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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
c-CSN: Single-cell RNA Sequencing Data Analysis by Conditional Cell-specific Network
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.05.005
PMID:33684532
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研究论文 | 本文提出了一种名为c-CSN的方法，用于构建条件细胞特异性网络（CCSN），以测量单细胞RNA测序数据中基因之间的直接关联 | c-CSN方法通过消除间接关联，能够准确测量基因之间的直接关联，并可用于细胞聚类和基于网络的维度降低 | NA | 克服单细胞RNA测序数据中的高噪声和低覆盖问题，提高基因关联分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件细胞特异性网络（CCSN） | 基因表达矩阵 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the origins and intrahepatic development of liver-resident IFN-γ-producing γδ T cells
2021-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00656-1
PMID:33692482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠肝脏和胸腺中γδ T细胞的异质性，揭示了γδ T细胞的发育轨迹及其在肝脏中的起源和发展 | 首次系统地阐明了γδ T细胞在肝脏中的起源和非胸腺依赖的发育途径 | NA | 探究γδ T细胞在肝脏中的起源及其非胸腺依赖的发育途径 | 小鼠肝脏和胸腺中的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肝脏和胸腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Insights Gained from Single-Cell Analysis of Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）在多种人类肿瘤中对肿瘤免疫微环境的研究进展 | 利用scRNA-seq技术深入解析了肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化及其在疾病进展和免疫治疗反应中的潜在作用 | NA | 旨在理解肿瘤免疫微环境，以识别癌症进展的免疫调节因子并开发癌症免疫疗法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种类型的人类肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
Formation and integration of new neurons in the adult hippocampus
2021-04, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-021-00433-z
PMID:33633402
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综述 | 本文综述了啮齿动物海马神经发生领域的最新进展，重点介绍了新技术（包括单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察）以及从干细胞激活到新生神经元整合到现有回路的不同发育步骤 | 采用了新技术如单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察 | NA | 提高对成年神经发生机制和功能后果的理解，并探讨该领域如何在急性与慢性神经损伤和基于干细胞的脑修复中更具转化相关性 | 成年海马神经发生的过程及其对脑功能的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-09 |
SSRE: Cell Type Detection Based on Sparse Subspace Representation and Similarity Enhancement
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.004
PMID:33647482
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研究论文 | 本文提出了一种基于稀疏子空间表示和相似性增强的单细胞聚类框架SSRE，用于提高细胞类型识别的准确性 | SSRE通过子空间假设建模细胞间关系，并生成细胞间相似性的稀疏表示，同时结合基因选择和增强策略提高相似性度量的有效性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏子空间表示 | 基因表达数据 | 测试了十个真实单细胞RNA测序数据集和五个模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Cellular plasticity balances the metabolic and proliferation dynamics of a regenerating liver
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.267013.120
PMID:33649154
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研究论文 | 本文通过部分肝切除术（PHx）结合单细胞转录组学，追踪了小鼠肝脏再生过程中约22,000个肝细胞的细胞转变和异质性 | 研究发现，在PHx后，一部分肝细胞暂时重新激活早期新生儿样的基因表达程序以增殖，而另一部分代谢高度活跃的细胞似乎补偿了肝脏功能的任何暂时性缺陷 | NA | 探讨成年肝脏在再生过程中如何维持其特化功能 | 小鼠肝脏再生过程中的细胞转变和异质性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 约22,000个肝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-09 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-04-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.053
PMID:33657410
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research paper | 本文通过大规模单细胞转录组图谱揭示了COVID-19患者的免疫特征 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析了大量COVID-19患者样本，构建了详细的免疫景观图谱 | NA | 深入理解COVID-19的病理机制并开发有效的治疗策略 | COVID-19患者的免疫细胞及其转录组变化 | digital pathology | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 284个样本，来自196名COVID-19患者和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-09 |
Direct Comparative Analyses of 10X Genomics Chromium and Smart-seq2
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.02.005
PMID:33662621
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研究论文 | 本文通过比较10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台在相同CD45细胞样本上的数据，系统评估了它们的特点 | 首次系统比较了10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台的优势和局限性 | 研究仅限于CD45细胞样本，可能无法完全代表所有细胞类型的表现 | 旨在深入理解10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台的特点，并为选择合适的平台提供依据 | 10X Genomics Chromium和Smart-seq2两种单细胞RNA测序平台 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 相同CD45细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Bardet-Biedl syndrome proteins regulate intracellular signaling and neuronal function in patient-specific iPSC-derived neurons
2021-04-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI146287
PMID:33630762
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研究论文 | 研究使用患者特异性诱导多能干细胞衍生的神经元模型，探讨Bardet-Biedl综合征蛋白在细胞内信号传导和神经功能中的作用 | 通过单细胞RNA测序和CRISPR基因编辑技术，揭示了BBS1和BBS10突变对胰岛素信号传导和瘦素信号的影响，并展示了通过基因校正恢复信号传导的可能性 | 研究主要集中在BBS1和BBS10突变的影响，其他BBS基因突变的影响未被探讨 | 探究Bardet-Biedl综合征在人类中的分子基础及其对肥胖的影响 | Bardet-Biedl综合征患者的诱导多能干细胞衍生的下丘脑弓状核样神经元 | 细胞生物学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | RNA | 涉及BBS1M390R和BBS10C91fsX95突变的神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-09 |
White matter aging drives microglial diversity
2021-04-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.01.027
PMID:33606969
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老过程中白质和灰质的微胶质细胞反应 | 首次鉴定了与白质相关的微胶质细胞（WAMs），这些细胞具有疾病相关微胶质细胞（DAM）基因特征的一部分，并涉及吞噬活性和脂质代谢相关基因的激活 | NA | 探究衰老过程中白质和灰质的微胶质细胞特定反应 | 白质和灰质的微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
Oxidized phosphatidylcholines found in multiple sclerosis lesions mediate neurodegeneration and are neutralized by microglia
2021-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00801-z
PMID:33603230
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研究论文 | 本文报道了多发性硬化症（MS）病变中的氧化磷脂酰胆碱（OxPCs）作为神经退行性的强力驱动因素，并指出微胶质细胞通过TREM2受体介导的清除作用可以中和OxPCs，从而防止神经退行性。 | 首次发现OxPCs在MS病变中作为神经退行性的强力驱动因素，并提出通过增强微胶质细胞介导的OxPC清除作用来预防神经退行性。 | NA | 识别并中和多发性硬化症中促进神经退行性的机制。 | 多发性硬化症病变中的氧化磷脂酰胆碱（OxPCs）及其对神经退行性的影响。 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及培养的神经元和少突胶质细胞，以及小鼠脊髓病变组织。 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-09 |
Decoding Cortical Glial Cell Development
2021-Apr, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-021-00640-9
PMID:33606177
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和交叉谱系分析，揭示了小鼠皮质放射状胶质细胞（RGCs）在胚胎晚期发育过程中生成皮质少突胶质细胞、星形胶质细胞和嗅球GABA能中间神经元的过程 | 首次展示了在E16.5左右，新皮质RGCs开始生成ASCL1EGFR顶端多能中间前体细胞（MIPCs），这些细胞随后分化为表达ASCL1、EGFR、OLIG2和MKI67的基底MIPCs，这些基底MIPCs通过多次分裂生成大部分皮质少突胶质细胞和星形胶质细胞以及嗅球中间神经元的一个亚群 | NA | 揭示皮质放射状胶质细胞谱系进展的过程以及皮质星形胶质细胞和少突胶质细胞的发育起源 | 小鼠皮质放射状胶质细胞（RGCs）及其生成的细胞亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
redPATH: Reconstructing the Pseudo Development Time of Cell Lineages in Single-cell RNA-seq Data and Applications in Cancer
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.06.014
PMID:33607293
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研究论文 | 本研究开发了一种名为redPATH的计算方法，用于通过共识非对称哈密顿路径算法重建单细胞RNA测序数据中的细胞谱系伪发育时间，并应用于癌症研究 | redPATH方法通过共识非对称哈密顿路径算法重建细胞谱系的伪发育时间，并开发了一种新的可视化方法来展示轨迹发展，为生物学提供了新的见解 | NA | 开发和验证一种新的计算方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞谱系伪发育时间 | 单细胞RNA测序数据中的细胞谱系及其在癌症中的应用 | 生物信息学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | 共识非对称哈密顿路径算法 | 单细胞转录组数据 | 多个神经干细胞和癌症数据集以及其他单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
Progress toward improved understanding of antibody maturation
2021-04, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2020.11.008
PMID:33610066
