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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
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研究论文 | 本研究揭示AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的恶化作用 | 首次阐明JAK2突变通过DNA复制应激激活AIM2炎症小体加剧动脉粥样硬化的机制 | 未提及具体局限性 | 探究克隆性造血相关基因突变(JAK2)促进动脉粥样硬化的分子机制 | 携带JAK2突变的巨噬细胞和模拟克隆性造血的嵌合小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2026-04-07 |
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01709-9
PMID:33902571
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,表征了重症哮喘患者外周血单个核细胞在Poly I:C刺激下的免疫反应模型 | 首次结合两种互补的单细胞技术(DropSeq scRNA-Seq和CyTOF)来表征重症哮喘患者PBMCs对TLR3激动剂Poly I:C的反应,揭示了基线状态下的促炎特征和刺激后强烈的干扰素通路诱导 | 样本量相对较小(5名SA患者和3名健康对照),且为体外模型,可能无法完全反映体内复杂的免疫微环境 | 表征重症哮喘患者外周血单个核细胞对TLR3激动剂Poly I:C刺激的免疫反应,以评估哮喘相关的干扰素反应缺陷 | 重症哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 8名个体(5名重症哮喘患者,3名健康对照)的PBMCs;scRNA-Seq分析9414个细胞,CyTOF分析160,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | DropSeq | NA |
| 3 | 2026-04-07 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
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研究论文 | 本文介绍了BatchBench,一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 | 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具,通过整合多个数据集进行性能分析 | 仅评估了八种方法,可能未涵盖所有现有技术,且依赖于特定数据集 | 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 | 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 多个已研究的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-07 |
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86070-z
PMID:33846365
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统,用于单细胞转录组分析,并展示了其在细胞周期研究中的应用 | 开发了一种新型微流控系统,具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率,且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置,支持不同缓冲液和条形码珠设置 | 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证,以及与其他现有平台的直接比较数据 | 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统,以促进细胞分辨率下的转录组学研究 | 异步人类和小鼠细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA序列数据 | 约50,000个单细胞或细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | Nadia Instrument | 基于液滴的微流控系统,支持3' mRNA捕获,可与Nadia Innovate模块结合使用 |
| 5 | 2026-04-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 | 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质,并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序样本量相对较小 | 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响,并鉴定关键致病细胞亚群 | CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 基因工程小鼠模型(具体数量未明确)、人类脑脊液样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-04-07 |
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101407
PMID:33769948
|
研究论文 | 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术,分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组,揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 | 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型,包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型,并发现了新的转录因子表达模式 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本;功能验证实验有限 | 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 | 小鼠肾脏厚壁升支(CTAL)和远端曲小管(DCT)区域的细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq,FACS(荧光激活细胞分选) | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 9099个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-15 |
Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation
2021-04-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1230
PMID:33888612
|
研究论文 | 本研究开发了RABID-seq技术,结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序,以研究中枢神经系统炎症中的单细胞相互作用 | 开发了RABID-seq技术,首次将条形码病毒追踪与单细胞RNA测序结合,用于在体内研究星形胶质细胞相互作用,并识别了介导小胶质细胞-星形胶质细胞相互作用的候选分子 | NA | 研究中枢神经系统炎症中细胞间相互作用,特别是小胶质细胞与星形胶质细胞之间的互作机制 | 星形胶质细胞、小胶质细胞及其在中枢神经系统炎症模型中的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Airspace Macrophages and Monocytes Exist in Transcriptionally Distinct Subsets in Healthy Adults
2021-04-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202005-1989OC
PMID:33079572
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示健康成人肺泡和气道中存在转录水平不同的巨噬细胞和单核细胞亚群 | 首次在健康人呼吸道中发现两个新的巨噬细胞亚群:促炎症基因表达谱和金属硫蛋白基因表达谱亚群 | 样本量较小(仅10名受试者),且仅针对健康成人 | 确定健康成人支气管肺泡灌洗液中人类细胞的转录异质性 | 健康成人的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10名健康成人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling for advancing birth defects research and prevention
2021-04-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.1870
PMID:33496083
|
综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在出生缺陷研究和预防中的应用前景 | 利用单细胞分辨率技术解析发育通路,结合计算模型发现关键组织原则 | NA | 推进出生缺陷研究和预防 | 发育过程和致畸作用的细胞分析 | 单细胞基因组学 | 出生缺陷 | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Rituximab-resistant splenic memory B cells and newly engaged naive B cells fuel relapses in patients with immune thrombocytopenia
2021-04-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abc3961
PMID:33853929
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研究论文 | 本研究揭示了利妥昔单抗耐药性脾脏记忆B细胞和新招募的幼稚B细胞共同导致免疫性血小板减少症患者复发的作用机制 | 首次在人类次级淋巴器官中鉴定出具有独特可逆表型的利妥昔单抗耐药记忆B细胞群体,并阐明其通过持续表达CD19成为现有抗CD19疗法有效靶点的特性 | 研究样本来源于接受脾切除术的特定患者群体,可能限制结果的普适性 | 探究免疫性血小板减少症患者对利妥昔单抗治疗产生耐药性和疾病复发的细胞学基础 | 免疫性血小板减少症患者的脾脏B细胞和浆细胞 | 单细胞组学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白基因谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据 | 接受治疗性脾切除术的复发免疫性血小板减少症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics
2021-04-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02302-5
PMID:33827654
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法ACME | 开发了同时实现细胞固定和解离的ACME方法,解决了单细胞测序需要活样本的限制 | NA | 开发适用于单细胞转录组学的细胞固定-解离方法 | 不同物种的细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,基于液滴的单细胞方法,组合条形码单细胞方法 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Application of Single-Cell Approaches to Study Myeloproliferative Neoplasm Biology
2021-04, Hematology/oncology clinics of North America
DOI:10.1016/j.hoc.2021.01.002
PMID:33641869
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综述 | 本文综述了单细胞技术在费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤研究中的应用进展 | 系统总结了新型单细胞技术在MPN研究中的最新应用成果 | NA | 探讨单细胞技术对MPN生物学机制的深入理解 | 费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPNs) | 数字病理学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞基因组学, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 数字病理学 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Fibroblastic reticular cell lineage convergence in Peyer's patches governs intestinal immunity
2021-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00894-5
PMID:33707780
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和细胞谱系示踪技术揭示了派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的双重谱系汇聚模式及其在肠道免疫调控中的关键作用 | 首次发现派尔集合淋巴结中血管周围和上皮下两种成纤维网状细胞谱系的协同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关机制仍需进一步验证 | 探究派尔集合淋巴结中成纤维网状细胞的分化机制及其在肠道免疫中的功能 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结中的成纤维网状细胞 | 单细胞生物学 | 肠道免疫疾病 | 单细胞转录组学, 细胞谱系示踪, 功能获得与缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞命运图谱 | 小鼠胚胎派尔集合淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Immune cells lacking Y chromosome show dysregulation of autosomal gene expression
2021-Apr, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03822-w
PMID:33837451
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研究论文 | 本研究探讨Y染色体缺失对免疫细胞基因表达的影响及其与疾病风险的关联 | 首次发现Y染色体缺失会导致约500个常染色体基因表达失调,并揭示其在不同免疫细胞类型中的特异性效应 | 研究主要集中于白细胞,尚未完全阐明Y染色体缺失影响疾病风险的具体分子机制 | 探究Y染色体嵌合缺失对基因表达的影响及其在疾病发生中的作用 | 人类白细胞(包括NK细胞、CD4+T细胞和粒细胞) | 基因组学 | 阿尔茨海默病,前列腺癌 | DNA分析,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,转录组RNA | 来自阿尔茨海默病和前列腺癌患者的白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序重新定义小鼠子宫内膜间充质细胞图谱 | 首次对成年小鼠子宫内膜间充质细胞进行明确分析,鉴定出五个亚群,为子宫内膜与其他易纤维化组织间充质细胞的比较提供平台 | 研究仅限于小鼠模型,人类子宫内膜的等效细胞群体存在与否尚不明确 | 重新定义子宫内膜间充质细胞组成和特征 | 小鼠子宫内膜间充质细胞 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | Pdgfrb-BAC-eGFP转基因报告小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病炎症中向致病性ILC3样状态转化的动态过程 | 发现皮肤ILCs在炎症刺激下通过多种轨迹向致病性ILC3样状态汇聚,而非由预定型ILCs直接响应 | 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤ILCs的类似机制需要进一步验证 | 探究皮肤驻留先天淋巴样细胞在银屑病发病机制中的状态转变和功能重塑 | 小鼠皮肤组织中的先天淋巴样细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 体内命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溃疡性结肠炎患者回肠肛袋免疫细胞的转录特征 | 首次在单细胞水平揭示回肠肛袋炎症中IL1B/LYZ+髓系细胞和FOXP3/BATF+T细胞的特异性群体 | 原始序列数据因患者隐私保护未公开,样本量相对有限 | 阐明回肠肛袋炎中肠道免疫系统的独特组织方式 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 26例患者(15例有回肠肛袋,11例无回肠肛袋) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
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综述 | 探讨表观遗传机制在细胞异质性形成中的基础作用 | 系统阐述单细胞表观基因组分析技术如何揭示染色质状态对基因表达异质性的贡献机制 | NA | 研究表观遗传特征与细胞异质性之间的关联机制 | 染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾修饰和增强子-启动子相互作用等表观遗传特征 | 表观遗传学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞表观基因组分析 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
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研究论文 | 本研究通过分子图谱分析揭示了间质性肺病中表型独特的衰老基底上皮细胞群体 | 首次在ILD中识别出具有独特表型的衰老基底上皮细胞群体,并建立了肺上皮细胞特异性衰老转录特征 | 缺乏功能性研究验证,人类肺组织样本中环境特异性细胞衰老特征分析工具不足 | 阐明间质性肺病中衰老细胞的起源和特征 | 特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化相关间质性肺病(SSc-ILD)的肺组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,体外模型 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 对照、IPF和SSc-ILD肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-07 |
The molecular landscape of neural differentiation in the developing Drosophila brain revealed by targeted scRNA-seq and multi-informatic analysis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109039
PMID:33909998
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研究论文 | 通过靶向单细胞RNA测序和多信息学分析揭示果蝇大脑发育过程中的神经分化分子图谱 | 首次在果蝇II型神经母细胞谱系中应用靶向scRNA-seq技术,结合计算分析和原位验证,从单一发育时间点解析分子景观 | 研究仅基于三龄幼虫大脑的单一发育时间点,缺乏时间序列动态观察 | 研究果蝇大脑发育过程中的神经分化分子机制 | 果蝇三龄幼虫大脑中的II型神经母细胞谱系 | 单细胞基因组学 | NA | 靶向单细胞mRNA测序, 多信息学分析, 原位验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 果蝇三龄幼虫大脑细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |