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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2024-08-07 |
Single-Cell Study of Two Rat Models of Pulmonary Arterial Hypertension Reveals Connections to Human Pathobiology and Drug Repositioning
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202006-2169OC
PMID:33021809
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了两种肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征，并探讨了其与人类PAH病理生物学的关联及药物再定位的可能性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了两种常用PAH模型中基因和通路的独特及共享失调情况，并展示了其与人类PAH的相关性和药物再定位的实用性 | NA | 确定并优先考虑PAH大鼠模型肺部失调的基因、通路和细胞类型，评估其与人类PAH的相关性并识别药物再定位候选物 | 肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括单冠毒素（MCT）、Sugen-低氧（SuHx）和对照组大鼠的肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Transcriptomic studies of systemic lupus erythematosus
2021-Apr-09, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00161-y
PMID:33836832
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综述 | 本文综述了系统性红斑狼疮（SLE）的转录组学研究，探讨了相关生物标志物和治疗策略的发现及其局限性 | 介绍了单细胞RNA测序在SLE血液和组织中的应用，揭示了分子异质性和关键亚群 | 某些研究发现仍存在争议，需要进一步研究以确定新的治疗靶点和精确的患者分层 | 探讨SLE的转录组学研究成果及其局限性 | 系统性红斑狼疮（SLE）的生物标志物和治疗策略 | NA | 系统性红斑狼疮 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas and chromatin accessibility landscape reveal differentiation trajectories in the rice root
2021-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22352-4
PMID:33824350
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性调查，分析了水稻根尖细胞的转录组和染色质可及性，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络 | 首次综合利用单细胞RNA测序和染色质可及性分析，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络，并比较了单子叶和双子叶植物根发育路径的异同 | NA | 解析水稻根尖分生组织在细胞分化中的作用及其转录调控网络 | 水稻根尖细胞的分化轨迹和调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个水稻根尖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Inhibition of Hedgehog Signaling Alters Fibroblast Composition in Pancreatic Cancer
2021-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3715
PMID:33495315
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研究论文 | 本文研究了 Hedgehog 信号通路抑制对胰腺癌微环境中成纤维细胞组成的影响 | 发现 Hedgehog 信号通路在成纤维细胞中特异性激活，并且在肌成纤维细胞性 CAF（myCAF）中差异性升高 | NA | 探讨 Hedgehog 信号通路抑制如何重编程胰腺癌微环境 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的成纤维细胞组成和免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 时间飞行流式细胞术，单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
CASB: a concanavalin A-based sample barcoding strategy for single-cell sequencing
2021-04, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010060
PMID:33821571
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研究论文 | 本文介绍了一种基于伴刀豆球蛋白A的样本条形码策略（CASB），用于单细胞测序，该策略适用于单细胞mRNA和ATAC测序技术 | CASB策略具有高标记效率、高准确性在不同细胞类型和遗传背景下分配细胞/细胞核到样本，以及高灵敏度检测双细胞 | NA | 开发一种通用的、成本效益高的单细胞测序样本多路复用策略 | 单细胞mRNA和ATAC测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体，并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular heterogeneity of aneurysmal infrarenal abdominal aorta
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa214
PMID:32678909
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了腹主动脉瘤（AAA）进展中腹主动脉下段（IAA）的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了腹主动脉瘤进展中血管细胞的异质性和细胞反应 | NA | 揭示腹主动脉瘤进展中血管细胞的转录特征和细胞反应 | 腹主动脉下段的血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过4500个腹主动脉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
TNFAIP8 Regulates Intestinal Epithelial Cell Differentiation and May Alter Terminal Differentiation of Secretory Progenitors
2021-04-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10040871
PMID:33921306