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综述 | 本文综述了抗体成熟研究的四个领域的最新进展 | 利用下一代和单细胞测序技术，结合计算方法和机器学习工具，对抗体库进行分析；通过X射线结构、热力学和动力学数据以及分子动力学模拟，深入了解提高亲和力的生物物理机制；研究了亲和力无关的多样性和自我/非自我识别机制；体内成熟结果有助于开发体外成熟方法，以改善治疗性抗体特性 | NA | 旨在深入理解抗体成熟过程及其在免疫系统中的功能 | 抗体成熟过程中的生物物理机制和免疫系统功能 | 生物信息学 | NA | 下一代测序、单细胞测序、X射线晶体学、分子动力学模拟 | 机器学习工具 | 序列数据、结构数据、动力学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of preadipocytes reveals the cell fate heterogeneity induced by melatonin
2021-Apr, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12725
PMID:33621367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了正常和褪黑素处理的前脂肪细胞的转录组，揭示了褪黑素诱导的细胞命运异质性 | 首次探讨了褪黑素对前脂肪细胞异质性的影响，并通过单细胞RNA测序技术揭示了细胞亚群的分子特征和分化轨迹 | 研究主要集中在体外和动物模型上，需要进一步的人体试验验证褪黑素的效应 | 探讨褪黑素对前脂肪细胞异质性的影响及其在肥胖治疗中的潜在作用 | 正常和褪黑素处理的前脂肪细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | tSNE分析 | 转录组 | 25,071个前脂肪细胞的转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-09 |
Linear-time cluster ensembles of large-scale single-cell RNA-seq and multimodal data
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.267906.120
PMID:33627473
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研究论文 | 本文提出了一种名为Specter的方法，用于大规模单细胞RNA测序和多模态数据的线性时间聚类集成 | Specter方法采用并扩展了最近在（快速）谱聚类中的算法进展，通过使用地标点创建完整数据的稀疏表示，从而在计算谱嵌入时实现线性时间复杂度 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中，由于数据量大而导致的算法可扩展性和数据量之间的矛盾 | 单细胞RNA测序数据和多模态数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谱聚类 | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Adult Mammalian Heart-State-of-the-Art and Future Perspectives
2021-04, Current heart failure reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s11897-021-00504-3
PMID:33629280
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在成年哺乳动物心脏研究中的应用现状及未来展望 | scRNA-seq技术的发展为研究健康与疾病心脏的转录异质性提供了新工具，有助于揭示心力衰竭（HF）的发病和进展的分子机制 | NA | 探讨scRNA-seq在心血管疾病研究中的应用，以期开发新的改进疗法 | 成年哺乳动物心脏的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及小鼠和人类心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
Targeting PIM1-Mediated Metabolism in Myeloid Suppressor Cells to Treat Cancer
2021-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0433
PMID:33579728
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析双侧肿瘤模型，发现免疫抑制性髓系细胞在免疫检查点阻断（ICB）耐药个体中占主导地位，并揭示了PIM1激酶通过PPARγ介导的活性调节脂质氧化代谢的新作用。 | 本文首次揭示了PIM1激酶在调节髓源抑制细胞（MDSC）脂质氧化代谢中的作用，并证明了PIM1抑制剂AZD1208在临床前癌症模型中增强PD-L1阻断的效果。 | NA | 研究PIM1激酶在髓源抑制细胞中的代谢调节作用及其在免疫检查点阻断耐药中的治疗潜力。 | 髓源抑制细胞（MDSC）、PIM1激酶、免疫检查点阻断（ICB）耐药机制。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 双侧肿瘤模型中的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
High expression of SARS-CoV-2 entry factors in human conjunctival goblet cells
2021-04, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108501
PMID:33600811
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了人结膜中SARS-CoV-2进入因子的高表达情况，特别是在杯状细胞中的ACE2和TMPRSS2的共表达 | 首次揭示了人结膜杯状细胞中ACE2和TMPRSS2的高共表达，以及这些细胞在免疫过程中的基因表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染建立过程中结膜细胞类型的识别 | 人结膜中的ACE2和TMPRSS2表达 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-09 |
Integrative analyses of scRNA-seq and scATAC-seq reveal CXCL14 as a key regulator of lymph node metastasis in breast cancer
2021-04-27, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab042
PMID:33564857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，分析了乳腺癌原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的转录组和染色质可及性，揭示了CXCL14在乳腺癌淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现CXCL14在乳腺癌阳性淋巴结中异常高表达，并验证了其在淋巴结转移中的重要作用 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 揭示乳腺癌淋巴结转移的细胞和分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据 | 55名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |