单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Activated Regulatory T-Cells, Dysfunctional and Senescent T-Cells Hinder the Immunity in Pancreatic Cancer
2021-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081776
PMID:33917832
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研究论文 | 本研究分析了32名胰腺癌患者的T细胞，通过多参数质谱细胞术和单细胞RNA测序，揭示了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的免疫抑制状态 | 发现了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的新免疫抑制状态，并确定了多个新的治疗靶点 | NA | 旨在更好地理解胰腺癌中的白细胞特征，以识别更好的治疗策略 | 胰腺癌患者的T细胞 | NA | 胰腺癌 | 多参数质谱细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学成像和空间分析 | NA | 细胞，组织 | 32名胰腺癌患者 |
| 22 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Parkinson's Disease
2021-Apr-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9040368
PMID:33916045
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在帕金森病分子发病机制研究中的应用 | 介绍了通过动物和体外人类模型以及测序技术，对帕金森病细胞组成和表型的无偏见全局视图的研究进展 | 主要限制包括死后脑组织稀缺和技术挑战，如RNA降解导致的质量问题 | 旨在深入理解帕金森病的分子发病机制 | 帕金森病的细胞类型及其特定疾病关联 | 数字病理学 | 帕金森病 | sc/snRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Gregarine single-cell transcriptomics reveals differential mitochondrial remodeling and adaptation in apicomplexans
2021-04-16, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01007-2
PMID:33863338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了五种从蟑螂中分离的格拉雷菌的转录组，结合其他顶复门生物的数据，进行了详细的系统基因组学分析，并描述了它们的线粒体代谢 | 首次广泛地探索了格拉雷菌的基因组规模，提供了该群体中差异性叶绿体保留的证据，并揭示了顶复门中线粒体代谢功能的可变重组 | 对于格拉雷菌线粒体的保留和代谢能力了解仍然有限 | 探讨顶复门生物中线粒体重塑和适应性的差异 | 从蟑螂中分离的五种格拉雷菌 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 五种格拉雷菌 |
| 24 | 2024-08-07 |
Single-Cell Study of Two Rat Models of Pulmonary Arterial Hypertension Reveals Connections to Human Pathobiology and Drug Repositioning
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202006-2169OC
PMID:33021809
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了两种肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征，并探讨了其与人类PAH病理生物学的关联及药物再定位的可能性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了两种常用PAH模型中基因和通路的独特及共享失调情况，并展示了其与人类PAH的相关性和药物再定位的实用性 | NA | 确定并优先考虑PAH大鼠模型肺部失调的基因、通路和细胞类型，评估其与人类PAH的相关性并识别药物再定位候选物 | 肺动脉高压（PAH）大鼠模型的肺部细胞和分子特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括单冠毒素（MCT）、Sugen-低氧（SuHx）和对照组大鼠的肺部样本 |
| 25 | 2024-08-07 |
Transcriptomic studies of systemic lupus erythematosus
2021-Apr-09, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00161-y
PMID:33836832
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综述 | 本文综述了系统性红斑狼疮（SLE）的转录组学研究，探讨了相关生物标志物和治疗策略的发现及其局限性 | 介绍了单细胞RNA测序在SLE血液和组织中的应用，揭示了分子异质性和关键亚群 | 某些研究发现仍存在争议，需要进一步研究以确定新的治疗靶点和精确的患者分层 | 探讨SLE的转录组学研究成果及其局限性 | 系统性红斑狼疮（SLE）的生物标志物和治疗策略 | NA | 系统性红斑狼疮 | 微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
2021-04-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02302-5
PMID:33827654
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research paper | 本文介绍了一种名为ACME的细胞固定-解离方法，用于单细胞转录组学研究 | ACME方法能够在固定细胞的同时进行解离，保持RNA完整性，支持多次冷冻保存，并且细胞可分类和可渗透 | NA | 开发一种适用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法 | 单细胞转录组学中的细胞解离问题 | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同物种的单细胞转录组数据 |
| 27 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas and chromatin accessibility landscape reveal differentiation trajectories in the rice root
2021-04-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22352-4
PMID:33824350
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和染色质可及性调查，分析了水稻根尖细胞的转录组和染色质可及性，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络 | 首次综合利用单细胞RNA测序和染色质可及性分析，揭示了水稻根细胞的分化轨迹和调控网络，并比较了单子叶和双子叶植物根发育路径的异同 | NA | 解析水稻根尖分生组织在细胞分化中的作用及其转录调控网络 | 水稻根尖细胞的分化轨迹和调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个水稻根尖细胞 |
| 28 | 2024-08-07 |
Inhibition of Hedgehog Signaling Alters Fibroblast Composition in Pancreatic Cancer
2021-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3715
PMID:33495315
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研究论文 | 本文研究了 Hedgehog 信号通路抑制对胰腺癌微环境中成纤维细胞组成的影响 | 发现 Hedgehog 信号通路在成纤维细胞中特异性激活，并且在肌成纤维细胞性 CAF（myCAF）中差异性升高 | NA | 探讨 Hedgehog 信号通路抑制如何重编程胰腺癌微环境 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的成纤维细胞组成和免疫浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 时间飞行流式细胞术，单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
CASB: a concanavalin A-based sample barcoding strategy for single-cell sequencing
2021-04, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010060
PMID:33821571
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研究论文 | 本文介绍了一种基于伴刀豆球蛋白A的样本条形码策略（CASB），用于单细胞测序，该策略适用于单细胞mRNA和ATAC测序技术 | CASB策略具有高标记效率、高准确性在不同细胞类型和遗传背景下分配细胞/细胞核到样本，以及高灵敏度检测双细胞 | NA | 开发一种通用的、成本效益高的单细胞测序样本多路复用策略 | 单细胞mRNA和ATAC测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Application of Single-Cell Approaches to Study Myeloproliferative Neoplasm Biology
2021-04, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2021.01.002
PMID:33641869
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综述 | 本文综述了利用多种新型单细胞技术研究人类疾病，特别是费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN）生物学的最新见解 | 应用单细胞基因组学、单细胞转录组学和数字病理学等新技术深入研究MPN生物学 | NA | 探讨MPN生物学的新见解 | 费城阴性骨髓增生性肿瘤（MPN） | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体，并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular heterogeneity of aneurysmal infrarenal abdominal aorta
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa214
PMID:32678909
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了腹主动脉瘤（AAA）进展中腹主动脉下段（IAA）的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了腹主动脉瘤进展中血管细胞的异质性和细胞反应 | NA | 揭示腹主动脉瘤进展中血管细胞的转录特征和细胞反应 | 腹主动脉下段的血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过4500个腹主动脉细胞 |
| 33 | 2024-08-07 |
TNFAIP8 Regulates Intestinal Epithelial Cell Differentiation and May Alter Terminal Differentiation of Secretory Progenitors
2021-04-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10040871
PMID:33921306
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research paper | 本文研究了TNFAIP8（TIPE0）在肠道上皮细胞分化中的作用，特别是对分泌前体细胞终末分化的影响 | 发现了三种可能的新型终末细胞命运决定因子：Nupr1、Kdm4a和Gatad1，并提出TIPE0可能在调节终末分化中起作用 | NA | 探究TNFAIP8在肠道上皮细胞分化中的作用及其对分泌前体细胞终末分化的影响 | 肠道上皮细胞分化及分泌前体细胞的终末分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小肠的单细胞样本 |
| 34 | 2024-08-07 |
Interrupting reactivation of immunologic memory diverts the allergic response and prevents anaphylaxis
2021-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.042
PMID:33338539
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研究论文 | 本文探讨了在花生过敏中IgE回忆反应的关键需求，并展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断如何中止IgE产生并改变细胞因子反应。 | 首次展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断可以中止IgE产生，并保护小鼠免受过敏反应的影响。 | NA | 研究IgE回忆反应在花生过敏中的关键需求。 | 人类外周血单核细胞（PBMCs）和小鼠模型。 | 免疫学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Hepatic Stellate Cells in Hepatocellular Carcinoma Promote Tumor Growth Via Growth Differentiation Factor 15 Production
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.015
PMID:33346004
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研究论文 | 研究探讨了肝星状细胞（HSCs）在肝细胞癌（HCC）微环境中通过生长分化因子15（GDF15）促进肿瘤生长的作用 | 首次揭示了HSCs通过GDF15在自噬依赖性方式下促进HCC肿瘤进展的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，需要在人体中进一步验证 | 探究HSCs在HCC微环境中的作用及其对肿瘤生长的影响 | 肝星状细胞（HSCs）和肝细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用GFAP-Atg7敲除（KO）和GFAP-GDF15KO小鼠模型，以及LX-2细胞和人类肝癌细胞的混合培养 |
| 36 | 2024-08-07 |
Fibroblastic reticular cell lineage convergence in Peyer's patches governs intestinal immunity
2021-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00894-5
PMID:33707780
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和细胞命运图谱技术，揭示了纤维母细胞网状细胞（FRCs）在派尔集合淋巴结（PPs）中的分化机制及其对肠道免疫的调控作用 | 首次阐明了PPs中FRCs的分化路径及其在肠道免疫中的关键作用 | NA | 探究FRCs在PPs中的分化机制及其对肠道免疫的调控作用 | 纤维母细胞网状细胞（FRCs）在派尔集合淋巴结（PPs）中的分化及其对肠道免疫的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，细胞命运图谱 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎样本 |
| 37 | 2024-08-07 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序方法揭示的细胞间基因表达水平的异质性，并分析了表观遗传信息如染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾部修饰和增强子-启动子相互作用对基因表达调控的影响。 | 本文介绍了单细胞表观基因组分析方法的最新进展，这些方法能够高分辨率地映射单个细胞中的染色质状态。 | NA | 研究细胞间基因表达异质性的表观遗传基础。 | 研究对象包括单细胞测序数据、染色质状态及其对基因表达的影响。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 38 | 2024-08-07 |
High-resolution single-cell transcriptomics reveals heterogeneity of self-renewing hair follicle stem cells
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14262
PMID:33319418
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术，揭示了自我更新阶段的毛囊干细胞的分子异质性 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序技术，详细分析了毛囊干细胞在自我更新阶段的转录组特征，揭示了不同亚群的分子标记和潜在功能 | 研究仅限于小鼠皮肤样本，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 揭示毛囊干细胞在自我更新阶段的分子异质性 | 毛囊干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从小鼠皮肤中分离的CD34 /K14-H2BGFP标记的毛囊干细胞 |
| 39 | 2024-08-07 |
Systems biological assessment of human immunity to BNT162b2 mRNA vaccination
2021-Apr-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-438662/v1
PMID:34013244
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研究论文 | 本研究采用系统生物学方法，全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗接种后免疫系统的反应，包括中和抗体的产生和免疫细胞的激活 | 研究样本仅限于56名健康志愿者，可能无法完全代表所有人群的免疫反应 | 探讨mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名接种了辉瑞-BioNTech mRNA疫苗的健康志愿者的免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19 | 系统生物学方法 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 56名健康志愿者 |
| 40 | 2024-08-07 |
Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity across viruses
2021-04-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.002
PMID:33765435
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研究论文 | 本研究通过分析多个队列中宿主免疫反应，识别出与病毒感染严重程度相关的保守保护性和有害模块 | 本研究首次整合了大量血液转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了不同病毒感染下宿主反应的共性和差异 | 研究主要集中在血液样本，可能无法全面反映所有组织中的宿主反应 | 探索不同病毒感染下宿主免疫反应与疾病严重程度的关系 | 16种病毒感染的患者血液转录组和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4,780个血液转录组样本和702,970个免疫细胞样本 |