单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
B cell-specific XIST complex enforces X-inactivation and restrains atypical B cells
2021-04-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.02.015
PMID:33735607
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研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA XIST在成人B细胞中维持X染色体失活的作用，并揭示了其在特定B细胞类型中的功能和调节机制。 | 发现了XIST在成人B细胞中持续需要以沉默某些X连锁免疫基因，如TLR7，并揭示了XIST依赖的基因缺乏启动子DNA甲基化，需要持续的XIST依赖的组蛋白去乙酰化。 | NA | 探讨XIST在成人B细胞中的持续作用及其在特定细胞类型中的功能和调节机制。 | 长链非编码RNA XIST及其在B细胞中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组测序，CRISPRi筛选 | NA | 转录组数据 | 女性系统性红斑狼疮或COVID-19感染患者的单细胞转录组数据 |
| 102 | 2024-08-09 |
Alignment of single-cell RNA-seq samples without overcorrection using kernel density matching
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.261115.120
PMID:33741686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dmatch的方法，利用人类初级细胞的外部表达图谱和核密度匹配来对齐多个单细胞RNA测序实验，以便进行下游生物学分析 | Dmatch方法在模拟中与其他对齐方法相比，在减少样本特定聚类和避免过度校正方面表现更优 | NA | 开发一种新的方法来对齐单细胞RNA测序数据，以消除批次效应并促进跨多个实验的整合和比较 | 单细胞RNA测序数据，特别是来自健康个体和自身免疫疾病患者的临床样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 核密度匹配 | 基因表达数据 | 来自健康个体和五名自身免疫疾病患者的样本 |
| 103 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal temporal dynamics of critical regulators of germ cell fate during mouse sex determination
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002420R
PMID:33749946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎期9.0至16.5天的14,914个XX和XY生殖细胞的基因表达动态变化，揭示了性别决定过程中关键调控因子的时序动态 | 首次全面描述了小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因表达动态，并识别了性别特异性的关键调控基因序列 | NA | 探究小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因网络 | 小鼠胚胎期9.0至16.5天的XX和XY生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14,914个XX和XY小鼠生殖细胞 |
| 104 | 2024-08-09 |
Epiregulin confers EGFR-TKI resistance via EGFR/ErbB2 heterodimer in non-small cell lung cancer
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01734-4
PMID:33750895
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研究论文 | 研究分析了七种EGFR配体对NSCLC细胞和患者EGFR-TKI敏感性的影响 | 发现Epiregulin通过诱导EGFR/ErbB2异二聚体形成，减少细胞对TKIs的敏感性，并揭示了肿瘤微环境中由巨噬细胞产生的Epiregulin作为EGFR-TKI治疗的新型调节因子和生物标志物 | 研究中Epiregulin在癌细胞中的过表达或敲低对TKI敏感性的影响较小 | 分析EGFR配体对NSCLC细胞EGFR-TKI敏感性的影响及其机制 | NSCLC细胞和患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫荧光实验 | NA | 基因表达数据 | 涉及NSCLC细胞和患者的数据 |
| 105 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics as a building block for determining mechanistic insight of abdominal aortic aneurysm formation
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab083
PMID:33723571
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-09 |
Methods and tools for spatial mapping of single-cell RNAseq clusters in Drosophila
2021-04-15, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab019
PMID:33713129
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review | 本文综述了在果蝇中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）簇空间映射的方法和工具 | 讨论了多重基因表达原位检测的需求、可用方法和试剂，以及利用现有数据集和新技术进行高分辨率空间映射的可能性 | 需要额外的验证来精确映射簇中细胞的空间位置 | 探讨如何将scRNAseq簇映射到果蝇的具体解剖区域 | 单细胞RNA测序实验中识别的细胞簇 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | text | NA |
| 107 | 2024-08-09 |
Decoding Neuronal Diversification by Multiplexed Single-cell RNA-Seq
2021-04-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.02.006
PMID:33711266
