单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 171 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-07 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
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研究论文 | 本研究发现了调节性嗜酸性粒细胞在关节炎消退中的作用机制 | 首次揭示嗜酸性粒细胞在关节炎中具有促消退功能，并鉴定出与肺部炎性嗜酸性粒细胞不同的关节调节性嗜酸性粒细胞亚群 | 机制研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究嗜酸性粒细胞在类风湿关节炎消退过程中的作用机制 | 小鼠模型和人类类风湿关节炎患者 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2024-11-17 |
The rise of single-cell proteomics
2021-Apr, Analytical science advances
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/ansa.202000152
PMID:38716457
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研究论文 | 本文讨论了单细胞蛋白质组学的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文介绍了单细胞蛋白质组学领域的最新技术进展，包括样品制备流程和质谱仪器的改进，能够从单个细胞中定量超过1000种蛋白质 | 目前单细胞蛋白质组学研究的数据通量和可靠性仍需进一步提高 | 旨在通过生成单个细胞的蛋白质表达谱，补充转录组和基因组数据，以更好地理解细胞功能和身份 | 单细胞蛋白质组学技术及其在生物学研究中的应用 | 蛋白质组学 | NA | 质谱(MS) | NA | 蛋白质表达谱 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-11-11 |
Pan-Cancer Drivers Are Recurrent Transcriptional Regulatory Heterogeneities in Early-Stage Luminal Breast Cancer
2021-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1034
PMID:33531373
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研究论文 | 本文研究了早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控，并识别出跨癌症类型的复发性基因异质性 | 本文改进了随机波动分析方法，结合10细胞RNA测序技术，识别出早期腔内乳腺癌中的复发性基因异质性，并发现这些基因与跨癌症类型的驱动基因有关 | 本文方法在敏感性、噪声和样本处理方面存在局限性 | 研究早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控，并识别出跨癌症类型的复发性基因异质性 | 早期腔内乳腺癌中的异质性转录调控 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 晚期发病、早期腔内乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-09-27 |
Embryonic Origin and Subclonal Evolution of Tumor-Associated Macrophages Imply Preventive Care for Cancer
2021-04-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10040903
PMID:33919979
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研究论文 | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的起源和亚克隆进化，并探讨其在癌症预防中的潜在作用 | 提出了TAMs的胚胎起源和亚克隆进化模型，揭示了TAMs的功能异质性与微环境提示和代谢重塑的关系 | NA | 探讨TAMs的起源和功能异质性，以及其在癌症发展中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其在癌症中的作用 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-10 |
Transcriptional profiling of mouse peripheral nerves to the single-cell level to build a sciatic nerve ATlas (SNAT)
2021-04-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58591
PMID:33890853
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研究论文 | 本文通过单细胞水平的转录组分析，构建了小鼠坐骨神经的转录组图谱（SNAT） | 首次结合了发育中的坐骨神经的批量RNA测序和Schwann细胞的批量及单细胞RNA测序，以及全坐骨神经的单细胞转录组分析 | NA | 促进对外周神经基本理解的研究 | 小鼠坐骨神经中的各种细胞类型 | NA | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括发育中的坐骨神经和成年坐骨神经的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-10 |
A single-cell genomics pipeline for environmental microbial eukaryotes
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102290
PMID:33870123
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研究论文 | 本文描述了一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 该流程整合了先进的单细胞基因组学工具和优化协议，旨在提高低成本下基因组质量 | NA | 开发和评估一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 环境中低丰度未培养的真核微生物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 环境样本和早期分化线菌及Chromista/SAR培养物 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-10 |
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-021-00728-4
PMID:33888112
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综述 | 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 | 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合，以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 | 讨论了该技术的挑战和未来展望 | 介绍脑类器官分化策略的现状，总结其在医学领域的进展和应用 | 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 | NA | 神经系统疾病 | 免疫染色技术，单细胞测序技术 | NA | 组织 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-10 |
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa235
PMID:33844835
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研究论文 | 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7，作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 | 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调，并证实其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | RNA测序（RNA-seq） | CRISPR/Cas9 | RNA | 175名髓母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-10 |
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004320
PMID:33898197
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研究论文 | 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度，揭示了结直肠癌干细胞的状态 | 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组，系统评估了结直肠癌干细胞 | NA | 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 | 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | SMART-seq2, 10 × Genomics | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-09 |
Research Techniques Made Simple: Use of Imaging Mass Cytometry for Dermatological Research and Clinical Applications
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.12.008
PMID:33752807
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研究论文 | 本文介绍了成像质谱流式细胞术（IMC）在皮肤病学研究和临床应用中的潜力 | IMC技术能够同时分析多达40种蛋白质标记物，生成高维图像，保留组织结构和细胞间空间关系 | NA | 强调IMC在皮肤病学研究和临床应用中的潜在用途 | 皮肤病学领域的组织和细胞 | 数字病理学 | NA | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-05 |
Cryopreservation of microglia enables single-cell RNA sequencing with minimal effects on disease-related gene expression patterns
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102357
PMID:33870145
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研究论文 | 本文研究了冷冻保存小胶质细胞对单细胞RNA测序的影响 | 探索了冷冻保存小胶质细胞的使用，证明其在单细胞RNA测序中具有良好的适用性 | 未明确指出冷冻保存对其他细胞类型的影响 | 研究冷冻保存小胶质细胞对疾病相关基因表达模式的影响 | 冷冻保存的小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了配对的新鲜和冷冻保存的小胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of angiotensin-converting enzyme II expression in human kidneys and bladders reveals a potential route of 2019 novel coronavirus infection
2021-Apr-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001439
PMID:33879756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类肾脏和膀胱中血管紧张素转换酶II（ACE2）的表达，探讨了2019新型冠状病毒（2019-nCoV）感染泌尿系统的潜在途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了ACE2在肾脏和膀胱细胞中的表达分布，为理解2019-nCoV感染泌尿系统的机制提供了新的视角 | 研究仅限于健康肾脏和膀胱样本，未涉及疾病状态下的ACE2表达情况 | 探讨2019-nCoV感染泌尿系统的潜在途径及肾脏损伤的可能原因 | 人类肾脏和膀胱细胞中ACE2的表达 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个已发表的肾脏细胞图谱数据集和两个自产的健康肾脏样本，以及三个膀胱样本 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Evaluation of Cell Type Annotation R Packages on Single-cell RNA-seq Data
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.07.004
PMID:33359678
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研究论文 | 本研究评估了十种公开可用的细胞类型注释R包在单细胞RNA测序数据上的表现 | 首次系统比较了专门为单细胞研究开发的流行方法与从DNA甲基化数据转用的方法在单细胞RNA测序数据上的适应性和性能 | Seurat在预测稀有细胞群体和区分高度相似的细胞类型方面存在明显不足 | 评估不同细胞类型注释方法在单细胞RNA测序数据分析中的准确性、鲁棒性和对稀有及未知细胞类型的检测能力 | 十种细胞类型注释方法在单细胞RNA测序数据上的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种公开的单细胞RNA测序数据集及模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Applying high-dimensional single-cell technologies to the analysis of cancer immunotherapy
2021-04, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-020-00449-x
PMID:33277626
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研究论文 | 本文探讨了高维单细胞技术在癌症免疫治疗分析中的应用 | 利用高维单细胞技术对肿瘤及其微环境的基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组特征进行多方面分析 | NA | 研究高维单细胞技术在免疫肿瘤学中的应用，特别是在临床反应和免疫治疗抵抗方面的进展 | 恶性肿瘤的单细胞分析 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组 | NA | 单细胞数据 | 数千至数百万个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Early satellite cell communication creates a permissive environment for long-term muscle growth
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102372
PMID:33948557
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研究论文 | 本研究通过追踪肌肉干细胞（卫星细胞）特异性的细胞外囊泡（EV）、卫星细胞耗竭、细胞培养和单细胞RNA测序，展示了卫星细胞在骨骼肌机械超负荷期间与其他细胞的交流 | 首次揭示了卫星细胞通过早期EV交流为长期肌肉生长创造适宜环境，即使在未融合到肌纤维的情况下也能支持成年小鼠的持续肥大 | NA | 探究卫星细胞在骨骼肌机械超负荷期间的细胞间交流及其对肌肉适应的影响 | 肌肉干细胞（卫星细胞）及其在骨骼肌生长中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
PseudotimeDE: inference of differential gene expression along cell pseudotime with well-calibrated p-values from single-cell RNA sequencing data
2021-04-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02341-y
PMID:33926517
|
研究论文 | 提出了一种名为PseudotimeDE的方法，用于从单细胞RNA测序数据中沿着细胞伪时间推断差异表达基因，并输出校准良好的p值 | PseudotimeDE方法适应多种伪时间推断方法，考虑了伪时间推断的不确定性，并输出校准良好的p值 | NA | 研究细胞状态变化背后的分子机制 | 差异表达基因 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Stabilized epithelial phenotype of cancer cells in primary tumors leads to increased colonization of liver metastasis in pancreatic cancer
2021-04-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108990
PMID:33852841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型，探讨了部分上皮间质转化（EMT）和上皮稳定化在胰腺导管腺癌（PDAC）生长和转移中的功能作用 | 首次揭示了上皮稳定化导致癌细胞集体迁移增强和免疫微环境调节，从而促进肝脏转移 | NA | 探讨胰腺癌转移的多样性机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的生长和转移 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约50个癌细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Activated Regulatory T-Cells, Dysfunctional and Senescent T-Cells Hinder the Immunity in Pancreatic Cancer
2021-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081776
PMID:33917832
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研究论文 | 本研究分析了32名胰腺癌患者的T细胞，通过多参数质谱细胞术和单细胞RNA测序，揭示了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的免疫抑制状态 | 发现了调节性T细胞和CD8 T细胞在胰腺癌中的新免疫抑制状态，并确定了多个新的治疗靶点 | NA | 旨在更好地理解胰腺癌中的白细胞特征，以识别更好的治疗策略 | 胰腺癌患者的T细胞 | NA | 胰腺癌 | 多参数质谱细胞术，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学成像和空间分析 | NA | 细胞，组织 | 32名胰腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Parkinson's Disease
2021-Apr-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9040368
PMID:33916045
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在帕金森病分子发病机制研究中的应用 | 介绍了通过动物和体外人类模型以及测序技术，对帕金森病细胞组成和表型的无偏见全局视图的研究进展 | 主要限制包括死后脑组织稀缺和技术挑战，如RNA降解导致的质量问题 | 旨在深入理解帕金森病的分子发病机制 | 帕金森病的细胞类型及其特定疾病关联 | 数字病理学 | 帕金森病 | sc/snRNA-seq | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Gregarine single-cell transcriptomics reveals differential mitochondrial remodeling and adaptation in apicomplexans
2021-04-16, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01007-2
PMID:33863338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了五种从蟑螂中分离的格拉雷菌的转录组，结合其他顶复门生物的数据，进行了详细的系统基因组学分析，并描述了它们的线粒体代谢 | 首次广泛地探索了格拉雷菌的基因组规模，提供了该群体中差异性叶绿体保留的证据，并揭示了顶复门中线粒体代谢功能的可变重组 | 对于格拉雷菌线粒体的保留和代谢能力了解仍然有限 | 探讨顶复门生物中线粒体重塑和适应性的差异 | 从蟑螂中分离的五种格拉雷菌 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 五种格拉雷菌 | NA | NA | NA | NA |