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research paper | 本文研究了TNFAIP8（TIPE0）在肠道上皮细胞分化中的作用，特别是对分泌前体细胞终末分化的影响 | 发现了三种可能的新型终末细胞命运决定因子：Nupr1、Kdm4a和Gatad1，并提出TIPE0可能在调节终末分化中起作用 | NA | 探究TNFAIP8在肠道上皮细胞分化中的作用及其对分泌前体细胞终末分化的影响 | 肠道上皮细胞分化及分泌前体细胞的终末分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小肠的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Interrupting reactivation of immunologic memory diverts the allergic response and prevents anaphylaxis
2021-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.042
PMID:33338539
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研究论文 | 本文探讨了在花生过敏中IgE回忆反应的关键需求，并展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断如何中止IgE产生并改变细胞因子反应。 | 首次展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断可以中止IgE产生，并保护小鼠免受过敏反应的影响。 | NA | 研究IgE回忆反应在花生过敏中的关键需求。 | 人类外周血单核细胞（PBMCs）和小鼠模型。 | 免疫学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Hepatic Stellate Cells in Hepatocellular Carcinoma Promote Tumor Growth Via Growth Differentiation Factor 15 Production
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.015
PMID:33346004
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研究论文 | 研究探讨了肝星状细胞（HSCs）在肝细胞癌（HCC）微环境中通过生长分化因子15（GDF15）促进肿瘤生长的作用 | 首次揭示了HSCs通过GDF15在自噬依赖性方式下促进HCC肿瘤进展的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，需要在人体中进一步验证 | 探究HSCs在HCC微环境中的作用及其对肿瘤生长的影响 | 肝星状细胞（HSCs）和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用GFAP-Atg7敲除（KO）和GFAP-GDF15KO小鼠模型，以及LX-2细胞和人类肝癌细胞的混合培养 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
High-resolution single-cell transcriptomics reveals heterogeneity of self-renewing hair follicle stem cells
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14262
PMID:33319418
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术，揭示了自我更新阶段的毛囊干细胞的分子异质性 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序技术，详细分析了毛囊干细胞在自我更新阶段的转录组特征，揭示了不同亚群的分子标记和潜在功能 | 研究仅限于小鼠皮肤样本，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 揭示毛囊干细胞在自我更新阶段的分子异质性 | 毛囊干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从小鼠皮肤中分离的CD34 /K14-H2BGFP标记的毛囊干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Systems biological assessment of human immunity to BNT162b2 mRNA vaccination
2021-Apr-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-438662/v1
PMID:34013244
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研究论文 | 本研究采用系统生物学方法，全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗接种后免疫系统的反应，包括中和抗体的产生和免疫细胞的激活 | 研究样本仅限于56名健康志愿者，可能无法完全代表所有人群的免疫反应 | 探讨mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名接种了辉瑞-BioNTech mRNA疫苗的健康志愿者的免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19 | 系统生物学方法 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 56名健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity across viruses
2021-04-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.002
PMID:33765435
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研究论文 | 本研究通过分析多个队列中宿主免疫反应，识别出与病毒感染严重程度相关的保守保护性和有害模块 | 本研究首次整合了大量血液转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了不同病毒感染下宿主反应的共性和差异 | 研究主要集中在血液样本，可能无法全面反映所有组织中的宿主反应 | 探索不同病毒感染下宿主免疫反应与疾病严重程度的关系 | 16种病毒感染的患者血液转录组和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4,780个血液转录组样本和702,970个免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.13.20153114
PMID:32699862
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研究论文 | 本文通过高通量测序技术研究了COVID-19患者在感染期间B细胞受体（BCR）库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞反应的特征，并发现了对SARS-CoV-1和SARS-CoV-2具有交叉反应性的BCR | 研究样本量较小，仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关联 | COVID-19患者的B细胞库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-08 |
