单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-09 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
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研究论文 | 本文介绍了一种用于比较单细胞RNA测序数据批次校正方法的模块化和灵活的管道BatchBench | BatchBench提供了一种系统的方法来比较不同批次校正方法的性能和计算需求 | NA | 评估和比较不同批次校正方法的性能 | 单细胞RNA测序数据的批次校正方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个经过充分研究的数据集 |
| 142 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal the intratumoral landscape of infiltrated T-cell subpopulations in oral squamous cell carcinoma
2021-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12910
PMID:33513276
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞亚群的内在景观 | 首次揭示了口腔鳞状细胞癌中14种不同的T细胞亚群及其发育轨迹，并发现了与肿瘤免疫抑制相关的标志基因 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解口腔鳞状细胞癌中T细胞的功能状态和异质性，以推动新型治疗策略的发展 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,866个单个T细胞样本来自三位患者 |
| 143 | 2024-08-09 |
Characteristics of B lymphocyte infiltration in HPV+ head and neck squamous cell carcinoma
2021-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14834
PMID:33529452
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研究论文 | 本研究旨在检测人乳头瘤病毒（HPV）相关头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B淋巴细胞亚群的浸润及其与预后的相关性 | 首次详细分析了HPV阳性HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润情况及其与预后的关系，并探讨了CD4 T淋巴细胞通过CXCL13/CXCR5轴对B淋巴细胞及其亚群的影响 | 研究样本量相对较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨HPV相关HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润与患者预后的关系 | HPV阳性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 124个HPV阳性和513个HPV阴性的HNSCC样本 |
| 144 | 2024-08-09 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本文研究了皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）在银屑病中的作用，发现IL-23或imiquimod诱导的小鼠银屑病模型中，皮肤ILCs会转变为类似病原性ILC3的状态。 | 首次展示了皮肤ILCs在银屑病诱导下会转变为病原性ILC3样状态，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序验证了这一转变。 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨皮肤驻留的先天淋巴细胞在银屑病中的作用及其细胞状态的转变。 | 皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）及其在银屑病中的作用。 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮肤ILCs样本 |
| 145 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of mouse bladder urothelium uncover novel cell type markers and urothelial differentiation characteristics
2021-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13007
PMID:33538002
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面表征了小鼠膀胱上皮细胞，揭示了新的细胞类型标记和上皮细胞分化特征 | 发现了由Plxna4标记的新型膀胱上皮细胞类型，可能与宿主反应和伤口愈合有关；识别出ASPM标记的基底样细胞，可能是成年膀胱上皮的祖细胞 | NA | 全面绘制膀胱上皮细胞的细胞解剖图谱 | 小鼠膀胱上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,917个单细胞 |
| 146 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling for advancing birth defects research and prevention
2021-04-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.1870
PMID:33496083
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在揭示发育途径和过程中前所未有的分辨率，以及其在实验胚胎学和人类胚胎发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了对不同细胞类型基因表达集的全面表征，并揭示了细胞类型从早期细胞状态的演变 | NA | 探讨单细胞技术在推进出生缺陷研究和预防中的应用 | 发育过程中的细胞分析和毒性研究 | 基因组学 | 出生缺陷 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 147 | 2024-08-09 |
Single-cell Immune Landscape of Human Recurrent Miscarriage
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.002
PMID:33482359
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了正常和不明原因复发性流产妊娠早期绒毛和外周白细胞的细胞和分子特征 | 揭示了复发性流产患者绒毛和外周白细胞的细胞和分子图谱，特别是发现了一种独特的促炎性CD56CD16 dNK亚群在复发性流产绒毛中大量积累 | NA | 深入理解复发性流产中的系统性和绒毛免疫环境 | 复发性流产患者的绒毛和外周白细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及正常和不明原因复发性流产妊娠早期的绒毛和外周白细胞样本 |
| 148 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing Deciphers Immune Landscape of Human Recurrent Miscarriage
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.12.005
PMID:33482360
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals mRNAs and lncRNAs important for oocytes in vitro matured in pigs
2021-Apr, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.13901
PMID:33496347
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了猪体内成熟卵母细胞的转录组，以揭示mRNA和lncRNA在卵母细胞体外减数分裂成熟过程中的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究猪卵母细胞体外减数分裂成熟过程中的mRNA和lncRNA的表达变化 | NA | 探索卵母细胞减数分裂过程中分子电路和模块的组织和原理 | 猪卵母细胞的mRNA和lncRNA在体外减数分裂成熟过程中的表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | GV和MII阶段的卵母细胞 |
| 150 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq analysis identified kidney progenitor cells from human urine
2021-04, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00816-5
PMID:33420958
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-09 |
Inflamed Ulcerative Colitis Regions Associated With MRGPRX2-Mediated Mast Cell Degranulation and Cell Activation Modules, Defining a New Therapeutic Target
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.076
PMID:33421512
|
研究论文 | 本文研究了MRGPRX2介导的肥大细胞脱颗粒和细胞激活模块在人类溃疡性结肠炎（UC）中的作用，并定义了一个新的治疗靶点。 | 首次详细探讨了MRGPRX2在人类UC中的作用，并发现了UC保护性遗传变异对MRGPRX2激活的影响。 | 研究主要基于特定人群（Ashkenazi犹太人）和特定的细胞模型，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在定义肥大细胞激活机制和MRGPRX2在人类UC中的作用。 | 从UC患者收集的结肠组织和黏膜下层细胞。 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、遗传关联分析 | NA | RNA序列数据 | 包括UC患者的结肠组织和黏膜下层细胞，以及Ashkenazi犹太人UC病例对照队列。 |
| 152 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies limbal stem cell population and cell types mapping its differentiation trajectory in limbal basal epithelium of human cornea
2021-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2020.12.004
PMID:33388438
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在人类角膜缘基底层中识别出角膜缘干细胞群体及其分化轨迹 | 发现了新的角膜缘干细胞标记物TSPAN7和SOX17，并揭示了维持角膜缘干细胞特性的转录因子网络和信号通路 | NA | 旨在揭示人类角膜异质性基底层中的新型细胞类型，以单细胞分辨率识别角膜缘干细胞 | 人类角膜缘基底层的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 16,360个角膜缘基底细胞 |
| 153 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞，以探讨储袋炎的免疫组织特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了储袋炎和溃疡性结肠炎中肠道炎症的相似性，并识别了特定的免疫细胞亚群及其转录标志物 | 原始序列数据未公开，受患者隐私保护限制 | 探讨回肠储袋-肛管吻合术后储袋炎的免疫组织特征，并寻找个性化治疗溃疡性结肠炎的生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15名有回肠储袋-肛管吻合术的溃疡性结肠炎患者和11名无此手术的患者 |
| 154 | 2024-08-09 |
scLM: Automatic Detection of Consensus Gene Clusters Across Multiple Single-cell Datasets
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.002
PMID:33359676
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLM的单细胞隐变量模型算法，用于在多个单细胞数据集中自动检测共识基因簇 | scLM算法能够同时对多个单细胞数据集进行共识聚类，提高了检测基因簇的准确性，并能有效避免批次效应的影响 | NA | 开发一种新的算法来提高单细胞RNA测序数据中基因共表达聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达簇 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 隐变量模型 | 单细胞数据 | 多个单细胞数据集 |
