单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.13.20153114
PMID:32699862
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研究论文 | 本文通过高通量测序技术研究了COVID-19患者在感染期间B细胞受体（BCR）库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞反应的特征，并发现了对SARS-CoV-1和SARS-CoV-2具有交叉反应性的BCR | 研究样本量较小，仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关联 | COVID-19患者的B细胞库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
| 42 | 2024-08-08 |
Accumulation of cytotoxic T cells in the aged CNS leads to axon degeneration and contributes to cognitive and motor decline
2021-04, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00049-z
PMID:37117598
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研究论文 | 研究揭示了在衰老的中央神经系统（CNS）中，细胞毒性CD8 T淋巴细胞的积累导致轴突退化，并促进认知和运动功能的下降 | 首次详细探讨了CD8 T细胞在衰老CNS中的作用，并通过单细胞转录组学分析了其群体异质性 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨衰老CNS中细胞毒性CD8 T细胞的作用及其对神经结构和功能的影响 | 衰老的中央神经系统中的CD8 T细胞及其对轴突和认知功能的影响 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年和老年小鼠脑组织，以及老年人类白质尸检材料 |
| 43 | 2024-08-08 |
SIEVE: identifying robust single cell variable genes for single-cell RNA sequencing data
2021-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000072
PMID:35402832
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research paper | 本文比较了九种常用方法在筛选单细胞RNA测序数据中可变基因的性能，并提出了一种新的策略SIEVE，通过多轮随机抽样来识别一组稳健的可变基因 | SIEVE策略通过多轮随机抽样，最小化随机噪声，并能恢复低表达的可变基因，显著提高了单细胞分类的准确性 | 现有的可变基因筛选方法在可重复性和准确性上存在不足，且偏好选择高表达基因 | 评估现有可变基因筛选方法的性能，并提出一种新的筛选策略 | 单细胞RNA测序数据中的可变基因筛选方法 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | text | 使用了来自造血干细胞/祖细胞和成熟血液细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 44 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of the aging human and macaque retina
2021-Apr, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa179
PMID:34691611
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研究论文 | 本文提供了一个基于119,520个单细胞的人和猕猴视网膜的综合转录组图谱，涵盖不同年龄段，揭示了视网膜细胞的分子特征和老化过程 | 首次提供了人和猕猴视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了视网膜细胞在不同区域和物种间的特异性，以及人类视网膜老化的区域和细胞类型特异性 | NA | 探究老化灵长类视网膜的分子和细胞过程 | 人类和猕猴的视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 119,520个单细胞 |
| 45 | 2024-08-08 |
Landscape of cell heterogeneity and evolutionary trajectory in ulcerative colitis-associated colon cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2021-Apr-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的细胞异质性和潜在的进化轨迹 | 首次在单细胞水平上揭示了从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的细胞组成和发展轨迹 | 研究样本仅来自一名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索结肠炎相关癌症中的肿瘤内异质性，并揭示从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的潜在进化轨迹 | 结肠炎相关癌症患者的肿瘤组织和邻近的溃疡性结肠炎组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 4,777个单细胞转录组，其中2,250个来自肿瘤组织，2,527个来自邻近的溃疡性结肠炎组织 |
| 46 | 2024-08-09 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Apr-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-380803/v1
PMID:34013247
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研究论文 | 本研究通过气管抽吸物批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq）评估了28名COVID-19患者和8名重症未感染对照组的低呼吸道免疫反应和微生物组动态变化，其中15名COVID-19患者发展为呼吸机相关肺炎（VAP） | 首次揭示了COVID-19患者在VAP发生前两周免疫信号传导的显著损害，并通过纵向元转录组分析揭示了VAP患者肺微生物组群落组成的破坏 | 样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证这些发现 | 探讨COVID-19患者中次级细菌性肺炎前的免疫信号障碍和肺微生物组变化 | COVID-19患者和重症未感染对照组的低呼吸道免疫反应和微生物组动态 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 28名COVID-19患者和8名重症未感染对照组 |
| 47 | 2024-08-09 |
Synthetic single cell RNA sequencing data from small pilot studies using deep generative models