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研究论文 | 本文通过多重单细胞RNA测序技术，研究了人类皮肤成纤维细胞中20种促进神经元转录因子的异位表达，揭示了神经元多样化的分子机制 | 本文采用多重单细胞RNA测序技术，首次展示了神经元多样化的广泛性和特异性，并揭示了神经元谱系特异性的关键决定因素和调控逻辑 | NA | 探索细胞类型特化和多样化的调控逻辑 | 人类皮肤成纤维细胞中的神经元多样化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种促进神经元的转录因子 |
| 108 | 2024-08-09 |
Topoisomerase IIβ immunoreactivity (IR) co-localizes with neuronal marker-IR but not glial fibrillary acidic protein-IR in GLI3-positive medulloblastomas: an immunohistochemical analysis of 124 medulloblastomas from the Japan Children's Cancer Group
2021-Apr, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-021-00396-0
PMID:33704596
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研究论文 | 本研究探讨了拓扑异构酶IIβ（TOP2β）在表达神经元标记物（NM）和胶质纤维酸性蛋白（GFAP）的成神经管细胞瘤中的作用，并分析了GLI3、NM、GFAP和TOP2β表达的病理角色。 | 研究首次揭示了TOP2β免疫反应性与神经元标记物共定位，而非与胶质纤维酸性蛋白共定位，这一发现有助于理解成神经管细胞瘤的神经分化调控机制。 | 研究主要基于免疫组织化学分析和单细胞RNA测序数据，可能需要更多类型的实验验证和更大样本量的研究来进一步确认结果。 | 旨在探讨TOP2β在成神经管细胞瘤中的作用及其与神经元分化相关标记物的关系。 | 研究对象为124例成神经管细胞瘤样本，分为NM-/GFAP-、NM+/GFAP-和GFAP+三组。 | 数字病理学 | 成神经管细胞瘤 | 免疫组织化学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 124例成神经管细胞瘤样本 |
| 109 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术重新定义了小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 首次明确分析了成年小鼠子宫内膜中的间充质细胞，并识别出五个亚群，为比较子宫内膜与其他易发生纤维化的成年组织中的间充质细胞提供了平台 | NA | 重新定义小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 小鼠子宫内膜的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的细胞 |
| 110 | 2024-08-09 |
Ethylene glycol butyl ether deteriorates oocyte quality via impairing mitochondrial function
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002157R
PMID:33710673
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研究论文 | 研究报告了乙烯乙二醇丁醚（EGBE）通过损害线粒体功能影响卵母细胞质量 | 首次详细探讨了EGBE对女性生殖系统特别是卵母细胞质量的影响，并揭示了其通过线粒体功能障碍导致卵母细胞质量下降的机制 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需要更多的临床和环境暴露研究来验证这些发现 | 探讨EGBE对卵母细胞质量的影响及其机制 | 乙烯乙二醇丁醚（EGBE）对卵母细胞质量的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 111 | 2024-08-09 |
Phosphatidylinositol-3 kinase signaling controls survival and stemness of hematopoietic stem and progenitor cells
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01733-5
PMID:33714985
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研究论文 | 研究探讨了磷脂酰肌醇-3激酶（PI3K）信号通路在调控造血干细胞和祖细胞（HSPCs）存活和干细胞特性中的作用 | 发现PI3K信号通路在调控HSPCs存活和干细胞特性中的关键作用，以及在pten突变胚胎中PI3K抑制剂的挽救效应 | NA | 研究PI3K信号通路在HSPCs存活和干细胞特性调控中的作用 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用突变斑马鱼胚胎进行体内活体成像研究 |
| 112 | 2024-08-09 |
Spinal macrophages resolve nociceptive hypersensitivity after peripheral injury
2021-04-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.02.018
PMID:33667343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了脊髓巨噬细胞在周围神经损伤后对痛觉过敏的调节作用 | 首次确定了脊髓巨噬细胞在周围神经损伤后通过上调抗炎介质Cd163来缓解神经炎症和痛觉过敏的作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究脊髓巨噬细胞在周围神经损伤后对痛觉过敏的调节机制 | 脊髓巨噬细胞及其在神经损伤后的抗炎反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 113 | 2024-08-09 |
Trem2 restrains the enhancement of tau accumulation and neurodegeneration by β-amyloid pathology
2021-04-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.02.010
PMID:33675684
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研究论文 | 研究探讨了TREM2在β-淀粉样蛋白和tau病理背景下对阿尔茨海默病进展的影响 | 揭示了TREM2通过限制β-淀粉样蛋白促进病理性tau扩散的程度，从而减缓阿尔茨海默病进展和减少tau介导的神经退行性变 | 研究仅限于pR5-183和TauPS2APP小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 理解TREM2在β-淀粉样蛋白和tau病理共同存在的情况下对阿尔茨海默病后期阶段的影响 | TREM2在阿尔茨海默病中的作用及其对tau和β-淀粉样蛋白病理的影响 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | pR5-183和TauPS2APP小鼠模型 |
| 114 | 2024-08-09 |
Knockdown of sorcin increases HEI-OC1 cell damage induced by cisplatin in vitro
2021-04-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2021.108752
PMID:33675811
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研究论文 | 研究通过敲降sorcin蛋白表达，探讨其对顺铂诱导的HEI-OC1细胞损伤的影响 | 首次揭示了sorcin在顺铂诱导的耳毒性中的保护作用及其通过P-ERK1/2信号通路发挥作用的机制 | NA | 探讨sorcin在顺铂诱导的耳毒性中的作用及其机制 | sorcin蛋白在HEI-OC1细胞中的表达及其对顺铂损伤的影响 | NA | 耳聋 | siRNA转染技术 | NA | RNA测序数据 | 小鼠外毛细胞及HEI-OC1细胞 |
| 115 | 2024-08-09 |
Complete Freund's adjuvant-induced decrement of pruriceptor-mediated suppression of itch
2021-Apr-15, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.1093/abbs/gmab027
PMID:33693534
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研究论文 | 本研究探讨了完全弗氏佐剂（CFA）对瘙痒感受器介导的瘙痒抑制的影响 | 首次揭示了CFA处理后瘙痒感受器的综合抑制作用，以及这种抑制如何影响瘙痒感知 | 研究主要集中在瘙痒感受器的基因表达变化，未深入探讨CFA处理后瘙痒抑制的具体神经机制 | 探究CFA处理对瘙痒感知的影响及其可能的细胞机制 | 瘙痒行为测试、钙成像、单细胞RNA测序和实时PCR | 神经科学 | NA | 钙成像、单细胞RNA测序、实时PCR | NA | 基因表达数据 | 涉及多种瘙痒感受器相关的DRG神经元 |
| 116 | 2024-08-09 |
Modeling expression ranks for noise-tolerant differential expression analysis of scRNA-seq data
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.267070.120
PMID:33674351
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研究论文 | 本文探讨了使用离散广义贝塔分布（DGBD）模型表达秩作为转录本丰度的稳健替代品，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 提出了ROSeq方法，该方法在表达噪声下表现出色，并能快速适应增加的样本大小 | NA | 旨在提高单细胞RNA-seq数据差异表达分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据的基因表达模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 离散广义贝塔分布（DGBD） | 基因表达数据 | 涉及两个表型差异显著的单细胞群体 |
| 117 | 2024-08-09 |
c-CSN: Single-cell RNA Sequencing Data Analysis by Conditional Cell-specific Network
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.05.005
PMID:33684532
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研究论文 | 本文提出了一种名为c-CSN的方法，用于构建条件细胞特异性网络（CCSN），以测量单细胞RNA测序数据中基因之间的直接关联 | c-CSN方法通过消除间接关联，能够准确测量基因之间的直接关联，并可用于细胞聚类和基于网络的维度降低 | NA | 克服单细胞RNA测序数据中的高噪声和低覆盖问题，提高基因关联分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件细胞特异性网络（CCSN） | 基因表达矩阵 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 118 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals the origins and intrahepatic development of liver-resident IFN-γ-producing γδ T cells
2021-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00656-1
PMID:33692482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠肝脏和胸腺中γδ T细胞的异质性，揭示了γδ T细胞的发育轨迹及其在肝脏中的起源和发展 | 首次系统地阐明了γδ T细胞在肝脏中的起源和非胸腺依赖的发育途径 | NA | 探究γδ T细胞在肝脏中的起源及其非胸腺依赖的发育途径 | 小鼠肝脏和胸腺中的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肝脏和胸腺样本 |
| 119 | 2024-08-09 |
Insights Gained from Single-Cell Analysis of Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）在多种人类肿瘤中对肿瘤免疫微环境的研究进展 | 利用scRNA-seq技术深入解析了肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化及其在疾病进展和免疫治疗反应中的潜在作用 | NA | 旨在理解肿瘤免疫微环境，以识别癌症进展的免疫调节因子并开发癌症免疫疗法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种类型的人类肿瘤样本 |
| 120 | 2024-08-09 |
Formation and integration of new neurons in the adult hippocampus
2021-04, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-021-00433-z
PMID:33633402
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综述 | 本文综述了啮齿动物海马神经发生领域的最新进展，重点介绍了新技术（包括单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察）以及从干细胞激活到新生神经元整合到现有回路的不同发育步骤 | 采用了新技术如单细胞RNA测序、活体成像和行为中新生细胞的功能观察 | NA | 提高对成年神经发生机制和功能后果的理解，并探讨该领域如何在急性与慢性神经损伤和基于干细胞的脑修复中更具转化相关性 | 成年海马神经发生的过程及其对脑功能的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 细胞 | NA |