Accumulation of cytotoxic T cells in the aged CNS leads to axon degeneration and contributes to cognitive and motor decline
2021-04, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00049-z
PMID:37117598
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研究论文 | 研究揭示了在衰老的中央神经系统（CNS）中，细胞毒性CD8 T淋巴细胞的积累导致轴突退化，并促进认知和运动功能的下降 | 首次详细探讨了CD8 T细胞在衰老CNS中的作用，并通过单细胞转录组学分析了其群体异质性 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨衰老CNS中细胞毒性CD8 T细胞的作用及其对神经结构和功能的影响 | 衰老的中央神经系统中的CD8 T细胞及其对轴突和认知功能的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年和老年小鼠脑组织，以及老年人类白质尸检材料 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-08 |
SIEVE: identifying robust single cell variable genes for single-cell RNA sequencing data
2021-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000072
PMID:35402832
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research paper | 本文比较了九种常用方法在筛选单细胞RNA测序数据中可变基因的性能，并提出了一种新的策略SIEVE，通过多轮随机抽样来识别一组稳健的可变基因 | SIEVE策略通过多轮随机抽样，最小化随机噪声，并能恢复低表达的可变基因，显著提高了单细胞分类的准确性 | 现有的可变基因筛选方法在可重复性和准确性上存在不足，且偏好选择高表达基因 | 评估现有可变基因筛选方法的性能，并提出一种新的筛选策略 | 单细胞RNA测序数据中的可变基因筛选方法 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | text | 使用了来自造血干细胞/祖细胞和成熟血液细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of the aging human and macaque retina
2021-Apr, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa179
PMID:34691611
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研究论文 | 本文提供了一个基于119,520个单细胞的人和猕猴视网膜的综合转录组图谱，涵盖不同年龄段，揭示了视网膜细胞的分子特征和老化过程 | 首次提供了人和猕猴视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了视网膜细胞在不同区域和物种间的特异性，以及人类视网膜老化的区域和细胞类型特异性 | NA | 探究老化灵长类视网膜的分子和细胞过程 | 人类和猕猴的视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 119,520个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-08 |
Landscape of cell heterogeneity and evolutionary trajectory in ulcerative colitis-associated colon cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2021-Apr-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的细胞异质性和潜在的进化轨迹 | 首次在单细胞水平上揭示了从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的细胞组成和发展轨迹 | 研究样本仅来自一名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索结肠炎相关癌症中的肿瘤内异质性，并揭示从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的潜在进化轨迹 | 结肠炎相关癌症患者的肿瘤组织和邻近的溃疡性结肠炎组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 4,777个单细胞转录组，其中2,250个来自肿瘤组织，2,527个来自邻近的溃疡性结肠炎组织 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Apr-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-380803/v1
PMID:34013247
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研究论文 | 本研究通过气管抽吸物批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估了28名COVID-19患者和8名重症未感染对照组的低呼吸道免疫反应和微生物组动态变化，其中15名COVID-19患者发展为呼吸机相关肺炎（VAP） | 首次揭示了COVID-19患者在VAP发生前两周免疫信号传导的显著损害，并通过纵向元转录组分析揭示了VAP患者肺微生物组群落组成的破坏 | 样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证这些发现 | 探讨COVID-19患者中次级细菌性肺炎前的免疫信号障碍和肺微生物组变化 | COVID-19患者和重症未感染对照组的低呼吸道免疫反应和微生物组动态 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 28名COVID-19患者和8名重症未感染对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Synthetic single cell RNA sequencing data from small pilot studies using deep generative models
2021-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88875-4
PMID:33931726
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研究论文 | 本文探讨了使用深度生成模型（如变分自编码器VAEs和深度玻尔兹曼机DBMs）从小型试点研究中生成合成单细胞RNA测序数据的可行性 | 本文提出了两种深度生成模型方法：单细胞变分推理scVI和单细胞深度玻尔兹曼机scDBMs，并探讨了它们在不同样本大小下的表现 | 所有方法在处理不同丰度的细胞类型时，存在过度表示高丰度细胞类型和遗漏低丰度细胞类型的问题，并且在处理双峰性问题时遇到困难 | 研究深度生成模型在单细胞转录组学中的应用，以支持scRNA-seq实验的设计 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAEs, DBMs | 数据 | 小型试点研究数据集 | NA | NA | NA | NA |