2021-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88875-4
PMID:33931726
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研究论文 | 本文探讨了使用深度生成模型（如变分自编码器VAEs和深度玻尔兹曼机DBMs）从小型试点研究中生成合成单细胞RNA测序数据的可行性 | 本文提出了两种深度生成模型方法：单细胞变分推理scVI和单细胞深度玻尔兹曼机scDBMs，并探讨了它们在不同样本大小下的表现 | 所有方法在处理不同丰度的细胞类型时，存在过度表示高丰度细胞类型和遗漏低丰度细胞类型的问题，并且在处理双峰性问题时遇到困难 | 研究深度生成模型在单细胞转录组学中的应用，以支持scRNA-seq实验的设计 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAEs, DBMs | 数据 | 小型试点研究数据集 |
| 48 | 2024-08-09 |
miRNA activity inferred from single cell mRNA expression
2021-04-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88480-5
PMID:33911110
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研究论文 | 本文通过利用miRNA结合已定义的序列基序并通常下调目标基因的特性，展示了从单细胞RNA测序数据中通过基序富集分析推导miRNA活性的方法 | 本文创新地反向利用基序富集分析，从miRNA种子站点推导单细胞中miRNA的活性测量 | NA | 展示如何从单细胞RNA测序数据中推导miRNA活性 | miRNA活性在单细胞水平上的估计 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 9679个TCGA癌症样本，以及人类和小鼠的单细胞RNA测序数据集 |
| 49 | 2024-08-09 |
Differentiation reveals latent features of aging and an energy barrier in murine myogenesis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109046
PMID:33910007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠肌肉单核细胞的肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs）在分化过程中的变化 | 研究发现分化过程揭示了衰老的潜在特征，并发现老年MuSCs在分化过程中接近命运决定时停滞 | NA | 探究年龄相关变化在分化轨迹中的表现 | 肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉单核细胞 |
| 50 | 2024-08-09 |
Investigating Cellular Trajectories in the Severity of COVID-19 and Their Transcriptional Programs Using Machine Learning Approaches
2021-04-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12050635
PMID:33923155
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本，通过机器学习算法推断细胞变化轨迹并识别其转录程序 | 本研究首次应用深度学习算法DrivAER识别COVID-19发病机制中的潜在驱动通路和转录因子，并发现巨噬细胞相关的功能与疾病严重程度的相关性更高 | NA | 探究COVID-19发病机制在单细胞层面的转录驱动因素及其动态变化 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的细胞变化轨迹及其转录程序 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习算法DrivAER | 基因表达数据 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 51 | 2024-08-09 |
Retinal glial remodeling by FGF21 preserves retinal function during photoreceptor degeneration
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102376
PMID:33937726
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研究论文 | 本研究探讨了纤维母细胞生长因子21（FGF21）在视网膜色素变性（RP）模型小鼠中对视网膜功能的保护作用 | 首次发现FGF21能通过调节Müller胶质细胞的形态和功能，保护视网膜在光感受器退化过程中的功能 | NA | 探索FGF21在视网膜退化疾病中的治疗潜力 | 视网膜色素变性（RP）模型小鼠 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | P23H小鼠 |
| 52 | 2024-08-09 |
Connectivity Map Analysis of a Single-Cell RNA-Sequencing -Derived Transcriptional Signature of mTOR Signaling
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094371
PMID:33922083
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据构建疾病转录组特征，并应用于连接图（CMaP）分析，以识别mTOR信号通路的抑制剂 | 开发了使用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析的新方法 | 传统的CMaP分析使用来自大量疾病组织的特征，缺乏分辨率以有效识别有效的治疗药物 | 开发和应用新的方法，利用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析，以识别有效的治疗药物 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）患者的肺组织scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自未经治疗和西罗莫司治疗的LAM患者的肺组织样本 |
| 53 | 2024-08-09 |
Single Cell Gene Expression Analysis in a 3D Microtissue Liver Model Reveals Cell Type-Specific Responses to Pro-Fibrotic TGF-β1 Stimulation
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094372
PMID:33922101
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | 本文首次应用单细胞测序技术揭示了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对TGF-β1刺激的分子反应，并识别了新的细胞特异性潜在纤维化标志物 | NA | 研究3D细胞培养系统中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | HepaRG、hTERT-HSC和THP-1细胞组成的肝脏微组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三种细胞类型的单细胞 |
