丙胺（METH）对胎儿脑发育的影响 | 首次在单细胞分辨率下研究METH诱导的神经炎症，并识别了转录上不同的星形胶质细胞和少突胶质细胞亚群 | NA | 探究METH如何通过分子机制导致神经发育缺陷 | 人脑类器官中的胶质细胞多样性和METH诱导的神经炎症 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 分析了来自八个未处理和六个METH处理的人脑类器官的20,758个细胞 |