| 155 | 2024-08-09 |
Post-infectious inflammatory disease in MIS-C features elevated cytotoxicity signatures and autoreactivity that correlates with severity
2021-Apr-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.12.01.20241364
PMID:33300011
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、无偏倚血清蛋白质组学和实验方法，定义了儿童多系统炎症综合征（MIS-C）与成人COVID-19及健康对照组的免疫异常 | 揭示了MIS-C患者中升高的S100A家族警报素、血清蛋白富集以及NK和CD8 T细胞毒性基因的升高，以及与严重程度相关的自身反应性 | NA | 定义MIS-C的免疫病理特征，为预测和管理由SARS-CoV2引起的儿童危重疾病提供依据 | 儿童多系统炎症综合征（MIS-C）患者的免疫异常 | NA | 儿童多系统炎症综合征 | 单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、血清蛋白质组学 | NA | RNA序列、血清蛋白 | NA |
| 156 | 2024-08-09 |
Antigen-driven PD-1+ TOX+ BHLHE40+ and PD-1+ TOX+ EOMES+ T lymphocytes regulate juvenile idiopathic arthritis in situ
2021-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202048797
PMID:33296081
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合T细胞受体分析，研究了幼年特发性关节炎（JIA）患者滑膜T淋巴细胞的转录和克隆异质性 | 首次鉴定出在原位通过抗原激活的克隆扩增T淋巴细胞亚群，并揭示了这些细胞在JIA中的功能 | NA | 探讨T淋巴细胞在幼年特发性关节炎（JIA）中的功能 | JIA患者的滑膜T淋巴细胞 | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 157 | 2024-08-09 |
Stem cell-intrinsic mechanisms regulating adult hair follicle homeostasis
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14251
PMID:33278851
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研究论文 | 本文聚焦于成体毛囊干细胞（HFSCs）内在机制在毛囊稳态中的调节作用 | 讨论了单细胞RNA测序和活体成像等技术进步，揭示了HFSC及其前体细胞的异质性，并增进了对HFSC与微环境间交流的理解 | NA | 探讨HFSC内在机制在成体皮肤稳态中的作用 | 成体毛囊干细胞及其在毛发生长和皮肤伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | RNA | NA |
| 158 | 2024-08-09 |
Transcriptional dynamics of induced pluripotent stem cell differentiation into β cells reveals full endodermal commitment and homology with human islets
2021-04, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2020.10.004
PMID:33246884
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了诱导多能干细胞（iPSCs）向β细胞分化的转录动力学，揭示了其完全的内胚层承诺及与人类胰岛的高度同源性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了iPSCs向β细胞分化的转录动态过程，并发现了内分泌/非内分泌细胞命运的分叉 | 研究指出，未来的工作需要改进生成的内分泌细胞，并避免分化为非胰腺内胚层细胞 | 研究iPSCs向β细胞分化的转录动力学，并确定最终分化产物的身份 | 诱导多能干细胞（iPSCs）及其向β细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从iPSCs向β细胞分化的四个阶段及人类供体胰岛中获取的数据 |
| 159 | 2024-08-09 |
An extracellular vesicle-related gene expression signature identifies high-risk patients in medulloblastoma
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa254
PMID:33175161
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞转录组学、细胞培养模型和生物物理方法等技术，探索髓母细胞瘤（MB）中的细胞间通讯，并识别与高风险患者相关的基因表达特征。 | 本研究发现了与髓母细胞瘤高风险患者相关的新型基因表达特征EVS，具有较高的预后意义。 | NA | 研究髓母细胞瘤的转录组景观，并识别高风险患者的基因表达特征。 | 髓母细胞瘤及其亚组的肿瘤细胞和患者样本。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞转录组学、纳米粒子跟踪分析、电子显微镜 | NA | 基因表达数据 | 大规模患者样本 |
| 160 | 2024-08-09 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
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研究论文 | 本研究探讨了哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎（RA）中的促分解特性及其机制 | 发现了嗜酸性粒细胞的一个新亚型——调节性嗜酸性粒细胞（rEos），其在关节炎的缓解中起关键作用 | NA | 研究哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎中的促分解作用及其机制 | 嗜酸性粒细胞、类风湿性关节炎、哮喘 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠模型和人类RA患者的样本 |