| 54 | 2024-08-09 |
Intratumoral Cellular Heterogeneity: Implications for Drug Resistance in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2021-Apr-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13092023
PMID:33922215
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）患者中肿瘤内异质性的生物学作用及其对获得性耐药发展的影响 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤，揭示了肿瘤内异质性由遗传、表观遗传和蛋白质修饰驱动的多样性 | NA | 探讨肿瘤内异质性在非小细胞肺癌患者治疗中的作用及其对耐药性的影响 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤内异质性及其对药物耐药性的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Activation of Blood Vessel Development in Endometrial Stromal Cells In Vitro Cocultured with Human Peri-Implantation Embryos Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2021-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11050367
PMID:33919335
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外共培养的人胚胎和子宫内膜基质细胞中血管发育的激活 | 首次揭示了子宫内膜基质细胞在植入阶段启动血管发育的分子机制 | 研究仅限于体外共培养模型，未涉及体内环境 | 探讨子宫内膜基质细胞与胚胎共培养后的转录组变化及其在植入过程中的作用 | 子宫内膜基质细胞和胚胎共培养后的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24个非共培养的子宫内膜基质细胞和57个共培养后的子宫内膜基质细胞 |
| 56 | 2024-08-09 |
[Research Progress of Single Cell Sequencing in Lung Cancer]
2021-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的进展，重点关注其在肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性方面的应用 | 单细胞测序技术能够解决传统测序技术在分辨个体细胞差异方面的不足，有助于深入理解肿瘤微环境中的细胞类型、状态及细胞间通信行为 | NA | 进一步理解肺癌的发生发展机制，发现新的诊断标志物和治疗靶点，为未来肺癌患者的精准治疗提供理论依据 | 肺癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Cannabinoid Receptor Type-2 in B Cells Is Associated with Tumor Immunity in Melanoma
2021-Apr-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081934
PMID:33923757
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研究论文 | 本研究探讨了大麻素受体2（CB2R）在B细胞中的作用及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | 首次证明了CB2R在黑色素瘤中通过B细胞介导的保护作用 | NA | 研究CB2R在黑色素瘤免疫反应中的作用，并探索其作为癌症治疗新靶点的潜力 | 大麻素受体2（CB2R）在B细胞中的表达及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 包括人类黑色素瘤样本和鼠类黑色素瘤模型 |
| 58 | 2024-08-09 |
From Oncogenic Signaling Pathways to Single-Cell Sequencing of Immune Cells: Changing the Landscape of Cancer Immunotherapy
2021-Apr-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26082278
PMID:33920054
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综述 | 本文综述了肿瘤发展中的关键信号通路，并探讨了单细胞测序技术在免疫细胞中的应用，以改善癌症免疫治疗 | 结合单细胞测序数据与免疫检查点抑制剂，提高抑制剂的响应率，减少免疫相关不良事件，并促进肿瘤细胞的消除 | 免疫检查点抑制剂在不同癌症患者中的响应率不一，且增加自身免疫疾病的风险 | 旨在回顾肿瘤发展的关键通路，并探讨单细胞测序的应用，以解决免疫检查点抑制剂的不足 | 肿瘤发展中的信号通路及单细胞测序在免疫细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
A new era for plant science: spatial single-cell transcriptomics
2021-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102041
PMID:33915520
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在植物科学中的最新进展及其应用 | 强调了空间转录组学方法在植物科学中的核心作用 | NA | 探讨如何通过空间转录组学技术全面理解生物体功能 | 植物细胞及其空间关系 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Comprehensive description of the current breast cancer microenvironment advancements via single-cell analysis
2021-Apr-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01949-z
PMID:33906694
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综述 | 本文综述了通过单细胞分析技术在乳腺癌微环境研究中的最新进展 | 利用单细胞DNA测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，深入探讨了乳腺癌肿瘤浸润细胞的表型和功能多样性 | NA | 总结乳腺癌肿瘤生态系统的单细胞特征化进展，并探讨肿瘤内细胞表型多样性及其潜在的预后相关性 | 乳腺癌的肿瘤细胞、免疫细胞、成纤维细胞和血管细胞等组成的复杂微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序（scDNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |