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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single Cell Gene Expression Analysis in a 3D Microtissue Liver Model Reveals Cell Type-Specific Responses to Pro-Fibrotic TGF-β1 Stimulation
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094372
PMID:33922101
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | 本文首次应用单细胞测序技术揭示了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对TGF-β1刺激的分子反应,并识别了新的细胞特异性潜在纤维化标志物 | NA | 研究3D细胞培养系统中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | HepaRG、hTERT-HSC和THP-1细胞组成的肝脏微组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 三种细胞类型的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Intratumoral Cellular Heterogeneity: Implications for Drug Resistance in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2021-Apr-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13092023
PMID:33922215
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌(NSCLC)患者中肿瘤内异质性的生物学作用及其对获得性耐药发展的影响 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤,揭示了肿瘤内异质性由遗传、表观遗传和蛋白质修饰驱动的多样性 | NA | 探讨肿瘤内异质性在非小细胞肺癌患者治疗中的作用及其对耐药性的影响 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤内异质性及其对药物耐药性的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Activation of Blood Vessel Development in Endometrial Stromal Cells In Vitro Cocultured with Human Peri-Implantation Embryos Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2021-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11050367
PMID:33919335
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外共培养的人胚胎和子宫内膜基质细胞中血管发育的激活 | 首次揭示了子宫内膜基质细胞在植入阶段启动血管发育的分子机制 | 研究仅限于体外共培养模型,未涉及体内环境 | 探讨子宫内膜基质细胞与胚胎共培养后的转录组变化及其在植入过程中的作用 | 子宫内膜基质细胞和胚胎共培养后的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24个非共培养的子宫内膜基质细胞和57个共培养后的子宫内膜基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
[Research Progress of Single Cell Sequencing in Lung Cancer]
2021-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的进展,重点关注其在肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性方面的应用 | 单细胞测序技术能够解决传统测序技术在分辨个体细胞差异方面的不足,有助于深入理解肿瘤微环境中的细胞类型、状态及细胞间通信行为 | NA | 进一步理解肺癌的发生发展机制,发现新的诊断标志物和治疗靶点,为未来肺癌患者的精准治疗提供理论依据 | 肺癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Cannabinoid Receptor Type-2 in B Cells Is Associated with Tumor Immunity in Melanoma
2021-Apr-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081934
PMID:33923757
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研究论文 | 本研究探讨了大麻素受体2(CB2R)在B细胞中的作用及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | 首次证明了CB2R在黑色素瘤中通过B细胞介导的保护作用 | NA | 研究CB2R在黑色素瘤免疫反应中的作用,并探索其作为癌症治疗新靶点的潜力 | 大麻素受体2(CB2R)在B细胞中的表达及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 包括人类黑色素瘤样本和鼠类黑色素瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
From Oncogenic Signaling Pathways to Single-Cell Sequencing of Immune Cells: Changing the Landscape of Cancer Immunotherapy
2021-Apr-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26082278
PMID:33920054
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综述 | 本文综述了肿瘤发展中的关键信号通路,并探讨了单细胞测序技术在免疫细胞中的应用,以改善癌症免疫治疗 | 结合单细胞测序数据与免疫检查点抑制剂,提高抑制剂的响应率,减少免疫相关不良事件,并促进肿瘤细胞的消除 | 免疫检查点抑制剂在不同癌症患者中的响应率不一,且增加自身免疫疾病的风险 | 旨在回顾肿瘤发展的关键通路,并探讨单细胞测序的应用,以解决免疫检查点抑制剂的不足 | 肿瘤发展中的信号通路及单细胞测序在免疫细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
A new era for plant science: spatial single-cell transcriptomics
2021-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102041
PMID:33915520
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在植物科学中的最新进展及其应用 | 强调了空间转录组学方法在植物科学中的核心作用 | NA | 探讨如何通过空间转录组学技术全面理解生物体功能 | 植物细胞及其空间关系 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Comprehensive description of the current breast cancer microenvironment advancements via single-cell analysis
2021-Apr-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01949-z
PMID:33906694
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综述 | 本文综述了通过单细胞分析技术在乳腺癌微环境研究中的最新进展 | 利用单细胞DNA测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术,深入探讨了乳腺癌肿瘤浸润细胞的表型和功能多样性 | NA | 总结乳腺癌肿瘤生态系统的单细胞特征化进展,并探讨肿瘤内细胞表型多样性及其潜在的预后相关性 | 乳腺癌的肿瘤细胞、免疫细胞、成纤维细胞和血管细胞等组成的复杂微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序(scDNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01709-9
PMID:33902571
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研究论文 | 本研究使用两种单细胞方法(DropSeq和CyTOF)对严重哮喘患者的PBMCs进行单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析,探讨了Poly I:C刺激后的免疫反应。 | 本研究首次采用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术对严重哮喘患者的PBMCs进行详细分析,揭示了Poly I:C刺激后的免疫反应和细胞亚群的变化。 | 研究样本量较小,仅包括五名严重哮喘患者和三名健康对照者,可能影响结果的普遍性。 | 研究严重哮喘患者PBMCs在Poly I:C刺激下的免疫反应和细胞亚群的变化。 | 严重哮喘患者的PBMCs及其对Poly I:C的免疫反应。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 细胞 | 9414个PBMCs,包括6099个来自5名严重哮喘患者和3315个来自3名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
In silico screening using bulk and single-cell RNA-seq data identifies RIMS2 as a prognostic marker in basal-like breast cancer: A retrospective study
2021-Apr-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000025414
PMID:33879671
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据,筛选出RIMS2作为基底样乳腺癌的预后标志物,并评估其与单细胞水平上细胞状态的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序数据验证RIMS2在基底样乳腺癌中的表达,并发现其与DNA修复能力和上皮-间质转化呈负相关 | 研究为回顾性分析,样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 旨在筛选和验证基底样乳腺癌中的预后相关基因 | 基底样乳腺癌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 20,530个基因,89个基底样细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation
2021-04-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1230
PMID:33888612
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研究论文 | 本文开发了一种名为RABID-seq的技术,结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序,用于研究中枢神经系统炎症中的星形胶质细胞相互作用 | RABID-seq技术首次结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序,用于在体内研究星形胶质细胞相互作用 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的相互作用及其潜在的治疗靶点 | 星形胶质细胞和微胶质细胞的相互作用 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
A fetal wave of human type 3 effector γδ cells with restricted TCR diversity persists into adulthood
2021-04-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf0125
PMID:33893173
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研究论文 | 本文通过高通量测序和单细胞RNA测序等技术,研究了人类胎儿和成人血液中γδ T细胞的多样性和功能特性 | 首次揭示了人类胎儿期和成人期存在具有半不变Vγ9Vδ2 TCR的功能性不同的先天样效应γδ T细胞波 | NA | 探究人类胎儿和成人血液中γδ T细胞的多样性和功能特性 | γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 高通量测序, 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, TCR测序 | NA | 血液样本 | 新生儿和成人血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
scSensitiveGeneDefine: sensitive gene detection in single-cell RNA sequencing data by Shannon entropy
2021-Apr-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04136-1
PMID:33888056
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研究论文 | 本研究开发了一种基于变异系数排名和香农熵的方法,用于在单细胞RNA测序数据中识别敏感基因,并验证了该方法的有效性 | 首次提出使用变异系数排名和香农熵来识别敏感基因,这些基因对环境刺激有高度敏感性,可能对细胞类型注释产生重大影响 | NA | 揭示细胞中随机基因表达模式的普遍性,比较细胞标记基因、管家基因和敏感基因之间的差异,并改进无监督聚类的结果 | 单细胞RNA测序数据中的敏感基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个来自不同人体组织的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Two reactive behaviors of chondrocytes in an IL-1β-induced inflammatory environment revealed by the single-cell RNA sequencing
2021-04-20, Aging
DOI:10.18632/aging.202857
PMID:33879632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了在IL-1β诱导的炎症环境中体外扩增的软骨细胞的异质性反应 | 本研究首次揭示了在IL-1β诱导的炎症环境中,软骨细胞通过两种不同的路径转化为具有骨关节炎表型和促炎特性的终端细胞簇 | 研究仅限于体外实验,尚未在体内环境中验证这些发现 | 探究在IL-1β诱导的炎症环境中体外扩增的软骨细胞的异质性反应 | 人关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 体外扩增的人关节软骨细胞,处理时间为0、24和48小时 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
XYZeq: Spatially resolved single-cell RNA sequencing reveals expression heterogeneity in the tumor microenvironment
2021-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg4755
PMID:33883145
|
研究论文 | 本文介绍了XYZeq工作流程,该流程将空间元数据编码到单细胞RNA测序库中,以揭示肿瘤微环境中细胞表达的异质性 | XYZeq工作流程的创新之处在于它能够捕获空间条形码转录组,从而提供细胞在解剖空间中的功能信息 | NA | 研究目的是更好地理解个体细胞在解剖空间中的功能 | 研究对象包括小鼠肿瘤模型中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses reveal SARS-CoV-2 interference with intrinsic immune response in the human gut
2021-04, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110232
PMID:33904651
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究,揭示了SARS-CoV-2感染人肠道后对固有免疫反应的干扰 | 发现了SARS-CoV-2感染肠道细胞后抑制自分泌干扰素作用,限制了干扰素刺激基因的表达 | NA | 探究SARS-CoV-2感染人肠道后触发的抗病毒程序 | SARS-CoV-2感染的肠道类器官 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Author Correction to: Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
2021-Apr-16, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01005-4
PMID:33863333
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Prediction of single-cell mechanisms for disease progression in hypertrophic remodelling by a trans-omics approach
2021-04-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86821-y
PMID:33854108
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研究论文 | 本研究提出了一种跨组学方法,通过整合单细胞RNA测序、ChIP-seq和基因相互作用组数据,预测心力衰竭的分子病理机制并识别区分异质表型的标记基因 | 本研究首次采用跨组学方法,结合多种组学数据,揭示了心力衰竭中Nppa表达水平与线粒体电子传递系统相关基因的负相关性 | NA | 预测心力衰竭的分子病理机制并识别标记基因 | 心力衰竭的分子机制和标记基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | 基因相互作用组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Mouse aging cell atlas analysis reveals global and cell type-specific aging signatures
2021-04-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62293
PMID:33847263
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研究论文 | 本研究利用Tabula Muris Senis单细胞RNA测序数据集,系统地描述了小鼠中多种细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 研究发现了衰老相关的基因在多个组织细胞类型中表达变化的一致性,表明了生物体水平的协调性衰老行为,并能够从转录组角度对比不同组织和细胞类型的衰老状态。 | NA | 系统地描述小鼠中多种细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 小鼠的76种组织细胞类型在衰老过程中的基因表达变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 76种组织细胞类型来自23种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals involution mimicry during the specification of the basal breast cancer subtype
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108945
PMID:33852842
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研究论文 | 本研究利用无偏倚的液滴单细胞RNA测序技术,揭示了在乳腺基底癌亚型分化过程中肿瘤进展的细胞基础 | 发现基底样癌细胞模仿怀孕后指定的乳腺小叶系,并包含异常的断奶后发育程序,触发肿瘤微环境重塑和转移扩散 | NA | 阐明乳腺基底癌亚型分化过程中的肿瘤进展机制 | 乳腺基底癌亚型的肿瘤进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |